华中农业大学《生物信息学》讲义

华中农业大学《生物信息学》讲义
华中农业大学《生物信息学》讲义

生物信息学

王石平

(华中农业大学生命科学技术学院)

2005.2.23

211.69.135.104/bio-informatics.files/bio-infor.htm https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/Embnetut/Gcg/index.htm

一、数据库

1.核苷酸数据库

GenBank 、EMBL 、DDBJ (在使用方法和连接的数据库上有差异,但数据量相同。) 注:氨基酸序列是非试验来源,为推倒的结果。使用时要谨慎!!!!)

(1)GenBank(NCBI)数据解释。 https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/

注:Display 中选FASTA 形式,显示原始的核苷酸数据,便于复制。

每条序列的3种编号(identifier)

无意义)

定义(描述) 版本 X.Y 1.位点名(基本2.注册号 3.Geninfor

identifier(GI 号) 6位(X12345)或8位数字(XY123456);例外:自编号(一般为基因组序列)

物种类型

一般与Accession NO.相同(

6位型:属+种+X12345 8位型:与AC 相同

10位数:早期8位数:现注:

NID(Nucleotide ID) 1999.12取消,改用序列的数据可以更改,GI 号、NID 号变化,但AC 号不变。 GI 号。 Coding sequence 谨慎使用!!!! 最后一条Reference 序列提交者

的文章为。可以知道这一基因的研究历史,便于研究。

(2)dbEST

EST来源于mRNA

-基因片度(300-400bp,数据长度足以分析编码的产物)或者全基因(已知)

-5’端或3’端的cDNA序列(EST)

-300-400bp single-pass sequence (可能有误,如果要求<0.1%的错误率,需要测序8-10次)

-GenBank中71%以上的是EST序列。

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/dbEST/index.html

(3)UniGene

来源于同一基因的非重复EST,组成基因序列群(contig)

注:不同实验室各自采用poly(T)15法和随机引物合成的cDNA(不完整),不同的cDNA的加工、拼接,形成重叠群(Contig)

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/UniGene/

(4)dbSTS (sequence tagged sites)

a.短序列(200-500bp)

b.已完成染色体上的定位

c.可以与电子PCR相连用

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/dbSTS/index.html

(5)dbGSS (genome survey sequence)

a.基因组短序列

b. cosmid、BAC、YAC外源插入片断末端序列

c. Alu PCR 序列

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/dbGSS/index.html

(6)HTG (high-throughput genome sequence)

尚未完成测序的重叠群(>2kb)更新快!!!

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/HTGS/

(7)dbSNP

每100-300bp有一个SNP

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/SNP/

(8)EMBL

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/embl/

(9)DDBJ

http://www.ddbj.nig.ac.jp/

(10)EPD (Eukaryotic Promoter Database)启动子数据库

http://www.genome.jp/dbget/dbget2.html

2.蛋白质数据库

(1)SWISS-PROT

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/sprot/

有详细的注释序列;与44个数据库相互参照(cross-reference)

(2)TrEMBL (translation of EMBL)

(3)PIR (Promoter information resource)

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/pir/

表明了结构域

(4)PRF (Promoter research foundation)

http://www4.prf.or.jp/

(5)PDBSTR (Re-organized Protein data Bank)

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/sprot/prosite.html

蛋白质的二级结构、α-碳位置

(6)Prosite

蛋白质家族、结构域

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/prosite/

3.结构数据库

(1)PDB (Protein Data Bank)

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/pdb/

(2) NDB (Nucleic Acid Database)

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/NDB/ndb.html

(3)DNA-bind Protein database

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/NDB/structure-finder/protein/index.html

(4)swiss-3D IMAGE

http://www.expasy.ch/sw3d/

4.酶和代谢数据库

(1)KEGG (Kyoto Eneyclopedin of genes & genemes)

http://www.genome.ad.jp/kegg/

(2)PKR (Protein Kinase Resource)

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/kinases

5.文献数据库

(1)PubMed

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/PubMed/

(2)OMIM

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/Omim

(3)Agricola

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/

农业相关的文献

6.提交数据

GenBank

BankIt提交 网上直接提交,立即得到临时编号(1周内提供Aceesion No.)

SequIn提交 下载软件填写表格,自动确定CDS、ORF和查找重复序列、查载体序列

用Update功能修改

二、检索数据库的方法

1、用关键词或词组进行的数据库检索 Text-based database searching

2、用和甘肃或蛋白质序列进行的数据库检索 Sequence-based database searching

关键词:名词;描述性词、词组;Accession number

体系:Entrz;Sequence retrieval system (SRS);Integrated database retrieval system (DBGET) 检索须知

1、连接词:AND OR NOT

用引号将两个词组成一个词组“disease resistance”表示必须两个词先后顺序连续出现

disease resistance 表示默认AND

2、wild card “*”放在单词后使检索范围扩大,但是专一性降低

Wan*=所有以Wan开头的单词 enzyme*=enzyme + enzymes 单复数同

(1)Entrz(NCBI)

优点:三种检索体系中最容易操作的; 缺点:检索范围有限

8大类29个与Entrz体系相连的数据库

1、Nucleiotide sequence database(6)

GenBank; SNP; Gene; Homologene; UniSTS; ProSet

2、Protein sequence database(1)

Proteins

3、Structure database(4)

Structure; PubChem; Compound; 3D-Domain; CDD

4、Taxonomy database(1)

Taxonomy

5、Genome database(2)

Genomes; Genome Project

6、Expression database(4)

UniGene; GEO Profiles; GEO database;GENSAT

注:数据库来源于mRNA-cDNA-protein(更确切)

7、Literature database(7)

PubMed(文摘); PubMed central(全文); Books; OMIM; Journals; NLM catalog; MeSH

8、Others

PubChem substance; Cancer chromosome; PubChem BioAssay; SiteSearch

检索方法:a、数据库间的检索 b、选择数据库 (可以限定检索内容和时间范围)

(2)SRS (Sequence Retrieval System)

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/ 有不同的版本,可以下载。

EBI 优点:检索面宽缺点:检索复杂

17大类194个数据库与SRS体系相连

检索方法:a、快速检索(操作简单,检索的数据库有限,适用于明确目标的检索。)

b、深入检索(检索稍微复杂,检索全部的数据库,适用范围广泛的检索。)

(3)DBGET

http://www.genome.jp/dbget/dbget2.html

优点:与KEGG相连,操作较SRS简单缺点:检索面较窄

检索方法:a、Basic search b、Advanced search

三、核苷酸和蛋白质序列为基础的数据库检索 Sequence-based database searching

1、序列对位排列(sequence alignment)

2、将两条或多条序列对位排列,突出相似的结构区域(分析功能、分析物种进化、检测突变,插入

或缺失、序列延长、序列定位、基因表达谱分析)

3、序列对位排列分析种类a、序列对库对位排列分析

(从数据库中寻找同源序列,主要涉及核苷酸库和蛋白质库)

b、两序(多序列)列对位排列分析

(一)序列对位排列分析的基本原理

1、记分矩阵(scoring matrix)

a、蛋白质序列对位排列分析记分复杂

b、一致氨基酸记分不同稀有氨基酸分值高,普通氨基酸分值低

c、相似氨基酸也积分,如D-E 用“+”表示氨基酸残基性质相似

2、空位(间隔)罚分(gap penalty)

基因进化过程中产生突变(插入、缺失)

序列对位排列分析是允许插入空位

空位罚分涉及两个参数:空位开放(gap opening)空位延伸(gap extension)

(二)序列对库对位排列分析

对待分析的序列对库进行相似性分析;重复许多次的两序列对位排列分析;从数据库找出所以的同源序列

主要检索体系:BLAST、FASTA、Blitz

1、基本概念

a、sequence identity 两序列在同一位点核苷酸或氨基酸残基完全相同

sequence similarity(or opositive)两序列在同一位点核苷酸或氨基酸残基化学性质相似

b、Global alignment 完整的序列比较

Local alignment 两序列相似程度最高的片断相比较

c、Gapped alignment 为达到最佳alignment序列中加入空位

Ungapped alignment 相比较的核苷酸或氨基酸残基连续

d、Alignment score 衡量两相比序列相似程度的标准

E (expect) value 期望得到的,完全由机会造成的,相当于或大于目前分值的alignment次数

Raw score 原始分,分值较大,两个比较序列相似性程度较大

Bit score 采用统计学方法以原始分为基础计算

E=10 ;表示方法5e-46=5×10-46E越小越好

可以接受的标准:E=10-5(重叠位置>40bp;identity>94%;远大于杂交标准)

