【生物课件】动物微生物实验实训指导书.doc
二、实验实训目录: 实验实训一
实验实训二
实验实训三
实验实训四
实验实训五
实验实训六
实验实训七
实验实训八
实验实训九
实验实训十
术
实验实训^一
实验实训十二
实验实训十三动物微生物实验实训指导书
一、实验实训指导说明：
1、性质与作用：动物微生物是高等农业职业院校畜牧兽医专业的一门岗位素质课程。对应岗位是：动物疫病诊断、检疫、检测技术等实训室技术岗位。作用是：研究微生物与畜禽的关系，并利用微生物学与免疫学的知识和技能来诊断、防治畜禽的疾病与人畜共患疾病，让学生具备畜牧兽医行业高等技术应用型专门人才所必须的畜禽疾病诊断、检测、预防等专业知识和熟练的职业专门技术能力，培养学生具备相应职业关键技术能力和职业道德。在教学过程中，使学生要掌握动物微生物与免疫所必须的专项实践技能和综合职业能力，基本掌握细菌类疾病、病毒类疾病、其他微生物实训室检验技术等。同时，在教学中对学生职业道德进行影响，注意敬业精神、吃苦耐劳、尽心钻研等方面的教育影响，并形成良好职业道德和敬业精神。
2、课程内涵：本课程的内涵是通过过程性的训练及考核，通过形成性联系及渐进式教学，使学生不但掌握专业知识而旦能够有效把握技能的知识背景及相应的产业历史，为学生在系统掌握本课程专业技能操作的同时，初步具有应对复杂问题及进行有效迁移以及创造的能力。使学生掌握动物微生物课程所必须的专业理论知识，专业实践能力和综合职业能力，掌握主要动物的疾病实训室诊断技术，可以独立的开展动物疫病的实训室检验，具有较强的工作岗位适应能力、分析和解决实际问题的能力以及创新意识和职业道德意识。经过本课程的学习及培养后学生应具有认真负责、踏实肯干，严谨求实的工作态度及独立思考、自主创业的精神。
显微镜油镜的使用及细菌形态观察方法
动物微生物检验中常用玻璃器皿的准备
细菌标本片的制备及染色方法
常用培养基的制备
细菌的分离培养及培养性状的观察技术
细菌的药物敏感试验（纸片法）技术
外界环境微生物测定技术
实验动物接种技术
病毒鸡胚接种技术
鸡新城疫病毒的红细胞（血）凝集与凝集抑制试验（微量法）操作技真菌的检验技术凝集试验
琼脂扩散试验技术
三、实践教学内容:
实验实训一显微镜油镜的使用及细菌形态的观察
一、目的要求：
1、要求学生掌握显微镜油镜的使用及保养方法。
2、认识细菌的形态、基本构造和特殊构造。
二、设备材料：
显微镜香柏油二甲苯擦镜纸细菌染色标本
三、实验实训内容：
（-）显微镜油镜的使用
1、油镜的识别：油镜是显微镜物镜的一种，因使用时必须浸于香柏油内，故称油镜。
油镜与其他物镜有以下区别：
（1）油镜一?般是所有物镜中最长的。
（2）油镜头上标有其放大倍数“100X”或“90X：
（3）不同厂家生产的显微镜,常在不同镜头上标有不同颜色的线圈以示区别，使用时应先熟悉一下油镜头上的线圈颜色，以防用错物镜。
2、基本原理：因光线在香柏油中的折射率3=1.515）与在玻璃中的折射率（n二1.52）相近，故可减少因折射而射入镜头外的光线，提高了视野的亮度。
3、使用方法：
（1）X'j光：将聚光器升至最高，将光圈放大至最大，调节凹面反光镜，使射入镜头中的光线最强。（2）装片：在细菌染色标本片的欲检部位滴-一滴香柏油后，将标本片安放于载物台上, 用弹簧片固定，将待检部位移至聚光器上，先用低倍镜寻找适当的视野，再换用油镜头观察。
（3）调焦：先用粗调节螺旋将载物台上升或使油镜头下降，使油镜头与标本片几乎接触，然后，边用眼睛观察D镜，边用细调节螺旋向相反方向缓慢旋转，直至出现完全清晰的物像为止。
（4）保养：油镜用毕，先用粗调节螺旋将载物台下移或使油镜头上升，将细菌标本片取下，用擦镜纸吸去香柏油，如油己干或模糊不清者，可在擦镜纸上滴1—2滴二甲苯或无水乙醇后将玻片上的香柏油吸净，并立即用干擦镜纸拭去二甲苯；用同样的方法将油镜头擦拭干净。然后将低倍镜转至中央或将物镜转成“八”字形，调节粗调节螺旋，
1、细菌基本形态的观察: （1） 球菌标本片的观察
（2） 杆菌标本片的观察
2、细菌特殊构造的观察:
（3）螺旋菌标本片的观察
（1） 细菌荚膜标本片的观察 （2） 细菌鞭毛标本片的观察 （3） 细菌芽饱标本片的观察
使物镜头与载物台接触，下降聚光器。将显微镜用绸布盖好后装入镜箱，置于阴凉干燥 处。
（-）细菌形态的观察：
注意事项：
1、 当油镜头与标本片几乎接触时，不可再用粗调螺旋向上移动载物台或下降油镜头， 以免损坏玻片甚至压碎镜
头。
2、 油镜头和玻片只能用擦镜纸擦拭，不能用手、棉布或其他纸张擦拭。
3、 香柏油的用量以1—2滴、能淹到油镜头的中间部分为宜，用量太多则浸染镜头，太 少则视野变暗不便观
察。
4、 为了增强视野的亮度，应做到三点：聚光器调至最高，光圈调至最大，反光镜用凹 面镜。
四、 教学组织：实验1人-?组，每人有一台显微镜，教师认真讲解操作规程，辿讲解辿 示范，学生观察做图，在学生基本清楚的下，教师进行分别指导教学。
五、 作业：1、实验报告。2、心得体会。3、将细菌形态画于实验册上。
实验实训二 动物微生物检验中常用玻璃器皿的准备
一、 目的要求：掌握动物微生物检验中常用玻璃器皿的准备 二、 设备材料：试管吸管平皿三角烧瓶烧杯量筒脱脂棉纱布旧报纸石 炭酸洗衣粉盐酸等 三、 实验实训内容： 玻璃器皿的准备
1、 购置的载片，先用2%盐酸浸泡一天，冲去盐酸。再用洗衣粉水洗涤，用自来水冲净, 浸泡在蒸馄水中或擦
干装盒备用。
2、 用过的玻璃器皿的处理：
&洗涤前必须灭菌：高压灭菌：油类的物品乘热洗涤（培养基、血液试管滴管等）。吸 管：浸泡于5%石炭酸48H 。&洗涤：
淤用过的载片，先用纸擦去香柏油，再放入洗衣粉液中煮沸（或5%的石炭酸48【1浸泡）, 稍冷后取出。逐个用清水洗净，放于酒精中。试管等物品同灭菌及洗涤。
※盖片使用前，可■用洗衣粉或洗液浸泡，洗净后再用95%乙醇浸泡，擦干备用，用过的 盖片也应及时洗净擦干保存。
※吸管浸泡于洗衣粉水中，用细铁丝取出棉花，用试管刷洗涤，再用自来水洗，用蒸馄 水冲洗。 &干燥：自然干燥或干燥箱。
&包装：※棉塞的制备※试管的包装※平皿的包装。※锥形瓶的包装。
四、教学组织：实验2-3人一?组，教师认真讲解操作规程，边讲解辿示范，学生理解、操作，在学生基本清楚的下，教师进行分别指导教学。
五、作业：1、实验报告。2、心得体会。
实验实训三细菌标本片的制备及染色方法
一、目的要求：
要求学生掌握细菌标本片的制备基染色方法。
二、设备材料：
病料细菌培养物接种环玻片酒精灯染色缸染色架染色液
三、实验实训内容：
（-）细菌涂片的制备：
1、液体培养物及液体病料：
（1）涂片用接种环取一?滴培养液或液体病料，于玻片的中央均匀地涂布成适当大小的薄层。
（2）干燥一般采用自然干燥，天气较冷时也可于酒精灯火焰上方30-40cm处适当加热干燥。
（3）固定分为火焰固定和化学固定两种。火焰固定时，将干燥好的玻片涂面朝上，以其背面在酒精灯火焰上来回通过数次，略作加热，以不烫手背为度；化学固定时，可将干燥好的玻片浸入甲醇中2-3min后取出晾干，或在涂片上滴加数滴甲醇使其作用2-3min后自然挥发干燥。此外，内酮和酒精也可用作化学固定剂；作瑞特氏染色的涂片不需固定，因染色液中含有甲醇，有固定作用。
（4）染色根据不同的材料和菌种选择不同的染色法。
2、固体培养物：用接种环取一滴生理盐水于玻片的中央，用接种环挑取一个菌落于生理盐水中混合，均匀地涂布成适当大小的薄层，干燥，固定，染色。
（-）细菌触片的制备：将固体病料（病变组织）作无菌切开，用切面在玻片中央接触一下或稍用力印压成一薄层，干燥，固定，染色。
（三）细菌的染色法：
1、单染色法：又称简单染色法，即只应用一?种染料进行染色的方法。
（1）美蓝染色法：在已干燥、固定好的涂片或触片上滴加适量的美蓝染色液，染色1 -2min后，水洗，干燥（吸水纸吸干或自然干燥），镜检。
（2）瑞特氏染色：在已干燥、固定好的涂片或触片上滴加瑞特氏染色液，为避免干燥, 可■适当多加一些，或视情况补充滴加，1 —3min后再加与染液等量的中性蒸馅水或缓冲液，轻轻晃动玻片，使之与染色液混合均匀，再经3-5min后，直接用水冲洗，吸干或烘干后镜检。也可在玻片上的涂抹处盖一?适当大小的滤纸，然后再在滤纸上轻轻滴加瑞特氏染色液，至略浸过滤纸，视情况补充滴加，维持不干，3-5min后直接用水冲洗，吸干或烘干后镜检。
（3）吉姆萨氏染色法：先将吉姆萨染色液原液稀释成常用的吉姆萨染色液（取5-10 滴原液于5ml新煮过的中性蒸馅水中，混合均匀），在经甲醇固定好的涂片上滴加足量的染色液，或将涂片浸入盛有染色液的染色缸中，染色30min或浸染数小时至24小时后取出，水洗，吸干或烘干后镜检。
2、复染色法：应用两种或两种以上的染料或再加媒染剂进行染色的方法。
（1）革兰氏染色法：在已干燥、固定好的涂片上滴加适量的草酸铉结晶紫染色液，染色1 —2min后，水洗，再加革兰氏碘液，作用1 一2min后，水洗，加95%酒精脱色0.5-lmin后，水洗，稀释石炭酸复红（或沙黄、番红）染色液复染0.5inin后，水洗，干燥，镜检。
（2）抗酸染色法：常用的有萋一尼氏染色法和沙黄一美蓝染色法。
%1萋一尼氏染色法：在已干燥、固定好的涂片上滴加较多量的石炭酸复红染色液，酒精灯火焰上方微微加热至冒出蒸气并维持3-5min,水洗；再用3%盐酸酒精脱色至无染色液流出，充分水洗；然后用碱性美蓝染液复染约Imin,水洗，吸干，镜检。
%1沙黄一美蓝染色法：在已干燥、固定好的涂片上滴加较多量的沙黄染色液，酒精灯火焰上方微微加热使冒蒸气3-5次，维持1 —2田比，水洗；再用再用3%盐酸酒精脱色至无染色液流出，充分水洗；然后用碱性美蓝染液复染约Imin,水洗，吸干，镜检。
注意事项：
1、做细菌涂片时，不宜涂得过厚，以免影响制片效果。
2、固定必须确实，火焰固定时不宜温度过高，以免破坏菌体结构。
3、每种染液染色的过程中应保持染色液不干，尤其加热染色的染液，在染色过程中应随时添加，以免蒸发干，影响染色效果。
4、每种染液染色后，应用水将染液一起冲掉，不可先将染液倾去后再用水冲洗。
四、教学组织：实验2-3人一组，教师认真讲解操作规程，边讲解边示范，学生操作、观察、做图，在学生基本清楚的下，教师进行分别指导教学。
五、作业：1、实验报告。2、心得体会。3、将每组涂片结果画于实验册上。
实验实训四常用培养基的制备
?、目的要求:
1、要求学生掌握常用培养基的制备过程
2、要求学生掌握培养基pH的测定和调节方法
二、设备材料：
