NCBI所有数据库简介
美国国家生物技术信息中心
(National Center of Biotechnology Information)
唐志立它的使命包括四项任务：
1. 建立关于分子生物学，生物化学，和遗传学知识的存储和分析的自动系统
2. 实行关于用于分析生物学重要分子和复合物的结构和功能的基于计算机的信息处理的，先进方法的研究
3. 加速生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。
山东师范大学
2016年4月10日星期日30则留学生经典笑话，英语不好伤不起！凭你在国内口语练得多么娴熟，去了国外，照样有犯痴呆傻的时候！
1、有次房东问我：did u eat anyting yet? 我说：no.
她听后重复了一遍：so u didn‘t eat anyting. 我说：yes.
房东老太太犹豫了下又问：did u eat? 我说：no.
她接着说：so u didn‘t eat. 我说：yes. 估计她当时要崩溃了……
2、刚上班不久，有个公司的A/R打电话来催支票，我循例问了一下他是哪间公司打来的，那男的很有礼貌的说：This is xxx calling from Beach Brother.
听懂了很开心，不过由于对公司名字还不熟，心想先用笔记下来公司名，省得等下忘记了，正得意忘形之间，顺嘴开始拼写人家公司的名字，还说得一本正经：b.i.t.c.h.bitch, correct? 那男的终于还是没能忍住怒火，近似于怒吼似的对我喊道：NO!
B.E.A.
C.H.BEACH! 接下来的一年里，没再跟这间公司有过任何生意往来……
3、我男朋友以前在温哥华乘skytrain 的时候，一个白人女人说：I am sorry. 他直接说：you are welcome. 对方都呆了。
4、第一次跟老外去打painball，玩的是抢旗的那种。由于第一次玩，一直跟着个看起来很专业的队友跑，一路上躲着子弹跑到对方的base. 我们人都挂了，对方就剩一个人在看老家，就听那老外跟我说了一大堆术语，我
也没听懂。他看我没听懂就跟我说：it‘s easy, just cover me when i go out. 说完了就喊了一声：cover me! 然后跑了出去，我也不懂他是让我掩护他，没等我想清楚他就跑了。我就顺手从一个箱子上扯下来一块帆布，丢他头上，把他盖住了，结果他就光荣牺牲了。当时大部分人都挂了，在旁边观战，所有人都笑趴了。
5、上次不知道是什么事情把我惹怒了，情急之下我本来要说：FUCK YOU! 但是却说成FUCK ME! 那老外开始愣了一下，后来他说：u wanna say fuck me? OR fuck you? 晕，我连吵架的气势都没了。
6、一个好朋友刚来加拿大，有一天口渴了想喝可乐。去到便利店很大声的说EXCUSE ME, DO YOU HAVE COKE? 可是我朋友刚出国，英文尚有很重的口音，好端端的COKE让她说出来，
就变成了EXCUSE ME, DO YOU HAVE COCK? 店主听得一惊一乍的，连连说：WHAT? WHAT? 最后店主终于弄明白她想要喝可乐，钱货两清之后，见我朋友多半是初来乍到，还很好心的给我朋友说，以后去买可乐不能再问别人有没有COCK了，那样很让人误会！本来我朋友完全不知道发生了什么事，可是店主解释以后恨不得立刻找个地缝钻进去！后来很长一段时间都不喝可乐了！
7、刚来的时候有一次跟一个兄弟去吃饭，那大哥吃饱以后指着满桌剩下的碟子一边划圈一边问服务生how much, all this, how much? 服务生五官扭曲的看着他。我最后实在忍不住了，告服务生说他想买单，结果服务生走以后他还不爽，说人服务生就快明白了，我打什么岔。
8、刚来的时候看到很多大厦门口都有
smoke free. 我由衷的感叹：加拿大就
是好，抽烟都免费。朋友那个汗……9、还有一次是去MC，问朋友圣代的
英文怎么说，他就说是音译sundae，我茅塞顿开，恍然大悟，十分自信的说了一句：那奶昔是不是叫nancy? 朋友当场喷可乐！
10、第一次打电话叫TAXI，对方问where you from? 我回答CHINA，还在奇怪叫taxi还分国籍？对方可能以为我在搞笑，很郁闷的说sorry, we can not do that.我一听火大，怎么有种族歧视啊。就问why? 对方楞了半天，挂了。
11、有一天去kfc, 要土豆泥，不会说，就在那里跟cashier苦喊potato sauce，她以为我sb呢，然后，丫给我了7、8袋ketchup，被鄙视了。
12、在加拿大帮老外拔火罐，但是罐很容易掉，我的英语不好，我解释说you have too much fur. 他听了之后大笑it is hair, not fur, fur is for animal. 我也大笑了起来。
13、我朋友刚来的时候不认识什么人，所以在班上试图交朋友。一日，觉得一白人哥们人挺好，于是想要人家电话号码，日后做朋友，于是问：HOW MANY IS YOU PHONE NUMBER? 白人说：TEN. (加拿大号码是十位的) 14、刚来的时候，去BURGER KING 去吃饭，点完汉堡，人家问我要酱不？我说要。人家问哪种？我忘了番茄酱咋说了，想了半天，想出了个JAM，人家还听不懂，最后一赌气说，IT‘S UP TO YOU.
