如何使用ImageJ测量荧光强度

如何使用ImageJ测量荧光强度
如何使用ImageJ测量荧光强度

如何使用ImageJ 测量荧光强度

上一篇小编给大家分享了一下细胞计数方法,今天小编给大家分享一下期待已久的荧光定量分析。荧光定量分析是生物图像处理中比较常见的一种,今天我们分享的如何使用ImageJ 进行荧光定量分析。下图就是在我们我们Revolve 正倒置一体显微镜上拍摄的照片,以此图为例来说明如何进行荧光定量分析。

拆分多通道图像

荧光强度的测量无法在同时显示多通道的Merge 图像中进行,在进行测量之前应该先把Merge 的图像拆分成单通道(或者直接对单通道图片进行测量)。拆分方法:Image →Color →Split Channels。

图像分割

在图像计算的角度而言,图像分割(Image Segmentation)便是将图片分割为多个片段的过程,其目的是简化图像不同部分的象征意义以便于图像分析。常用的图像分割技术主要用来定位图像中的目标物体并勾画出其边界。ImageJ中可通过多种方法实现图像分割,在此我们先介绍一下最基本的一种-手动图像分割。此种方法主要通过控制图像直方图中的强度阈值来实现,分割出阈值范围内的图像区域,并进行后续的测量分析。实现方法:Image→Adjust→Threshold,红色蒙版即代表选中区域。

测量荧光强度

实现方法:Analyse→Measure。

注意:默认数值显示的是整张图片的荧光强度和面积,我们需要进行参数设定才可以显示所选区域的统计值。

如果需要导出数据或者设定测量参数,点击右键(也可以通过Analyse→Set Measurement实现),选中Limite to threshold和Area fraction。

好啦,现在进行Analyse→Measure,就可以得到想要的统计值了。

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