生物化学第十次作业

一、名词解释

1. Complex and Conjugated Saccharides:

复合糖，糖类的还原端和蛋白质或脂质结合的产物。在生物中分布广泛，有多种重要功能，细胞的识别、定性以及免疫等无不与之有关。糖类和蛋白质结合有以蛋白质为主的称糖蛋白，如血液中的大部分蛋白质；也有以糖为主的，如蛋白聚糖是动物结缔组织的重要成分。和脂质结合的，如脂多糖存在于细菌的外膜，成分以多糖为主；另外有称为糖脂的，组成以脂质为主，大多和细胞的膜连系在一起。糖脂可由鞘氨醇，也可由甘油等衍生，但在自然界分布最广，迄今研究得最多的是鞘糖脂（见鞘脂）。

复合糖的不对称：糖脂和糖蛋白只分布于细胞的外表面。

2．Domain of protein:蛋白质的结构域，结构域（Structural Domain）是介于二级和三级结构之间的另一种结构层次，结构域通常都是几个超二级结构单元的组合。

3. UDP—glucose:尿苷二磷酸葡萄糖可看作“活性葡萄糖”，在体内充作葡萄糖供体。最后在糖原合酶（glycogen synthase）作用下，UDPG的葡萄糖基转移给糖原引（primer）的糖链末端，形成α-1,4糖苷键。

4. Okazaki fragments:Okazaki认为3′→5′走向的DNA链的合成是不连续的，是由许多5′→3′方向合成的DNA片段连接起来的，这些不连续的DNA片段称为冈崎片段（Okazaki fragment）。

5. homopolysaccharide:同多糖水解时只产生一种单糖或单糖衍生物，如糖原、淀粉、壳多糖等。

6.Glycerophospholipids and Sphingolipids:即甘油磷脂和鞘脂类，它们都属于磷脂。甘油鞘脂类和鞘脂类含鞘氨醇磷脂和鞘糖脂。

7. codon：密码子定义：mRNA分子中每相邻的三个核苷酸编成一组，在蛋白质合成时，代表某一种氨基酸，称为密码子。特点：

①. 密码子具有通用性：不同的生物密码子基本相同，即共用一套密码子。

②. 密码子不重叠：两个密码子见没有标点符号，读码必须按照一定的读码框架，从正确的起点开始，一个不漏地一直读到终止信号。

③. 密码子具有简并性：大多数的氨基酸都可以具有几组不同的密码子

④. 密码子阅读与翻译具有一定的方向性：从5'端到3'端.

8.fatty acid:脂肪酸是指一端含有一个羧基的长的脂肪族碳氢链，是有机物，通式

是C(n)H(2n+1)COOH，低级的脂肪酸是无色液体，有刺激气味，高级的脂肪酸是蜡状固体。脂肪酸是最简单的一种脂，它是许多更复杂的脂的成分。

9. Substrate-level phosphorylation：底物水平磷酸化：ADP或某些其它的核苷-5′—二磷酸的磷酸化是通过来自一个非核苷酸底物的磷酰基的转移实现的。这种磷酸化与电子的转递链无关。

指在分解代谢过程中，底物因脱氢、脱水等作用而使能量在分子内部重新分布，形成高能磷酸化合物，然后将高能磷酸基团转移到ADP形成ATP的过程。例如在糖的分解代谢过程中，甘油醛-3-磷酸脱氢并磷酸化生成甘油酸-1，3-二磷酸，在分子中形成一个高能磷酸基团，在酶的催化下，甘油酸-1，3-二磷酸可将高能磷酸基团转给ADP，生成甘油酸-3-磷酸与ATP。

10. Pentose phosphate pathway：磷酸戊糖途径（pentose phosphate pathway）葡萄糖氧化分解的一种方式。由于此途径是由6-磷酸葡萄糖（G－6－P）开始，故亦称为己糖磷酸旁路。此途径在胞浆中进行，可分为两个阶段。第一阶段由G－6-P脱氢生成6-磷酸葡糖酸内酯开始，然后水解生成6-磷酸葡糖酸，再氧化脱羧生成5-磷酸核酮糖。NADP+是所有上述氧化反应中的电子受体。第二阶段是5-磷酸核酮糖经过一系列转酮基及转醛基反应，经过磷酸丁糖、磷酸戊糖及磷酸庚糖等中间代谢物最后生成3-磷酸甘油醛及6-磷酸果糖，后二者还可重新进入糖酵解途径而进行代谢。11. Homotropic and heterotropic regulatory enzymes 酶的同型调节和异型调节：

Substrate and modulator are identical酶的底物与调节酶是形态相同的；modulator is

a molecule other than the substrate底物和调节酶的分子结构等是不同的

12. Allosteric enzyme and allosteric effect别构酶和别构化作用。别构酶（alloste ric enzyme）一种其活性受到结合在活性部位以外部位的其它分子调节的酶，又称为变构酶，是一类重要的调节酶。在代谢反应中催化第一步反应的酶或交叉处反应的酶多为别构酶。别构酶均受代谢终产物的反馈抑制。

别构效应又称为变构效应，是寡聚蛋白与配基结合改变蛋白质的构象，导致蛋白质生物活性改变的现象.