灭菌锥形瓶烧杯试管平皿天平高压灭菌器过滤装置漏斗纱布电炉玻棒新鲜牛肉或牛肉浸膏蛋白豚磷酸氢二钾氯化钠琼脂蒸馄水0.1 mol/1 氢氧化钠溶液精密pH试纸等
三、实验实训内容：
（-）基础培养基的制备：
1、普通肉汤培养基：用新鲜牛肉先制成肉浸液。取新鲜牛肉去脂肪和筋膜，切成小块, 称重，按肉水比1：2的比例加水浸泡过夜（夏季应置于冰箱内），煮沸约lh后用纱布滤去肉渣挤出肉水，然后用滤纸过滤肉浸液，
补足原有水量，装入锥形瓶中用高压灭菌器灭菌（0.1（）5Mpa, 2（）min）后，置阴凉喑处保存。取上述肉浸液1000ml于锥形瓶中，称取蛋白豚10g、磷酸氢二钾lg,氯化钠5g,加入肉浸液中充分搅拌溶解，必要时可稍加温促进溶解。测定和调整pH为747.6,用滤纸过滤，置高压过滤器内灭菌（0.105Mpa, 20min）后，于无菌室或超净台内分装于试管内，每管约10ml,无此设备者可先分装后灭菌。如无新鲜牛肉，也可用牛肉浸膏代替。用量是每1000ml培养基3-5g o
2、普通琼脂培养基：取1000ml普通肉汤培养基于烧杯中，加入20-30g琼脂，煮沸使琼脂充分融化，趁热用2-4层纱布过滤，补充蒸馄水至1000ml,测定和调节pH至所需标准。高压灭菌后无菌分装于试管（装量为1/4—1/3管）中趁热斜置，冷却即成琼脂斜面；或分装平皿（厚度为2—3mm）中，水平静置冷却即成琼脂平板。也可先分装于试管中，再进行高压灭菌，然后趁热斜置冷却。
（二）营养培养基的制备：
1、鲜血琼脂培养基：亦称为血液琼脂培养基。将灭菌后的普通琼脂培养基加热溶解，冷却至45-50°C时加入无菌鲜血（每100ml普通琼脂中加入鲜血5~6ml）,摇匀后趁热分装于试管中制成斜面，或分装于平皿中制成平面。若温度过高时加入鲜血，则血液变为暗褐色，称为巧克力琼脂。
2、血清琼脂培养基：方法同鲜血琼脂培养基，血清用量是每100ml普通琼脂中加入5 —6ml。
（三）其他常用培养基的制备：
1、半固体培养基：制备方法同普通琼脂，只是将琼脂的用量减少为0.5%—0.7%。
2、马铃薯琼脂培养基：马铃薯200g,去皮后切成小块，加蒸馅水煮沸30min,用4层纱布过滤，加入葡萄糖20g,加入融化后补充蒸馄水至1000ml，调节pH至4.5,灭菌后分装即可。主要用于霉菌和担子菌的分离培养。
3、麦抗凯琼脂培养基:蛋白腺2g、乳糖lg、氯化钠0.5g、胆盐0.5g、1 %中性红水溶液0.5ml、蒸馄水加至1000ml□
4、SS琼脂培养基：蛋白腺5g、牛肉浸膏5g、乳糖10g、胆盐10g、枸椽酸钠10-14g> 硫代硫酸钠8.5g、枸椽酸铁0.5g、0.5%中性红水溶液4.5ml、0.1%亮绿溶液0.33ml、琼脂25-33g.蒸馄水加至1000mlo （四）pH测定法：
1、精密pH试纸法：取该试纸一条浸入欲测的培养基中，0.5s后取出与标准比色卡比较, 如为酸性，滴加lmol/1氢氧化钠溶液至pH在所需范围之间。在滴加lmol/1氢氧化钠溶液时，应充分摇匀，再用试纸测定。
2、标准比色管法：一?般细菌生长的pH为767.8,测定方法如下：
（1）取大小相同的比色管4支，每管分别加入不同的溶液：①培养基管（对照管）加肉汤培养基5ml；
②标准比色管;③加有指示剂的培养基管（内装5ml肉汤培养基和0.02% 酚红指示剂0.25ml）④蒸馄水管。（2）对光观察：比较两侧观察孔内颜色是否相同，若培养基为酸性（一般为酸性），则向③管内慢慢滴入滴加0.1mol/l氢氧化钠溶液，每滴一次，将试管内液体摇匀，直至④两管相加的颜色与①②两管相同为止。（3）记录5ml培养基用去滴加0.1 mol/1氢氧化钠溶液的用量，按下列公式计算培养基总量中需加滴加1 mol/1氢氧化钠溶液的用量。
全部培养基加滴加二5ml
培养基所需x培养基总毫升X "I。
话iol/l氢氧化钠溶液0.1 mol/1氢氧化钠（ml） 50 培养基的分装装置与棉塞
四、教学组织：实验2-3人一组，教师认真讲解操作规程，边讲解边示范，学生理解、操作，在学生基本清楚的下，教帅进行分别指导教学。
五、作业：1、实验报告。2、心得体会。
实验实训五细菌的分离培养及培养性状的观察
一、Fl的要求：
1、要求学生掌握细菌的分离培养、纯化的操作机能；
2、要求学生掌握细菌在培养基上的生长特性；
二、设备材料：
B
恒温培养箱病料或细菌培养物接种环接种针酒精灯灭菌吸管各种细菌培养基无水碳酸钠氢氧化钠或氢氧化钾凡士林及生理盐水
三、实验实训内容：
（-）细菌的分离培养：
1、病料的采取：将新鲜肛门拭子用灭菌生理盐水洗涤，洗涤液可用于分离培养；无菌采取新鲜粪便的中心部分，用灭菌生理盐水稀释搅匀后澄清，其上清液可用于分离培养; 如为病理组织，可用烧红的刀片在其表面烫一下，随即用此刀片在烫过的地方切开一小口，用灭菌接种环在切口内醮一下即可用于分离培养。
2、平板划线分离培养：目的是将病理材料中的细菌分散，以便使细菌单在，从而发育成单个菌落，防止长成菌苔。
（1）直接划线分离培养：点燃酒精灯后，左手持皿，底朝下，盖在上，以无名指和小指托底，拇指、食指和中指将皿盖揭开成20度的角度，角度不宜过大，以防空气进入; 右手持接种环，在火焰上烧灼后取少许的材料涂在培养基边缘，将接种环上多余的材料在火焰上烧掉，然后在培养基表面进行“Z”字形划线，然后将平皿盖好，倒置于恒温培养箱中培养。
（2）分区划线分离培养：用玻璃铅笔在皿底外面划线，将培养基分成3-6个小区，持皿方法同直接划线，但每划完一个小区应将平皿旋转一定角度，以便于划线。
平板划线操作示意图
1
A B
划线分离示意图
（3）斜面划线分离培养：左手持试管，手掌朝上，食指和拇指夹住试管；右手持接种环，先将试管的棉塞端在酒精灯火焰上方旋转两周，然后用右手小指和手掌边缘央住棉塞，打开试管，保持试管口在火焰上方进行操作，在斜面上从试管底部向试管口作“Z” 字形划线，接种完毕，在酒精灯火焰附近塞上棉塞后，在火焰上方旋转两周。用铁丝篓或试管架直立放置于恒温培养箱中培养。
（4）增萌培养：当病料中的细菌很少时，直接进行分离培养往往不易成功，常先用液体培养基进行增菌培养。方法是取少许病理材料直接加入培养基中，置恒温培养箱中培养24-48h后，可取少量培养液作划线分离培养。
（-）细菌的纯化：操作方法基本同分离培养，但进行斜面纯化移植时左手应同时握住原培养管和待接种管，右手小指和手掌边缘夹住一个棉塞，无名指和中指夹住一个棉塞, 必要时中指和食指还可夹住第三个棉塞，液体培养基的纯化移植同液体培养基初次分离培养。
（三）细菌-在培养基上的生长特性观察：
1、固体培养基上的生长特性：细菌在固体培养基上生长繁殖，可形成菌落。观察菌落时，主要看以下内容：
（1）大小：不同细菌，其菌落大小变化很大。常用其直径来表示，单位是mm或urn。
（2）形状：主要有圆形、露滴状、乳头状或油煎蛋状、云雾状、放射状或蛛网状、同心圆状、扁平和针尖状等。
（3）边缘特征：有整齐、波浪状、锯齿状、卷发状等。
（4）表面性状：有光滑、粗糙、皱褶、颗粒状、同心圆状、放射状等。
（5）湿润度：有干燥和湿润两种。
（6）隆起度：有隆起、轻度隆起、中央隆起和云雾状等。
（7）色泽和透明度：色泽有白、乳白、黄、橙、红及无色等；透明度有透明、半透明、不透明等。
(8) 质地：有坚硬、柔软和粘稠等。
（9）溶血性：分为a —溶血、。一溶血和丫一溶血三种；
2、液体培养基上的生长特性：
（1）浑浊度：有强度浑浊、轻微浑浊和透明三种。
（2）底层情况：包括有沉淀和无沉淀两种，有沉淀又可分为颗粒状和絮状两种。
（3）表面性状：分为形成荚膜、菌环和无变化三种情况。
（4）产生气体和气味：很多细菌在生长繁殖的过程中能分解一些有机物产生气体，可通过观察是否产生气泡或收集产生的气体来判断；另一些细菌在发酵有机物时能产生特殊气味，如鱼腥味、醇香味等。
（5）色泽：细菌在生长繁殖的过程中能使培养基变色，如绿色、红色、黑色等。
3、半固体培养基上的生长特性：有运动性的细菌会沿穿刺线向周围扩散生长，形成侧松树状、试管刷状；无运动性的细菌则只沿穿刺线呈线状生长。
注意事项：
1、细菌的分离培养必须严格无菌操作。
2、接种环或接种针在挑取菌落之前应先在培养基上无菌落处冷却，否则会将所挑的菌落烫死而使培养失败。
3、划线接种时应先将接种环的环部稍弯曲，同时用力适度；分区接种时，每区开始的第一条线应通过上一区的划线。
4、不同细菌所需要的培养时间相差很大，应根据不同的菌种培养观察足够的时间。
四、教学组织：实验2-3人一组，教师认真讲解操作规程，边讲解边示范，学生操作，在学生基本清楚的下，教师进行分别指导教学。
五、作业：1、实验报告。2、心得体会。
实验实训六细菌的药物敏感试验（纸片法）技术
一、目的要求：
1、掌握消毒药及治疗药物的杀菌或抑菌作用。
2、学会药物敏感性试验的操作技术。
二、设备材料：
接种环酒精灯试管架恒温箱锡子常用消毒剂浸有药物的干燥滤纸片普通琼脂平板大肠杆菌枯草杆菌和金黄色葡萄球菌的培养物各种抗生素
三、实验实训内容：
（-）化学消毒剂的杀菌作用：
1、以接种环取大肠杆菌及葡萄球菌菌液（18-24h肉汤培养物），用连续划线法分别接种于两个琼脂平板上，使菌液密布于培养基表面。
2、以灭菌镶子夹取纸片（直径6mm）分别浸于0.1%升汞、5%石炭酸、2%来苏儿、2%
图
1：药物敏感性试验纸片
的贴法
碘酊中，每管中浸2片。浸透后，再将纸片一一?取出，分别放在已接种细菌的琼脂平板 表面，各纸片间的距离要大致相等。
3、置37°C 培养24h,观察结果。测量各消毒剂纸片周围的抑菌圈，并记录、分析实验 结果。
(-)细菌对抗生素等药物的敏感试验：测定细菌对抗生素等药物的敏感度，可供临诊 上正确选用药物。
1、 取6-8h 的大肠杆菌与金黄色葡萄球菌的肉汤培养物，以密集均匀划线法，分别接 种在两个普通琼脂平板表
面。
2、 在平皿底部背面用蜡笔标记“青霉素”、“链霉素”、“庆大霉素〃、“盐水”、“黄连素”。
3、 用灭菌镣子夹取浸有药物的干燥滤纸片，按标记位置，轻轻贴在已接种好细菌的琼 脂培养基的表面，一次放
好，不得移动。
4、置37°C 温箱内培养18 —24h 后取出，观察并记录结果、分析结果。根据纸片周围有 无抑菌圈及其直径大
小，按表1标准确定细菌对抗生素等药物的敏感度。
表1细菌对不同抗菌药物敏感性标准
药物名称
抑菌圈直径
(mm)
敏感度 青霉素
<10 不敏感 11-20 中度敏感 >20
高度敏感 土霉素 四环素、新霉素 链霉素、磺胺 <10
不敏感 11-14
