生物信息
【上海市生物信息学会】生物信息分析暑期培训班
【2014年高通量测序数据分析培训班】
【基础理论和实例化教学方式】
【为您的科研提供理论基础和实践经验】
【简介】
上海市生物信息学会（Shanghai Society for Bioinformatics，缩写SSBI）成立于2005年6月，是上海市科学技术协会下属的地方性学术团体。现有单位会员超过6家，并已经吸收了80多位个人会员，学会接受主管单位上海市科学技术协会的业务指导和上海市社会团体管理局的监督管理。上海市生物信息学会的挂靠单位为上海生物信息技术研究中心。
上海生物信息技术研究中心隶属于上海科学院，是由上海市科学技术委员会依托中国科学院上海生命科学研究院、国家人类基因组南方研究中心、复旦大学、上海交通大学、上海医药工业研究院等11家科研单位，整合上海生物信息学主要研究力量，正式组建了上海生物信息技术研究中心（以下简称“中心”）。中心是国内第一个以推动我国生物信息学数据共享为目的，专业从事生命科学研究、生物信息研究和数据库建设、生物信息学软件开发的独立事业法人单位。2006年成立博士后科研工作站。
随着基因组学技术的发展，中心建立了新一代测序技术平台，包含Roche 454，Illumina HiSeq 2000/2500，Illumina MiSeq，Ion Proton，Solid等测序系统，能够开展新基因组测序（de novo sequencing）、基因组重测序（re-sequencing）、靶向测序（targeted sequencing）、甲基化测序（Methyl-Seq）、转录因子结合位点测序（ChIP-Seq）、全转录组测序（RNA-Seq）、miRNA 测序（miRNA-Seq）等实验和数据分析。中心在系统建模、定量组学数据获取、分析、数据整合及其相互作用网络分析技术平台建设方面已经有了很多重要的研究成果。在蛋白质组学研究、细胞信号转导研究等多个领域研究达到了国际先进水平，在系统生物学和生物信息学研究方面也取得国内外瞩目的研究成果。
【会议日程】
【拟邀请报告人】
李亦学，博士，研究员，博士生导师。上海生物信息技术研究中心主任，中科院上海生命科学研究院生物信息中心主任，中科院系统生物学重点实验室副主任，国家“十一五”863计划生物与医药领域专家组成员。曾任国家“十五”高技术发展计划（863计划）生物和农业技术领域生物信息技术主题专家组组长，国家中长期发展规划第十五专题组副组长，上海市2002年科学预见专家，中国科学院生命科学领域战略发展专家组专家，国家科技部中英E-Science国际合作计划中方协调人。2003年度上海市劳动模范，2003 年度上海市优秀学科带头人。现为国家自然科学基金委员会生命科学部自然科学基金专职评审专家，德国Journal of Integrative Bioinformatics杂志，美国Medical Science Monitor杂志特邀审稿人，国内《科学通报》特邀编辑，生物物理和生物化学学报、中国生物工程杂志以及Genomics,Proteomics and Bioinformatics 等杂志编委。
丁国徽博士，上海生物信息技术研究中心/上海生物医学研究院个人基因组研究组组长。2009年11月，破格提升为中国科学院上海生命科学研究院副研究员。丁国徽博士主要以分子进化，基因组学和生物医学信息作为研究方向，已发表论文57篇，其中以第一作者或通讯作者发表SCI 论文20篇，参与申请专利5项，软件著作权11项。
郑广勇博士，副研究员，中国科学院－马普学会计算生物学伙伴研究所，副研究员；上海生物信息技术研究中心，病原基因组学课题组，CO-PI. 郑广勇博士目前已在Nature genetics, PNAS, Human Mutation, Molecular & Cellular Proteomics, Bioinformatics, BMC bioinformatics，BMC genomics, Nature communications 等国际重要学术刊物发表了一系列论文，论文总影响因子超过70，总引用次数超过400次。
李虹博士，在中科院系统生物学重点实验室任助理研究员，主要研究兴趣为计算基因组学和癌症组学大数据挖掘。共以第一作者发表SCI论文8篇（PloS Genetics, Molecular & Cellular Proteomics, Nucleic Acids Research. Bioinformatics等），累计引用139次；参与发表SCI论文10篇，累计引用729次；参与申请软件著作权4项。
李光高级工程师，多年从事生物信息数据的采集，分析工作。熟练使用Linux系统，依托Linux 系统搭建高通量分析平台，构建数据库，结合Mysql，Php，Java可以提供基本展示平台。使用Perl，R等分析工具处理数据，进行进一步统计分析。
王振博士，现为上海生命科学研究院博士后。博士阶段的研究方向为基因组进化与功能的研究。主要工作是研究蛋白质磷酸化的进化，通过分子进化的方法，发现脊椎动物不同功能模块中的磷酸化位点的保守性存在显著差异，从而揭示了磷酸化对脊椎动物特异性功能形成的作用。博士后阶段的方向为模式生物的基因组研究。基于基因组的深度测序，利用比较基因组和群体遗传学的方法，解析模式生物特殊性状的分子机制。
袁力贇博士，中国科学院上海生命科学研究院系统生物学实验室博士后。研究细胞全能性的分化机制。构建非编码RNA的分析流程，研究lncRNA的生物学功能及其在不同疾病中的分子调控机制。还参与包括高通量测序数据的质量控制，全基因组和外显子基因组数据分析的流程构建等工作。
李君一中国科学院上海生命科学研究院系统生物学国家重点实验室博士后。科研兴趣主要是运用统计的算法以及数理的模型，结合高通量数据来研究解决遗传学和表观遗传学有关的生物信息学问题。
【主办单位】上海生物信息学会
【协办单位】苏州贝斯派生物科技有限公司
上海生物信息技术研究中心
上海众信生物技术有限公司
【培训地址】上海市科技创业中心1号楼
【具体上课地点】上海市徐汇区钦州路100号1号楼12楼
【付费方式】 7月21号之后付款3000元/人/期
7月21号之前付款2800元/人/期
在校学生持学生证2500元/人/期
同一个单位，4人以上集体报名（含4名），2500元/人。
同一个人，同时报3期培训，2500元/期。
【说明】以上费用含证书（上海生物信息学会颁发）、教材、税金、午餐、茶点
李伟伟021-********