整理)慢病毒稳转细胞株步骤

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稳转慢病毒

令狐采学

一、所需试剂

1、慢病毒载体(详细信息见附录及《质粒的扩增提取》)(大肠杆菌-80℃保存2-3年,质粒-20℃保存2-3年,病毒液-80℃保存1年)

(1)载体质粒:两端的LTR、剪切位点、包装信号Ψ以及抗性或荧光基因、gag基因5′端350bp的序列及位于env序列中的RRE,含宿主RNA聚合酶识别部分

(2)包装质粒(psPAX2):包含了pol、gag包装成分

(3)包膜质粒(pMD2.G):用其他病毒的包膜蛋白代替了env 基因.

三种质粒共同转染产生不具有自我复制能力的病毒载体。

2、包装细胞:293T细胞

3、菌株:大肠杆菌,用于提取质粒

4、转染试剂:XTREME-GENE(-20℃保存,不可分装),一种脂质与其他组份构成的混合物

5、浓缩试剂(配好后4℃保存,原材料室温保存):5X PEG8000/NaCl溶液(聚乙二醇):NaCl 8.766 g; PEG8000 50g溶解在200ml Milli-Q纯水中,高压蒸汽灭菌

**也可直接从公司买来病毒液(-80℃封口膜封口冻存管保存,

4℃保存3天):滴度一般为108TU/ml

6、10mg/ml polybrene(-20℃分装保存):溴化己二甲铵。是带正电的小分子,与细胞表面的阴离子结合,提高慢病毒对细胞的感染效率,通常加入polybrene能提高感染效率2~10 倍。有一定细胞毒性,需要摸索浓度(1~10μg/ml)

7、无血清培养基:optimen

8、贴壁细胞(复苏后3代以上的细胞)

9、puromycin:嘌呤霉素,用于筛选稳转细胞

二、具体步骤

<一>病毒包装与收集(中皿,转染步骤类似于瞬转)

第一天

1、种板,10×105个293T细胞,加入全培养基双抗DMEM 4-5ml,过夜

2、配制5X PEG8000/NaCl溶液

称取NaCl 8.766 g; PEG8000 50g溶解在200ml Milli-Q纯水中;121摄氏度30min 湿热灭绝30min;保存在4℃

第二天

1、配管

A+B混合室温静置20min

2、加入2ml全培养基DMEM

3、将1加入2,孵育10h,换成5ml全培养基

第四天第五天:

1、9:00和17:00各收取一次5ml培养液,共20ml(-80℃保存)

2、过滤:用孔径为0.45mm的过滤器除去上清中的293T细胞

3、加入5ml 5XPEG8000/NaCl溶液,每30min-1h上下摇匀一次

4、4℃过夜

第六天

1、4℃,3500rpm,20min

2、弃上清,倒扣纸上静置1-2min,吸干残余液体

3、加入120-150μl PBS,缓慢吹打,以防形成气溶胶

4、50μl分装,-80℃保存。

<二>慢病毒转染靶细胞

前期预实验MOI(步骤同正式试验)(见三2,直接订购病毒液时才需要)

前期测病毒滴度(稀释法,还有一种qPCR法见资料)

1、第一天:准备96孔板,每孔加入10000个293T,为每个病毒准备20个孔(稀释10个浓度,各2个副孔)。放入37℃,5%CO2培养箱中培养。

2、第二天:在EP管中做10倍梯度稀释,连续10个稀释度。稀释方法如下:每种病毒准备10个1.5ml EP管,每管加入207μl

培养液,往第一个管中加入23μl病毒原液,混匀后,吸取23μl 加入第二个管混匀。依此类推,做十个稀释度(10~10-8)。

吸取96孔板中原有的培养基,加入含稀释好的病毒液。并做好标记。

3、第三天:换液

4、第四天:观察结果并计算滴度

在荧光显微镜下观察结果,并数出最后两个有荧光的荧光细胞克隆数。假设为X和Y,则滴度(TU/ml)=(X+Y×10)/2/X 孔的病毒液的含量(μl )×1000。(前面算出的是没μl病毒量,所以乘于1000)

第一天:

1、种板(12/24孔板)需第二天为50%-70%,大约12孔板1×105

第二天

1、准备病毒液(可在第一天做):在冰上融解

2、准备完全培养基和Polybrene混合物(1:1000-1:2000稀释,终浓度在5-10μg/ml之间),加入相应培养板中(6孔板2ml,12孔板1ml,24孔板500μl)

3、加入浓缩病毒液(12孔板30μl-50μl)(如果是直接购买病毒液需根据MOI确定病毒液量加入病毒液,自己包的病毒可以)

4、培养过夜,对polybrene毒性敏感的细胞在4-6小时候换液第三天

1、对细胞进行换液

第五天

1、用药物进行稳定株的筛选(具体筛选药物根据载体内的基因定,用氨苄青霉素0.5μg/ml-10μg/ml)

2、需设置空白对照(未处理细胞加入相同浓度氨苄青霉素,党对照全部死光为筛选周期)

第六天之后(根据筛选周期)

1、换液传代

2、观察GFP报告基因确定转染效率,或用qRT-PCR确定转染效率

三、注意事项及知识点

1、名词解释

(1)病毒感染复数(multiplicity of infectionMOI):含义是感染时病毒与细胞数量的比值,即为每个细胞被多少个有活力病毒所感染

2、慢病毒摸索时加入梯度(具体见自己的说明书)

3、慢病毒的储存与稀释:

可以将病毒暂时放置于4 ℃保存;如需长期保存请放置于-80℃(病毒置于冻存管,并使用封口膜封口)

A.病毒可以存放于-80℃ 6个月以上;但如果病毒储存时间超过6个月,我们建议在使用前需要重新滴定病毒滴度

B.反复冻融会降低病毒滴度:每次冻融会降低病毒滴度10%;因此在病毒使用过程中按照每次的使用量进行分装。4、慢病毒载体示意图

《1》载体质粒(PLKO.1 抑制载体,PCDH-GFP+puro过表达载体):

(1)5’LTR:long terminal repeat即长末端重复序列,不编码蛋白质,但含有启动子,增强子等调控元件

(2)包组信号ψ:LTR-ψ通过包装细胞的RNA聚合酶转录为RNA,通过ψ信号起始包装

(3)启动子、酶切位点和抗性基因(amp氨苄青霉素puro嘌呤霉素)

(4)stuffer:目的基因插入位点(慢病毒载体可插入5kbp左右)(5)GFP:green fluorescent protein绿色荧光蛋白

(6)WPRE:Woodchuck Hepatitis Virus (WHP) Posttranscriptional Regulatory Element 肝炎病毒转录后调控元件。转录后可形成三级结构,促进基因的表达

(7)cPPT/CTS:逆转录病毒顺式作用区域,其中该cPPT和CTS 区域诱导三链DNA结构

(更新于2018.11)《2》包装质粒

(1)gag基因编码病毒的核心蛋白基质蛋白、衣壳蛋白、核衣壳蛋白等

(2)pol基因编码病毒复制所需的酶类,如反转录酶、整合酶、

蛋白酶

(3)pro基因则编码切割蛋白前体所需的蛋白酶

(4)多种酶切位点和巨细胞病毒启动子

《3》包膜载体

(1)VSV-G:水疱性口炎病毒糖蛋白G基因,用于代替env基因

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