基因工程实验方案

基因工程实验方案
基因工程实验方案

实验一、大肠杆菌质粒的提取与电泳检测

一、实验目的

学习质粒DNA提取的基本原理,理解各种试剂的作用,掌握质粒最常用的提取方法,为基因工程提供载体原料。

二、实验原理

将一个有用的目的DNA片段通过重组DNA技术,送进受体细胞中去进行繁殖或表达的工具较载体。细菌质粒是重组DNA技术中最常用的载体。

质粒是一种独立于染色体外的稳定的遗传因子,为双链、闭环的DNA分子,并以超螺旋状态存在于宿主细胞总,大小从1—200kb不等。质粒主要发现于细菌、放线菌和真菌细胞中,它具有自主复制和转录能力,能在子代细胞中保持恒定的拷贝数,并表达所携带的遗传信息。质粒的复制和转录依赖于宿主细胞编码的某些酶和蛋白质,如离开宿主细胞则不能复制,而宿主即使没有质粒也可以正常存活。但质粒的存在使得宿主细胞具有一些额外的特性,如对抗生素的抗性等。常用的质粒载体大小在2.7—10kb之间。如pBR32、pUC系列、pGEM系列和pBluescript(简称pBS)等。

细菌质粒的提取是根据环状质粒DNA分子具有相对分子质量小,易于复性的特点进行的。在热或碱性条件下DNA分子双链解开,若此时将溶液置于复性条件,由于变性的质粒分子能在较短时间内复性而染色体DNA不能复性。用碱变性方法提取质粒就是利用离子型表明活性剂SDS溶解细胞膜上的脂肪及蛋白,在pH 高达12.6的碱性条件下染色体DNA氢键断裂,双螺旋结构解开而变性,成了杂乱无章的片段。而相对分子质量较小的质粒DNA的大部分氢键也断裂,但超螺旋共价闭合环状结构的两条互补链不完全分离,当pH4.8的NaAc或KAc高盐缓冲液调节pH至中性时,变性的质粒DNA可以完全形成互补链,又恢复到原来的构型。而染色体DNA不能恢复而形成缠连的网状结构,变性DNA与菌体的蛋白质凝聚成块。经过离心,出去的沉淀是变性的染色体DNA和蛋白质杂质,而上清液中的质粒DNA分子,则利用无水乙醇与盐凝聚形成沉淀。由于乙醇沉淀的时候,不光DNA还有性质相似的RNA也一起被沉淀下来。为了除去RNA,可以利用RNA酶进行处理,其后采用苯酚使RNA酶失活。出去RNA酶活性往往会采用一些复合物如苯酚、氯仿等,并且苯酚不仅使RNA酶失活,还能有效去除菌

体的蛋白质等物质。因为只用无水乙醇沉淀,样品中还是混有蛋白质。所以为了获得高纯度质粒,应在无水乙醇沉淀前,先用苯酚进行处理,以便除去其中的蛋白质。

三、实验试剂

1.含质粒的大肠杆菌菌株

LB培养基:1%蛋白胨、0.5%酵母粉、1%Nacl、调pH7.2

抗生素:氨苄青霉素:母液100mg/mL,工作浓度100ug/mL

溶液I:50 mmol.L-1Tris-HCl,pH7.5,10 mmol.L-1 EDTA,pH8.0,高压灭菌后室温保存。

溶液II:0.2 M/LNaOH,1% SDS(以2M NaOH和10% SDS母液现用现配)

溶液III:1.32 M KAc(pH4.8),(3mol/L NaAc)高压灭菌后室温保存。

TE缓冲液(pH=8.0):10mmol/LTris-Hcl/1mmol/LEDTA

2mg/mLRNase A溶解于10mmol/LTris-Hcl(pH7.5)、15mmol/LNacl

3mol/LNaAc(pH5.2

苯酚/氯仿/异戊醇(PCI)、冰冷无水乙醇、冰冷70%乙醇

碱裂解法小量提取质粒DNA步骤如下:

(a)挑单菌落接种于含相应抗生素的LB培养基中,37℃摇菌过夜。

(b)每管取1ml菌液然后12,000 g离心30 秒,集菌。

(c)加200 μl溶液I,用振荡器剧烈振荡悬浮菌体。

(d)加300 μl新配制的溶液II,温和颠倒混匀5次以上。

(e)溶液澄清后立即加入300 μl预冷的溶液III,混匀后冰上放置5分钟。(f)4℃、12000 g离心10 (或5)分钟。

(g)取上清,加入等体积的氯仿,颠倒混匀后,4℃、12000 g离心10 分钟沉淀蛋白。

(h)吸取上清,加等体积异丙醇,混匀。室温放置10分钟。

(i)12000 g离心10 分钟,弃上清,再用75% (v/v)乙醇洗涤沉淀,12000 g 离心5分钟。

(k)沉淀在37 ℃干燥后后溶于适量水或TE(50ul),(-20°C)保存备用。质粒DNA的检测:取5ul的质粒与2ul的6×上样缓冲液混合后,在0.7%凝胶上电泳检测。

溶液I:50 mmol.L-1Tris-HCl,pH7.5,10 mmol.L-1 EDTA,pH8.0,高压灭菌后室温保存。

溶液I的作用:

1、任何生物化学反应,首先要控制好溶液的pH,因此可用适当浓度和适当pH值的Tris-HCl溶液。

2、大家知道EDTA是Ca2+和Mg2+等二价金属离子的螯合剂,配在分子生物学试剂中的主要作用是:抑制DNase的活性,和抑制微生物生长。在溶液I 中加入高达10 mM的EDTA,无非就是要把大肠杆菌细胞中的所有二价金属离子都螯合掉。