中度敏感 >14 高度敏感 庆大霉素 卡那霉素 <12
不敏感 13-14
中度敏感 >14
高度敏感 氯霉素 红霉素
<10 不敏感 11-17 中度敏感 >17 高度敏感 其他
<10 不敏感 11-15 中度敏感 >15
高度敏感
附：干燥抗菌纸片的制备法
取直径6响的无菌滤纸片，浸于一定浓度的抗菌药液中，如青霉素为lOOTU/ml 链霉素、 氯霉素等抗生素为
2mg/ml,磺胺嚅嚏针剂为0. Img/ml,黄连素或其他中药可根据需要 稀释原液。一般每亳升药液中装有滤纸片100片，浸泡］-2h 后干燥备用，药剂维持1 —2个月有效。
注意事项：
1、试验用菌种对于被测定的抗生素应具有高度敏感性。
2、药检所下发的试验菌种为冷冻干燥品，保存于5—8°C冰箱内，一般可保存约1—3 年。
3、实验时，一?定要建立“无抗生素操作的观念”。
4、磺胺类药物用无豚琼脂平板，因蛋白质会使磺胺失去作用。
四、教学组织：实验2-3人一组，教师认真讲解操作规程，边讲解边示范，学生理解、操作，在学生基本清楚的下，教师进行分别指导教学。
五、作业：1、实验报告。2、心得体会。
实验实训七外界环境微生物测定技术
一、实验目的：
1、了解自然界中微生物的的分布及其意义。
2、掌握水中细菌总数的测定方法。
二、设备材料：
琼脂玻璃平皿生理盐水试管吸管恒温箱自来水
三、实验实训内容：
（-）空气中的微生物：取琼脂平皿数个，分别置于不同的地方，打开皿盖，暴露于空气中，经5、10、30、60分钟后，将盖盖好，置恒温箱中培养24-48小时，观察生长情况。
（二）水中的微生物：水的来源不同，所含细菌种类及活菌数亦不同，按国家规定，1ml 饮用水中的细菌总数不得超过100个，大肠杆菌指数不应大于3。
水的细菌总数检查法如下：
1、吸取自来水1ml移至无菌空培养皿内。
2、另取3只空培养皿鸡2支盛有9ml生理盐水的试管备用。吸取井水或池水1ml移至第一个空培养皿内，另1ml移至第一支盐水管中。用吸管吹吸三次，将第一支盐水管混匀后吸出1ml （1：10）移至第二个空培养皿内；吸另1ml移至第二支盐水管中，用同法混匀后，吸出1 ml （1： 100）移至第三个空培养皿内。
3、取4个融化后冷至45°C的高层琼脂，分别倾于上述四个培养皿内，混匀后，静置凝固。
4、将上述四个凝固后的培养皿置于恒温箱（37°C）内，孵育24小时，取出观察。分别在细菌菌落计算器上算出自来水、井水或池水中每亳升所含活菌数。计算菌落时，一般选择生长有30-30（）个菌落的培养皿，算出精确菌落数后，分别乘以稀释倍数，再取其平均值即得。
（三）动物毛上的微生物：用无菌剪刀和镶子剪取牛毛一束，浸于无菌生理盐水3-5 亳升中，振荡片刻，吸取浸泡液（）.5亳升作倾注培养，置恒温箱中，次口观察其结果。
（四）家畜口腔中的微生物：取新鲜琼脂平皿及加有5%蔗糖的培养琼脂平皿各一个，距离一尺，对准家畜的鼻腔，其呼吸三次，盖好后置恒温箱中培养，次日或再次日检查结果。
四、教学组织：实验2-3人一?组，教师认真讲解操作规程，边讲解辿示范，学生理解、操作，在学生基本清楚的下，教师进行分别指导教学。
五、作业：1、实验报告。2、心得体会。
实验实训八实验动物接种技术
一、实验目的：
1、掌握实验动物注射的一般方法。
2、掌握实验动物的剖检技术。
3、掌握微生物学诊断用病料的采取法及包装寄送。
二、设备材料：实验动物注射器针头酒精碘酊注射药物
三、实验实训内容：
（-）实验动物接种操作技术
1、实验动物的选择和接种后的管理：根据病原微生物的生物学特点和实验目的的要求选择适宜的实验动物（应考虑经济、健康、适龄、体重和性别适宜）和接种途径。接种完毕后，实验动物必须隔离饲养，作好标记，并作详细记载。
2、实验动物的固定方法：示教。
3、实验动物的接种（感染）方法：
%1皮下接种：一般在前肢或腋下皮下接种。
%1腹腔接种：将后肢抬高，从腹后侧注射，确定注射针进入腹腔后方可注射。
%1静脉注射：家兔可进行耳外缘静脉注射，小鼠可■可■尾中缘静脉注射。
%1肌肉注射：从肌肉丰满处注射。
（-）实验动物的剖检、病料采取、包装要求
1、实验动物死亡后立即解剖，以免腐败菌及肠道菌侵入脏器，给病原菌的分离带来困难，甚至不能得到应有的结果，同时亦影响病理变化的观察。
2、解剖用器械，必须经煮沸或高压灭菌。每一?脏器用一套器械。
3、实验动物放瓷盘中固定后，先用消毒药水将毛充分浸湿，打开皮肤后，用酒精棉球采灼烧腹壁，剪开腹壁。%1以无菌操作法取病料，放入无菌容器送检或进行接种工作，再取病料制片，以备染色镜检。
%1用酒精棉球灼烧胸壁，打开胸腔，无菌采取胸水、心包液及血液进行培养或送检，并取病料制片染色镜检。%1观察实验动物有无特殊病变。
%1作好详细记录。
四、教学组织：实验2-3人一?组，教师认真讲解操作规程，边讲解辿示范，学生理解、操作，在学生基本清楚的下，教师进行分别指导教学。
五、作业：1、实验报告。2、心得体会。
实验实训九病毒鸡胚接种技术
一、目的要求：
1、要求学生掌握病毒的鸡胚培养方法
2、掌握病毒的鸡胚接种技术
二、设备材料：
消毒设备注射器头皮针滴管接种环酒精灯受精卵照蛋器孵化设备卵盘卵杯接种箱眼科镶子和剪子毛细吸管锥子灭菌平皿恒温箱碘酒70%酒精镶子剪刀封蜡
三、实验实训内容：
1.准备蛋胚：孵育前的鸡卵先用清水以布洗净，再用干布擦干，放入孵卵器内进行孵育（37°C,相对湿度是45—60%）,孵育三口后，鸡卵每口翻动1—2次。孵至第4 □, 用检卵灯观察鸡胚发育情况，未受精卵，只见模糊的卵黄黑影，不见鸡胚的形迹，这种鸡卵应淘汰。活胚可看到清晰的血管和鸡胚的暗影，比较大一些的可以看见胚动，随后每口观察一次，将胚动呆滞或没有运动的、血管昏暗模糊者，即W能是己死或将死的鸡胚，要随时加以淘汰。生长良好的蛋胚一?直孵育到接种前，具体胚龄视所拟培养的病毒种类和接种途径而定。
心W"
树
2.接种：
(1)绒毛尿囊膜接种
(a)将孵育10—12天的蛋胚放在检卵灯上，用铅笔勾出气室与胚胎略近气室端的绒毛尿囊膜发育得好的地方。
(b)用碘酒消毒气室顶端与绒毛尿囊膜记号处，并用磨壳器或齿钻在记号处的卵壳上磨开一三角形或正方形(每边约5—6mm)的小窗，不可弄破下面的壳膜。在气室顶端钻一小孔。
(c)用小镶子轻轻揭去所开小窗处的卵壳，露出壳下的壳膜，在壳膜上滴一滴生理盐水，用针尖小心地划破壳膜，但注意切勿伤及紧贴在下面的绒毛屑囊膜，此时生理盐水破口处流至绒毛屑囊膜，以利两膜分离。
(d)用针尖刺破气室小孔处的壳膜，再用橡皮乳头吸出气室内的空气，使绒毛尿囊膜下陷而形成人工气室。
(e)用注射器通过窗口的壳膜窗孔滴0.05— 0. 1ml牛痘病毒液于绒毛尿囊膜上。
⑴在卵壳的窗口周围涂上半凝固的石蜡，作成堤状，立即盖上消毒盖玻片。也可用揭下的卵壳封口，则将卵壳盖上，接缝处涂以石蜡，但石蜡不能过热，以免流入卵内。将鸡卵始终保持人工气室在上方的位置进行37°C培养，48-96小时观察结果。
(2)尿囊腔接种：用孵育10—12天的蛋胚，因这时尿囊液积存得最多。
(a)将蛋胚在检卵灯上照视，用铅笔画出气室与胚胎位置，并在绒毛尿囊膜血管较少的地方作记号。
(b)将蛋胚竖放在蛋座木架上，钝端向上。用碘酒消毒气室蛋壳，并用钢针在记号处钻一小孔。
(c)用带18mm长针头的1ml注射器吸取鸡新城疫病毒液，针头刺入孔内，经绒毛尿囊膜入尿囊腔，注入0. 1ml病毒液。
(d)用石蜡封孔后于37°C孵卵器孵育72小时。
(3)羊膜腔接种
(a)将孵育10-11天的蛋胚照视，画出气室范围，并在胚胎最靠近卵壳的一?侧做记号。
(b)用碘酒消毒气室部位的蛋壳。用齿钻在气室顶端磨一三角形，每边约1cm的裂痕。
注意勿划破壳膜。
(C)用灭菌镶子揭去蛋壳和壳膜，并滴加灭菌液体石蜡一滴于下层壳膜上，使其透明，以便观察，若将蛋
胚放在检卵灯上，则看得更清楚。
(d)用灭菌尖头镶子，两页井拢，刺穿下层壳膜和绒毛尿囊膜没有血管的地方，并夹住羊膜从刚才穿孔处
拉出来。
(e)左手用另一把无齿镶子夹住拉出的羊膜，右手持带有26号针头的注射器，刺入羊膜腔内，注入鸡新
城疫病毒液0. 1ml。针头最好用无斜削尖端的钝头，以免刺伤胚胎。
⑴用绒毛尿囊膜接种法的封闭方法将卵壳的小窗封住，于37°C孵卵器内孵育48-72小时，保持蛋胚的钝
端朝上。
3.收获
(1)绒毛尿囊膜
(消用碘酒消毒人工气室上的卵壳，去除窗孔上的盖子。
(b)将灭菌剪子插入窗内，沿人工气室的界限剪去壳膜，露出绒毛尿囊膜，再用灭菌眼科镶子将膜正中央
起，用剪刀沿人工气室边缘将膜剪下，放入加有灭菌生理盐水的培养皿内，观察病灶形状。然后或用于传代，或用50%甘油保存。
(2)尿囊腔接种法收获尿囊液
(a)将蛋胚放在冰箱内冷冻半口或一夜，使血管收缩，以便得到无胎血的纯尿囊液。
(b)用碘酒消毒气室处的卵壳，并用灭菌剪刀除去气室的卵壳。切开壳膜及其下面的绒毛尿囊膜，翻开到
卵壳边上。
(c)将鸡卵倾向一侧，用灭菌吸管吸出尿囊液。一?个蛋胚约可收获6ml左右尿囊液。若操作时损伤了血
管，则病毒会吸附在红细胞上，尿囊液成为无用。收获的尿囊液经无菌试验后可在4°C以下的温度中保存。
(d)观察鸡胚，看有无典型的症状。
(3)羊膜腔接种法收获羊水
(a)按收获尿囊液的方法消毒、去壳，翻开壳膜和尿囊膜。
(b)先吸出尿囊液。再用镶子夹出羊膜，以尖头毛细吸管插入羊膜腔，吸出羊水，放入灭菌试管内，每蛋
胚可吸().5—1. 0mlo经无菌试验后，保存于低温中。
(c)观察鸡胚的症状。
四、教学组织：实验2-3人一?组，教师认真讲解操作规程，边讲解辿示范，学生理解、操作，在学生基本清楚的下，教师进行分别指导教学。
五、作业：1、实验报告。2、心得体会。
实验实训十鸡新城疫病毒的红细胞(血)凝集与凝集抑制试验(微量法)操作技术
?、目的要求:
1、要求学生掌握鸡新城疫病毒的红细胞凝集和凝集抑制试验（微量法）的操作方法。
2、要求学生掌握这两个试验的判定方法。
二、设备材料：
96孔V型微量血凝集反应板微量吸液器（0. 025ml）微量振荡器玻璃注射器离心管离心机灭菌生理盐水0.5%鸡红细胞悬液鸡新城疫弱毒疫苗II系或Lasota系鸡新城疫标准阳性血清和阴性血清被检血清
三、实验实训内容：
（-）试验准备
1、0. 5%红细胞液的制法：由鸡翅静脉或心脏采血，放入灭菌试管（按每亳升血加入3. 8% 灭菌柠檬酸钠
0.2而做抗凝剂）内，迅速混匀，将此血液注入离心管中，经3000转/分钟，离心5-10 min,用吸管吸去