15、刚来加拿大的时候去酒吧玩，而且还带了一个美美去的。她在国外呆
了很一段时间，我看她很吊的样子，于是我就装的很帅，走过去打算请她喝酒。于是我问她喝什么酒，她说sex ON THE beach. 但是当时很吵，我也压根不知道酒吧里都啥酒名，听成son of bitch. 当时我也愣了下，然后吧台很性感的bartender已经在等我叫酒，我回头大声地喊can i have a son of bitch? 接下来，我不想再回忆……
16、有次买车票，工作人员问我one way? 我回答：No, two way. 他又问了我几遍，我的答案还是一样的。结果那人很郁闷的看着我，后来才反应过来自己还在中文的思维中，我把他的意思解释为One way=一位？我们是两个人，所以two way=两位。
17、第一次去唐人街吃粥，当时服务员都讲广东话，我叫了个果子（油条）和一碗粥。不久服务员就端了杯桔子汁，我以为送的，什么都没说，粥都
喝完了，油条还没来。准备结帐时，和服务员抱怨没吃到果子。服务员说：你的―果汁‖不是喝了么？
18、我的一个朋友说，当时他一个不懂英文的朋友刚来多伦多，自己一个人出去了，迷路了然后打电话给他，他说没关系，你把你现在呆的地方路名拼给我听，他朋友一个字母一个字母地拼出来了‖S-T-O-P‖，我那朋友当场就乐傻啦！
19、刚来上发现老外都喜欢用铅笔，所以去book store跟风买铅笔和橡皮。找不到橡皮就问do you have ruber? 人家笑笑说让我去phamacy买，郁闷，为什么去药店买橡皮？去了药店问do you hv ruber? 人家笑笑拿给我一盒避孕套，我倒！原来加拿大管橡皮叫eraser！
20、刚来的时候，经常说you too. 结
果我生日那天我的homestay mom买了个生日蛋糕给我，还跟我说happy birthday. 结果我很快的就来了句you too.
21、刚来加拿大的时候去买快餐，英文很烂我就说i want combo one. 后来那个人又说了一大堆英文问我要洋葱cheese么之类的？我听不懂就一个劲说i want combo one. 后来我看见那个人像中国人，我就直接问他Can you spell Chinese? 然后那个人郁闷了好久我为啥问他能不能拼chinese. 后来才发现是speak不是spell，丢脸！
22、一同学第一次去吃McDonald，结果进去后一紧张，大声说了句i want to this han baobao. 边说边指，对方一时不知所措，我那同学又重复了n遍。
23、有个朋友来加拿大第一次去吃牛排，服务员问How would you like your
steak done? 我朋友没听懂，就听别人点的时候说medium, 他就想能不能跟他们学。他就跟服务员说large please. 服务员一愣，说sorry we don‘t have that. 然后他又说small please. 服务员又吓了一跳，说sorry we don‘t have that. 他身边的朋友着急了，告诉他，人家问你牛排要几分熟？他随口就说80%。服务员又一愣，说sorry we don‘t have that.
24、我陪朋友去买车，当天逛了很多车行，留的电话全是我的。大家都知道，车行啊、餐馆啊打电话给客户的时候，都是以超级快的速度说了一大串东西，刚闯加拿大的我怎么听得清楚啊！某日，电话铃响，看电话号码好像BMW打来的，愉快接听。
–Hello ·#￥%……—*#￥%, It is a great day. @#$%^
–Hello, is it BMW?
对方停顿两秒，声音低两度，估计暴
汗。
–No. It‘s Toyota and Lexus.
这个估计和在麦当劳柜台问肯德基在哪儿差不多。
25、我妈一天晚上从超市回来开车，天黑了，倒车的时候，突然喊了句：―妈呀，前面的车无人驾驶啊。‖我楞了，仔细一看，是个小黑在开车。
26、跟我爸妈去超市，看见一个好像南美洲的人，我爸说，―你看人家买东西，不看价，啥都要，都往小车里拿。‖后来我才明白，那是超市理货员，人家是把不该放那的东西拿走。
27、有个ESL的女老师，在白板上写字，我冲她的背影大叫excuse me, sir. 她转过来说i need to consider which washroom i should go.