溶液II:0.2 M/LNaOH,1% SDS(以2M NaOH和10% SDS母液现用现配)用新鲜的0.4 N的NaOH和2%的SDS等体积混合后使用的。要新从浓NaOH 稀释制备0.4N的NaOH,无非是为了保证NaOH没有吸收空气中的CO2而减弱了碱性。其实破细胞的主要是碱,而不是SDS,所以才叫碱法抽提。事实上NaOH是最佳的溶解细胞的试剂,不管是大肠杆菌还是哺乳动物细胞,碰到了碱都会几乎在瞬间就溶解,这是由于细胞膜发生了从bilayer(双层膜)结构向micelle(微囊)结构的相变化所导致。

既然是NaOH溶解的细胞,那为什么要加SDS呢?那是为下一步操作做的铺垫。这一步要记住两点:第一,时间不能过长,千万不要这时候去接电话,因为在这样的碱性条件下基因组DNA片断会慢慢断裂;第二,必须温柔混合

不然基因组DNA也会断裂。基因组DNA的断裂会带来麻烦,

溶液III:1.32 M KAc(pH4.8),(3mol/L NaAc)高压灭菌后室温保存。

加入溶液III后出现大量沉淀,这与SDS的加入有关系。这其实是十二烷基硫酸钠遇到钾离子后变成了十二烷基硫酸钾(potassium dodecylsulfate, PDS),而PDS是水不溶的,因此发生了沉淀。如此看来,溶液III加入后的沉淀实际上是钾离子置换了SDS中的钠离子形成了不溶性的PDS,而高浓度的盐,使得沉淀更完全。大家知道SDS专门喜欢和蛋白质结合,平均两个氨基酸上结合一个SDS分子,钾钠离子置换所产生的大量沉淀自然就将绝大部分蛋白质沉淀了,让人高兴的是大肠杆菌的基因组DNA也一起被共沉淀了。这个过程不难想象,因为基因组DNA太长了,长长的DNA自然容易被PDS给共沉淀了,尽管SDS并不与DNA分子结合。

琼脂糖电泳进行鉴定质粒DNA时,多数情况下你能看到三条带。其实这三条带以电泳速度的快慢排序,分别是超螺旋、开环和复制中间体(即没有复制完全的两个质粒连在了一起)。如果你不小心在溶液II加入后过度振荡,会有第四条带,这条带泳动得较慢,远离这三条带,是20-100kb的大肠杆菌基因组DNA的片断。

实验二、DNA片段(PCR或者酶切)的体外连接感受态细胞的制备重组质粒的转化阳性克隆的筛选(抗性筛选、蓝白斑筛选)

大肠杆菌质粒DNA的提取(碱裂解法)

此方法适用于小量质粒DNA的提取提取的质粒DNA可直接用于酶切PCR扩增。

1. 取1.5ml细菌培养物于EP管中,4000rpm离心1分钟,弃上清液,使细菌沉淀尽量干燥;

2. 将细菌沉淀重悬于用冰预冷的100μl 溶液I(50mmol/L葡萄糖,10mmol/L EDTApH8.0,25mmol/LTris-HClpH8.0)中,剧烈振荡;

3. 加入200μl 新配制的溶液II(0.2mol/LNaOH,1%SDS(m/v)),盖紧EP管

口,快速颠倒离心管5次,以混合混合物,确保离心管的整个内表面与溶液

II接触,不要涡旋,置于冰浴中;

4. 加入150μl预冷溶液III(每100ml的溶液III中含60ml5mol/L乙酸钾,11.5

ml冰乙酸,28.5mlH2O),盖紧EP管口,反复颠倒数次,使溶液III在粘稠

的细菌裂解物中分散均匀,之后将管置于冰上3~5分钟;

5. 在最大转速下离心5min,取上清液于另一新EP管;

6. 用两倍体积的乙醇室温沉淀双链DNA,振荡混合于室温放置2分钟,最大转速离心5分钟;

7. 小心吸去上清液,将离心管倒置于滤纸上,以使所有液体都流出,在将附于管壁的液滴除尽;

8. 加1ml70%乙醇洗涤沉淀,振荡混合,用12,000g离心2分钟,弃上清,将

开口的EP管置于室温使乙醇挥发,直至EP管中内没有可见的液体存在(5~

10分钟),用适量的ddH2O溶解;

9. 用0.5μl的RNase37℃温育5~10分钟;

10.电泳鉴定。

乙醇沉淀DNA

1. 加入1/10体积的乙酸钠(3mol?L,PH=5.2)于DNA溶液中充分混匀,使其

最终浓度为0.3mol?L;

2. 加入2倍体积用冰预冷的乙醇混合后再次充分混匀置于-20℃中15~30分钟;

3. 12,000g离心10分钟,小心移出上清液,吸去管壁上所有的液滴;

4. 加入1/2离心管容量的70%乙醇,12000g离心2分钟,小心移出上清液,吸去管壁上所有的液滴;

5. 于室温下将开盖的EP管的置于实验桌上以使残留的液体挥发至干;

6. 加适量的ddH2O溶解DNA沉淀。

酶切

1. 酶切前确定待切样品的浓度, 并选择合适的限制性内切酶和配套Buffer。

2. 在离心管中加入如下成分:

10×Buffer 1μl

待切样品xμl

酶0.5-1μl

加水补足10μl

3. 混匀样品并短暂离心使样品沉于管底。

4. 将离心管置于37℃中温育1-3hr,若待切样品为PCR产物,则可将反应时间适当延长。

5. 用未酶切的质粒作为对照,琼脂糖电泳鉴定酶切结果。

注:当酶切样品用于回收而不是鉴定时,可按比例适当加大反应体积。双酶

切可选用二者活性都较高的Buffer或者通用Buffer,但要注意不能有星反应。)

连接

1. 连接前先电泳确定待连接载体与片段的浓度。

2. 在离心管中加入如下成分:

10×连接Buffer1μl

待连接的样品(胶回收产物或PCR产物,载体与片段的mol比为1∶3-5)

连接酶0.5-1μl

加水补足10μl

3. 混匀样品并短暂离心使样品全部沉于管底。

4. 将离心管置于连接酶要求的温度孵育适当的时间(根据不同公司的酶的要求而定,一般为22℃1-3hr或16℃连接过夜)。

连接完的样品可直接用于转化,也可放4℃冰箱短期保存。

感受态细胞的制备

1. 挑取适当菌株的E.coli单菌落接种于2mlSOB培养液中,37℃摇床过夜。

2. 取0.5-1ml过夜培养的菌液转种到50mlSOB中,18℃剧烈震荡,直到A600

达到0.6。

3. 将培养物转移到50ml离心管中,4℃4,000rpm/min 离心10min。同时在冰浴上配置TB溶液。

4. 弃上清,将离心管倒置于滤纸上,使培养液被吸干。

5. 取1ml刚配的TB溶液打散菌体沉淀,再加入15mlTB(1/3体积的起始培养液),冰浴10-15min,4℃4,000rpm/min 离心10min。

6. 弃上清,沉淀重悬于4mlTB(1/12.5体积的起始培养液),冰浴10min。

7. 加入280μl DMSO,缓缓滴入并轻轻摇晃,使其充分混合均匀,冰浴10min。

8. 将菌液分装于EP管中,-80℃或液氮冻存。

9. 取两管感受态细胞分别加入1μl无菌ddH2O(阴性对照)和1μl纯质粒(阳性对照)进行转化(见后),以检测感受态的质量。阴性对照平板上应该无菌落生长,阳性对照平板上菌落数目的多少显示感受态效率的高低。

注:上述溶液均需高压蒸汽灭菌处理

0.1MK-Pipes(pH=6.7)的配制:

称取3.02gPipes粉末溶于80mlddH2O中,此时粉末不能完全溶解,用10N KOH或KOH固体调节PH值,只有当PH接近6.7时粉末才能完全溶解,此时

当小心少量地加入KOH直至达到所需PH值。

转化

1. 取100μl感受态细胞于冰浴上融化。

2. 加入1μl纯质粒或连接产物,轻轻吹打混匀,冰浴30min。

3. 将菌液放入42℃水浴中热激90秒,立即放入冰浴中2min。

4. 加入0.9mlSOC,于37℃恒温摇床上200rpm×1hr温育。

5. 将菌液4000rpm/min离心3min,留200μl上清将菌体打散,均匀涂布于含适当

抗生素的琼脂平板表面,平板于37℃倒置培养过夜。

i. 注:新倒的平板可于37℃培养箱中预先放置数小时至过夜干燥。

ii. 当转化的是TA克隆连接产物时可在菌液中加入8μl 1MIPTG 和40μl

20mg/mlX-gal以进行蓝白斑筛选。

重组子的筛选和鉴定

重组子可通过酶切进行鉴定,也可以利用扩增引物通过PCR进行鉴定,阳

性重组子能切出所需要的片段或得到相应片段的PCR产物。

1. 用牙签挑取平板上的菌落接种于2ml含适当抗生素的LB培养基中,37℃摇床培养过夜。

2. 次日取菌液0.2-0.5ml,13,000rpm×3min离心,弃上清,加入20μl ddH2O和20μl 酚/氯仿,震荡混匀,13,000rpm×5min离心。

3. 取上清进行琼脂糖电泳,加入载体质粒DNA作为阴性对照,根据质粒大小初步筛选重组子,重组子的泳动速度应该慢于载体质粒。

4. 用碱法小量制备可能是重组子的质粒DNA。

5. 选取适当的酶,对重组子进行酶切分析,酶切体积均为10μl体系。酶切样品进行琼脂糖电泳鉴定是否有所需片段。

6. 酶切分析正确的重组子分成两份,一份进行测序反应,另外一份保种。

7. 若用PCR法鉴定,则在第2步时每个样本取0.5-1.0μl 菌液为模板进行PCR 反应,每管反应体系最低可少至10μl,PCR产物电泳,能得到所需条带的样

本进一步提取质粒酶切鉴定或送样品测序。

基因工程实验教学教案

基因工程实验 教学方案 湖南人文科技学院生命科学系生物技术教研室 指导教师:吴娟

实验一重组质粒的提取及转化表达型菌株 Ⅰ质粒DNA的提取 实验目的 通过本实验学习和掌握碱裂解法提取质粒的技术与方法。 实验原理 1.碱变性法基本原理是,在Ph12.0-12.6碱性环境中,线性的大分子量细菌染色体DNA变性,而共价闭环质粒DNA仍为自然状态。将PH调至中性并有高盐浓度存在的条件下,染色体DNA之间交联形成不溶性网状结构大部分DNA和蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀,而质粒DNA仍为可溶状态,通过离心可除去大部分细胞碎片,染色体DNA,RNA及蛋白质,质粒DNA尚在上清中,再用酚氯仿或硅基质膜柱子进一步纯化DNA。 2.设计构建体外重组DNA分子 构建体外重组DNA分子,首先要了解目的基因的酶切图谱。选用的限制性内切酶不能在目的基因内部有识别位点,也就是说用一种或两种限制性内切酶就能切割得到完整的外源DNA基因。构建体外重组DNA分子,最简单的重组方式就是在目的基因DNA的两端用两种不同的限制性内切酶进行酶解,产生两个不同的粘性末端。再用这两种限制性内切酶去选择合适的载体进行酶切,也产生这两个不同的粘性末端,这样构建的重组DNA分子,目的基因DNA片段是从一个方向插入质粒载体中的,重组的效率高,也易于筛选处重组子。 附表达载体pGEX-6P-1-mreB的构建图:

仪器材料与试剂 (一)仪器 1.恒温摇床 2.台式离心机 3.漩涡混合仪 (二)材料与试剂 1.含pGEX-mreB质粒的大肠杆菌DH5α 2.含pGEX质粒的大肠杆菌DH5α 3.液体LB培养基 4.100mg/mL氨苄青霉素Amp 5.新捷质粒提取试剂盒 实验步骤 分为两组:一组提取质粒pGEX-mreB,另一组提取质粒pGEX。 1)12000rmp 离心30秒收集1-5ml过夜培养的细菌,弃尽培养基。加入250ul 已加入Rnase A的Buffer Ⅰ, 充分悬浮细菌沉淀。 2)加入250ul Buffer Ⅱ, 温和并充分地翻转离心管4-6次。 3)加入350ul Buffer Ⅲ,温和并充分地翻转离心管4-6次。 4)13000 rmp 离心10分钟。 5)将核酸纯化柱置于2ml 离心管中,转移步骤4中的上清液到核酸纯化柱中,盖上管盖,12000rmp离心30秒。 6)弃2ml 离心管中的滤液,将核酸纯化柱置回到2ml离心管中,在核酸纯化柱中加入700ul Buffer W2,盖上管盖,12000rmp离心30秒。 7)弃2ml离心管中的滤液,将核酸纯化住置回到2ml离心管中,14000 rmp离心1分钟。 8)弃2ml离心管,将核酸纯化住置于一个洁净的1.5ml离心管中,在纯化柱的膜中央加入50-100ul Buffer TE ,盖上管盖,室温静置1分钟,12000rmp离心30秒。 9)弃纯化柱,洗脱的质粒可立即用于各种生物学实验,或储存于-20℃。 实验结果 实验安排 3个小时

基因工程》课程实验指导书

《基因工程》课程实验指导书 生物技术专业 黄淑坚黄良宗编写 佛山科学技术学院 2005年12月

目录 前言 (Ⅱ) 实验一反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR) (1) 实验二DNA目的片段的回收与DNA的体外连接 (7) 实验三重组DNA的转化 (10) 实验四重组DNA的鉴定 (13) 实验五外源基因在大肠杆菌中的诱导表达 (16) 实验六表达产物的检测与分析——SDS-PAGE (18) 附录 (22) 参考文献 (34)

前言 基因工程学是以生物化学、分子生物学和分子遗传学等学科为基础而发展起来的一门新兴技术学科,自DNA重组技术于1972年诞生以来,作为现代生物技术核心的基因工程技术得到飞速的发展,并广泛应用于医学、农业、工业、水产、环保等行业。本实验指导书在在方法上,力求可行性、实用性,内容涵盖基因工程操作的基本过程,整个实验基本上是一个连续的过程,通过学习,要求学生能在原有的相关理论知识基础上,较全面和深入理解基因工程原理、基本掌握基因工程常用的实验方法,以求为以后的学习和科研工作打下良好和扎实的基础。 由于基因工程的发展异常迅速,加之编写人员水平有限,难免有疏漏与错误,敬请各位师生批评指正。 编者 2005年12月

实验一反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR) 一、目的和要求 了解反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)基本原理和实验应用,掌握RT-PCR 反应的基本技术。 二、实验内容 RT-PCR扩增猪流感病毒M2基因部分片段。 三、仪器、设备和实验准备 1、仪器 恒温水浴槽、移液枪、EP管、PCR管、超净工作台、PCR仪、电泳仪。 2、试剂 反转录酶、RNA酶抑制剂(RNase Inhibitor)、流感病毒RNA、随机引物、流感病毒M2基因PCR引物、dNTP、Taq酶。 3、实验准备 用RNA抽提试剂盒抽提猪流感病毒RNA。 四、实验原理 RT-PCR是将RNA模板的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。RT-PCR技术灵敏而且用途广,可用于检测产生的转录产物,分析表达的水平,不需构建和筛选cDNA文库而能直接克隆cDNA产物。 反转录反应是在反转录酶作用下,以RNA为模板指导合成互补的DNA链的过程。反转录反应可以使用反转录酶,以随机引物、oligo(dT)或基因特异性的引物(GSP)起始。 PCR(Polymerase Chain Reaction,聚合酶链反应)是一种选择性体外扩增DNA或RNA的方法。它包括三个基本步骤: (1) 变性(Denature):目的双链DNA 片段在94℃下解链; (2) 退火(Anneal):两种寡核苷酸引物在适当温度(50℃左右)下与模板上的目的序列通过氢键配对;(3) 延伸(Extension):在Taq DNA聚合酶合成DNA的最适温度下,以目的DNA为模板进行合成,由这三个基本步骤组成多轮循环。