上清液和红细胞上的白细胞薄膜，将沉淀的红细胞加生理盐水洗涤，如此反复洗涤三次，将最后一次离心后的红细胞，按0.5%的稀释度加入生理盐水即配成0. 5%鸡红细胞生理盐水悬液。
（二）病毒的红细胞凝集试验（微量法）
1、用微量吸液器每孔均滴加生理盐水0. 025ml o
2、用微量吸液器再吸取0. 025ml病毒，滴于第1孔中，用吸液器挤5次混合后吸至第2 孑L,依次倍比
稀释到第11孑L,弃去0. 025ml,病毒稀释倍数依次为1： 2?1： 2048, 第12孔做对?照。
3、再以微量吸液器每孔加0. 5%鸡红细胞悬液0. 025ml o
4、置于振荡器上振荡混匀约Imin,放入37°C恒温箱中15?30 min,取出观察结果。
表1鸡新城疫红细胞凝集（HA）试验（微量法）（单位：ml）
注：++++表示完全凝集 ++表示不完全凝集一表示不凝集
观察结果：将反应板倾斜成45度角，沉于管低的红细胞沿着倾斜面向下呈线状流动者, 表明红细胞未被或不完全被病毒凝集；如果孔低的红细胞铺平孔低，凝成均匀薄层，倾斜后红细胞不流动，说明红细胞被病毒所凝集。
如上例:病毒液的HA效价1 : 256, HI试验时,病毒抗原液0. 025 ml内须含4个凝集单位, 则应将病毒液作成256/4 = 64倍的稀释液.
（-）病毒的红细胞凝集抑制试验（IIT）:
1、用微量吸液器1T0孔均滴加生理盐水0. 025ml,第11孔滴加0. 05 ml。
2、用微量吸液器再吸取0. 025ml被检血清，滴于第1孔中，用吸液器挤5次混合后吸至第2孔，依次
倍比稀释到第10孑L,弃去0. 025ml,被检血清稀释倍数依次为1 ：2? 1： 1024o
3、再以微量吸液器每孔加入含有4个单位的病毒液0. 025而至第10孔，第11孔为红细胞对?照孔，不加病毒液。
4、置于振荡器上振荡混均约Imin,放入37°C恒温箱中15?20 min。
5、再以微量吸液器每孔加0.5%鸡红细胞悬液0. 025ml,放振荡器上振荡1?2混匀, 置15?30 min,判定结果。
6、每次试验应做抗原对照管。
表2鸡新城疫细胞凝集抑制试验操作术式（微量法）（单位：ml）
注：一表示不凝集 ++表示不完全凝集 ++++表示完全凝集
结果观察：将反应板倾斜成45度角，沉于管低的红细胞沿着倾斜面向下呈线状流动者, 表明红细胞未被或不完全被病毒凝集；如果孔低的红细胞铺平孔低，凝成均匀薄层，倾斜后红细胞不流动，说明红细胞被病毒所凝集。
能将4单位病毒物质凝集红细胞的作用完全抑制的血清最高稀释倍数，称为该血清的红细胞凝集抑制效价，用被检血清的稀释倍数或以2位底的对数表示。
四、教学组织：实验2-3人一组，教师认真讲解操作规程，边讲解边示范，学生理解、操作，在学生基本清楚的下，教师进行分别指导教学。
五、作业：1、实验报告。2、心得体会。
实验实训真菌的检验技术
一、Fl的要求：
1.掌握观察霉菌形态的基本方法，并观察其形态特征。
2.掌握常用的霉菌制片方法
二、设备材料：
曲霉青霉根霉毛霉乳酸石炭酸棉蓝染色液20%甘油查氏培养基平板马铃薯培养基无菌吸管载玻片盖玻片U形棒解剖刀玻璃纸滤纸等
三、实验实训内容：
1.一般观察法
于洁净载玻片上，滴一滴乳酸石炭酸棉蓝染色液，用解剖针从霉菌菌落的边缘处取小量带有抱子的菌丝置染色液中，再细心地将菌丝挑散开，然后小心地盖上盖玻片，注意不要产生气泡。置显微镜下先用低倍镜观察，必要时再换高倍镜。
2.载玻片观察法
(1)将略小于培养皿底内径的滤纸放入皿内，再放上U形玻棒，其上放一洁净的载玻片, 然后将二个盖玻片分别斜立在载玻片的两端，盖上皿盖，把数套(根据需要而定)如此装置的培养皿叠起，包扎好，用1.
05kg/cm2, 121. 3°C灭菌20分钟或干热灭菌，备用。
(2)将6—7而灭菌的马铃薯葡萄糖培养基倒入直径为9项的灭菌平皿中，待凝固后，用无菌解剖刀切成0. 5—1cm2的琼脂块，用刀尖铲起琼脂块放在己灭菌的培养皿内的载玻片上，每片上放置2块。
(3)用灭菌的尖细接种针或装有柄的缝衣针，取(肉眼方能看见的)一点霉菌泡子，轻轻点在琼脂块的边缘上，用无菌镶子夹着立在载玻片旁的盖玻片盖在琼脂块上，再盖上皿盖。
(4)在培养皿的滤纸上，加无菌的20%甘油数亳升，至滤纸湿润即可停加。将培养皿置28°C培养一定时间后，取出载玻片置显微镜下观察。
3.玻璃纸透析培养观察法
⑴向霉菌斜面试管中加入5ml无菌水，洗下饱子，制成饱子悬液。
(2)用无菌镶子将己灭菌的、直径与培养皿相同的圆形玻璃纸覆盖于查氏培养基平板上。
(3)用1ml无菌吸管吸取0.2ml泡子悬液于上述玻璃纸平板上，并用无菌玻璃刮棒涂抹均匀。
(4)置28°C温室培养48小时后，取出培养皿，打开皿盖，用镶子将玻璃纸与培养基分开, 再用剪刀剪取一小片玻璃纸置载玻片上，用显微镜观察。
四、教学组织：实验2-3人一?组，教师认真讲解操作规程，边讲解辿示范，学生理解、操作，在学生基本清楚的下，教师进行分别指导教学。
五、作业：1、实验报告。2、心得体会。
实验实训十二凝集试验
一、目的要求：
1、掌握玻片凝集和试管凝集试验的操作方法
2、掌握这两种试验的结果判定。
二、设备材料：
沙门氏菌诊断血清鸭沙门氏菌及大肠杆菌24h培养物布氏杆菌阳性及阴性血清布氏杆菌抗原生理盐水毛细吸管试管架刻度吸管接种环玻片
三、实验实训内容：
（-）玻片凝集试验：将玻片分成三格，在第3格内加1滴生理盐水，第1、2内各加1 滴沙门氏菌诊断血清，用接种环自斜面挑取鸭沙门氏间液置于第3格内混匀，随即再取一环置第1格内混匀；接种环灭菌后取大肠杆菌混匀于第2格，静止2-3min后观察结果。
结果判定：第一格内应形成白色块状凝集物；第2、3格内均无凝集物形成。
（二）试管凝集试验：
1、取小试管7支依次编号，按表1先加入生理盐水。
2、吸取布氏杆菌阳性血清0.2ml于第1管连续吹吸3次，充分混匀后，吸出1.5ml弃之, 再吸出0.5ml加入第2管，同法混匀后又吸取0.5ml于第3管，依次类推连续稀释到第4管，混匀后吸弃0.5ml。第5管不加阳性血清，第6管中加1：25稀释的阳性血清0.5ml, 第7管中加1：25稀释的阳性血清o.5mlo
3、吸取1： 20布氏杆菌抗原于各管内0.5ml,分别摇匀后置37°C24h,观察结果。
4、结果判定：
以产生明显凝集（++）的血清最高稀释度为其效价。判定标准：
++++大凝集块，液体透明，为100%凝集。
+++ 凝集片明显，液体较透明，为75%凝集。
++ 凝集片可见，液体不太透明，为50%凝集。
+ 液体浑浊，少量细菌凝集，为25%凝集。
—液体均匀浑浊，无凝集。
大地测量学实验指导书汇总
《大地测量学基础》实验指导书 XXX大学土木工程系测绘工程教研室 2010年7月
第一部分：实验与实习须知 控制测量学是测绘工程专业一门践性很强的专业主干课程，其实验与实习是教学中必不可少的重要环节。只有通过实验与实习，才能巩固课堂所学的基本理论，进而掌握仪器操作的基本技能和测量作业的基本方法，并为深入学习测绘专业理论和有关专业知识打下基础。在进行实验之前，必须明确实验的基本规定，了解仪器的借还手序及仪器的保护、保养等知识，做到爱护仪器，达到实习之目的，防患于未然。 实验与实习规定 1．在实验或实习之前，必须复习教材中的有关内容，认真仔细地预习本指导书，以明确目的、了解任务、熟悉实验步骤和过程、注意有关事项并准备好所需文具用品。 2．实验或实习分小组进行，组长负责组织协调工作，办理所用仪器工具和借领和归还手续。 3．实验或学习应在规定的时间进行，不得无故缺席或迟到早退；应在指定的场地进行，不得擅自改变地点或离开现场。 4．必须遵守“测量仪器工具的借领与使用规则”和“测量记录与计算规则”。 5．应该服从教师的指导，严格按照本指导书的要求认真、按时、独立地完成任务。每项实验或实习，都应取得合格的成果，提交书写工整规范的实验报告或实习记录，经指导教师审阅同意后，才可交还仪器工具，结束工作。 6．在实验或实习过程中，还应遵守纪律，爱护现场的花草、树木和农作物，爱护周围的各种公共设施，任意砍折、踩踏或损环者应予赔偿。 测量仪器工具的借领与使用规则 对测量仪器工具的正确使用、精心爱护和科学保养，是测量人员必须具备的素质和应该掌握的技能，也是保证测量成果质量、提高测量工作效率和延长仪器工具使用寿命的必要条件。在仪器工具的借领与使用中，必须严格遵守下列规定。 一、仪器工具的借领 1．在指定的地点凭学生证办理借领手续，以小组为单位领取仪器工具。 2．借领时应该当场清点检查。实物与清单是否相符，仪器工具及其附件是否齐全，背带及提手是否牢固，脚架是否完好等。如有缺损，可以补领或更换。 3．离开借领地点之前，必须锁好仪器箱并捆扎好各种工具；搬运仪器工具时，必须轻取轻放，避免剧烈震动。 4．借出仪器工具之后，不得与其他小组擅自调换或转借。
生物信息学实验指导书_新版本
生物信息学 实验指导书 重庆邮电大学
生物信息学实验指导书生物信息教学部谭军编 重庆邮电大学生物信息学院
前言 生物信息学是上世纪90年代初人类基因组计划(HGP)依赖，随着基因组学、蛋白组学等新兴学科的建立，逐渐发展起来的生物学、数学和计算机信息科学的一门交叉应用学科。目前生物信息学的研究领域主要包括基于生物序列数据的整理和注释、生物信息挖掘工具开发及利用这些工具揭示生物学基础理论知识等领域。生物信息学作为新型交叉应用学科，可以依托本校已有的计算机科学、信息学、生物学和数学等学科优势，充分展现投入少、见效快、起点高的特色，推动学校学科建设和本科教学水平。 本实验指导书中的8个实验均设计为综合性开发实验，面向生物信息学院全体本科学生和研究生，以及全校对生物信息学感兴趣的其他专业学生开放。生物信息学实验室将提供系统的保障，包括采用mail服务器和linux帐号管理等进行实验过程管理和支持。限选《生物信息学及实验》的生物技术专业本科生至少选择其中5个实验，并不少于8个学时，即为课程要求的0.5个学分。其他选修者按照课时和学校相关规定计算创新学分。