28、刚来的时候去麦当劳吃饭，没有
餐巾，然后跟人说要paper，那人过会给我拿来了张白纸，还问do you need a pen? 我狂晕了半天，然后去厕所洗手的。
29、跑到M记买面包，之前表现很是不错，一直维持到服务员问here or to go? 第一次接触外带餐这词，还好思维敏捷马上明白过来了，可是嘴上紧张，对着那男服务员直接喊出Let‘s go! 服务员石化1秒后，说了句K。
30、我一朋友，中午去吃汉堡，厨子问他要加什么，他说：tomato, cheese, and washroom (mushroom). 当时所有人流汗到地。
thank you 和sorry在英语口语中使用频率很高，它们的答语有些是相同的，有些却只能用于其中的一种情况。现简述如下：
1）两种情况均可使用的应答语：
（1）Not at all. 不用谢。/没关系。
（2）That's all right. 不用谢。/没关系。
（3）That's OK. 不用谢。/没关系。
（4）It's nothing. 没什么。/没关系。
（5）Don't mention it. 不要客气。
（6）Forget it. 忘掉它。
（7）No problem. 没问题。
2）只能用于thank you 的答语：
（1）It's a pleasure. 不用谢。
（2）You are welcome. 别客气。
（3）My pleasure. 我很乐意。
3）只能用于sorry的答语：
（1）It doesn't matter. 没关系。如：
— I'm sorry I'm late. 对不起，我迟到了。
— It doesn't matter. 没关系。
（2）Never mind. 没关系。如：
—I'm sorry I can't help you. 对不起，我不能帮你了。
— Never mind. 没关系。
留学生经典语录~半夜两点成功笑抽~英语不好的要好好看了。
1.有次房东问我did u eat anyting yet? 我说no.
她听后重复了一遍so u didn‘t eat anyting. 我说yes...
房东老太太犹豫了下
又问did u eat ？
我说no. 她接着说so u didn‘t eat .
我说yes ......
估计她当时要崩溃了
2.刚上班不久，有个公司的A/R打电话来催支票，我循例问了一下他是哪间公司打来的，那男的很有礼貌的说：―This is xxx calling from Beach Brother." 听懂了很开心，不过由于对公司名字还不熟，心想先用笔记下来公司名，省得等下忘记了，正得意忘形之间，顺嘴开始拼写人家公司的名字，还说得一本正经："b.i.t.c.h......bitch, correct?"。。。。。那男的终于还是没能忍住怒火，近似于怒吼似的对我喊道："NO!!!
B.E.A.
C.H.....BEACH!!!!!!"
接下来的一年里，没再跟这间公司又过任何生意往来......汗
5.我男朋友以前在温哥华乘skytrain的时候，一个白人女人说：I am sorry. 他直接说: you are welcome. 对方都呆了。
7.第一次跟老外去打painball，玩的是抢旗的那种。由于第一次玩，一直跟着个看起来很专业的队友跑，
一路上躲着子弹跑到对方的base. 我们人都挂了，对方就剩一个人在看老家。
就听那老外跟我说了一大堆术语，我也没听懂。他看我没听懂就跟我说：it‘s easy just cover me when i go out. 说完了就喊了一声cover me! 然后跑了出去，
我也不懂他是让我掩护他，没等我想清楚他就跑了。
我就顺手从一个箱子上扯下来一块帆布，丢他头上，把他盖住了。结果他就光荣牺牲了。当时大部分人都挂了，在旁边观战。所有人都笑趴了。
9.上次不知道是什么事情把我惹怒了,情急之下我本来要说: FUCK YOU!! 但是却说成FUCK ME!!! 那来外开始愣了一下, 后来他说: u wanna say fuck me ?? OR fuck you?? 晕...我连吵架的气势都没了.
11.一个好朋友刚来加拿大，有一天口渴了想喝可乐。去到便利店很大声的说EXCUSE ME, DO YOU HAVE COKE? 可是我朋友刚出国，英文尚有很重的口音，好端端的COKE 让她说出来就变成了EXCUSE ME, DO YOU HAVE COCK？
店主听得一惊一乍的，连连说：WHAT??? WHAT ? 最后店主终于弄明白她想要喝可乐，钱货两清之后，见我朋友多半是初来乍到，还很好心的给我朋友说以后去买可乐不能再问别人有没有COCK了，那样很让人误会！本来我朋友完全不知道发生了什么事，可是店主解释以后恨不得立刻找个地缝钻进去！后来很长一段时间都不喝可乐了！
12.剛來的時候有一次跟一個兄弟去吃饭，那大哥吃飽以後指著滿桌剩下的碟子一邊劃圈一邊問服務生how much, all this, how much？服務生五官扭曲的看著他。。。。。我最後實在忍不住了，告服務生說他想買單，結果服務生走以後他還不爽，說人服務生就快明白了我打什麼岔。。。
15.刚来的时候看到很多大厦门口都有smoke free..... 我由衷的感叹..加拿大就是好,抽烟都免费...朋友那个汗......
16.还有一次是去MC, 问朋友
圣代
的英文怎么说, 他就说是音译sundae, 我茅塞顿开, 恍然大悟,十分自信的说了一句....那奶昔
是不是叫nancy ???? 朋友当场喷可乐.........
18.第一次打电话叫TAXI......
对方问where you from.....我回答CHINA,还在奇怪叫taxi还分国籍~?对方可能以为我在搞笑,很郁闷的说sorry, we can not do that.....我一听...火大...怎么有种族歧视啊..就问: why~?对方楞了半天,挂了.....