E=10-30基因组分析,功能与序列中相似

E取决于alignment分值,相比较序列的长短和库中数据数量

e、Low-complexity alignment region(LCR)

核苷酸序列中短的重复序列或由少数几种核苷酸或氨基酸残基组成的序列(如polyA)

数据库中半数以上的序列至少带有一处LCR

序列alignment 应避免LCR相互配对得分

BLAST用Filter功能避免比较LCR 用X和N分别代表LCR中的每个氨基酸残基和核苷酸

2、BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)

(1)Nucleiotide Blast (Blastn)

(2) Protein Blast (Blastp、PSI blast、PHI blast;Conserved domain (rpsblast)

(3) Translated blast (blastx;tblstn;tblsatx)

(4) Special Blast (Blast 2 sequence;bl2seq;VecScreen)

BLAST program

Blastn 用核苷酸序列检索核苷酸库

BlastP 用氨基酸序列检索蛋白质库

Blastx 用核苷酸序列通过6种阅读框翻译成不同的氨基酸序列检索蛋白质库

tblastn 将蛋白质序列译成不同的核苷酸序列检索核苷酸库

tblastx 将核苷酸序列通过6种阅读框翻译成不同的氨基酸序列检索核苷酸库(库中的序列也被译成不同的氨基酸序列)

Blast database

nr (nucleiotide blast) GenBank(无EST、STS、GSS、HTGS)

nr (protein blast) GenBank CDS translation + PDB + SwissProt + PIR + PRF

(1)BLASTN

序列的粘贴(或用GI号)-选择database-Autoformat(full/semi)

(2)BLASTP

(3)PSI-blast (Position Specific Iterated Blast)

氨基酸序列检索;重复循环检索数据库。

注意:PHI和PSH同一网页,需要设定。

(4)PHI-blast (Pattern Hit Initiated Blast)

蛋白质并带有特殊的结构域(pattern)检索库中的相似蛋白质(带有同样的特殊结构域或者这一临近的序列与被查找的序列相似。)

与PSI-blast相连,可以循环检索。

(5)Translated Blast

(6) Conserved Domain Blast (rpsblast)

3、FASTA

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/fasta33/index.html

fasta3 用DNA序列检索核苷酸序列,用氨基酸序列检索蛋白质库。

Fastx3/fastay3 将DNA序列及其互补的序列通过6种读码框翻译成不同的氨基酸序列检索蛋白质库

注意:提交结果的形式与Blast不同(表格形式)

4、Blitz

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/bic_sw/

能检索出远缘的序列;发现家族成员上可靠;只用于蛋白质库;慢!一般用email服务。

(三)两序列对位排列分析

全局(贯穿整条序列长度);局部(相似性变大区段)

1、Blast 2 sequence

任两条序列,允许空位。

blastn, blastp, tblastn(比较蛋白质序列1与核苷酸序列翻译成蛋白质序列2比较。

blastx 比较核苷酸序列(译成蛋白质)(seq1)和蛋白质序列(seq2)

tblastx 两条核苷酸比较(译成蛋白质)

2、Global alignment program (GAP)

两条序列,允许空位,可以选记分的矩阵,全局对位排列,提交有格式。

>sequence 1

ATGTGAGGTCCCTGA

>sequence 2

GCTGCAAGTCGTAGC

四、多序列对位排列分析和系谱分析

主要用于分析基因或蛋白质的进化;通过分析各个基因和蛋白质序列的同源性确定它们在进化上的关系;

分析基因或蛋白质的功能。

1、多序列对位排列分析(Multiple Sequence Alignment)

-两条以上序列排列分析

-可以发展保守的结构域(重要的功能位点?)

-多序列允许插入空位

-Clustal W 目前公认的最好的序列alignment的方法之一(可以下载)

对要分析的序列输入格式有要求 FAST(Pearson)格式

>sequence 1

ATGTGAGGTCCCTGA

>sequence 2

GCTGCAAGTCGTAGC

-分析方法(举例)

Bayor college of medicine (BCM)生物信息学主页

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,

Multiple sequence alignment –Clustal W 1.8-结果

[o] full options form 修改

-可以修改分析参数

一些参数的定义:

(1)Gap opening penalty 增大数值使Gap数减小;

(2) Gap extension penalty 增大数值使Gap变短;

(3)Weight transition penalty A-G转换成C-T 转换(multiple DNA alignment)

(4) Hydrophilic gap 选“on”将增加形成gap的机会(multiple protein alinment)

(5)Residue-specific gap penalties 选“on”将增加在某些氨基酸残基处形成gap的机会,而减少在另一些氨基酸残基处形成gap的机会。

-可以进一步对排列好的序列进行修饰

Boxshade 功能,突出相同或相似位点。

结果网页复制绿色的部分-点击Boxshade-选“other”的输入格式;input formation选other;output 选RTF_new

-颜色修饰功能,突出相同或相似位点

用EBI的Clustral

2、系谱分析(Phylogenetic analysis)

分析基因或蛋白质进化关系系谱树(Phylogenetic tree):有根树(rooted tree)

无根树(unrooted tree)

分析方法(举例)

EBI Clustral W网页

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/clustralw/index.htm

Guide tree---Cladogram tree

Phylogre

五、基因预测和基因结构分析

预测编码蛋白质的基因

基本分析内容:排除重复序列;确定开放阅读框架(ORF);确定基因的调控区-启动子

(一)基因预测的基本方法

1、序列相似性搜索

Genomic DNA sequence ――Blast(Blastn)――确定基因的数目和对应的ORF (有时不能鉴别内含子,但可以证明有基因,不能证明基因的结构;用6种阅读框架翻译并与蛋白质库中序列进行分析比较,对EST库中同一生物的cDNA序列进行比较。)

2、根据模式序列预测基因

各种基因预测软件(取决于人们对已知基因结构的特征的认识)

采用统计学的方法(基于一个或多个已知序列(启动子、内含子、外显子)的模式对未知序列进行分类;密码子的偏爱性;对发现的模式进行统计检查。)

“目前还没有一个基因预测工具可以完全正确的预测基因组中所有基因。”(Mathetal 2002)

综合多个基因预测软件的分析结果。

-一种工具可以选择分析基因的不同结构;(exon,polyA,promoter)

-重复序列

-选择物种的模式(matrix)作为参照比较对象

(二)分析举例

(1)Softberry https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,

GeneFinding工具分三类:GeneFinding in Eukaryota

Operon and GeneFinding in Bacteria

GeneFinding in Viruses

分析时只用已知基因的片断预测不准,需要加上5’和3’末端序列分析的准确度更高。

备注:CDS=exon

CDS0基因之有一个exon

TSS=translated start site

CDS r起始 CDS i中间 CDS l最后

(2)GenScan https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/GENSCAN.html

三个物种模式为参照(Vertebrate、Arabidopsis、Maize)

(3)GrailEXP https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/grailexp/

分析重复序列

(4)Gene Feature Searches https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,

包括多个基因预测软件

NNPP分析启动子序列

六、蛋白质性质和结构分析

序列相似性的蛋白质具有相似的三维结构;分析预测蛋白质的功能

ExPasy (Expert Protein Analysis System) https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/

Swiss institutive of Bioinformatics (SIB)的分析工具

蛋白质序列、性质、结构分析,2D-PAGE分析

(一)分析蛋白质的一级结构 (氨基酸组成、等电点(pI)、分子量(Mw)、疏水性及其他

1、分析蛋白质的分子量、等电点和氨基酸组成(ProtParam)

Primary structure analysis----ProtParam

2、分析蛋白质的疏水性(ProtScale)

Primary structure analysis----ProtScale

3、分析蛋白质的重复序列(REP)

Primary structure analysis----REP

(二)分析蛋白质的二级结构

1、预测蛋白质的α-螺旋和β-折叠 (nnPredict)