基因工程实验技术介绍

一、大肠杆菌质粒DNA的提取 质粒DNA的提取是从事基因工程工作中的一项基本实验技术,但提取方法有很多种,以下介绍一种最常用的方法:碱裂解法。此方法适用于小量质粒DNA的提取,提取的质粒DNA可直接用于酶切、PCR扩增、银染序列分析。方法如下: 1、接1%含质粒的大肠杆菌细胞于2ml LB培养 基。 2、37℃振荡培养过夜。 3、取1.5ml菌体于Ep管,以4000rpm离心3 min,弃上清液。 4、加0.lml溶液I(1%葡萄糖,50mM/L EDTA pH8.0,25mM/L Tris-H Cl pH8.0)充分混合。 5、加入0.2ml溶液 II(0.2 mM/L NaOH,1% SDS),轻轻翻转混匀,置于冰浴5 min 。 6、加入0.15m1预冷溶液III(5 mol/L KAc,p H4.8),轻轻翻转混匀,置于冰浴5 min 。 7、以10,000rpm离心20min,取上清液于另 一新Ep管 8、加入等体积的异戊醇,混匀后于?0℃静置1 0min。 9、再以10,000rpm离心20min,弃上清。 10、用70%乙醇0.5ml洗涤一次,抽干所有 液体。 11、待沉淀干燥后,溶于0.05mlTE缓冲液中 二、质粒DNA琼脂糖凝胶电泳鉴定 琼脂糖是从海藻中提取出来的一种线状高聚物,应选用电泳纯的,琼脂糖此级产品筛除了抑制物和核酸酶,而且用溴化乙锭染色后荧光背景最小。 (1)琼脂糖凝胶电泳装置

由于琼脂糖凝胶电泳既要求不高,而适应性又强,在过去15年里已成功地设计了形形色色及大大小小的电泳槽。对这些装置的选择主要是依据个人的喜恶。使用最普遍的装置是Walt er Schaffner发明的水平板凝胶。 水平板凝胶通常在一块可安放于电泳槽平台的玻璃板或塑料盘上灌制。在有些装置中,则可将凝胶直接铺在平台上。凝胶恰好浸在缓冲液液面下进行电泳。凝胶的电阻几乎与缓冲液的电阻相同,所以有相当一部分的电流将通过凝胶的全长。 (2)琼脂糖凝胶的制备 琼脂糖凝胶的制备是将琼脂糖在所需缓冲液中熔化成清澈、透明的溶液。然后将熔化液倒入胶模中,令其固化。凝固后,琼脂糖形成一种固体基质,其密度取决于琼脂糖的浓度。通贯凝胶的电场接通后,在中性pH值下带负电荷的DNA向阳极迁移。 (3)琼脂糖凝胶的染色 电泳完毕,将琼脂糖凝胶转移入含EB的染液中,染色10分钟,取出紫外灯下观察。 三、质粒DNA热激法转化大肠杆菌 感受态的细胞可以摄入外部溶液中的DNA,而常态的细胞却不能,所以要转化质粒DNA进入大肠杆菌必须首先制备感受态的大肠杆菌细胞。 1、取1%大肠杆菌E.coli接种于含2ml LB培 养基的试管中,37℃振荡培养过夜 2、取0.1ml过夜培养物转种于含10ml LB培 养基的三角瓶中,37℃振荡培养3h至OD600=0. 3 3、然后把培养物倒入1.5ml离心管中,冰浴1 0min。 4、在4℃下以4000rpm离心5min,去上清液 5、把菌体悬浮于15m1冰冷的0.1M CaCl2溶液 中,置冰上30min 6、然后再在4℃下以4000rpm离心10min,去 上清液

基因工程实验报告

基因工程实验报告 、

小麦GAPDH截短体的重组与表达 摘要:本实验通过基因工程(genetic engineering)手段对小麦总RNA进行提取、PCR扩增及与质粒载体的重组构建的操作,并将重组质粒以氯化钙法导入大肠杆菌感受态细胞,诱导目的基因表达,并在蛋白水平进行Western检测。通过本对实验的实践,我们对基因工程技术将会有一个比较全面的认识和了解。 关键字:小麦基因;载体;感受态 前言 基因工程(genetic engineering)又称基因拼接技术和DNA重组技术。为在分子水平上对基因进行操作的复杂技术,是将外源基因通过体外重组后导入受体细胞内,使这个基因能在受体细胞内复制、转录、翻译表达的操作。它是用人为的方法将所需要的某一供体生物的遗传物质——DNA大分子提取出来,在离体条件下用适当的工具酶进行切割后,把它与作为载体的DNA分子连接起来,然后与载体一起导入某一更易生长、繁殖的受体细胞中,以让外源物质在其中“安家落户”,进行正常的复制和表达,从而获得新物种的一种崭新技术。它克服了远缘杂交的不亲和障碍。 (一)实验过程

1.实验部分流程:

2.小麦总RNA提取(Trizol法) 2.1 材料 小麦幼苗 2.2 试剂配制及器具处理 ① 0.1%的DEPC H2O(DEPC:焦碳酸二乙酯) ②器具处理:试剂瓶、量筒、研钵、大小枪头和1.5ml和0.2ml 的EP管等用纱布包裹,在 0.1%的DEPC H2O中浸泡过夜(37℃),高压灭菌,80℃烘干备用。剪刀、镊子和药匙等160℃烘烤6h以上。 ③无RNA酶灭菌水(DEPC H2O):用将高温烘烤的玻璃瓶(180℃×2h)装蒸馏水,然后加入 0.1%的DEPC(体积/体积),处理过夜后高压灭菌。 ④Trizol ⑤ 75%乙醇:用新打开的无水乙醇和DEPC处理过的水配制75%乙醇(用高温灭菌器皿配制),然后装入高温烘烤的玻璃瓶中,存放于低温冰箱。 ⑥氯仿(最好用新的)。 ⑦异丙醇(最好用新的)。 2.3 操作步骤: ①先在研钵中加入液氮,再将小麦叶片剪成小段在液氮中磨成粉末,用液氮预冷的药匙取50~100mg组织粉末加入已盛有1ml的Trizol液的EP管中(注意研磨粉末总体积不能超过所用Trizol体积的10%),充分混合均匀。 ②室温放置5min,然后加入200μL的氯仿,盖紧EP管并剧烈摇荡15秒钟。 ③ 12000rpm离心10min,取上层水相于一新的EP管中(千万不要将中间的沉淀层和下层液混入,否则重新离心分离),加入500μL异丙醇,温和颠倒混匀。室温放置10min,12000rpm 离心10min。 ④小心地弃去上清液,加入1ml的75%乙醇,涡旋混匀,4℃下12000rpm离心5min。 ⑤重复步骤④。 ⑥弃去上清液(尽量将残余液体除去),室温或真空干燥5~10min(注意不要干燥过分,否则会降低RNA的溶解度)。用30μL DEPC处理过的水将RNA溶解,必要时可55℃~60℃水浴10min。RNA可进行mRNA分离,或贮存于70%乙醇并保存于-70℃。 3. RT-PCR扩增目的基因cDNA 3.1 试剂 ① RNA模板 ②Olig(dT)18 ③反转录缓冲液 ④dNTP ⑤ M-MULV反转录酶 ⑥ RNA抑制剂(RNasin) ⑦Premix EX Taq DNA聚合酶 ⑧ PCR特异引物 3.2操作步骤: 3.2.1 RNA的反转录 采用Thermo Scientific(Fermentas)RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit Total RNA 6μL(需加入RNA约1μg) OligodT primer 1μL H2O(nuclease-free)5μL 12μL 65℃ 5min,补加下列试剂: 5× Reaction buffer 4μL RibolockRNase Inhibitor 1μL 10mM dNTP Mix 2μL RevertAid M-MuLV Reverse Transcriptase 1μL 20μL 42℃ 60min 70℃,5min,﹣20℃保存

植物基因工程实验技术

植物基因工程实验技术
编者: 赵 燕
主审: 张学文
湖南农业大学植物科学实验教学中心
2007 年 4 月



基因工程是现代生物技术的核心, 也是现代分子生物学研究的重 要手段. 掌握基因工程技术对于生物技术专业及其它生物学相关专业 学生都很重要. 基因工程本身是由一系列分子生物学操作技术组成的系统性技 术体系,本实验指导侧重于 DNA 重组操作,将基因工程操作的常用 和核心技术组织起来, 以为我校生物技术本科生及有关专业研究生基 因工程实验提供简单而明确的指导. 为适应基因工程的飞速发展,一些生物技术公司匠心独运,开发 出专门的试剂盒,使一些复杂的实验操作简单化了.这对于实验者来 说自然是好事,但也使实验者动手胜于用脑.对于实验人员来说,一 定应知其然并知其所以然, 才会在实验中运用自己的知识予以创新性 的发展.期望本实验指导不成为实验中的教条.


2007 年 4 月
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实验一 实验二 实验三 实验四 实验五 实验六 实验七 实验八 实验九 实验十 附录:

大肠杆菌的对照培养,单菌落的分离及菌种保存 ...............3 强碱法小量制备质粒 DNA.....................................................5 琼脂糖凝胶电泳......................................................................7 植物总 DNA 的提取,纯化和检测 ........................................9 DNA 的 PCR 扩增................................................................. 11 植物总 RNA 的分离 .............................................................15 RT-PCR..................................................................................17 体外重组分子的构建,筛选及检测.....................................21 植物表达载体的构建,筛选及检测.....................................22 植物遗传转化技术 ................................................................23 实验中常用的仪器与器皿 .....................................................24
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基因工程试验指导

《基因工程》实验指导 湖南师范大学生命科学学院 遗传与发育生物学系 2009年5月

基因工程课程综合实验---转基因斑马鱼的构建 一、实验目的 本课程的教学目的是让学生对基因工程技术所涉及的主要环节的基本原理、完整流程和基本技术进行系统地学习和掌握,培养学生具有通过这些原理进行基因工程实验和研究方面的设计能力。在基因工程理论课程的讲授和实践课程的实际操作过程中对学生进行基因操作与社会伦理方面的训练和教育,重在素质和能力的培养。 二、实验原理 转基因动物(transgenic animal)是指动物所有细胞基因组中整合有外源基因的一类动物,具有将外源基因遗传给子代的能力,整入动物基因的外源基因被称为转基因(transgene)。转基因动物技术是常规分子生物学技术的延伸和拓展,是基因工程技术的核心内容之一,它不仅为人们研究生命科学提供了一个更有效的工具,转基因技术是生物学领域最新重大进展之一,已能渗透到生物学、医学、畜牧学等学科的广泛领域。转基因动物已成为探讨基因调控机理、致癌基因作用和免疫系统反应的有力工具。同时人类遗传病的转基因动物模型的建立,为遗传病的基因治疗打下坚实的理论和实验基础。转基因技术涉及外源基因的获取、重组载体的构建与检测鉴定、受体系统的准备、显微注射基因导入、供转基因胚胎发育的体外培养系统和宿主动物的饲养等方面的内容。 三、材料