22.有一天去kfc, 要土豆泥，不会说，就在那里根cashier苦喊potato sauce,
她以为我sb呢，
然后，丫给我了7,8带ketchup........
被鄙视了~~~~~
23.在加拿大帮老外拔火罐,但是罐很容易掉，我的英语不好，我解释说you have too much fur.他听了之后大笑
：it is hair ,not fur, fur is for animal.我也大笑了起来。
26.我朋友刚来的时候不认识什么人, 所以在班上试图交朋友, 一日, 觉得一白人哥们人挺好,
于是想要人家电话号码,日后做朋友, 于是问:HOW MANY IS YOU PHONE NUMBER? 白人说:TEN. (加拿大号码是十位的)
28.刚来的时候，去BURGER KING去吃饭，点完汉堡，人家问我要酱不，我说要，人家问，哪种？我忘了番茄酱咋说了，想了半天，想出了个JAM，人家还听不懂，最后一赌气说，IT‘S UP TO YOU.
30.刚来加拿大的时候去酒吧玩。。而且还带了一个美美去的，她在国外呆了很一段时间。。。我看她很吊的样子，于是我就装的很帅，
走过去打算请她喝酒，
于是我问她，喝什么酒，她说。。sex ON THE beach...但是当时很吵，我也压根不知道酒吧里都啥酒名，听成son of bitch...当时我也愣了下，
然后吧台很性感的bartender已经在等我叫酒，我回头大声地喊，can i have a son of bitch....... 接下来。。我不想再回忆
33.有次买车票,工作人员问我one way? 我回答：No,two way....他又问了我几遍我的答案还是一样的。。。结果那人很郁闷的看着我~~~后来才反应过来自己还在中文的思维中~~~我把他的意思解释为One way=一位？
我们是两个人，所以two way=两位
34.第一次去唐人街吃粥，当时服务员都讲广东话。我
叫了个果子（油条）和一碗粥。不久服务员就端了杯桔子汁，我以为送的，
什么都没说，
粥都喝完了，油条还没来。准备结帐时和服务员抱怨没吃到果子。
服务员说：你的‖果汁" 不是喝了么？
36.我的一个朋友说，当时他一个不懂英文的朋友刚来多伦多，自己一个人出去了，迷路了然后打电话给他，他说没关系你把你现在呆的地方路名拼给我听，他朋友一个字母一个字母地拼出来了―S ---T--O--P",我那朋友当场就乐傻啦！
37.刚来上发现老外都喜欢用铅笔，所以去book store跟风买铅笔和橡皮。找不到橡皮就问do you have ruber. 人家笑笑说让我去phamacy买。郁闷。。。为什么去药店买橡皮，去了药店问do you hv ruber.人家笑笑拿给我一盒避孕套。我倒~~！！原来加拿大管橡皮叫eraser
38.刚来的时候经常说you too....结果我生日那天我的homestay mom 买了个生日蛋糕给我，还跟我说happy birthday...结果我很快的就来了句you too...
39.还有刚来加拿大的时候去买快餐，英文很烂我就说i want combo one,后来那个人又说了一大堆英文问我要洋葱cheese么之类的？我听不懂就一个劲说i want combo one,后来我看见那个人像中国人，我就直接问他Can you spell Chinese? 然后那个人郁闷了好久我为啥问他能能拼chinese..后来才发现是speak不是spell............丢脸
40.想起来一个是一同学第一次去吃McDonald
结果进去后一紧张，大声说了句:i want to this han baobao，边说边指
对方一时不知所措，我那同学又重复了n遍...
42.有个朋友来加拿大第一次去吃牛排，服务员问How would you like your steak done? 我朋友没听懂，就听别人点的时候说medium , 他就想―我不能跟他们学‖。
他就跟服务员说，large please.
服务员一愣，说sorry we don‘t have that. 然后他又说，small please.
服务员又吓了一跳，说sorry wedon‘t have t hat.
他身边的朋友着急了，告诉他，人家问你牛排要几分熟。、他随口就说，80% 。服务员又一愣说，sorry we don‘t have that......
......
48.我陪朋友去买车，当天逛了很多车行，留的电话全是我的
大家都知道，车行啊餐馆啊打电话给客户的时候都是以超级快的速度说了一大串东西，刚闯加拿大的我怎么听得清楚啊
某日，电话铃响，看电话号码是好像BMW打来的，愉快接听。
-- Hello ·#￥%……—*#￥%, It is a great day. @#$%^
--Hello, is it BMW?