4-8个氨基酸(β-strand)组成β-sheet 3-4个氨基酸 turn(使蛋白质体积疏松)

Loop(襻)长的弯状结构

Secondary structure prediction-----nnPredict

2、预测蛋白质的其他二级结构(SOUPMA)

3、预测蛋白质的coiled coil位点(2-4个α-helix组成)蛋白质亚单位间的结合结构

Primary structure---paircoil

(三)分析蛋白质的三级结构

1、根据已知的蛋白质结构推测未知蛋白质的结构

Blast检索-------在PDB中检索同源蛋白质的结构

2、通过分子建模(molecular modeling)分析蛋白质的三维结构

分析复杂,适用于专业人员。 Territory structure----Email服务

(四)分析膜蛋白

膜镶嵌蛋白;膜附着蛋白

膜蛋白的跨膜区一般形成α-Helix(20aa左右)

膜附着蛋白的形成:a、形成膜镶嵌蛋白(在ER腔中)

b、部分蛋白被剪切

c、与脂分子(如GPI)连接

d、跨膜区滞留在脂质双层中

1、预测蛋白质的跨膜区

Topology prediction------SOSUI

其他工具:DAS:分析原核生物蛋白质的跨膜结构

TMpred:分析蛋白质的跨膜结构和存在于膜上的方向

2、分析附着蛋白的GPI剪接位点(DGPI)

Post-translational modification prediction--------DGPI

(五)分析蛋白质的翻译后修饰

1、分析信号肽及剪接位点(SignalP)

Post-translational modification prediction-------SignalP

2、分析糖链连接位点

NetOGlyc分析O-连接糖蛋白

NetNGlyc分析N-连接糖蛋白

其他工具:DictyOGlyc 、YinOYang

(六)分析蛋白质的亚细胞定位

Topology prediction-------- PSORT

(七)分析化学因子作用的蛋白质位点

Protein identification and characterization ------ PeptideCutter

七、农业类数据库的利用

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,美国农业部图书馆

(一)农作物比较基因组学分析

作物基因组间的比较(染色体上基因分布呈线性),相同功能基因序列的比较,利用模式植物分析大基因组物种基因

禾本科植物比较基因组库 Gramene database

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,

水稻(rice)、大麦(berley)、小麦(wheat)、玉米(maize)、燕麦(oat)、高粱(sorgheum)

以一个物种基因为模板――――与其他物种基因组比较

分析方法:Gramene-CAMP-Maps-选择物种和map set-选择染色体的编号-Charge maps -点击show comparism menu(显示比较染色体的选择栏目)-选择一条或者多条染色体

注意:由于分离群体大小不相同,不同的遗传连锁图上标记的距离出现很大的差异。

(二)作物基因组库中的其他查询内容

基因或分子标记的染色体位置;形态标记连锁图(早期);分子标记(marker/locus/loci);RFLP标记;cDNA标记;基于PCR(SSR;RAPD);数量性状遗传(QTL);突变体;蛋白质

1、查看遗传连锁图

分析方法(1) Gramene

Graneme-CMap-Maps-选择物种,map的类型,点击show selected set’s maps-

染色体网页可以单击分子标记查看相关的内容

(2)SoyBase 129.186.26.94

Soybase—goto soybase—soybase class browser—maps

(3)GrainGenes

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,(类似soybase)

2、在遗传连锁图上定位基因

a.以一条染色体(水稻)cDNA(EI12I1)序列检索核苷酸库(blast)

b.检索与它同源的基因组序列是否具有分子标记信息

c.通过RGP(http://rgp.dna.affire.go.jp/cgi-bin/statusdb/status.pl/)查询与先前的序列是否具有相同的分子标记信息

d.根据已经定位的分子标记以及和他相邻的分子标记在已知的连锁图的位置,在自己的遗传连锁图上定位这一cDNa序列

3、查看QTL信息

许多性状受多基因控制(数量性状);各种QTL基因???;

鉴定QTL基因:大通量鉴定与某个性状相关得cDNA (cDNA芯片分析,差减cDNA文库构建,cDNA 克隆测序)

将差异表达的cDNA克隆定位在遗传连锁图上

确定染色体位置与已知QTL相对的cDNA

分析该cDNA的表达谱

基因功能互补试验(超量表达目标基因;抑制基因功能(RNAi)检索QTL数据:在Graneme 中关键词检索

物种数据库选:QTL――种类――QTL目录,注释――QTL在染色体的位置

4、查看突变体(mutant)信息

Graneme-mutant-mutant search –字母顺序查找

(三)家禽、家畜的基因组数据库

ArkDB (https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,)

猪(pig)鸡(chicken)马(horse)猫(cat)tillapia 火鸡(tuekey)鹿(deer)羊(sheep)鲑鱼(salmon)牛(cattle)

(四)植物(Botanical Database)

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/botanicaldatabase.htm

药用植物、食用植物、植物化合物

八、核酸序列的其他分析方法

1、确定DNA的分子量和碱基组成

从North Carolia State University微生物系网页

https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/BioEdit/bioedit.html下载

2、序列变换

DNA-DNA;DNA-RNA;DNA-protein

BioEdit 或SRS(https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,)--Tool---Transeq(可以选择翻译的区间)

3、分析限制性酶切位点

展示DNA序列的酶切位点图分析克隆基因或特定DNA片断;分子标记(CAPS)

可以选择限制性内切酶

4、设计PCR引物

确定PCR片断大小;确定引物所在的区域;确定引物序列的长度范围;确定引物的Tm范围

Primer 3 (https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,/cgi-bin/prmer3/primer3_www.cgi

5、DNA序列格式修饰

BioEdit

6、在染色体上定位DNA序列

涉及GenBank的dbSTS库和NCBI的UniSTS库

采用electron PCR(e-PCR)功能

Forward e-PCR 用待分析序列检索dbSTS数据库(定位)

Reverse e-PCR 用STS数据库检索核苷酸数据库

华中农业大学硕士研究生培养方案

华中农业大学硕士研究生培养方案 (学科门类:理学一级学科代码:0710 一级学科名称:生物学) (二级学科代码:071005 二级学科名称:微生物学) 一、培养目标 微生物学是生命科学领域研究活跃、应用前景广阔,对其它学科影响最重要的生命科学之一。它的许多理论和实践方法不仅正被广泛应用于其它生命科学研究中,而且,正以前所未有的速度以分子生物学、基因组学和分子生态学等多个层次丰富着新的理论和技术,微生物学目前的研究内容涉及固氮微生物分子生物学、微生物农药及芽胞杆菌分子生物学、放线菌及链霉菌分子生物学、微生物-植物互作及分子生态学、蓝细菌分子生物学、动物病源微生物与分子病毒学、土壤与环境微生物学、植物病源微生物学、应用真菌生物技术、食品微生物学等。 微生物学不仅是现代生物科学、生物技术和生物工程等相关学科的基础,又是处于生命科学前沿的一门实践性极强的独立学科。 二、学习年限 培养适应我国社会主义现代化建设需要,德、智、体全面发展,品学兼优的高级专门人才。具体要求是:1.进一步学习和掌握马克思主义、毛泽东思想、邓小平理论和“三个代表”重要思想,树立马克思主义世界观;坚持党的基本路线,政治上同党中央保持高度一致;热爱祖国,关心时事,遵纪守法,品德优良,具有集体主义观念和艰苦奋斗的工作作风;服从国家需要,积极为社会主义现代化建设事业服务。 2.热爱专业,掌握本专业坚实的基础理论、系统的专业知识以及熟练的实验技能;了解所从事研究方向的国内外发展动态;具有从事科学研究、独立担负专门技术工作和管理工作等能力;具有严谨的治学态度、理论联系实际的工作作风和诚挚的协作精神。 3.掌握一门外国语,具有熟练的阅读能力、一定的写译能力和听说能力。 4.身心健康。 三、研究方向 1、分子微生物学 2、杀虫、抗病微生物学 3、微生物与植物相互作用微生物学 4、应用与环境微生物学 5、食品微生物学 6、应用真菌生物学 四、课程设置与考试要求

华中农业大学研究生学位论文形式规范(自然科学类)