实验一熟悉生物信息学网站及其数据的 生物学意义 实验目的： 培养学生利用互联网资源获取生物信息学研究前沿和相关数据的能力，熟悉生物信息学相关的一些重要国内外网站，及其核酸序列、蛋白质序列及代谢途径等功能相关数据库，学会下载生物相关的信息数据，了解不同的数据文件格式和其中重要的生物学意义。 实验原理： 利用互联网资源检索相关的国内外生物信息学相关网站，如：NCBI、SANGER、TIGR、KEGG、SWISSPORT、Ensemble、中科院北京基因组研究所、北大生物信息学中心等，下载其中相关的数据，如fasta、genbank格式的核算和蛋白质序列、pathway等数据，理解其重要的生物学意义。 实验内容： 1.浏览和搜索至少10个国外和至少5个国内生物信息学相关网站，并描 述网站特征； 2.下载各网站的代表性数据各10条（组）以上，并说明其生物学意义； 3.讨论各网站适合做何种生物信息学研究的平台，并设计一个研究设想。 实验报告： 1.各网站网址及特征描述； 2.代表性数据的下载和生物学意义的描述； 3.讨论：这些生物信息学相关网站的信息资源，可以被那些生物信息学 研究所利用。 参考书目： 《生物信息学概论》罗静初等译，北京大学出版社， 2002； 《生物信息学手册》郝柏林等著，上海科技出版社， 2004； 《生物信息学实验指导》胡松年等著，浙江大学出版社， 2003。
BioEdit实验报告
生物信息学引论实验课报告（3） 一、实验目的与要求 1、熟悉使用BioEdit软件基于核酸序列比对分析的真核基因结构分析； 2、熟悉使用BioEdit软件进行核酸序列的点突变定位； 二、实验内容 （一）使用BioEdit软件进行序列分析（选取一种数据）； （二） 1. 人瘦素(leptin) 基因编码区点突变408 A→C的定位：打开BioEdit软件→将人瘦素(leptin) mRNA的FASTA格式序列输入分析框→点击左侧序列说明框中的序列说明→点击Sequence栏→选择Nucleic Acid→点击Find next O RF→从起始密码ATG的第一个碱基开始查找该基因编码区408（464，NM_000230）位碱基（A）； 2. 人瘦素(leptin) 基因编码区点突变408 A→C的限制酶切点分析：再点击Sequence栏→选择Nucleic Acid→点击Restriction M ap→点击Generate Map按钮→找到该基因编码区408（464，NM_000230）位碱基后可见该位置有限制酶Hind III 的切点（AAGCTT）；（提示：如发生408 A→C突变，则该酶切点消失）； 3. 人瘦素(leptin) 基因编码区点突变408 A→C分析的引物设计：调用Internet浏览器并在其地址栏输入primer3网址（https://www.360docs.net/doc/df10694620.html,/cgi-bin/primer/primer3.cgi）→用复制/粘贴方式将人瘦素(leptin) mRNA（NM_000230）的FASTA格式序列输入分析框→在targets框填入464，1→选择Product Size (~300 bp)和Primer Tm (~58.0) →点击Pick Primesr按钮→从显示的五队引物中选择合适的引物； 4. 人瘦素(leptin) mRNA定量的引物设计：方法同“3. 人瘦素(leptin) 基因编码区点突变408 A→C分析的引物设计”，但在targets框将突变点位置改为外显子交会点位置，另外Product Size 一般选择~150 bp。
测量学实验实训指导书
《测量学》实验实训指导书 许昌职业技术学院 二〇〇七年三月六日
测量实习须知 一、测量实习规定 （1）在测量实验之前，应复习教材中的有关内容，认真仔细地预习实验或实验指导书，明确目的与要求、熟悉实验步骤、注意有关事项，并准备好所需文具用品，以保证按时完成实验任务。 （2）实验分小组进行，组长负责组织协调工作，办理所用仪器工具的借领和归还手续。 （3）实验应在规定的时间进行，不得无故缺席或迟到早退；应在指定的场地进行，不得擅自改变地点或离开现场。 （4）必须严格遵守本书列出的“测量仪器工具的借领与使用规则”和“测量记录与计算规则” （5）服从教师的指导，每人都必须认真、仔细地操作，培养独立工作能力和严谨的科学态度，同时要发扬互相协作精神。每项实验都应取得合格的成果并提交书写工整规范的实验报告，经指导教师审阅签字后，方可交还测量仪器和工具，结束实验。 （6）实验过程中，应遵守纪律，爱护现场的花草、树木和农作物，爱护周围的各种公共设施，任意砍折、踩踏或损坏者应予赔偿。 二、测量仪器工具的借领与使用规则 （一）测量仪器工具的借领 1．在教师指定的地点办理借领手续，以小组为单位领取仪器工具。 2．借领时应该当场清点检查。实物与清单是否相符，仪器工具及其附件是否齐全，背带及提手是否牢固，脚架是否完好等。如有缺损，可以补领或更换。 3．离开借领地点之前，必须锁好仪器箱并捆扎好各种工具；搬运仪器工具时，必须轻取轻放，避免剧烈震动。 4．借出仪器工具之后，不得与其他小组擅自调换或转借。
5．实验结束，应及时收装仪器工具，送还借领处检查验收，消除借领手续。如有遗失或损坏，应写出书面报告说明情况，并按有关规定给予赔偿。 （二）测量仪器使用注意事项 1．携带仪器时，应注意检查仪器箱盖是否关紧锁好，拉手、背带是否牢固。 2．打开仪器箱之后，要看清并记住仪器在箱中的安放位置，避免以后装箱困难。 3．提取仪器之前，应注意先松开制动螺旋，再用双手握住支架或基座轻轻取出仪器，放在三脚架上，保持一手握住仪器，一手去拧连接螺旋，最后旋紧连接螺旋使仪器与脚架连接牢固。 4．装好仪器之后，注意随即关闭仪器箱盖，防止灰尘和湿气进人箱内。仪器箱上严禁坐人。 5．人不离仪器，必须有人看护，切勿将仪器靠在墙边或树上，以防跌损。 6．在野外使用仪器时，应该撑伞，严防日晒雨淋。 7．若发现透镜表面有灰尘或其他污物，应先用软毛刷轻轻拂去，再用镜头纸擦拭，严禁用手帕、粗布或其他纸张擦拭，以免损坏镜头。观测结束后应及时套好物镜盖。 8．各制动螺旋勿扭过紧，微动螺旋和脚螺旋不要旋到顶端。使用各种螺旋都应均匀用力，以免损伤螺纹。 9．转动仪器时，应先松开制动螺旋，再平衡转动。使用微动螺旋时，应先旋紧制动螺旋。动作要准确、轻捷，用力要均匀。 10．使用仪器时，对仪器性能尚未了解的部件，未经指导教师许可，不得擅自操作。 11．仪器装箱时，要放松各制动螺旋，装人箱后先试关一次，在确认安放稳妥后，再拧紧各制动螺旋，以免仪器在箱内晃动。受损，最后关箱上锁。
生物信息学大实验_实验指导
实验1基因组序列组装（软件CAP3的使用） 一、实验目的 1．了解基因组测序原理和主要策略； 2．掌握CAP3序列组装软件的使用方法。 二、实验原理 基因组测序常用的两种策略是克隆法（clone-based strategy）和全基因组鸟枪法（whole genome shotgun method）。克隆法先将基因组DNA打成大的片段，连到载体上，构建DNA文库；再对每一个大片段（克隆）打碎测序。序列组装时先组装成克隆，再组装成染色体。克隆测序法的好处在于序列组装时可以利用已经定位的大片段克隆, 所以序列组装起来较容易, 但是需要前期建立基因组物理图谱, 耗资大, 测序周期长。 全基因组鸟枪法测序无需构建各类复杂的物理图谱和遗传图谱，采用最经济有效的实验设计方案，直接将整个基因组打成不同大小的DNA片段构建Shotgun文库，再用传统Sanger测序法或Solexa等新一代测序技术对文库进行随机测序。最后运用生物信息学方法将测序片段拼接成全基因组序列。该方法具有高通量、低成本优势。 序列组装时，先把把单条序列（read）组装成叠连群（contig）、再把叠连群组装成“支架”（scaffold），最后组装成染色体。 本实验将练习在Linux环境下用CAP3软件组装流感病毒基因组。 1．CAP3序列组装程序简介 Huang Xiaoqiu. 和 Madan，A. 开发的一套用于序列拼接的软件，此软件适用于小的数据集或 EST 拼接，它有如下特征： 1. 应用正反向信息更正拼接错误、连接contigs。 2. 在序列拼接中应用 reads 的质量信息。 3. 自动截去 reads5`端、3`端的低质量区。 4. 产生 Consed 程序可读的ace 格式拼接结果文件。 5. CAP3 能用于Staden软件包的中的GAP4 软件。 2．下载 此软件可以免费下载，下载地址：http：//https://www.360docs.net/doc/df10694620.html,/download.html。填写基本信息表格，即可下载。CAP3 详细参考文档可见：http：//https://www.360docs.net/doc/df10694620.html,/sas.html。 3．安装 （1）上传cap3 的压缩包到本地linux/unix 运算服务器； （2）解压缩： bash-2.05b$ tar xvf cap3.tar CAP3/ CAP3/README CAP3/cap3
生物信息学专业实习总结范文
《浙江大学优秀实习总结汇编》 生物信息学岗位工作实习期总结 转眼之间，两个月的实习期即将结束，回顾这两个月的实习工作，感触很深，收获颇丰。这两个月，在领导和同事们的悉心关怀和指导下，通过我自身的不懈努力，我学到了人生难得的工作经验和社会见识。我将从以下几个方面总结生物信息学岗位工作实习这段时间自己体会和心得： 一、努力学习，理论结合实践，不断提高自身工作能力。 在生物信息学岗位工作的实习过程中，我始终把学习作为获得新知识、掌握方法、提高能力、解决问题的一条重要途径和方法，切实做到用理论武装头脑、指导实践、推动工作。思想上积极进取，积极的把自己现有的知识用于社会实践中，在实践中也才能检验知识的有用性。在这两个月的实习工作中给我最大的感触就是：我们在学校学到了很多的理论知识，但很少用于社会实践中，这样理论和实践就大大的脱节了，以至于在以后的学习和生活中找不到方向，无法学以致用。同时，在工作中不断的学习也是弥补自己的不足的有效方式。信息时代，瞬息万变，社会在变化，人也在变化，所以你一天不学习，你就会落伍。通过这两个月的实习，并结合生物信息学岗位工作的实际情况，认真学习的生物信息学岗位工作各项政策制度、管理制度和工作条例，使工作中的困难有了最有力地解决武器。通过这些工作条例的学习使我进一步加深了对各项工作的理解，可以求真务实的开展各项工作。 二、围绕工作，突出重点，尽心尽力履行职责。 在生物信息学岗位工作中我都本着认真负责的态度去对待每项工作。虽然开始由于经验不足和认识不够，觉得在生物信息学岗位工作中找不到事情做，不能得到锻炼的目的，但我迅速从自身出发寻找原因，和同事交流，认识到自己的不足，以至于迅速的转变自己的角色和工作定位。为使自己尽快熟悉工作，进入角色，我一方面抓紧时间查看相关资料，熟悉自己的工作职责，另一方面我虚心向领导、同事请教使自己对生物信息学岗位工作的情况有了一个比较系统、全面的认知和了解。根据生物信息学岗位工作的实际情况，结合自身的优势，把握工作