对方停顿两秒，声音低两度（估计暴汗）
--No. It‘s Toyota and Lexus
。。。。。
这个估计和在麦当劳柜台问肯德基在哪儿差不多
49.还一个我妈的。。。我妈一天晚上从超市回来开车，天黑了，倒车的时候，突然喊了句。。。―妈呀，前面的车无人驾驶啊。。‖我楞了，仔细一看。。。是个小黑在开车。。。
还有我爸一个，跟我爸妈去超市，看见一个好像南美洲的人，我爸说，―你看人家买东西，不看价，啥都要，都往小车里拿。。。。‖后来我才明白，那是超市理货员，人家是把不该放那的东西拿走。。。
NCBI分子数据库介绍
NCBI分子数据库介绍 信息来源：中国生命科学论坛更新时间：2003-10-12 2:33:00 核酸序列(nucleotides) ·Entrez核酸- 用accession number,作者姓名，物种，基因/蛋白名字，以及很多其它的文本术语来搜索核酸序列记录（在GenBank + PDB中）。更多的关于Entrez的信息见下。如果要检索大量数据，也可使用Batch Entrez （批量Entrez）。 ·RefSeq - NCBI数据库的参考序列。校正的，非冗余集合，包括基因组DNA contigs，已知基因的mRNAs和蛋白，在将来，整个的染色体。Accession numbers用NT_xxxxxx, NM_xxxxxx, NP_xxxxxx, 和NC_xxxxxx的形式来表示。 ·dbEST - 表达序列标签数据库，短的、单次（测序）阅读的cDNA序列。也包括来自于差异显示和RACE实验的cDNA序列。 ·dbGSS -基因组调查序列的数据库，短的、单次（测序）阅读的cDNA序列，exon trap获得的序列，cosmid/BAC/YAC 末端，及其他。 ·dbSTS -序列标签位点的数据库，短的在基因组上可以被唯一操作的序列，用于产生作图位点。 ·dbSNP - 单核苷酸多态性数据库，包括SNPs，小范围的插入/缺失，多态重复单元，和微卫星变异。 完整的基因组 ·参见Genome 和Maps 部分，包括各种物种资源，人，小鼠，大鼠，酵母，线虫，疟原虫，细菌，病毒，viroids，质粒。 ·UniGene - 被整理成簇的EST和全长mRNA 序列，每一个代表一种特定已知的或假设的人类基因，有定位图和表达信息以及同其它资源的交叉参考。序列数据可以以cluster 形式在Unigene 网页下载，完整的数据可以从FTP站点repository/UniGene 目录下下载。 1.奶牛UniGene 2.人类UniGene 3.小鼠UniGene 4.大鼠UniGene 5.斑马鱼UniGene ·BLAST - 将你的序列同核酸库中的的序列比较，检索相似的序列。（更详细的信息见下面Tools/Sequence 相似搜索部分） 蛋白序列(proteins) · Entrez蛋白-用accession number,作者姓名，物种，基因/蛋白名字，以及很多其它的文本术语来搜索蛋白序列记录（在GenPept + Swiss-Prot + PIR + RPF + PDB中）。更多的关于Entrez的信息见下。如果要检索大量数据，也可使用Batch Entrez（批量Entrez）。
一步一步教你使用NCBI数据库资源
一步一步教你使用NCBI数据库资源 随着ncbi数据库各种资源的涌现，NCBI已经成为科研工作者必不可少的资料查找，数据分析的工具。那么NCBI 数据如何使用，新手入门一步一步教你认识和使用NCBI数据库。 一综合数据库 NCBI数据库集美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information)，即我们所熟知的NCBI 是由美国国立卫生研究院(NIH)于1988年创办。创办NCBI 的初衷是为了给分子生物学家提供一个信息储存和处理的 系统。除了建有GenBank核酸序列数据库(该数据库的数据资源来自全球几大DNA数据库，其中包括日本DNA数据库DDBJ、欧洲分子生物学实验室数据库EMBL以及其它几个知名科研机构)之外，NCBI还可以提供众多功能强大的数据检索与分析工具。目前，NCBI提供的资源有Entrez、Entrez Programming Utilities、My NCBI、PubMed、PubMed Central、Entrez Gene、NCBI Taxonomy Browser、BLAST、BLAST Link (BLink)、Electronic PCR等共计36种功能，而且都可以在NCBI的主页https://www.360docs.net/doc/f710131753.html,上找到相应链接，其中多
半是由BLAST功能发展而来的。 1 NCBI最新进展 1.1 PubMed搜索功能的增强 去年，NCBI对PubMed进行了几项改进工作，改动最大的是搜索界面和摘要浏览界面。其中，搜索界面中新增了“Advanced Search”选项(这实际上是对以往“Limits”和“Preview/Index”功能的整合)，并且增加了一个新的窗口，用户可以在此窗口下通过“论文作者名”、“论文所属杂志名称”、“论文出版日期”等限定条件进行搜索。而且，“论文作者名”和“论文所属杂志名称”还设有文本框自动填充功能。现在，在PubMed数据库中进行文本搜索的同时还可以立即通过两个“内容传感器(content sensors)”进行分析。一个“内容传感器”是根据作者姓名、所属杂志名称或杂志名缩写、出版日期、卷号或刊号等信息进行分析，然后将符合条件的搜索结果排列到结果列表的顶端。另一个“内容传感器”是根据文章是否与用户给出的条件，例如是否与某种药物相关，在NCBI的新增数据库PubMed Clinical Q&A 中进行搜索，然后给出搜索结果。
NCBI_功能详细介绍[1]