华中农业大学研究生学位论文形式规范 (自然科学类) (1999年3月制定, 2009年1月修订) 为进一步规范学位论文写作和装订,促进研究生学位论文形式标准化,特制订本规范,其各项要求适用于答辩前后的论文,研究生在论文写作时务必认真阅读,严格执行。 1 论文组成 一般地,一篇完整的学位论文包括封面、扉页、目录、缩略语表、论文摘要、正文、参考文献、致谢、附录等几个部分。其中正文由前言、材料与方法、结果与分析、讨论等几个部分组成。 “华中农业大学学位论文独创性声明及使用授权书”置于扉页与目录之间。 2 论文外观 论文装订一律采用A4开本(297×210 mm),其中上边距30m,下边距25 mm,左边距32 mm,右边距25 mm,页眉20mm,页脚15 mm,页眉页脚居中排列,其中奇数页页眉为论文题目,偶数页页眉为“华中农业大学××届博/硕士研究生学位论文”。定稿后,用优质A4纸双面复印(不允许以A3纸单面复印后对折),装订整齐、美观。 论文目录按罗马数字(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ…)单独编排页码,目录之后按顺序编排阿拉伯数字(1、2、3…)编排页码,装订好后,页码无漏编、重编、倒编等错误。论文正式输出前应认真仔细地校对,特别要严格检查错别字、漏字、段落错乱、标题混乱等问题。论文装订好后,文中不应出现手工涂改的痕迹,整篇论文的错别字、漏字应控制在10次以下。 论文中的各级标题与正文、表头、题头等可以用不同的字号和字体加以区别,但通篇论文的同级标题和正文应采用统一的字间距、行间距、字体和字号。一般地,论文标题可设三级,一级标题采用三号黑体,二级标题采用小三号黑体,三级标题采用四号黑体,且都采用左对齐排版;标题以外的段落,一般采用小四号宋体(英文用Times New Roman字体);图表应同时标注中英文对照标题和注释,中文标题用小四号宋体加粗,英文标题用小四号Times New Roman 加粗;图表内的文字一般中文采用五号宋体,英文采用五号Times New Roman 体。 论文中的各级标题应采用统一的编号体系,一般按“1”、“1.1”、“1.1.1”体系进行标题编号,不能将“一、”、“1、”、“1.1”、“(1)”等混编在一起。

(完整word版)华中农业大学生物化学本科试题库第10章脂类代谢

第10章脂类代谢单元自测题 (一)名词解释 1.血浆脂蛋白2.血脂3.高脂蛋白血症4.酮体5.不饱和脂肪酸6.必需脂肪酸 7.脂动员8.脂肪酸β-氧化 (二)填空题 1.动物不能合成而需要由日粮提供的必需脂肪酸有和。 2.脂肪消化产物在十二指肠下段或空肠上段被吸收后,与磷脂、载脂蛋白等组成经淋巴进入血循环。 3.脂肪动员指在脂肪酶作用下水解为释放人血以供其他组织氧化利用。 4.游离脂肪酸不溶于水,需与结合后由血液运至全身。 5.脂肪酸β-氧化的限速酶是。 6.脂酰CoA经一次β-氧化可生成1分子乙酰CoA和。 7. 一分子14碳长链脂酰CoA可经次β-氧化生成个乙酰CoA。 8.肉碱脂酰转移酶工存在于细胞。 9.脂酰CoA每一次β-氧化需经脱氢和硫解等过程。 10.酮体指、和。 11.酮体合成的酶系存在,氧化利用的酶系存在于。 12.丙酰CoA的进一步氧化需要和作酶的辅助因子。 13.一分子脂肪酸活化后需经转运才能由胞液进入线粒体内氧化;线粒体内的乙酰CoA需经才能将其带出细胞参与脂肪酸合成。 14.脂肪酸的合成需原料、、和等。 15.脂肪酸合成过程中,乙酰CoA来源于或,NADPH来源于。 (三)选择题 1.动物合成甘油三脂最强的器官是: a.肝b.肾c.脂肪组织d.脑e.小肠 2.脂肪动员是指: a.脂肪组织中脂肪的合成b.脂肪组织中脂肪的分解 c.脂肪组织中脂肪被脂肪酶水解为游离脂肪酸和甘油并释放入血供其他组织利用 d.脂肪组织中脂肪酸的合成及甘油的生成e.以上都对 3. 能促进脂肪动员的激素有: a.肾上腺素b.胰高血糖素c.促甲状腺素d.ACTH e.以上都是 4.脂肪酸合成的限速酶是: a.酰基转移酶b.乙酰CoA羧化酶c.肉碱脂酰CoA转移酶Ⅰ d.肉碱脂酰CoA转移酶Ⅱe.β-酮脂酰还原酶 5.酮体在肝外组织氧化分解,原因是肝内缺乏: a.乙酰乙酰CoA硫解酶b.琥珀酰CoA转硫酶c.β-羟丁酸脱氢酶 d.β-羟-β-甲戊二酸单酰CoA合成酶e.羟甲基戊二酸单酰CoA裂解酶 6.脂酰CoA的β-氧化过程反应顺序是: a.脱氢,加水,再脱氢,加水b.脱氢,脱水,再脱氢,硫解 c.脱氢,加水,再脱氢,硫解d.水合,脱氢,再加水,硫解 e.水合,脱氢,硫解,再加水 7.可作为合成前列腺素前体的脂肪酸是: a.软脂酸b.花生四烯酸c.亚麻酸d.亚油酸e.硬脂酸 8.能将肝外胆固醇转运到肝脏进行代谢的血浆脂蛋白: a.CM b.LDL c.HDL d.IDL e.VLDL 9.可由呼吸道呼出的酮体是: a.乙酰乙酸b.β-羟丁酸c.乙酰乙酰CoA d.丙酮e.以上都是 10.并非以FAD为辅助因子的脱氢酶有: a.琥珀酸脱氢酶b.脂酰CoA脱氢酶c.二氢硫辛酰胺脱氢酶 d.β-羟脂酰CoA脱氢酶e.线粒体内膜的磷酸甘油脱氢酶 11.不能产生乙酰CoA的分子是: a.酮体b.脂肪酸c.胆固醇d.磷脂e.葡萄糖 12.参与甘油磷脂合成过程的核苷酸是: a.A TP b CTP c.TIP d.UTP e.GTP 13.脂肪酸分解产生的乙酰CoA去路: a.合成脂肪酸b.氧化供能c.合成酮体d.合成胆固醇e.以上都是 14.胆固醇合成的限速酶是: a.HMGCoA合成酶b.乙酰CoA羧化酶c.HMGCoA还原酶 d.乙酰乙酰CoA硫解酶e.HMGCoA裂解酶 15.下列不是载脂蛋白的功能的是:

华中农业大学-武汉市农业科学技术研究院研究生联合培养基地招生简介

2012年华中农业大学-武汉市农业科学技术研究院研究生联合培养基地专业学位招生简介 一、武汉市农业科学技术研究院基本情况 武汉市农业科学技术研究院前身是1984年组建的市农业科学技术研究中心,1989年更名为市农业科学技术研究院。是一个集农业科研、开发、推广、服务为一体的公益性正局级事业单位。 研究院下设六个研究所、两个中心及三个直属公司。即蔬菜科研所、畜牧兽医科研所、水产科研所、农业科研所、林业果树科研所、农业机械化科研所、农业干部培训中心、农业生物技术研究中心、武汉中博生化股份有限公司、武汉科慧都市农业发展有限公司、武汉现代都市农业规划设计院。 现有各类人员1068名,其中在职职工547人。有各类专业技术人员338人,其中高级职称145人(含正高27人),中级职称145人。专业技术人员中有博士11人,研究生52人。享受国务院津贴专家17人;享受省、市政府津贴35人;国家、省、市人才工程人选16人;省市有突出贡献专家15人。 从1984年建院以来,市农科院共承担各级各类科技项目500多项,取得农业科技成果280余项,获国家、部省、市级科技奖244项。与此同时,取得国家新专利16项、产品登记4项、湖北省品种审(认)定36项。先后承担完成了国际生物多样性组织、国家科技部、农业部、建设部、国家星火计划、国家引智项目、湖北省科技厅等省部以上项目30余项。正在实施的重大项目有国家公益性行业(农业)科研专项经费项目、国家科技部支撑计划、农业部“948”项目、国家科技基础条件平台工作重点项目、农业部蔬菜遗传与生理重点开放实验室项目、农业部农作物种质资源保护项目、湖北省科技攻关计划项目、湖北省农业科技成果转化资金项目等。由院蔬菜所主持承担的国家行业计划《甜菜夜蛾防控技术研究与示范》项目及《水生蔬菜产业技术体系研究与示范》项目,确立了市农科院在这两个研究领域国内的主导地位。