心理测量学实训指导书
《心理测量学》实验指导书 实验名称：心理测量学实验 学时：10 学分：1 适用专业：心理学、心理保健与咨询、社区康复 一、实验目的与任务：作为心理测量学的实践环节的教学内容，是学生在学习心理测量学基础知识的基础上，进一步对心理测量学知识的巩固和运用。学生通过学习，能进一步深刻认识心理测量学的基本原理，掌握心理现象的基本活动规律，提高对研究心理现象的兴趣，初步培养学生的实验设计能力及实验技能，形成科学严谨的研究态度。 二、教学基本要求：心理学实验教学是一门实践性很强的课程。要求学生结合对教材内容的学习，主动参加实验环节的实践训练，运用所学的内容，进行心理实验实际操作，提高实验设计能力及实验技能，形成科学严谨的研究态度。本课程主要以验证实验为主。 四、实验教学内容： 实验一：症状自评量表（SCL90）测量 实验报告人： 被试姓名： 主试姓名： 实验时间：
实验原理简介：症状自评量表（The self-report symptom inventory,symptom check list,90,简称SCL90）由上海铁道医学院吴文源氏引进修订。临床应用证明，该量表的评估有比较高的真实性，而且具有内容广，反映症状丰富。能准确反映患者的病情及其严重程度，是目前心理咨询门诊中应用最多的一种自评量表，适用于一般来询者，也适用于神经症患者。 问卷包含90个项目，每一个项目均采取5级评分制：（1）无：自觉无该项症状问题；（2）轻度：自觉有该项症状问题，但发生得并不频繁、不严重；（3）中度：自觉有该项症状，其严重程度为轻到中度；（4）相当重：自觉常有该项症状，其严重程度为中到中严重；（5）严重：自觉常有该项症状，频度和程度都十分严重。 90个项目中包括10个因子：（1）躯体化；（2）强迫症状；（3）人际关系敏感；（4）忧郁；（5）焦虑；（6）敌对；（7）恐怖；（8）偏执；（9）精神病性；（10）睡眠及饮食状况 通过对总分和各因子的分析，可以判断被测者症状分布特点及自感不适的程度，为咨询和治疗提供参考。 （一）目的：学习和掌握症状自评量表（SCL90）测量的原理和方法 （二）主要实验仪器及材料：PsyTech心理实验系统或测验文本、记录纸、打印纸。 （三）方法与程序： （1）主试按照测验的指导语要求向被试讲解或呈现症状自评量表（SCL90）测量的基本要求，主要包括测量目的、如实作答、消除顾虑、承诺保密等。 （2）主试指导被试按照测验的要求具体作答，及时消解被试作答过程中出现的疑虑，但要避免给被试以诱导或暗示。 （3）被试作答完成后及时回收问卷或在电脑上保存测试数据。 （四）结果： 1．运用PsyTech心理实验系统或手工计算及时处理被试个体的测量数据，分别计算（1）总分、总均分、阳性症状均分；（2）10个因子的分别得分； 2．分别计算全体被试、男、女被试的测试结果，并进行男、女被试的比较、全体被试与正常成人常模的比较。 （五）讨论： 1．根据自己所测试成绩，判断自己的心理健康状况。 2．你认为男、女被试、全体被试与正常成人常模的比较有无显著差异，为什么? 实验二：自评抑郁量表（SDS）测量 实验报告人： 被试姓名： 主试姓名： 实验时间： 实验原理简介：抑郁(depression)是一种感到无力应付外界压力而产生的消极情绪，并伴有厌恶、痛苦、羞愧、自卑等情绪体验，性格内向孤僻、多疑过虑，不爱交际，生活中遇到意
长春应化所
长春应化所 专业名称（代码） 研究方向 070301无机化学 指导教师 考试科目 01 稀土光功能材料的研发 苏锵* 一组：①101 政治②201英语一③619物理化学（甲）或611生物化 学（甲）④819无机化学或820有机化学 或821分析化学 二组：①101 政治②201英语一③602高 等数学（乙）或617普通物 理（甲）④809固体物理或 811量子力学 或825物理化 学（乙） 02 稀土有机/无机杂化材料发光性能的研究；新型纳 米材料的构筑及性能的研究；稀土荧光免疫分析 张洪杰 03 稀土纳米发光材料及其在生物医学领域的应用 林君 04 光、电、磁功能材料合成与结构；新型稀土镁合金材料研究 孟健 05 超高强铝合金的制备、性质与应用研究 马贤锋 06 生物无机化学、分子生物学，纳米材料在生物上的应用 倪嘉缵* 刘琼◇ 07 生物分子构像与功能、生物纳米材料、生物电化学、药物合成 曲晓刚 08 纳米生物化学，化学生物学，药物筛选，无机、有机化学 任劲松 09 离子液体；绿色分离材料；稀土绿色分离化学与清洁工艺 陈继 10 新型纳米涂料的研制 王成 11 L ED 等用高效发光材料的合成与应用；纳米光信息功能材料的合成与应用 尤洪鹏 12 稀土分离化学与低碳清洁冶金；金属-杯芳烃配位化合物与超分子化学 廖伍平 13 功能分子材料、分子纳米磁性材料 唐金魁 14 铜基薄膜太阳能电池材料与器件 潘道成 15 清洁能源材料和高能化学电源 张新波 16 稀土光功能材料的研发 李成宇 17 稀土配位化学及材料化学；稀土金属有机化学及稀土催化 孙忠明 18 光电功能无机新材料 薛冬峰 19 微/纳米结构材料及其生物医学、环保领域等应用 张吉林 专业名称（代码） 研究方向 070302分析化学 指导教师 考试科目 01 电分析化学 汪尔康*# 一组：①101政治②201英语一③619物理化学（甲） 02 电分析化学 董绍俊# 03 化学物理；物理化学；生物物理和化学 汪劲◇ 04 电分析化学及电化学传感 牛利
水生生物学实习报告
云南农业大学 实习报告 学院：动物科学技术学院 专业：水产养殖 年级： *****级 学生学号： ********** 学生姓名： ****** 指导老师： ****** 实习地点：海埂公园（滇池）田溪公园 日期： 2014年6月30日——7月9日 实习报告 云南农业大学动物科学技术学院 姓名：****** 学号：********** 目录 摘要 (1) 前言 (1)
一.分组情 况 (2) 二.实验目 的 (2) 三.实验准 备 (2) 1.了解实 验 (2) 2.简易采水器制 作 (2) 四.实验流 程 (2) 五.实验器材及药 品 (2) 六.实习步骤安 排 (3) 七.注意事 项 (3) 八.实验成 果 (3) 九.实习总 结 (6)
十.附 录………………………………………………………………………………………… 7 十一．参考文献 (7) 摘要 水生生物学是我校水产养殖学专业的重要课程。所以学院的老师为了使我们 学得更多的专业性知识和巩固课堂的理论知识，达到此专业的一定知识水平，让 我们初步掌握一般的普遍的水生生物的调查研究方法，培养独立思考能力的目的。 通过对各类简单水生维管束的和简单结构的微生物的形态、生活习性以及水域环 境的实习观察，达到实际操作和理论知识相结合的目的。此实习我们主要是对滇 池动植物采样和田溪公园水体采样。通过实习，让我学会了如何采取水样，制作 标本和鉴定步骤等专业知识。 前言 滇池位于昆明市中心偏西南方地区总面积770平方公里。昆明历史悠久，远 在三万年前的旧石器时代，滇池周围地区就有人居住。滇池亦称为昆明湖、昆明 池。中国云南省的大湖，在昆明市西南，连同湖西侧的西山是着名游览、疗养胜 地。由地势构造陷落而成。湖面海拔1886米，面积330平方公里，平均水深5米 最深8米。有“高原明珠”之美称的滇池，是昆明风景名胜的中心。 滇池地区湿地观赏植物种类丰富，通过本次实地勘察发现在滇池地区湿地观 赏植物种类数目庞大，具有较高观赏、生态及其他实用价值。根据2001~2002年 对滇池浮游植物群落得调查结果表明，在调查期间共鉴定出浮游植物107种及变
测量学实验指导书模板
《测量学》 实验教学指导书 课程编号: XXXXXXX 撰写人: 刘正才 审核人: 湘潭大学 土木工程与力学学院 二○○七年十二月二十八日
前言 一、实验总体目标 《测量学》实验教学是将理论知识和实践相结合的重要教学环节, 重在培养土木工程专业本科学生关于工程测量上的测、算、绘等基本技能。《测量学》实验教学共包括十二个实验, 其中验证性实验8个, 演示性实验2个和综合性实验2个, 涵盖了《测量学》课程的水准测量、角度测量、距离测量与直线定向、全站仪及GPS的使用、小地区控制测量、地形测量和建筑施工测量等知识面的主要的实验性教学环节, 是实习前必须的教学过程。 二、适用专业年级 适用于土木工程专业本科第二年级( 第4学期) 的学生。 三、先修课程 高等数学、画法几何、大学物理、计算机文化基础、工程数学等。 四、实验项目及课时分配
五、实验环境 根据我校招生规模, 每届有土木工程专业学生6个班, 约200人。以分2个批次进行测量学实验为原则, 需配备: DJ6级光学/或电子经纬仪30台, 其中实时可用的20台, 备用10台; DS3级水准仪30台, 其中实时可用者20台, 备用10台; 供演示用的全站仪多套, GPS接收机一套; 应配备带空调和抽湿机等电器设备的仪器室和仪器维修室, 还应有其它配套工具和设备等。 六、实验总体要求 经过实验教学, 达到以下几点总体要求: 1、让学生掌握常见测量仪器( 经纬仪、水准仪等) 的使用、记录和手薄计算方法; 2、让学生理解常见测量仪器的检验校正方法; 3、让学生掌握水准测量、角度测量、距离测量和地形测量等基本方法、操作程序和限差要求; 4、让学生理解和掌握建筑物轴线交点的放样的基本方法、操作程序和限差要求。 七、本课程实验的重点、难点及教学方法建议 本课程实验的重点: 经纬仪、水准仪、全站仪等常见测量仪器的操作和使用。 本课程实验的难点: 经纬仪的操作、地形测量和建筑物轴线的测设。 教学方法建议: 1、加强实验室建设, 增加一些现场常见的仪器, 如全站仪、GPS接收机等;
生物信息学论文
生物信息学论文 论文题目 PBL教学法在生物信息学课程教学中的应用与实践 指导老师：谷峻 学生姓名：吕晓莹 学号： 20112501092 院系：生命科学学院 专业：生物科学 撰写时间：2014年4月