GenBank Overview 基本信息 ?什么是GenBank？GenBank是一个有来自于70,000多种生物的核苷酸序列的数据库。每条纪录都有编码区（CDS）特征的注释，还包括氨基酸的翻译。GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织，包括EMBL和DDBJ。 ?纪录样本- 关于GenBank的各个字段的详细描述，以及同Entrez搜索字段的交叉索引。 ?访问GenBank - 通过Entrez Nucleotides来查询。用accession number，作者姓名，物种，基因/蛋白名字，还有许多其他的文本术语来查询。关于Entrez更多的信息请看下文。用BLAST来在GenBank和其他数据库中进行序列相似搜索。用E-mail来访问Entrez和BLAST可以通过Query 和BLAST服务器。另外一种选择是可以用FTP下载整个的GenBank和更新数据。 ?增长统计- 参见公布通知的2.2.6（每个分类的统计），2.2.7（每个物种的统计），2.2.8（GenBank 增长）小节。 ?公布通知，最新- 最近和即将有的变化，GenBank的分类，数据增长统计，GenBank的引用。 ?公布通知，旧- 同上相同，是过去公布的统计。 ?遗传密码- 15个遗传密码的概要。用来确保GenBank中纪录的编码序列被正确的翻译。（向）GenBank提交（数据） ?关于提交序列数据，收到accession number，和对纪录作更新的一般信息。 ?BankIt - 用于一条或者少数条提交的基于WWW的提交工具软件。（请在提交前用VecScreen去除载体） ?Sequin - 提交软件程序，用于一条或者很多条的提交，长序列，完整基因组，alignments，人群/种系/突变研究的提交。可以独立使用，或者用基于TCP/IP的“network aware”模式，可以链接到其他NCBI的资源和软件比如Entrez和PowerBLAST。（请在提交前用VecScreen去除载体）?ESTs - 表达序列标签，短的、单次（测序）阅读的cDNA序列。也包括来自于差异显示和RACE 实验的cDNA序列。 ?GSSs - 基因组调查序列，短的、单次（测序）阅读的cDNA序列，exon trap获得的序列，cosmid/BAC/YAC末端，及其他。 ?HTGs - 来自于大规模测序中心的高通量基因组序列，未完成的（阶段0，1，2）和完成的（阶段3）序列。（注意：完成的人类的HTG序列可以同时在GenBank和Human Genome Sequencing页面上访问。） ?STSs - 序列标签位点。短的在基因组上可以被唯一操作的序列，用于产生作图位点。 ?注：SNPs - 人类的和其他物种的遗传变异数据可以提交到NCBI数据库的单核苷酸多态性库中（dbSNP）。 国际核苷酸序列数据库合作组织 ?GenBank，DDBJ，EMBL - 合作计划的概述，并链接到相应的主页。GenBank，DDBJ（DNA Data Bank of Japan），and EMBL （European Molecular Biology Laboratory）数据库共享的数据是每天都交换的，因此他们是相等的。数据纪录的格式和搜索方式可能会不一样，但是accession number，序列数据和注解都是一模一样的。即，你可以用accession number U12345在GenBank，DDBJ或EMBL中查找相应纪录，得到的结果是完全一样的序列数据，参考内容等等。 ?DDBJ/EMBJ/GenBank特性表—特性表格式和标准被合作数据库用在序列记录的注释上，使得数据共享成为可能，包括详细的描述生物特性和特性限定语的附录，以及IUPAC规定的核苷酸和氨基酸的代号。
教你如何使用NCBI
一步一步教你使用NCBI 查找DNA、mRNA、cDNA、Protein、promoter、引物设计、BLAST序列比对等 作者：urbest 2007-8-1 苏州大学生命科学学院
最近看到很多战友在论坛上询问如何查询基因序列、如何进行引物设计、如何使用BLAST进行序列比对……，这些问题在NCBI上都可以方便的找到答案。现在我就结合我自己使用NCBI的一些经历（经验）跟大家交流一下BCBI的使用。希望大家都能发表自己的使用心得，让我们共同进步！ 我分以下几个部分说一下NCBI的使用： Part one 如何查找基因序列、mRNA、Promoter Part two 如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列 Part three 运用STS查找已经公布的引物序列 Part four 如何运用BLAST进行序列比对、检验引物特异性 特别感谢本版版主，将这个帖子置顶！ 从发帖到现在，很多战友对该帖给与了积极的关注，在此向给我投票的（以及想给我投票却暂时不能投票的）各位战友表示真诚的感谢，谢谢各位战友！ 请大家对以下我发表的内容提出自己的意见。关于NCBI其他方面的使用也请水平较高的战友给予补充 First of all，还是让我们从查找基因序列开始。 第一部分 利用Map viewer查找基因序列、mRNA序列、 启动子（Promoter） 下面以人的IL6（白细胞介素6）为例讲述一下具体的操作步骤 1．打开Map viewer页面，网址为：https://www.360docs.net/doc/f710131753.html,/mapview/index.html 在search的下拉菜单里选择物种，for后面填写你的目的基因。操作完毕如图所示： 2．点击“GO”出现如下页面：
怎么使用NCBI[1]