(完整word版)华中农业大学生物化学本科试题库第15章RNA生物合成

第15章 RNA生物合成五单元自测题 (一)名词解释或概念比较 1.转录与逆转录 2.单顺反子与多顺反子 3.反意义链与有意义链 4.启动子与终止子 5.内含子与外显子 6.RNA聚合酶全酶与核心酶 7.操纵子与操纵基因 8.顺式作用元件与反式作用因子。 9.阻遏物与辅阻遏物 10.-10序列与TA TA box 11. 核酶 (二)填空题 1. 引物酶与转录中的RNA聚合酶之间的差别在于它对不敏感,并可以作为底物。 2. 大肠杆菌中DNA指导的RNA聚合酶全酶的亚基组成为,去掉因子的部分称为核心酶,这个因 子使全酶能辩认DNA上的位点。 3. 利福平抑制细菌中转录的起始,因为。 4. 原核生物中各种RNA是催化生成的。而真核生物基因的转录分别由种RNA聚合酶催 化,其中rRNA基因由转录,hnRNA基因由转录,各类小分子量RNA则是的产物。 5. 一个转录单位一般应包括序列、序列和顺序。 6. 真核细胞中编码蛋白质的基因多为。编码的序列还被保留在成熟mRNA中的是,编码的序 列在前体分子转录后加工中被切除的是。在基因中______被_____分隔,而成熟的mRNA中外显子转录的序列被拼接起来。 7. 真核生物与原核生物的tRNA前体一个重要的区别就是前者含有。 8. 在原核细胞中,由同一调控区控制的一群功能相关的结构基因组成一个基因表达调控单位,称为,其 调控区包括和。 9. 大肠杆菌乳糖操纵子调节基因编码的与结合,对lac表达实施负调控;和 的复合物结合于上游部分,对lac表达实施正调控。 10. 大肠杆菌色氨酸操纵子阻遏蛋白必须先与辅阻遏物相结合,才能结合于操纵基因。在trp操纵基因与 结构基因之间有一段能被转录的,可编码含有2个残基的14肽。色氨酸充裕时,翻译迅速,转录中断,色氨酸不足时,翻译迟滞,结构基因的转录得以继续进行,称为调节。 11. 乳糖操纵子的启动,不仅需要有诱导物乳糖存在,而且培养基中不能有,因为它的分解代谢产物会降 低细胞中的水平,而使复合物不足,它是启动基因启动所不可缺少的调节因子。 12.中心法则是于年提出的其内容可概括为。 (三)选择题 1. hnRNA是: A. 存在于细胞核内的tRNA前体 B. 存在于细胞核内的mRNA前体 C. 存在于细胞核内的rRNA前体 D. 存在于细胞核内的snRNA前体 2. 真核细胞中RNA聚合酶Ⅲ的产物是: A. mRNA B.hnRNA C. rRNA D. tRNA和snRNA 3. 合成后无需进行转录后加工修饰就具有生物活性的RNA是: A. tRNA B. rRNA C. 原核细胞mRNA D. 真核细胞mRNA 4. 下列抑制剂哪一种既抑制DNA的复制又抑制转录作用: A. 利福平 B. 丝裂霉素G C. 高剂量放线菌素 D. α-鹅膏蕈碱 5. 下列核酸合成抑制剂中对真核细胞RNA聚合酶Ⅱ高度敏感的抑制剂是: A. 利福平 B. 氨甲喋呤 C. α-鹅膏蕈碱D氮芥 6. 以下哪种物质常造成碱基对的插入或缺失,从而发生移码突变? A. 嘧淀衍生物 B. 5-氟尿嘧啶 C. 羟胺 D. 亚硝基胍 7. 下列关于基因增强子的叙述错误的是: A. 删除增强子通常导致RNA合成的速度降低 B. 增强子与DNA-结合蛋白相互作用 C. 增强子增加mRNA翻译成为蛋白质的速度 D. 在病毒的基因组中有时能够发现增强子 8. 下列有关操纵子的论述哪个是错误的? A. 操纵子是由启动基因、操纵基因与其所控制的一组功能上相关的结构基因组成的基因表达调控单位

华中农业大学研究生学籍管理细则

华中农业大学研究生学籍管理细则 (2005年制订,2010年8月修订) 第一章总则 第一条为全面贯彻党的教育方针,维护学校正常的教育教学秩序,保障研究生合法权益,不断提高教育教学质量,培养德、智、体、美全面发展的社会主义合格建设者和可靠接班人,根据《中华人民共和国高等教育法》和教育部2005年3月颁布的《普通高等学校学生管理规定》,结合学校实际,制定本细则。 第二条本细则适用于接受学历教育的研究生。 第三条硕士研究生学习年限(含休学)一般为2-3年,最长不超过5年;博士研究生学习年限(含休学)一般3-4年,最长不超过6年;硕博连读、提前攻博研究生学习年限(含休学)一般5-6年,最长不超过8年。 研究生在学校规定的基本学习年限内未能完成学业的,经导师、学院和研究生处批准,可以申请延期毕业。但延期毕业年限不得超过学校规定的最长学习年限。 第二章入学与注册 第四条按照国家招生规定,经我校录取的研究生新生持华中农业大学研究生录取通知书和学校规定的其它有关证件,按期到校办理入学手续。因故不能按期入学者,必须向所在学院书面请假并附相关证明。请假时间一般不得超过两周。未请假,或未准假逾期两周不报到者,或假满逾期两周不报到者,除因不可抗力等正当事由外,视为放

弃入学资格。 第五条新生办理入学手续后,学校在三个月内按照国家和学校招生规定对其政治、思想品德、文化、健康状况等进行复查。复查合格者予以注册,取得学籍。复查不合格者,由学校区别情况予以处理,直至取消入学资格。 凡属违反国家招生规定,弄虚作假、徇私舞弊被录取者,无论何时发现,一经查实,取消其入学资格或者学籍,退回原户籍所在地。情节恶劣的,报请有关部门查究。 第六条入学体检复查由华中农业大学医院负责。对达不到入学体检标准的新生,取消其入学资格;对患有疾病经学校指定的二级甲等以上医院(下同)诊断不宜在校学习的新生,经本人申请,学校批准,可保留入学资格一年。保留入学资格的新生应在申请被批准后两周内办理离校手续。治疗期间的医疗费用自理。无故不办理离校手续者,取消入学资格。 保留入学资格的学生,应当在下一学年开学前,持二级甲等以上医院病愈诊断证明和体检表以及所在地街道(乡)等单位开具的学生行为表现证明,向学校招生办公室提交入学申请,经学校指定医院诊断,符合入学体检要求,学校复查合格后,可以按当年新生办理入学手续。 复查不合格者取消入学资格,逾期两周不办理入学手续者,被视为放弃入学资格。 保留入学资格者不具有学籍,不享受在校生或休学生待遇。学校不对学生保留入学资格期间发生的事故负责。保留入学资格期间,如有严重违法乱纪行为者,取消其入学资格。 第七条每学期开学时,已取得学籍的研究生持研究生证,在校历规定的时间内到所在学院办理注册手续,未按学校规定缴纳学费或者其他不符合注册条件者不予注册。确因在校外从事科研、调研、撰写论文、实践等工作,不能按期注册的,应当事先履行暂缓注册手续,

华中农业大学-《畜牧微生物学》课程-试题(附参考答案与评分标准)