别构效应（allosteric effect）某种不直接涉及蛋白质活性的物质，结合于蛋白质

活性部位以外的其他部位（别构部位），引起蛋白质分子的构象变化，而导致蛋白质

活性改变的现象。

14. tRNA and SnRNA：转移RNA是小RNA分子，能够在转译时，携带特定的氨基酸到正在加上氨基酸的多肽链（polypeptide chain）的ribosomal site上。tRNA能认得特定的密码子，有个能使氨基酸接附在其上的位置。借由反密码子使得每个tRNA能辨识的密码子均不同。（反密码子包含一段与mRNA上一段互补的序列）每个tRNA分子理论上只能与一种氨基酸接附，但是遗传密码有简并性（degenerate），使得有多于一个以上的tRNA可以跟一种氨基酸接附。和小核RNA：它参与真核生物细胞核中RNA的加工。snRNA和许多蛋白质结合在一起成为小核核糖核蛋白（snRNP即small nuclear ribonucleoproteins），参与信使RNA前体(pre-mRNA)的剪接，使后者成为成熟mRNA。

15. semi-conservative replication of DNA：DNA 半保留复制是：DNA 在进行复制的时候一其中的一条链为模板连开始复制，经过一系列酶（DNA聚合酶、解旋酶、

链接酶等）的作用复制出新的DNA双螺旋。子代DNA 其中的一条链式亲代DNA 保留下来的也就是说新合成的DNA 中一条链是新合成的另一条是亲代DNA留下来的。

16. Tm and Cot1/2 values

二、写出下列化合物的中文名称和化学结构

1. NAD﹢：烟酰胺腺嘌呤二核苷酸

2. cAMP: 环磷酸腺苷

3.UDP-glucose: 二磷酸尿苷葡萄糖

4.m6A ：N N

N

N

H

CH 3dR

N 6-Methyl-dA

N6-甲基腺嘌呤 5.NADP ﹢:

烟酰胺腺嘌呤二核苷磷酸

7. cGMP 环磷酸鸟苷

9. Citric acid：柠檬酸

10. Trp色氨酸 Tryptophan Trp W

三、填空题

1. 组成蛋白质的氨基酸，在远紫外区均有吸收，但在近紫外区只有酪氨酸、苯丙

氨酸和色氨酸有吸收光的能力。

2. 细胞色素氧化酶除含辅基外，还含，它也参与氧化还原。

3. 一个酶的分类编号为EC3.

4.2.1，它属于水解酶类类。

4. 糖酵解中最关键的调节酶是磷酸果糖激酶。

5. 磷酸化酶激酶是一种依赖 GTP 的蛋白激酶。

6. 线粒体内膜胞浆侧的膜电位比基质侧为负。

7. 异戊烯醇焦磷酸酯是合成一些重要生物活性化合物如等的活泼前体。

8. 当DNA复制时，一条链是连续的，另一条链是不连续的，称为不连续复制；复

制得到的子代分子，一条连来自亲代DNA，另一条链是新合成的，这种方式叫半保留复制。

9. 双链DNA分子中，一条链组成为：A-23%、C-18%、G-35%、T-24%，按Chargaff规则，

另一条链组成为：A- 24 %、C- 35 %、G- 18 %、T- 23 % 。

10. 大肠杆菌有三种DNA聚合酶，DNA聚合酶Ⅰ主要参与切除引物和修

复。DNA聚合酶Ⅱ仅参与修复。DNA聚合酶Ⅲ主要参与者复

制 .