怎么使用NCBI (National Center for Biotechnology Information), 美国国家生物技术信息中心 [url]https://www.360docs.net/doc/f710131753.html,/[/url] NCBI是NIH的国立医学图书馆（NLM）的一个分支。 NCBI提供检索的服务包括： 1．GenBank（NIH遗传序列数据库）：一个可以公开获得所有的DNA序列的注释过的收集。GenBank是由NCBI受过分子生物学高级训练的工作人员通过来自各个实验室递交的序列和同国际核酸序列数据库（EMBL和DDBJ）交换数据建立起数据库的。它同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。这三个组织每天交换数据。其中的数据以指数形式增长，最近的数据为它已经有来自47000个物种的30亿个碱基。 2．Molecular Databases（分子数据库）： Nucleotide Sequence（核酸序列库）：从NCBI其他如Genbank数据库中收集整理核酸序列，提供直接的检索。 Protein Sequence （蛋白质序列库）：与核酸类似，也是从NCBI多个不同资源中编译整理的，方便研究者的直接查询。 Structure（结构）-——关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划，另外也可以访问三维蛋白质结构的分子模型数据库（MMDB）和用来搜索和显示结构的相关工具。MMDB：分子模型数据库—一个关于三维生物分子结构的数据库，结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。 Taxonomy（分类学）——NCBI的分类数据库，包括大于7万余个物种的名字和种系，这些物种都至少在遗传数据库中有一条核酸或蛋白序列。其目的是为序列数据库建立一个一致的种系发生分类学。 3．Literature Databases（文献数据库） （1）PubMed是NLM提供的一项服务，能够对MEDLINE上超过1200万条的上世纪六十年代中期至今的杂志引用和其他的生命科学期刊进行访问，并可以连接到参与的出版商网络站点的全文文章和其他相关资源。 （2）PMC/PubMed Center：也是NLM的生命科学期刊文献的数字化存储数据库，用户可以免费获取PMC的文章全文，除了部分期刊要求对近期的文章付费。 （3）OMIM（孟德尔人类遗传）：有关人类基因和无序基因的目录数据库由Victor A.McKusick 和他的同事共同创造和编辑的，由NCBI网站负责开发，其中也包括对MEDINE众多资源和Entrez系统的序列记录，以及NCBI中其他有关资源的链接。
NCBI数据库集
NCBI数据库集 生物信息学 2010-08-20 16:08:59 阅读202 评论0字号：大中小订阅 NCBI数据库集 https://www.360docs.net/doc/f710131753.html,/?p=20049 一综合数据库 NCBI数据库集 美国国立生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information），即我们所熟知的NCBI是由美国国立卫生研究院（NIH）于1988年创办。创办NCBI的初衷是为了给分子生物学家提供一个信息储存和处理的系统。除了建有GenBank核酸序列数据库（该数据库的数据资源来自全球几大DNA数据库，其中包括日本DNA数据库DDBJ、欧洲分子生物学实验室数据库EMBL以及其它几个知名科研机构）之外，NCBI还可以提供众多功能强大的数据检索与分析工具。目前，NCBI提供的资源有Entrez、Entrez Programming Utilities、My NCBI、PubMed、PubMed Central、Entrez Gene、NCBI Taxonomy Browser、BLAST、BLAST Link (BLink)、Electronic PCR等共计36种功能，而且都可以在NCBI的主页https://www.360docs.net/doc/f710131753.html,上找到相应链接，其中多半是由BLAST功能发展而来的。 1 NCBI最新进展 1.1 PubMed搜索功能的增强 去年，NCBI对PubMed进行了几项改进工作，改动最大的是搜索界面和摘要浏览界面。其中，搜索界面中新增了“Advanced Search”选项（这实际上是对以往“Limits”和“Preview/Index”功能的整合），并且增加了一个新的窗口，用户可以在此窗口下通过“论文作者名”、“论文所属杂志名称”、“论文出版日期”等限定条件进行搜索。而且，“论文作者名”和“论文所属杂志名称”还设有文本框自动填充功能。现在，在PubMed数据库中进行文本搜索的同时还可以立即通过两个“内容传感器（content sensors）”进行分析。一个“内容传感器”是根据作者姓名、所属杂志名称或杂志名缩写、出版日期、卷号或刊号等信息进行分析，
NCBI所有数据库简介
美国国家生物技术信息中心 (National Center of Biotechnology Information) 唐志立它的使命包括四项任务： 1. 建立关于分子生物学，生物化学，和遗传学知识的存储和分析的自动系统 2. 实行关于用于分析生物学重要分子和复合物的结构和功能的基于计算机的信息处理的，先进方法的研究 3. 加速生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。
山东师范大学 2016年4月10日星期日30则留学生经典笑话，英语不好伤不起！凭你在国内口语练得多么娴熟，去了国外，照样有犯痴呆傻的时候！ 1、有次房东问我：did u eat anyting yet? 我说：no. 她听后重复了一遍：so u didn‘t eat anyting. 我说：yes. 房东老太太犹豫了下又问：did u eat? 我说：no. 她接着说：so u didn‘t eat. 我说：yes. 估计她当时要崩溃了…… 2、刚上班不久，有个公司的A/R打电话来催支票，我循例问了一下他是哪间公司打来的，那男的很有礼貌的说：This is xxx calling from Beach Brother.