限制性内切酶:Eco R I、Sal I、Age I、Not I、Bam H I;T4 DNA聚合酶;LA DNA聚合酶混合物均为大连TaKaRa公司产品; 3. 2菌株及细胞系 DH5α感受态细胞:由本实验室自行制备并存于-20℃; 3. 3 质粒与表达载体系统 3. 3.1 pEGFP-N1载体 pEGFP- N1载体是一种把异源性的蛋白质融合至EGFP的N端的哺乳动物表达载体,为Clontech公司的产品。含有人类巨细胞病毒(CMV)启 图1 含有绿色荧光蛋白基因的卡那霉素抗性的pEGFP-N1质粒 动子,SV40 Poly A尾,pUC复制起始点(原核)和SV40复制起始点(真核),20个多克隆位点,具有筛选标志卡那霉素(原核)和新霉素(真核)的抗性基因,见图1。异源性蛋白与EGFP阅读框一致地克隆入pEGFP-N1,形成的表达重组体在CMV启动子启动下,表达EGFP和目标蛋白的融合蛋白。该融合蛋白保持了EGFP的荧光特性,可对融合蛋白进行活细胞内

基因工程实验指导 - 专业实验I

基因工程实验指导书

缩略词表

实验一植物总DNA 的抽提及电泳检测 一【实验目的】 1、了解植物DNA抽提的主要方法; 2、掌握快速抽提DNA的方法。 3、了解掌握检测DNA质量的方法以及DNA定量的方法; 4、了解影响DNA在琼脂糖凝胶中泳动速率的因素; 5、训练DNA的琼脂糖凝胶电泳操作。 二【实验原理】 该方法简便、快速,DNA产量高(纯度稍次,适用于一般分子生物学操作) 。CTAB (十六烷基三乙基溴化铵)是一种非离子去污剂,植物材料在CTAB的处理下,结合65℃水浴使细胞裂解、蛋白质变性、DNA被释放出来。CTAB与核酸形成复合物,此复合物在高盐(>0.7mM)浓度下可溶,并稳定存在,但在低盐浓度(0.1-0.5mM NaCl)下CTAB-核酸复合物就因溶解度降低而沉淀,而大部分的蛋白质及多糖等仍溶解于溶液中。经离心弃上清后,CTAB-核酸复合物再用70-75%酒精浸泡可洗脱掉CTAB。再经过氯仿/异戊醇(24:1) 抽提去除蛋白质、多糖、色素等来纯化DNA,最后经异丙醇或乙醇等DNA沉淀剂将DNA沉淀分离出来。CTAB能溶解于乙醇。 改进的CTAB植物DNA抽提液迅速裂解细胞和灭火细胞内核酸酶,氯仿抽提后通过离心清除多糖、多酚和蛋白质,上清加入异丙醇离心沉淀基因组DNA,进一步去除其它各种杂质,然后基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心步骤,进一步将多糖,多酚和细胞代谢物,蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将基因组DNA从硅基质膜上洗脱。 琼脂糖凝胶电泳技术是DNA分子片段的分子量测定和分子构象研究以及DNA分离纯化的重要实验手段。DNA分子在琼脂糖凝胶电泳中泳动时受到电场驱动力和凝胶的摩擦阻力。一般情况下,单位长度双链DNA带有几乎相等的电荷,故在一定电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于凝胶的摩擦阻力,即DNA分子本身的大小和构型。DNA分子的迁移速度与相对分子量的对数值成反比关系,具有不同长度的DNA 片段由于其泳动速度不同而得到分离。具有相同一级结构但构型不同的DNA分子也可以通过这种方法进行分离。

基因工程实验(答案)

——凯1.简述本学期从基因组DNA提取到重组质粒鉴定的实验流程?(实验题目的总结) 答:①基因组DNA的提取;②PCR扩增目的基因;③凝胶电泳分离纯化PCR扩增的DNA片段以及DNA的体外连接;④重组质粒的转化及转化子的筛选;⑤重组质粒的抽提;⑥重组质粒的酶切鉴定。 2.如何正确使用微量移液器?(自己写的) 答:①选取合适量程的移液器;②根据取液量设定量程;③安装(吸液)枪头;④按至第一档,将枪头垂直伸入液面下适当位置吸液;⑤按至第二档将液体打入容器;⑥弃掉枪头;⑦将量程调至最大,放回原处。 3.在琼脂糖凝胶电泳点样时,DNA通常和什么试剂混匀,其主要成分和作用是什么? 答:loading Buffer。主要成分为溴酚蓝,二甲苯青和甘油。 溴酚蓝和二甲苯青起指示作用;甘油加大样品密度,从而沉降于点样孔中,以免浮出。 4.简述制作1%的琼脂糖凝胶电泳的操作步骤。(题目有歧义) 答:①取0.5g琼脂粉置于锥形瓶,量取50ml 1×TBE溶液于瓶中,微波炉加热至琼脂溶解; ②将移胶板放入胶室中,选取合适梳子垂直安插在移胶板上方,待琼脂降温至55℃下后,缓慢导入该胶室里;③量取合适量1×TBE溶液导入洗净的电泳槽,并正确插好电泳线;④等凝胶凝固后,将梳子垂直拔出;⑤点样;⑥轻放移胶板至电泳槽的合适位置;⑦打开电泳仪的开关,调好参数,开始电泳;⑧一定时间后,停止电泳,取出凝胶板,然后经BE染色放入成像系统显色、观察。 5.琼脂糖凝胶电泳中DNA分子迁移率受哪些因素的影响?(实验书P75) 答:①样品DNA的大小和构象;②琼脂糖浓度;③电泳电场;④温度;⑤缓冲液;⑥嵌入染料的存在与否; 6.在使用苯酚进行DNA抽提时应注意什么?(实验书P31) 答:注意不要吸取中间的变性蛋白质层。 7.在基因组DNA提取过程中常用酚、氯仿、异戊醇试剂,它们各有什么作用? 答:酚——是蛋白质变性,抑制DNA酶的降解作用;氯仿——除去脂类,同时加速有机相与水相的分层;异戊醇——降低表面张力,从而减少气泡的产生。 8.提取DNA实验中,通常可选用哪些试剂沉淀DNA? 答:冷的无水乙醇,冷的异丙醇,终浓度为0.1~0.25mol/L 的NaCl 9.简述在DNA提取实验中个试剂的作用(SDS,EDTA,酚/氯仿/异戊醇、无水乙醇,70%乙醇)。 答:SDS——破坏细胞膜,解聚核蛋白;EDTA——整合金属离子,抑制DNase活性;酚/氯仿/异戊醇——见第7题;无水乙醇——沉淀DNA;70%乙醇——洗涤DNA沉淀。 10.简述PCR扩增技术的原理及各种试剂的作用(Mg2+,dNTP,引物,DNA,缓冲液,Taq