华中农业大学本科课程考试试卷 考试课程与试卷类型:畜牧微生物学A 姓名: 学年学期:2004-2005-1 学号: 考试时间:2004-01-18 班级:动物科技学院2002级1-4班_______________________________________________________________________________ ____________ 一. 单项选择题(从下列各题四个备选答案中选出一个正确答案,并将其代号写在答题纸的相应位置。答案选错或未选者,该题不得分。每小题1分, 共10分) 1.创造了低温消毒法的是____。标准答案:B A. 荷兰人吕文虎克 B. 法国学者巴斯德 C. 德国学者柯赫 D. 德国学者贝哲林克 2.酵母菌属____。标准答案:B A. 单细胞原核微生物 B. 单细胞真核微生物 C. 多细胞原核微生物 D. 多细胞真核微生物 3.对乙醇这个药剂来说,其消毒效果最好的浓度是____。标准答案:C A. 25% B. 55% C. 70% D. 95% 4.____含量越高,青贮饲料的品质越差。标准答案:B A. 乳酸 B. 丁酸 C. 酒精 D. 醋酸 5.类毒素具有____。标准答案:C A. 免疫原性和毒性 B. 非免疫原性和毒性 C. 免疫原性和非毒性 D. 非抗原性和非毒性 6.金黄色葡萄球菌的拉丁文命名正确的为____。标准答案:C A. staphylococcus aureus B. Staphylococcus Aureus C. Staphylococcus aureus D. staphylococcus Aureus 7.担子菌是以产生____的方式进行繁殖。标准答案:C A. 节孢子 B. 分生孢子 C. 担孢子 D. 孢子囊孢子 8.沙门氏菌的吲哚试验为阴性,说明该菌不能分解____。标准答案:D A. 葡萄糖 B. 胱氨酸 C. 吲哚 D. 色氨酸 9.大肠杆菌(Escherichia coli)在麦康凯琼脂培养基上生长时,产生____菌落,据此可与沙门氏菌(Salmonella)相区别。标准答案:C A. 白色 B. 黄色 C. 红色 D. 无色 10.下面有关黄曲霉毒素的叙述,错误的是____。标准答案:A A. 不耐热 B. 难溶于水 C. 具有荧光性 D. 没有免疫原性 二.多项选择题(从下列各题四个备选答案中选出所有正确答案。答案选错或未选全者,该题不得分。每小题2分,共10分) 担子菌的三大特点是____。标准答案:ABC

在华中农业大学,你不可不知道的50个真相

在华中农业大学,你不可不知道的50个真相 华中农业大学你不可不知的50个真相NO.01我们学校有多个别名:“湖北农务学堂”,“华中植物园”,“南湖农垦培训学校”,“帝国养猪种地职业技术学院”......如果你听到这几个名字,别弄错了,其实说的都是一个学校。NO.02华农的前身可追溯到1898年清朝光绪年间湖广总督张之洞创办的湖北农务学堂,学校前身华中农学院由武汉大学农学院、湖北农学院全部系科以及原中山大学、原南昌大学等6所综合性大学农学院的部分系科在1952年组建而成。1985年更名为华中农业大学,至今已历经118个年头。华农100多年前的风貌。NO.03国家211,中国农林类高校前三,重点大学该有的都有。园艺学专业全国第一,兽医学和畜牧学全国第二。NO.04华农图书馆的汇雅书邨是个好地方。NO.05逢年过节在家,华农学子都需要回答一个亘古不变但是每年都要回答的问题: “读的哪个大学啊?” “华农。” “哪个华农?” “武汉的华中农业大学......” “哦,毕业以后是要耕田种树?”(大妈您真的知道华农是哪个嘛?)NO.06南湖是华农人口口相传的情人湖。静谧清新,

树木葱茏,清风拂面,想起它就想起美好的初恋,一路牵着的手,两个人一起散步,永远走不到路的尽头。 有没有带心爱的她来到这个浪漫的地方?NO.07作为农林 类的高校,华农的男女比例接近1:1,然并卵,有很多华农 人还是没找到对象。NO.08华农男女比例最悬殊的是工学院,男女比例约为7:1,真是华科男女比例再现,有些班级甚至是和尚班。但别慌,我们有假面舞会帮你找到真爱。NO.09华农有三宝,早操、听力、环湖跑。这三样总是虐得你不要不要的。NO.10南面是华农著名的试验田基地,每年春季的油菜花,是全武汉闻名的春景,有“三月到华农看菜花”之美誉。当然,看妹子的更多。NO.11华农有着全国高校中最长的湖岸线,长达8550米,学校四周有3/4以上的边界被湖 水包围,是名副其实的“三面环水”。NO.12 武汉各大高校中,只有华农有如此魄力,把食堂改成了自习室——标准的学累了吃,吃完了睡,睡醒了再学。NO.13华农有早操!华农有早操!华农有早操!重要的事情要说三遍。操是以前的教授编排的,学校会另外教。老实说,动作有点傻。NO.14一到秋天,华农的银杏超级美!并不输于武大的樱花。摄影:Por_una_CabecaNO.15 早操要好好学,国庆的时候要选人参加11月的校运动会开 幕式的广播操比赛,有综测加分。NO.16华农的校歌是由著名声乐家喻宜萱女士和朱再庵先生共同创作。大家对喻宜萱

华中农业大学学士学位论文封面

本科毕业论文 题目稻曲病菌对戊唑醇的室内抗性筛选 In vitro adaptation to tebuconazole in Ustilaginoidea virence strains 姓 名黄进学号060801024专业动植物检疫 指导教师罗朝喜职称教授 中国·武汉二○一○年六月

分类号密级华中农业大学本科毕业论文 稻曲病菌对戊唑醇的室内抗性筛选In vitro adaptation to tebuconazole in Ustilaginoidea virence strains 学生姓名:黄进 学生学号:060801024 学生专业:动植物检疫 指导教师:罗朝喜教授 华中农业大学植物科学技术学院 二○一○年六月

摘要..........................................................................................................................................II Abstract...................................................................................................................................III 关键字.....................................................................................................................................III 1前言 (1) 1.1稻曲病菌 (1) 1.2戊唑醇 (3) 1.3病原菌室内抗性筛选 (5) 2材料与方法 (5) 2.1试验材料 (5) 2.2实验内容 (5) 2.3实验结果与分析 (5) 2.4讨论 (8) 参考文献 (9) 致谢 (9) 附录 (10)

华中农业大学生物化学本科试题库-第1章---糖--类

第一章糖类单元自测题 (一)名词解释 1、单糖, 2、还原糖, 3、不对称碳原子, 4、α-及β-异头物, 5、蛋白聚糖, 6、糖脎, 7、改性淀粉, 8、复合多糖,9、糖蛋白,10.糖胺聚糖 (二)填空题 1、判断一个糖的D-型和L-型是以碳原子上羟基的位置作依据。 2、糖苷是指糖的和醇、酚等化合物失水而形成的缩醛(或缩酮)等形式的化合物。 3、蔗糖是由一分子和一分子组成,它们之间通过糖苷键相连。 4、麦芽糖是由两分子组成,它们之间通过糖苷键相连。 5、乳糖是由一分子和一分子组成,它们之间通过糖苷键相连。 6、纤维素是由组成,它们之间通过糖昔键相连。 7、多糖的构象大致可分为、、和四种类型,决定其构象的主要因素是。 8、直链淀粉的构象为,纤维素的构象为。 9、人血液中含量最丰富的糖是,肝脏中含量最丰富的糖是,肌肉中含量最丰富的糖是。 10、糖胺聚糖是一类含和的杂多糖,其代表性化合物有、和等。 11、肽聚糖的基本结构是以与组成的多糖链为骨于,并与肽连接而成的杂多糖。 12、常用定量测定还原糖的试剂为试剂和试剂。 13、蛋白聚糖是由和共价结合形成的复合物。 14、自然界较重要的乙酰氨基糖有、和。 15、鉴别糖的普通方法为试验。 16、脂多糖一般由、和三部分组成。 17、糖肽的主要连接键有和。 18、直链淀粉遇碘呈色,支链淀粉遇碘呈色。 (三)选择题 1、单选题(下列各题均有五个备选答案,试从其中选出一个) (1)环状结构的己醛糖其立体异构体的数目为( ) (A)4 (B)3 (C)16 (D)32 (E)64 (2)右图的结构式代表哪种糖?( ) (A)α-D-吡喃葡萄糖 (B)β-D-吡喃葡萄糖 (C)α-D-呋喃葡萄糖 (D)β-L-呋喃葡萄糖 (E)α-D-呋喃果糖 (3)、下列哪种糖不能生成糖脎?( ) (A)葡萄糖(B)果糖(C)蔗糖(D)乳糖(E)麦芽糖 (4)下图所示的结构式代表哪种糖胺聚糖?( ) (A)几丁质(壳多糖) (B)硫酸软骨素(C)肝素(D)透明质酸(E)硫酸角质素 (5)、下列物质中哪种不是糖胺聚糖?( ) (A)果胶(B)硫酸软骨素(C)透明质酸(D)肝素(E)硫酸黏液素 (6)糖胺聚糖中不含硫的是( ) (A)透明质酸(B)硫酸软骨素(C)硫酸皮肤素(D)硫酸角质素(E)肝素 (7)下图的结构式代表哪种糖?( )