听懂了很开心，不过由于对公司名字还不熟，心想先用笔记下来公司名，省得等下忘记了，正得意忘形之间，顺嘴开始拼写人家公司的名字，还说得一本正经：b.i.t.c.h.bitch, correct? 那男的终于还是没能忍住怒火，近似于怒吼似的对我喊道：NO! B.E.A. C.H.BEACH! 接下来的一年里，没再跟这间公司有过任何生意往来…… 3、我男朋友以前在温哥华乘skytrain 的时候，一个白人女人说：I am sorry. 他直接说：you are welcome. 对方都呆了。 4、第一次跟老外去打painball，玩的是抢旗的那种。由于第一次玩，一直跟着个看起来很专业的队友跑，一路上躲着子弹跑到对方的base. 我们人都挂了，对方就剩一个人在看老家，就听那老外跟我说了一大堆术语，我
如何在ncbi上检索
如何在ncbi上检索NCBI包括五个部分，第一部分是欢迎进入NCBI，包括NCBI的最新信息、计划与活动、读者来信、服务地址和用户评论等。第二部分是基因序列数据库(GenBank)，包括基因库概述、检索与投稿。第三部分是数据库服务，包括免费的PubMed检索、Entrez 检索、BLAST序列族性检索、电子邮件服务(详见本章第四节)、匿名FTP服务。第四部分是NCBI的其它资源。GenBank的检索在NCBI主页的第二部分点击"Searching GenBank"，即可进入GenBank的检索屏幕。NCBI?提供了五种检索，即Entrez浏览检索、BLAST序列类似性检索、dbEST检索、dbSTS?检索和文本检索(Text Searching)。一、Entrez浏览检索1.Entrez检索的数据库及其检索信息Entrez浏览器(Entrez Browser)可以检索以下与NCBI?链接的基因序列数据库的分子生物数据和书目文献资料。???? (1) GenBank、EMBL、DDBJ中的DNA序列; ???? (2) SWISS-PROT、PIR、PRF、PDB中的蛋白质序列以及DNA序列数据库中翻译的蛋白质序列; ???? (3) 基因和染色体图像数据; ???? (4) PDB以及收入NCBI分子模型数据库(MMDB)的蛋白质三维结构; ???? (5) 通过PubMed检索Medline和PreMedline数据库。???? 2.Entrez检索功能???? Entrez提供了以下三种检索功能。 ?? (1)自由词检索功能??? 用户可以通过文本词、关键词、截词、期刊名或文献的作者检索Entrez数据库。截词用*号，期刊名必须用Medline刊名缩写，作者姓名必须是姓在前，名在后，用首字母缩写。????(2)索引词表(List Terms)检索功能 ????索引词表检索是当你键入检索词，Entrez?在你选定的字段中显示从该检索词开始的一个索引词表窗口，这时，你可以选择一个或几个词进行检索，这对单词拼写不准确时非常有用。?例如:在输入框中键入"P53"，选择文本字段(Text Words)和索引词表(List Terms)?检索功能，再点击"Search"，这时返回一个以"P53"开始的索引词表窗口，浏览选择一个或几个索引词，点击"Search"，Entrez将返回检索结果。 ????(3)自动检索功能 ????自动检索功能就是Entrez浏览器根据用户输入的检索式自动进行检索，返回当前检索式检出的文献数，如满意，可进一步取得检索结果，如不满意，则可对当前检索式进行修改，直到用户满意为此。例如在输入框键入"P53"，?选择所有字段和自动检索功能，?点击"?Search?"，?Entrez返回一个Web页，包括当前检出文献数、加词检索和修改当前检索三个部分。如果你对检出文献数不满意(过多或过少)，可以在加词检索部分增加更专指的检索词，以提高查准率，也可以在修改当前检索部分选择某一布尔算符(AND、OR、NOT、ANDNOT)，对当前的检索策略进行修改，直到你满意为止。 ????对于检出文献，用户可以选择浏览格式进行浏览，也可以打印或存盘。 ????3 Entrez检索规则 (1)Entrez支持"*"号截词检索; ? (2)Entrez对你键入的词可以进行逻辑识别。例如:键入"Lipman DJ Genomics"，Entrez将它识别为作者的姓名Lipman DJ和自由词?Genomics?，?并将提问式转换为"?Lipman ?DJ?"?AND Genomics。对于Entrez不能识别的提问式，如bac 1，必须加双引号，?系统就会将它们作为一个词进行检索; (3)Entrez支持复杂的布尔逻辑检索; (4)Entrez支持限定字段检索; 字段标识符的全称如下: WORD=Text Word, TITL=Title Word,