图说meta十四:漏斗图暨Stata软件使用方法简介

图说meta十四:漏斗图暨Stata软件使用方法简介
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图说meta十四:漏斗图暨Stata软件使用方法简介2017-05-06 科研创新服务平台弗雷赛斯弗雷赛斯微信号freescience 功能介绍Freescience由浙江大学医学院几个硕博士发起创建,旨在最广泛分享有价值的科研技能和知识;FreeScience的宗旨:“科学自由分享、人人平等,共求真理”。>>>> 漏斗图最常见的识别发表性偏倚的方法就是漏斗图法, 以样本含量(或效应量标准误的倒数)与效应量(或效应量对数)作的散点图, 效应量可以为

RR ,OR ,RD 和死亡比或者其对数值等。漏斗图所基于的假设是效应量估计值的精度随着样本量的增加而增加, 其宽度随精度的增加而逐渐变窄, 最后趋近于点状, 其形状类似一个对称倒置的漏斗,故称为漏斗图。即样本量小的研究, 数量多、精度低, 分布在漏斗图的底部呈左右对称排列;样本量大的研究, 精度高, 分布在漏斗图的顶部, 且向中间集中。利用漏斗图可以直接观察原始研究的效应量估计值是否与其样

本含量有关。但当存在发表性偏倚时, 则表现为漏斗图出现不对称, 则呈偏态分布。绘制漏斗图, 需要纳入较多的研究个数,原则上需纳入9篇研究以上才能进行。>>>> 漏斗图的制作流程Step1:Stata软件下载与安装Stata软件为收费软件,目前该软件已更新至14.0,我们公众号本着“自由分享,

人人平等,共求真理”的宗旨,为大家免费准备了Stata12.0版本,公众号后台回复stata即可获取(积极宣传公众号,推动20人关注公众号者微信添加1606093959可获取

stata14.0版本)

Step2:Meta面板加载

创建profile.do文件1.点击菜单栏Help→Search→Search all (Keywords: meta_dialog) 2.选择加载包进行安装(click here to install)3.输入命令help meta_dialog 4.复制代码5.点击菜单栏Window→Do.file Editor→ New Do.file Editor,粘贴代码6.点击保存,选择存储至stata安装位置,命名为profile重新打开Users次级菜单出现Meta-AnalysisStep3:整理纳入文献格式需要注意的是,Stata软件中数据分析格式与RevMan数据格式是不一致的,RevMan中二分类变量表示为研究事件发生数与样本量,而Stata软件中为试验组发生事件数与试验组未发生事件数,在整理数据时需表示为如下格式,示例:

Step4:数据输入1.点击菜单栏Data Editor(Edit)2.输入数据或复制粘贴数据。.复制粘贴整理格式后的数据,选择将第一行变为变量名称

Step5:制作漏斗图1.进行二分类变量meta分析,计算效应量OR(具体方法参见:)2.计算logOR:gen log_ES=log( _ES);重命名log_ES:rename log_ES logOR(图形显示需要,

_selogES系统默认,可不进行重命名)3.依次点击

Users→Meta-Analysis→Funnel Graph,vertical(metafunnel)进入漏斗图制作面板。4. 选择logOR,selog_ES进行数据分析。5.漏斗图制作完毕(重命名保证横纵坐标变量说明一致)

6. 点击保存,选择*.png进行图形的保存与查看,或选择保存为矢量图。

附1:Egger 回归法或Begg秩相关法1.进行二分类变量meta分析,计算效应量OR(具体方法参见:)2.计算logOR:gen log_ES=log( _ES);重命名log_ES:rename

log_ES logOR(图形显示需要,_selogES系统默认,可不进行重命名)3.输入命令:metabias6 logOR

_selogES ,graph ( begg)或metabias6 logOR

_selogES ,graph ( egger).(若菜单栏Publishion Bias (metabias)支持,也可选择metabias 命令,P>0.05,无明显发表性偏倚)4.漏斗图制作完毕(以Begg's为例)本文选自公众号:科研创新服务平台科研创新服务平台旨在帮助研究生快速提高科研能力,搭建交流平台,帮助本科生学好医学知识,提供接触科研的机会。Freescience精彩内容回顾(点击即达)论文信号通路图,模式图,全搞定| 谷歌不能上?有这个,一劳永逸| 临床统计傻瓜式解决| 外文写作润色神器| 不花钱下载SCI全文黄金攻略!| PubMed有

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Stata在meta分析中的应用

1 定量资料两组比较的meta分析 2 定性资料两组比较的meta分析 实例: 分类资料的meta分析 为了探讨用Aspirin预防心肌梗塞(myocardial infarction,MI)后死亡的发生。美国在1976——1988年问进行了7个关于Aspirin 预防MI后死亡的研究,详细结果见表1,其中6项研究的结果表明Aspirin组与安慰剂组的MI后死亡率的差别无统计学意义。只有1项结果表明Aspirin预防MI后死亡有效并且差别有统计学意义。现根据表1提供的结果进行meta分析 表1 Aspirin预防心肌梗塞死亡的临床试验结果 研究发表年份 Aspirin组安慰剂组 总例数死亡例数总例数死亡例数 MRC-1 1974 615 49 624 67 CDP 1976 758 44 771 64 MRC-2 1979 832 102 850 126 GASP 1979 317 32 309 38 PARIS 1980 810 85 406 52 AMIS 1980 2237 246 2257 219 ISIS-2 1988 8587 1570 8600 1720 操作步骤 1 把数据输入stata软件