摘要：PBL Problem-Based Leaming)，即基于问题学习，是由美国神经病学教授Barrows首创并于1969年在加拿大的麦克马斯特大学医学院试行的一种新的教学方法。PBL 的基本特点是以教师为引导，以学生为中心，通过解决问题来学习，与传统的以学科为基础，以教师为中心的教学方法相比有很大的不同。本论文通过对照PBL 教学理念和生物信息学课程理论，来探究PBL 教学法在生物信息学课程教学中应用与实践，为提高生物信息学课程教学质量提供一种可行方法。 关键词：PBL 教学法，生物信息学，应用与实践 1 前言 生物信息学是20世纪90年代由多种学科知识相互渗透、融合而兴起的一门用数理和信息科学的观点、理论以及方法去研究生命现象、组织和分析呈现指数增长的生物医学数据的一门学科，具有开放性、发展性、交叉性、综合性、应用性等特点。鉴于此，尽管国内的生物信息学科学研究开展得如火如荼，但由于受到师资、教材、授课对象、教学条件、教学法等因素限制，开设该课程的高校尚未真正形成一套成熟的、科学的教学体系。 目前, 国内的生物信息学教学基本沿用以“教师讲授为主”的传统教学模式。以课堂为中心、以理论教学为主, 进行“满堂灌”式教育, “照本宣读”的方式也比较常见。缺乏与生物信息学交叉前沿性特点相适应的型教学模式。同时，实验教学比较单一, 常以验证性为目的, 有些甚至成为了“文献检索”课程, 缺乏和专相适应的综合性、设计性实验。现代教学改革与实践证明，在教学过程中必须要突出“学生是教学活动的主体”，既要注意张扬学生“个性”，更要强化学生团队合作意识及创新、创业能力培养，以保证人才培养质量。在这种情况下，传统的教学模式已与当前社会快速发展的局面格格不入，迫切需要变革。因此，为激发学生的学习积极性和教学参与热情，探索先进的教学法以革新生物信息学的教学内容及考核方式等显得尤为重要。其中，以PBL 为例的教学法在生物信息学课程教学应用与实践中取得了良好的课程教学效果。 2 PBL 教学法的优势 2.1 PBL 教学顺应时代的发展 当今社会是信息时代, 生物学不断发展, 知识不断更新, 老师要讲的内容越来越多, 学生要读的书越来越厚, 授课内容与课时不相适应的矛盾非常突出, 且教学双方负担过重, 教学效果难以保证, 这种填鸭式的传统教学越来越无法适应信息社会的要求, 这就要求学生在接受人类已有的科学知识基础上, 着重培养创造能力, 学会自己寻找知识和创造知识的本领。而PBL 教学模式能明显减少说教式教学和学习负担, 既能加强学生独立学习，又能减轻教师的教学负担，顺应了时代的发展。 2.2 有利于培养学生主动学习的能力和形成双向交流 传统的教学模式是以学科为基础, 教师课堂讲解为主, 教学内容进度和方法均由老师决定，其 对象是学生整体, 容易忽视单一个体的学习兴趣、能力及个性特征, 学生始终处于被动地接受知识的地位, 不利于主动学习能力的培养。而PBL 教学法打破传统的界限, 采取以“学生为中心、问题为核心”的教育方式。在教师的整体把握和指导下, 学生充分运用现代化科技手段如教材、图书馆、录像、模型、文献检索系统、电脑学习软件、网络以及多媒体等多种形式进行自学。课堂上,PBL模式强调学生主动参与学习, 从而大大提高学习效果和长期记忆的形成。从教学的角度来看, 指导老师长期与同一小组学生
《测量学》经纬仪实验指导书 2018(1) (1)
《经纬仪实验》实验指导书 实验课仪器使用及安全须知 1、严格遵守“1米原则”、“一臂原则”！ 2、严禁在道路中间安置测站！ 3、严禁坐仪器箱子及其他实验器材！ 4、长距离搬运仪器应装箱，短距离搬运严禁扛在肩上、不加任何防护！装 箱仪器拿起前，务必检查箱盖是否紧闭！ 5、严禁将水准尺靠着树干、路灯或墙柱上！水准尺不用时，应顺着放在路 边。 6、仪器取用及装箱，严禁在手托或怀抱仪器箱的情况下进行！仪器装箱前 务必将所有制动螺旋松开，光学经纬仪须将竖盘指标补偿器关闭。 7、仪器安置前，务必检查三脚架是否安装稳固！在光滑地面上，必须做好 相应防护措施！ 8、安置仪器时，在旋紧连接螺旋前绝对不能松手！ 9、使用钢尺严禁遭车辆碾压！钢尺使用完毕应做擦拭处理。 10、三脚架、仪器上所有螺旋的使用宜用力适度，严禁用力过猛！严禁用手、 手帕等物擦拭目镜、物镜等光学部件！ 11、实验/实习完成后，收工时务必清点仪器和工具，以防丢失！尤其是测 钎、尺垫等工具，应派专人负责看守与携带。
经纬仪实验1 经纬仪的认识与使用 一、实验目的 1、根据测角原理掌握经纬仪的构造特点。 2、认识DJ6光学经纬仪的基本结构、主要部件名称和作用、轴系关系。 3、学会经纬仪的基本操作和读数方法。 二、实验内容 1、认识DJ6经纬仪各部件的名称；熟悉经纬仪各螺旋的作用及操作方法。 2、了解经纬仪上主要轴线的名称及应满足的条件。 3、练习经纬仪的基本操作和读数。 三、实验步骤 1、认识DJ6光学经纬仪的各操作部件，掌握其使用方法。 将经纬仪三脚架架腿张开安放在地面上，使架头大致水平，三个脚尖插入地面使之稳定。开箱取出经纬仪放在架头上，一手扶住经纬仪，一手旋紧脚架中心连接螺旋，将经纬仪与三脚架稳固连接。逐一认识经纬仪的各操作部件，了解其作用及使用方法。 2、掌握经纬仪的基本操作。经纬仪的基本操作步骤可分为：对中、整平、瞄准和读数。 1）对中和整平——光学对中、整平 （1）目估法对中、整平（未放仪器的情况） 使三脚架的中心位于测站点的铅垂线上（丢石子）；目估法使架头保持水平 （2）前后左右移动两个脚法对中（已安放仪器的情况） 固定三脚架一脚；双手持脚架另二脚并不断调整其位置；同时观测光学对点器十字分划，使对点器十字分划基本对准测站标志，踩实脚架
水生生物学知识点
高级水生生物学 第一章绪论 一、水生生物学的定义、内容和任务 二、水生生物学发展简史 三、水体及其生物分区 四、水生生物的生态类群 五、参考书目 一、水生生物学的定义、内容及任务 1、定义：水生生物学是研究水生生物（浮游植物、浮游动物、底栖动物、游泳动物、水生大型植物等）生命现象及其生命活动规律，并探讨其控制利用的科学。 2、水具有许多适合维持生命的特性 水是生物体的主要组成部分 生物体代谢活动必须以水作为介质 水的热稳定性 水的浮力和黏性 3、水生生物学研究内容：本课程以水生生物的形态、分类、生理、生态、经济意义等为主要内容，系统介绍常见和典型的水生生物类群。 4、水生生物学目的：在学习水生动植物生物学特征和种类鉴定的基础上，着重了解水生生物的生理生态，并初步掌握其采集、鉴定、培养、利用的理论与方法，探讨生物的系统演化、地理分布、生物学和经济意义。 二、水生生物学发展简史 1、国外研究状况 Aristotle（384－322 B. C.）最早建立生物学分类系统； Leeuwenhoek（1632－1723）研制显微镜； C. Linnaeus在《自然系统》中确定双命名法； Forbes1815年用底拖网采集观察了海岸底栖生物的分带现象； Muller1845年在德国沿海用浮游生物网采集浮游生物； 19世纪中期，西欧探险船对世界海洋考察 德国学者Hensen在1887年率远征队去大西洋采集和调查浮游生物的种类和分布，首先创用了Plankton一词。 20世纪50年代，进行水域生产力研究。 2、国内研究状况 1920年进行全国海洋综合调查 1952年中科院海洋所对黄、渤海进行调查 1980年对全国海岸及海涂资源进行调查 20世纪50年代初，中苏合作对黑龙江进行调查 中科院水生所调查长江中、下游湖泊、青海湖 1980年始，国务院部署全国渔业资源调查 1985年和1988年，建立南极长城站、中山站 《华东水生维管束植物》裴鉴等，1952； 《中国淡水轮虫志》王家楫，1961； 《中国海洋浮游硅藻类》金德详等，1965； 《中国海洋浮游桡足类》郑重等，1965； 《中国动物志—淡水枝角类》蒋燮治、堵南山，1979；
《测量学》实训指导书(精)
《测量学》实训指导书 第一部分实训与实习注意事项 一、实验注意事项 （1）学生进入实验室必须遵守实验室规章制度，遵守课堂纪律，衣着整洁，保持安静，不得迟到早退，严禁喧哗、吸烟、吃零食和随地吐痰，如有违反，指导教师有权停止其实验。 （2）实验课前，要认真阅读实验教材，做好预习。了解实验目的、实验原理、实验方法和实验步骤，以及有关的原理、计算公式和注意事项。 （3）实验课上必须认真听讲，服从指导教师的安排和指导。 （4）在使用大型精密仪器设备前，必须接受技术培训，经考核合格后方可使用，使用时严格遵守操作规程，并详细填写使用记录。 （5以小组为单位进行实验，根据实验内容明确分工，做到有条不紊。 （6）实验中，要认真操作，如实记录各种实验数据，仔细观察、记录各种实验现象，积极思考分析。 （7）严格遵守操作规程，爱护仪器设备及工具，明确注意事项，避免出现人身与设备的损伤事故。 （8）实验中遇到异常情况或仪器设备的损坏，应立即报告指导教师，凡损坏的仪器设备等均应检查原因，填写报告单，并视具体情况，按学校有关规定进行处理。 ） （9）要养成良好的实验习惯。实验结束后，学生应切断电源，整理好实验仪器设备及桌椅。 （10）实验数据须由指导教师检查、签字。 二、测量仪器工具的借领与使用规则 对测量仪器工具的正确使用、精心爱护和科学保养，是测量人员必须具备的素质和应该掌握的技能，也是保证测量成果质量、提高测量工作效率和延长仪器工具使用寿命的必要条件。在仪器工具的借领与使用中，必须严格遵守下列规定。 1．仪器工具的借领 （1）在教师指定的地点凭学生证办理借领手续，以小组为单位领取仪器工具。 （2）借领时应该当场清点检查，实物与清单是否相符，仪器工具及其附件是否齐全，背带及提手是否牢固，脚架是否完好等。如有缺陷，可以补领或更换。 （3）离开借领地点之前，必须锁好仪器箱并捆扎好各种工具；搬运仪器工具时，必须轻取轻放，避免剧烈震动。 （4）借出仪器工具之后，不得与其他小组擅自调换或转借。 （5）实验或实习结束后，应及时收装仪器工具，送还借领检查验收，消除借领手续。如有遗失或损坏，应写出书面报告说明情况，并按有关规定给予赔偿。 2．仪器的安装 * （1）在三脚架安置稳妥之后，方可打开仪器箱。开箱前应将仪器箱放在平稳处，严禁托在手上或抱在怀里。 （2）打开仪器箱之后，要看清并记住仪器在箱中的正确安放位置，避免以后装箱困难。 （3）提取仪器之前，应先松开制动螺旋，再用双手握住支架或基座轻轻取出仪器，放在三脚架上，保持一手握住仪器，一手去拧连接螺旋，最后旋紧连接螺旋使仪器与三角脚架连接牢固。 （4）装好仪器之后，注意随即关闭仪器箱盖，防止灰尘和湿气进入箱内。严禁坐在仪器箱上。 3．仪器的使用 （1）仪器安装之后，不论是否操作，必须有人看护，防止无关人员搬弄或行人车辆碰
生物质谱分析蛋白质磷酸化位点