华中农业大学805植物生理学考研练习题

华中农业大学805植物生理学考研练习题 一、名词解释 1.水分代谢2.水势3.压力势4.渗透势5.根压6.自由水7.渗透作用8.束缚水9.衬质势10.吐水11.伤流12.蒸腾拉力13.蒸腾作用14.蒸腾效率15.蒸腾系数16.生态需水17.吸胀作用18.永久萎蔫系数19.水分临界期20.内聚力学说2l.植物的最大需水期22.小孔扩散律23.重力势24.水通道蛋白25.节水农业 二、写出下列符号的中文名称 1.RWC 2.Ψw 3.Ψs 4.Ψm 5.Vw 6.Ψp 7.SPAC8.RH9.Mpa10.AQP 三、填空题 1.水分在植物体内以和两种形式存在。 2.将一个充分饱和的细胞放入比其细胞液低10倍的溶液中,其体积。 3.植物细胞的水势是由、、等组成的。 4.细胞间水分子移动的方向决定于,即水分从水势的细胞流向的细胞。 5.水分通过叶片的蒸腾方式有两种,即和。 6.和现象可以证明根压的存在。 7.无机离子泵学说认为,气孔在光照下张开时,保卫细胞内离子浓度升高,这是因为保卫细胞内含,在光照下可以产生,供给质膜上的作功而主动吸收离子,降低保卫细胞的水势而使气孔。 8.影响蒸腾作用最主要的外界条件是。 9.细胞中自由水越多,原生质粘性,代谢,抗性。 10.灌溉的生理指标有,细胞汁液浓度,渗透势和。 11.植物细胞吸水有三种方式,未形成液泡的细胞靠吸水,液泡形成以后,主要靠吸水,另外还有吸水,这三种方式中以吸水为主。 12.相邻的两个植物细胞,水分移动方向决定于两端细胞的。 13.干燥种子吸收水分的动力是。

14.植物对蒸腾的调节方式有、和。 15.某种植物每制造一克干物质需要消耗水分500克,其蒸腾系数为,蒸腾效率为。 16.水滴呈球形,水在毛细管中自发上升。这两种现象的原因是由于水有。 17.影响气孔开闭的最主要环境因素有四个,它们是,, 和。 18.植物被动吸水的能量来自于,主动吸水的能量来自于。 19.影响植物气孔开闭的激素是、。 20.将已发生质壁分离的细胞放入清水中,细胞的水势变化趋势是,细胞的渗透势,压力势。 四、问答题 1.温度过高或过低为什么不利于根系吸水? 2.试述气孔运动的机理。 3.试述水对植物生长发育的影响。 4.蒸腾拉力能将水分提升至植物体的各个部位,其途径和机理是什么? 5.解释“烧苗”现象的原因。 6.土壤通气不良造成根系吸水困难的原因是什么? 7.蒸腾作用的强弱与哪些因素有关,为什么? 8.禾谷类作物的水分临界期在什么时期,为什么? 9.合理灌溉在农业生产中的意义,如何做到合理灌溉。 10.简述植物体内水分的存在的状态与代谢的关系。 11.简述蒸腾作用的生理意义。 12.简述保卫细胞的特点。 13.简述外部因素对气孔运动的影响。

2020年华中农业大学研究生院植物科学技术学院介绍

2020年华中农业大学研究生院植物科学技术学院 介绍 2013年研究生考试已经告一段落,出国留学考研网为14年考生 提供华中农业大学介绍相关院校信息及专业简介,帮助考生在复习 之初建立明确的目标院校,有针对性的进行后期复习。 华中农业大学植物科学技术学院办学历史悠久。其前身始于清朝光绪年间湖广总督张之洞1898年创办的湖北农务学堂,后几经演变,于1952年由武汉大学农学院、湖北农学院、中山大学等六所大学的 农艺系合并成立华中农学院农学系,下设农学、植保、土化三个专业。1954年在农学、植保、土化三个专业的基础上设立农学系、植 保系、土化系。农学系和植保系师资力量雄厚,汇聚了一批知名专 家在此任教,有二级岗教授杨新美、胡仲紫、章锡昌、刘后利等。 随着学校改革发展的不断深入,在学校院系与学科调整过程中,原 农学系和原植物保护系于2002年7月合并,成立植物科学技术学院。 学院现设作物遗传育种系、农学系和植物保护系,下设作物育种学、遗传学、作物栽培学、植物病理学、昆虫学、植物生理生化、 农业气象学、农药学和应用真菌学9个教研室,专任教师118人, 开设植物科学与技术(含种子工程)、农学、植物保护(含植物检疫)3个本科专业,现有在校本科生1600余名,研究生800余名, 留学生13名,继续教育学生580余名。 二、学科优势明显,培养条件优越 学院现有作物学与植物保护学两个一级学科,其中:作物学(含作物遗传育种、作物栽培学与耕作学)被评为国家一级重点学科、 国家211工程第三期重点建设学科、湖北省高校优势学科,2002年 作物学评估排名第一;植物保护学被评为湖北省重点学科,植物病 理学被评为湖北省高校特色学科。学院建有2个一级学科博士点、2 个博士后科研流动站,12个博士学位授予权专业,13个硕士学位授 予权专业,具有学士、硕士、博士及博士后的完备人才培养体系。

华中农业大学考研微生物英语题库

Test 1: Development of Microbiology 1 Multiple Choice (choose one answer) 1.The fundamental unit of all living organisms is the Membrane cell nucleus cell wall https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,anisms that do not contain a true nucleus are referred to as fungi eukaryotic prokaryotic nankaryotic 3.The three kingdom classification system of organisms was proposed by Pasteur Bacon Winogradsky Woese 4.Fungi differ from bacteria in a number of characteristics. The cell walls in fungi are composedof , while the cell walls of bacteria are composed of peptidoglycan Chitin phospholipids protein glucosamine 5.The first microscopes were developed by Ehrlich Metchnikoff Leewenhoek Lister 6.Control of microbial infections can be accomplished by chemical or immune mechanisms. The first report on the production of an antibiotic is credited to: Lister Fleming Ehrlich Koch 7The term "antibiotic" means a substance produced by the laboratory that kills or inhibits other microorganisms a substance produced by microorganisms that kills or inhibits molds a substance produced by microorganism that kills or inhibits other microorganisms a substance produced by microorganisms that kills or inhibits cancer cells 8 The first documented use of a vaccine for smallpox was reported by the English physician Lister .Florey Fleming Jenner 9 Active immunity can be distinguished from passive immunity in that the former requires: development of antibodies in one's own body by stimulation with external antibodies development of antibodies in one's own body by stimulation with external antigens Flemingdevelopment of antibodies in a foreign host and transfer to one' s own body development of antigens in one's own body by stimulation with external antibodies 10The process of nitrification by bacteria described by Winogradsky converts ammonia to nitrate ions nitrate ions to ammonia N2 to ammonia ammonia to urea 11The transfer of DNA from one organism to another through the use of a viral vector is referred to as Electroporation conjugation transformation transduction 12The genetic material of a bacteria is located in the molecule: RNA DNA protein lipid 2 Fill in the Blank https://www.360docs.net/doc/7f2264011.html,anisms that contain a true nucleus are called_______ 2.Bacteria do not have a true nucleus and are considered _______ 3.. Bacteria can be divided into two groups, the _______and the ______ 4._______ are organisms that can grow without using molecular oxygen. 5. Microorganisms that can synthesize complex organic compounds from CO2:are called _______.