2 变量的解释 Study 纳入的研究 Year 年份 Death1 Aspirin组的死亡人数 Live1 Aspirin组的存活人数 Death2 安慰剂组的死亡人数 Live2 安慰剂组的死亡人数 3 进行meta分析 metan death1 live1 dead2 live2, or label(namevar=study, yearvar=year) 结果:

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诊断性meta分析手把教你做临床Meta 分析——诊断试验性 Meta-Disc 分析 导读:诊断性meta分析,手把教你做临床Meta 分析——诊断试验性 meta分析stata诊断性试验meta 手把教你做临床Meta 分析——诊断试验性Meta-Disc 分析 临床治疗的基础首先是需要准确的诊断,准确诊断性Meta 分析是Meta 分析的一个重要部分,本次想向大家推荐的是一款专用于诊断性试验的免费Meta 分析软件,临床医学、临床检验、临床病理、临床科研人员、临床康复科及临床影像科等工作人员可用它写上一篇高大上的诊断准确性试验的Meta 分析文章。 安装软件 Meta-DiSc 是一个免费的下载软件,登录 http://www.hrc.es/investigacion/metadisc_en.htm,下载安装软件,目前最新版本是1.4 版。 运行软件

在试行此软件之前,必须明确和熟悉准确诊断性Meta 分析里结果计算的经典四格表(可能不会在您所纳入的文献中出现,需要研究人自己总结并准确的填写在四格表内,不易混淆而且方便分析)。 TP:True positive 表示真阳性的结果,用数字表示; FP:False positive 表示假阳性的结果,用数字表示; FN:False negative 表示假阴性的结果,用数字表示; TN:True negative 表示真阴性的结果,用数字表示。 1打开软件,可以看到如下界面 Author:第一作者名+ 文章年限,如Rachow 2013; StudyID:纳入文献的排序编号,亦可以按照自己理想的排名排序; 2数据的输入

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用stata进行单个率meta分析程序总结 感谢版主对我的方法进行验证,这里整理一下方面大家研究 谷歌的程序(标红部分,分批录入stata12.0.可得到结果。)clear input study cases total 1 20 1000 2 40 5000 3 30 1500 4 2 5 3300 end gen p = . gen se = . // get proportions and std errors forv i =1(1)4 { cii total[`i'] cases[`i']

qui replace p = r(mean) in `i' qui replace se = r(se) in `i' } // get the inverse variance-weighted proportion // use the official Stata -vwls- command gen cons =1 vwls p cons, sd(se) // use the user written -metan- command // for fixed-effects meta-analysis metan p se, nograph fixed // for random-effects meta-analysis metan p se, nograph random 我的数据,用谷歌方法运行的命令:clear input study cases total

1 76 451 2 86 202 3 2 4 97 4 401 2502 end gen p = . gen se = . forv i =1(1)4 { cii total[`i'] cases[`i'] qui replace p = r(mean) in `i' qui replace se = r(se) in `i' } gen cons =1 vwls p cons, sd(se) metan p se, nograph fixed metan p se, nograph random

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手把教你做临床分析诊断性meta 分析——诊断试验性Meta 分析Meta-Disc Meta 分析——诊断试验性手把教你做临床meta分析, 导读:诊断性诊断性,推荐访问:stata,诊断性试验meta,Meta-Disc 分析诊断性meta分析meta分析stata?诊断性试验meta 手把教你做临床Meta 分析——诊断试验性Meta-Disc 分析 临床治疗的基础首先是需要准确的诊断,准确诊断性Meta 分析是Meta 分析的一个重要部分,本次想向大家推荐的是一款专用于诊断性试验的免费Meta 分析软件,临床医学、临床检验、临床病理、临床科研人员、临床康复科及临床影像科等工作人员可用它写上一篇高大上的诊断准确性试验的Meta 分析文章。安装软件 运行软件 在试行此软件之前,必须明确和熟悉准确诊断性Meta 分析里结果计算的经典四格表(可能不会在您所纳入的文献中出现,需要研究人自己总结并准确的填写在四格表内,不易混淆而且方便分析)。. TP:True positive 表示真阳性的结果,用数字表示;

FP:False positive 表示假阳性的结果,用数字表示; FN:False negative 表示假阴性的结果,用数字表示; TN:True negative 表示真阴性的结果,用数字表示。 1打开软件,可以看到如下界面 Author:第一作者名+ 文章年限,如Rachow 2013; StudyID:纳入文献的排序编号,亦可以按照自己理想的排名排序; 2数据的输入 有三种方法可以输入,我们掌握其中两种就足够运用,一种是当纳入的文献较多的时候,可以按照软件中表格的形式对应写在Excel 表上,点击复制Ctrl+c,并点击黏贴Ctrl+v,便可以copy 至软件中的表格内;另一种当纳入的文献数量较少时,则可以直接用手动输入到Meta-disc 数据表内,如下图。 3数据的分析 (1)合并统计量的分析运行 如下图点击Analyze,在下拉窗口中选择Tabular Results,并点击向右指示的三角箭头,可出现Sensitivity/Specificity;Likelihood Ratio;Diagnostic OR 和灰色的SROC Area(SROC 面积)。根据操作人的实验需要,可点击需要的分析类型并进行分析。 (2)绘制结果森林图的分析 在Analyze 的下拉窗口中选择Plots...,在Select plot 的下拉框中出现ROC ;Diagnostic OR;Negative LR;Positive LR;Specificity;Sensitivity 。操作者可根据合并统计量结果的分析选择对应的森林图;SROC CurvePlane

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