四、是非判断题（对打“√”，错打“×”，说明理由)

（×） 1. 病毒是核酸和蛋白质的复合体，每一病毒都含有蛋白质、DNA和RNA （√） 2. 肽链合成时，延伸方向是从N端到C端

（√） 3．蛋白质是两性电解质，当溶液的pH在其等电点以上时，蛋白质带负电荷，而pH在其等电点以下时，带正电荷

（√） 4、凝集素是一类能和糖类相互作用的蛋白质

（×） 5．蛋白激酶对蛋白质磷酸化的部位除了Ser，Thr和Tyr外，还有His，Cys，Asp等

（√）6．磷酸化酶有A和B两种形式，其中A因为是磷酸化形式而没有活性

（√）7．维生素B1的化学名称为硫胺素，它的磷酸酯为脱羧辅酶

（√）8．辅酶与酶的结合比辅基与酶的结合更为紧

（×）9.典型哺乳动物细胞内的游离 Ca2+的离子浓度为细胞外的 1／100

（√）10．生物膜上蛋白质分布二侧不对称，但脂双层上脂的分布基本上是对称的（√）11．膜蛋白不溶于水，它们基本上不含α螺旋

（√）12．磷酸脂酶A2是指水解一分子磷脂生成2分子脂肪酸的一种水解酶

（×）13．已知mRNA的编码区不含修饰核苷酸

（×）14．基因表达的最终产物都是蛋白质

（√）15．用氯化铯梯度超离心纯化质粒DNA时，蛋白质在溶液的最上部，而RNA沉在底部

五、问答题

1. What are the proximity and orientation effects of enzyme?

邻近效应：指两个反应的分子，它们反应的基团需要互相靠近，才能反应。

定向效应: 指酶的催化基团与底物的反应基团之间的正确定向

2. What does the genetic central dogma mean?

描述从一个基因到相应蛋白质的信息流的途径。遗传信息贮存在DNA中，DNA被复制传给子代细胞，信息被拷贝或由DNA转录成RNA，然后RNA翻译成多肽。不过，由于逆转录酶的反应，也可以以RNA为模板合成DNA。

3. How to deduce the amino acid sequence of protein from DNA sequence?

1.隔离蛋白质的遗传密码

2.确定DNA序列

3.确定mRNA的序列

4.通过遗传密码确定AA的序列

4. Try to describe the major steps of Analysis of aa sequence in the polypeptide.

（1）肽链的拆开和分离与纯化

（2）末端分析：包括N端分析，C端分析

（3）肽链的氨基酸组成分析

（4）肽链的部分水解

（5）肽段的分离和氨基酸序列测定

（6）找重叠肽从而推断整个肽链的氨基酸序列

（7）二硫键位置的确定

5. What is the structural characteristics of RNA? RNA为单链结构，由A、U、G、C四种核糖核苷酸构成，分为mRNA，tRNA.rRNA三种，有的RNA按照碱基互补配对的原则构成局部双链

6. What is the configuration?构型（configuration）

一个有机分子中各个原子特有的固定的空间排列。比如：正·异·顺（Z）·反（E）·R·S·这

种排列不经过共价键的断裂和重新形成是不会改变的。构型的改变往往使分子的光学活性发生变

化。

区别于构象（conformation）

构型指在立体异构体中取代原子或基团在空间的取向。

7. What is the homopolysaccharide：同多糖由同一种单糖聚合而成，如淀粉、糖原、

纤维素等。

8. What is the mutarotation变旋现象是环状单糖或糖苷的比旋光度由于其α-和β-端

基差向异构体达到平衡而发生变化，最终达到一个稳定的平衡值的现象。变旋现象往

往能被某些酸或碱催化。

9. What is the saponification number or value，皂化反应。油脂按其化学性质可分

为皂化类油脂和不皂化类油脂两大类。都是从动植物体制备得来的，不溶于水而且密

度比水小的油脂，是一种复杂的有机化合物的混合物。油脂在化学成分上都是高级脂

肪酸和甘油所生成的酯，属于酯类，主要成分是脂肪，这类油脂与碱能发生作用，分

解成能溶于水的脂肪酸盐(肥皂)和甘油：(RCOO)3C3H5+3NaOH→3RCOON a+C3H5(OH3)这

种反应叫皂化反应，也叫皂化作用。

10. Do you know what configuration means in biochemistry?

11. How many types are there in the nucleic acid?

12. What is the structural characteristics of RNA?

13. Try to describe the major steps of Analysis of aa sequence in the polypeptide.

14. How to deduce the amino acid sequence of protein from DNA sequence?

15. What is hydrogen bond?

16. What does the genetic central dogma mean?

17. What is the conformation?

18. What function of nicotinamide ( vitamin B5 or vitamin PP )?

19.What are the proximity and orientation effects of enzyme?

20.举出两种蛋白质序列与其基因序列存在的不对应关系及其可能原因？