华中农业大学研究生学位论文写作指南

华中农业大学研究生学位论文写作指南(社会科学类) 1998年7月,校学位委员会研究决定:对博士研究生学位论文实行先答辩后装订的规范管理,以提高博士学位论文的学术水平和印制质量。具体做法是:在博士研究生进行学位论文答辩之前,以简装(线装或钉书机装订)本提供给评阅专家和答辩委员使用。待答辩后再修改,正式装订。为了规范研究生博士学位论文的写作,特制定本写作指南,务请各位研究生在写作论文前认真阅读并遵照执行。 1.论文组成要素 学位论文是表明作者从事科学研究取得创造性的结果或有了新的见解,并以此为内容撰写而成,作为提出申请授予相应的学位时评审用的学术论文。一本完整的论文包括:封面、扉页、目录、中文摘要、英文摘要、正文、参考文献、致谢几个部分,必要时还可在参考文献后添加1个或数个附录。 2.论文印制规格和质量要求 论文的开本为A4纸,其尺寸为297 mm×210 mm,其中上边距25mm、下边距25mm、左边距32mm、右边距25mm、页脚15mm,定稿后用优质A4纸双面或单面复印(不允许以A3纸单面复印后对折)。 论文文字均采用宋体字按统一标准编排。标题、图题、参考文献、附录用5号宋体字,脚注用小5号宋体字,行间距可根据内容进行适当调整。标题段前段后各6磅,同一级的标题,要采用同样的字号与字体,所有的正文文字应采用同一字号与字体。标题级别一般不超过三级为宜。一类标题用3号宋体字,二类标题用小3号字,宋体字,三类标题用4号宋体字。其余文字内容用小4号宋体字、1.25倍的行间距,不设段前段后。 一段文字的最后一行不落在下一页,一段文字的启始一行不放在前一页。在Miccrosoft word编辑软件下实现的方法是:在“格式”下拉框中选“段落”,在“段落”列表中选“换行与分页”,然后选中“孤行控制”即可。 所有的表图,包括标题、图题和脚注等,都应尽可能放在同一页,以保持表图的完整性。 论文正式输出要认真仔细地校对,避免出现错误。打印出的论文中不应出现手工

华中农业大学《生物化学实验》试卷

华中农业大学本科生课程考试试卷 考试课程与试卷类型:植物生理学实验原理与技术(A)姓名: 学年学期:2008-2009-1 学号: 考试时间:2009--班级: 一、名词解释 ( 每题 4 分 , 共 12分 ) 1. 聚丙烯酰胺凝胶 2. 离心技术 3.可见光分光光度法/反相纸层析 二、填空题 ( 每空 2 分 , 共 42分 ) 1. 反相纸层析法分离油菜不饱和脂肪酸的实验中 ,分离后的不饱和脂肪酸经红氨酸溶液显色后 , 其最终产物颜色是(1),从点样端起层析谱带所对应的脂肪酸依次是 (2) 、(3)、(4)、(5)、(6)。 2. 圆盘聚丙烯酰胺凝胶电泳分离过氧化物酶同工酶的实验中 , 电泳时上槽接电源(7)极 ,下槽接电源 (8) 极 , 电泳开始电流应调节至每管(9)mA, 十分钟后电流调节至每管 (10) mA; 在上槽或样品中加入溴酚蓝是起(11)的作用。 3. 核酸提取过程中 , 将含有 DNA 的溶液置72℃处理 3 分钟,其目的是(12);在淀粉酶活性测定过程中将淀粉酶液置于 70℃下处理 15 分钟的目的是(13)。 4.在微量凯氏定氮法测定植物组织中的总氮和蛋白氮,有三个主要的实验阶段,它们分别是(14)、(15)和(16)。在第二阶段,若收集三角瓶中的溶液颜色由_(17)变为(18),表明反应完全。第三阶段所用的标准浓度的滴定溶液名称是(19)。 5. DNA 提取研磨时加入的研磨缓冲液的NaCl浓度是(20),研磨时加入SDS的作用是(21)

三、是非判断题 (判断对错,对的标T,错的标F,每题 2 分,共 10 分 ) 1.萌发的小麦种子中含有很高活性的淀粉酶,其中α-淀粉酶不耐热,在70℃迅速钝化。() 2.本学期测定还原性糖和可溶性蛋白含量时都用到了斐林试剂,这两个实验中所用的斐林试剂的配方是相同的。() 3.DNA提取中,加入冷乙醇是为了使DNA分子复性变粗。() 4.离心机使用中,要求同一台离心机所用的离心管都有相同的重量。()5.油菜种子硫甙葡萄糖苷的快速分析法中,反应的实质是测定水解硫苷产生的葡萄糖的数量。() 四、问答题(共36分) 1.试述维生素C测定的基本原理及其实验过程中的注意事项(12分) 2.简述凯氏定氮法测定蛋白质含量的基本原理。为什么一些不法商人要在蛋白质制品中加入三聚氰胺?(12分) 3.凝胶电泳法测定同工酶的原理是什么?为什么本学期所作的胶条染色后显示的谱带就是过氧化物同工酶带?(12分)

华中农业大学342《农业知识综合四》(文法)考试大纲

华中农业大学文法学院全日制专业学位农业推广硕士 342《农业知识综合四》考试大纲 农村政策学 第一章公共政策与公共政策系统 1.公共政策的概念 2.公共政策系统的主体(政策主体) 3.公共政策系统的客体(政策客体) 4.公共政策环境 5.公共政策系统的划分 第二章公共政策分析的基本框架 2.1公共政策分析的不同模式、理论和方法 2.2公共政策分析的构成要素 2.3公共政策分析的程序 第三章公共政策问题界定 3.1政策问题的性质 3.2问题界定的过程 3.3问题界定的方法 3.4农村公共政策问题界定的特殊性 第四章公共政策目标、指标和标准 4.1公共政策目标 4.2公共政策指标 4.3公共政策评估标准 4.4农村公共政策目标、指标和标准的特殊性 第五章农村公共政策的主要内容与发展变化 5.1农村公共政策的概念 5.2农村公共政策的主要内容 5.3农村公共政策的发展变化 第六章农村公共政策过程 6.1政策过程 6.2农村公共政策的制定 6.3农村公共政策的执行 6.4农村公共政策的监控 6.5农村公共政策的结果评估 6.6农村公共政策的调整、终结与变化 参考书:《公共政策学——政策分析的理论、方法和技术》(“十五”国家级规划教材),陈振明编著,中国人民大学出版社,2004年版

管理学 主要内容:管理的理论概述、管理组织、管理过程、管理方式、管理绩效等五大部分。 一、管理概述 (一)重要概念 管理定义,管理创新,管理人,管理主体和客体,管理角色, (二)基本考点 1.管理的的内涵和基本特征; 2.管理的目标和手段; 3.管理中的人性假定; 4.现代管理理论特征; 5.管理主体能力结构; 二、管理组织 (一)重要概念 组织概念,组织的类型,管理幅度,组织权变,组织整合,科层制,现代公司制度(二)基本考点 1.管理组织的类型、功能; 2.组织目标制定与管理; 3.组织设计理论与原则; 4.组织结构特性与基本类型; 5.组织制度体系、特点; 6.组织变革动因、阻力与发展方向; 7.组织的运行机制。 三、管理过程 (一)重要概念 决策的本质,计划、领导者、激励、控制 (二)基本考点 1.决策内涵与决策方法 2.计划的特点、内容、和类型; 3.领导的类型、权利与领导风格; 4.激励本质与激励理论; 5.控制的模式、方式与要点; 四、管理方式 (一)重要概念 共同愿景,目标管理,人际沟通,管理流程,管理效率,管理成本 (二)基本考点 1.建立共同愿景的方式与步骤; 2.目标管理的方式; 3.人际沟通的模式与改进; 4.再造工作流程的基本路径; 5.管理效率的影响因素与控制。 四、管理绩效评价 (一)重要概念 标杆管理,流程再造,学习型组织,竞争合作

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