磷酸化蛋白的高效富集 在线酶解与快速鉴定 项目申请人：袁敏婷黄懿 指导教师：杨芃原 摘要：蛋白质的可逆磷酸化具有重要的生物学意义，对蛋白质磷酸化位点进行分析有助于阐明蛋白质磷酸化的机制与功能。生物质谱是目前进行蛋白质磷酸化分析最有力的方法之一，但由于蛋白质磷酸化的丰度低以及磷酸化的肽段离子化效率低，在质谱分析前，依然需要结合富集或分离的步骤。本作品旨在利用四氧化三铁磁性纳米材料对磷酸化肽或蛋白快速高效的特异性吸附，结合在线酶解技术的快速，高序列覆盖度特性构建一个快速，高效鉴定分析磷酸化蛋白的新技术。 关键词：蛋白质磷酸化；Fe3O4磁性材料富集；在线酶解 1.引言 蛋白质的翻译后修饰（PTMs）是目前蛋白质组研究中的一个重要课题。蛋白质磷酸化是最普遍、最重要的一种蛋白翻译后修饰方式，它几乎调节着生命活动的整个过程，包括细胞的增殖、发育和分化，神经活动，肌肉收缩，新陈代谢，肿瘤发生等。了解蛋白质磷酸化对功能的影响可深入理解生命系统如何在分子水平进行调控。据统计，在哺乳动物中大约有三分之一的蛋白质被认为是磷酸化修饰的，而脊椎动物基因组中有5%的基因编码蛋白激酶或磷酸酯酶。对众多生物化学功能起开/关调控作用，是一种普遍的调控机制。 蛋白质的可逆磷酸化使得蛋白质组学研究更为复杂。真核生物细胞蛋白质中主要的磷酸化氨基酸为丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸，其比例大概为1800∶200∶1。大多数磷酸化蛋白质都有多个磷酸化位点，并且其磷酸化位点是可变的。因此,一种蛋白可能有多种磷酸化形式。对单一蛋白质进行研究的传统方法远不能满足分析这一层面上蛋白质的多样性和复杂性的需要，用蛋白质组技术和生物信息学高通量地研究翻译后蛋白质的修饰已成为必然趋势。虽然对磷酸化蛋白质组学分析已有很大进步，但依然存在多个难点亟待解决包括磷酸化蛋白和肽段的富集，可逆性磷酸化位点的鉴定以及磷酸化位点的定量等。 在过去几十年中已有多种分离和鉴定蛋白质磷酸化的技术发展起来，包括放射性同位素标记、免疫沉淀反应、化学修饰、固定金属离子亲合色谱法等，而生物质谱技术已经成为磷酸化蛋白鉴定的主要工具，串联质谱更是可以高通量，快速的给出详细的磷酸
最新生物信息学学习心得
生物信息学学习心得 第一篇：生物信息学 生物信息学是上世纪90年代初人类基因组计划(hgp)依赖，随着基因组学、蛋白组学等新兴学科的建立，逐渐发展起来的生物学、数学和计算机信息科学的一门交叉应用学科。目前生物信息学的研究领域主要包括基于生物序列数据的整理和注释、生物信息挖掘工具开发及利用这些工具揭示生物学基础理论知识等领域。生物信息学作为新型交叉应用学科，可以依托本校已有的计算机科学、信息学、生物学和数学等学科优势，充分展现投入少、见效快、起点高的特色，推动学校学科建设和本科教学水平。 本实验指导书中的8个实验均设计为综合性开发实验，面向生物信息学院全体本科学生和研究生，以及全校对生物信息学感兴趣的其他专业学生开放。生物信息学实验室将提供系统的保障，包括采用mail服务器和linux帐号管理等进行实验过程管理和支持。限选《生物信息学及实验》的生物技术专业本科生至少选择其中5个实验，并不少于8个学时，即为课程要求的0.5个学分。其他选修者按照课时和学校相关规定计算创新学分。实验一熟悉生物信息学网站及其数据的生物学意义 实验目的：
培养学生利用互联网资源获取生物信息学研究前沿和相关数据的能力，熟悉生物信息学相关的一些重要国内外网站，及其核酸序列、蛋白质序列及代谢途径等功能相关数据库，学会下载生物相关的信息数据，了解不同的数据文件格式和其中重要的生物学意义。 实验原理： 利用互联网资源检索相关的国内外生物信息学相关网站，如：ncbi、sanger、tigr、kegg、sble、中科院北京基因组研究所、北大生物信息 学中心等，下载其中相关的数据，如fasta、genbank格式的核算和蛋白质序列、pathatdb格式化库文件，并输入blast命令进行计算，获得结果文件。 实验内容： 1. 向网上blast服务器提交序列，得到匹配结果； 2. 本地使用blast，格式化库文件，输入命令行得到匹配结果；
生物大分子动态修饰与化学干预重大研究计划2018年度项目指南
生物大分子动态修饰与化学干预重大研究计划2018年度项目指南 生物大分子的动态修饰是指作为生命体系基本“元件”的生物大分子（蛋白质、核酸、糖脂等）时刻处于修饰位点与种类多变、时空特异和双向可逆的化学修饰之中。生物大分子化学修饰的动态属性在生物体的生理活动和病理变化中通常都发挥着关键作用。 一、科学目标 拟充分发挥化学、生命科学和医学的特点以及学科交叉的优势，引领生物大分子动态修饰与化学干预研究，为生物大分子动态修饰的机制研究提供具有化学特征的新工具和新模式，获得针对动态修饰的新药物靶标和相应的干预小分子；加速从基础研究到药物开发的转化，为认识生命体系调控的内在规律、为重大疾病的诊断与防治提供基础性和前瞻性的科学技术储备；促进化学与生命科学和医学研究的衔接和交叉集成，形成新的学科生长点，提升我国生物大分子动态修饰的基础研究和应用性研究的综合实力，及其在国际化学生物学领域和生物医学前沿研究中的地位；同时，造就一支学科深度交叉、具有国际影响力的化学生物学科研队伍。 二、核心科学问题 生物大分子动态修饰研究的最基本问题是发现和阐明生物大分子化学修饰的动态特性，揭示其生物学效应和调控机制，并实现对生物大分子动态修饰的靶向化学干预。本计划旨在以化学生物学研究模式为指导，发展生物大分子动态修饰的特异标记和检测工具，解析生物大分子动态修饰的功能和调控机制，为药物
研发提供潜在干预小分子和新靶标。本计划将组织包括化学、生命科学、医学、数理科学、信息科学等多学科的科学家共同开展研究。拟解决的核心科学问题如下： （一）生物大分子化学修饰的动态特性：生物大分子化学修饰的化学特征与动态过程； （二）生物大分子动态修饰的调控机制: 动态修饰的生物学效应和调控规律； （三）生物大分子动态修饰的化学干预：基于动态修饰的新药靶和靶向干预策略。 三、2018年度重点资助研究方向 2018年拟围绕上述核心科学问题开展如下研究工作： （一）生物大分子动态修饰的化学标记与检测技术。 生物大分子动态修饰的化学标记与检测技术是开展生物大分子动态修饰研究的基础。通过修饰生物大分子的体外样品制备与化学标记、生物大分子修饰时空探测和高分辨成像技术的发展，实现对生物大分子动态修饰的高效、特异和时空动态检测，为从分子、细胞和个体等多个层次揭示生物大分子动态修饰的特征和调控机制奠定基础。研究重点如下： 1.发展生物大分子动态修饰的精准标记、检测和鉴定的新技术、新方法； 2.发展探测和鉴定动态化学修饰属性、揭示生物大分子动态修饰与生物功能关系的物理及化学方法； 3.发展金属蛋白动态化学修饰及其功能调控的新策略、新工具。
生物信息学实验指导讲解
生物信息学实验指导 适用专业：生物技术与制药大类 生物技术 编写：解增言 生物信息学院 2014年9月
目录 实验1 在线BLAST同源序列查询 (3) 实验2 本地BLAST同源序列查询 (8) 实验3 利用ClustalX与MEGA进行多序列比对与分子系统发生树构建 (10) 实验4 利用RNAfold预测RNA二级结构 (14) 实验5 Pfam蛋白质结构域分析 (17) 实验6 利用PSSpred预测蛋白质二级结构 (19) 实验7 利用Cn3D和RasMol分析蛋白质三级结构 (21) 实验8 利用GO及EST数据分析基因功能 (24)
实验1 在线BLAST同源序列查询 一、实验目的 1．了解同源序列查询的原理和用途； 2．掌握利用NCBI在线BLAST工具查找同源序列的方法。 二、实验原理 在生物学种系发生理论中，若两个或多个结构具有相同的祖先，则称它们同源（homologous）。分子生物学中的同源指两条序列来自于一条共同的祖先序列。一般来说，相似超过一定程度的序列具有同源性。在生物信息学研究中，常用序列比对（alignment）来研究序列的同源性以及推测物种之间的关系。 最常见的比对是蛋白质序列之间或核酸序列之间的两两比对，通过比较两个序列之间的相似区域和保守性位点，寻找二者可能的分子进化关系。进一步的比对是将多个蛋白质或核酸同时进行比较，寻找这些有进化关系的序列之间共同的保守区域或位点，从而探索导致它们产生共同功能的序列模式。此外，还可以把蛋白质序列与核酸序列相比来探索核酸序列可能的表达框架；把蛋白质序列与具有三维结构信息的蛋白质相比，从而获得蛋白质折叠类型的信息。 比对还是数据库搜索算法的基础，将查询序列与整个数据库]的所有序列进行比对，从数据库中获得与其最相似序列的已有的数据，能最快速的获得有关查询序列的大量有价值的参考信息，对于进一步分析其结构和功能都会有很大的帮助。近年来随着生物信息学数据大量积累和生物学知识的整理，通过比对方法可以有效地分析和预测一些新发现基因的功能。 序列两两比对 序列比对的理论基础是进化学说，如果两个序列之间具有足够的相似性，就推测二者可能有共同的进化祖先，经过序列内残基的替换、残基或序列片段的缺失、以及序列重组等遗传变异过程分别演化而来。序列相似和序列同源是不同的概念，序列之间的相似程度是可以量化的参数，而序列是否同源需要有进化事实的验证。在残基－残基比对中，可以明显看到序列中某些氨基酸残基比其它位置上的残基更保守，这些信息揭示了这些保守位点上的残基对蛋白质的结构和功能是至关重要的，例如它们可能是酶的活性位点残基，形成二硫键的半胱氨酸残基，与配体结合部位的残基，与金属离子结合的残基，形成特定结构motif的残基等等。但并不是所有保守的残基都一定是结构功能重要的，可能它们只是由于历史的原因被保留下来，而不是由于进化压力而保留下来。因此，如果两个序列有显著的保守性，要确定二者具有共同的进化历史，进而认为二者有近似的结构和功能还需要更多实验和信息的支持。通过大量实验和序列比对的分析，一般认为蛋白质的结构和功能比序列具有更大的保守性，因此粗略的说，如果序列之间的相似性超过30%，它们就很可能是同源的。 早期的序列比对是全局的序列比较，但由于蛋白质具有的模块性质，可能由于外显子的交换而产生新蛋白质，因此局部比对会更加合理。通常用打分矩阵描述序列两两比对，两条序列分别作为矩阵的两维，矩阵点是两维上对应两个残基的相似性分数，分数越高则说明两个残基越相似。因此，序列比对问题变成在矩阵里寻找最佳比对路径，目前最有效的方法是Needleman-Wunsch动态规划算法，在此基础上又改良产生了 Smith-Waterman算法和SIM算法。在 FASTA程序包中可以找到用动态规划算法进行序列比对的工具LALIGN，它能给出多个不相互交叉的最佳比对结果。