基因工程综合实验教学大纲

《基因工程综合实验》教学大纲 学时:54学时学分:3学分课程性质:必修 实验个数:7个适用专业:生物技术,生物工程大纲执笔人:朱常香大纲审定人:郑成超 一、实验课的性质与任务 本课程是一门专业实验课。该课程以植物基因工程的研究程序为主线,综合了目的基因的分离、克隆,载体的构建,目的基因转化、转基因植株的鉴定等方面的实验内容,在注重专业性和可操作性的前提下突出先进性和系统性,加强教学内容的选择性。通过本课程的学习和实践,使学生对基因工程的全过程有系统、明确的认识,达到熟识、理解并掌握基因工程的实验原理和操作方法,提高分析问题和解决问题的能力,开拓创新能力,为从事生物技术及其相关领域的科学研究工作打下基础。 二、实验的目的与要求 本课程的目的是培养高年级本科生及研究生进行基因操作的能力。教学中,要求调动教学双方的主观能动性,组织学生参加实验准备,让学生和教师共同讨论理论和实验问题,指导学生分析总结实验结果,学会正确书写科学报告(论文)。

三、实验项目及内容提要

四、实验报告的格式 实验报告的撰写要求使用专用实验报告纸。实验报告的内容应包括:实验目的,实验的基本原理,实验用的仪器设备及试剂,实验操作程序,实验结果,实验应注意事项。 五、本课程考核方式、方法及实验成绩评定方法 考核可采取闭卷、开卷、课程论文等形式,或多种形式相结合,对学生的学习情况做出全面科学的评价。 成绩评定把学生的实际动手能力放在重要地位。根据考试情况、实验报告撰写情况及平时表现给予综合评定。 六、实验应配套的主要仪器设备及台(套)数

附:教学参考书目 1、使用实验指导 《基因工程综合实验》操作手册。温孚江,朱常香,宋云枝等,2003。 2、参考书目 (1)《分子克隆实验指南》(第三版)。J·萨姆布鲁克,D·W·拉塞尔著,黄培堂等译。科学出版社,2002。 (2)《基因工程原理与技术》。王关林,方宏筠主编,科学出版社,1998。

基因工程实验考试试题(答案)

1.简述本学期从基因组DNA提取到重组质粒鉴定的实验流程? 答:①基因组DNA的提取;②PCR扩增目的基因;③凝胶电泳分离纯化PCR扩增的DNA片段以及DNA的体外连接;④重组质粒的转化及转化子的筛选;⑤重组质粒的抽提;⑥重组质粒的酶切鉴定。 2.如何正确使用微量移液器? 答:①选取合适量程的移液器;②根据取液量设定量程;③安装(吸液)枪头;④按至第一档,将枪头垂直伸入液面下适当位置吸液;⑤按至第二档将液体打入容器;⑥弃掉枪头;⑦将量程调至最大,放回原处。 3.在琼脂糖凝胶电泳点样时,DNA通常和什么试剂混匀,其主要成分和作用是什么? 答:loading Buffer。主要成分为溴酚蓝,二甲苯青和甘油。 溴酚蓝和二甲苯青起指示作用;甘油加大样品密度,从而沉降于点样孔中,以免浮出。 4.简述制作1%的琼脂糖凝胶电泳的操作步骤。 答:①取0.5g琼脂糖置于锥形瓶,量取50ml 1×TBE溶液于瓶中,微波炉加热至琼脂糖溶解;②将移胶板放入胶室中,选取合适梳子垂直安插在移胶板上方,待琼脂降温至55℃下后,缓慢导入该胶室里;③量取合适量1×TBE溶液导入洗净的电泳槽,并正确插好电泳线; ④等凝胶凝固后,将梳子垂直拔出;⑤点样;⑥轻放移胶板至电泳槽的合适位置;⑦打开电泳仪的开关,调好参数,开始电泳;⑧一定时间后,停止电泳,取出凝胶板,然后经BE染色放入成像系统显色、观察。 5.琼脂糖凝胶电泳中DNA分子迁移率受哪些因素的影响?(实验书P75) 答:①样品DNA的大小和构象;②琼脂糖浓度;③电泳电场;④温度;⑤缓冲液;⑥嵌入染料的存在与否; 6.在使用苯酚进行DNA抽提时应注意什么?(实验书P31) 答:注意不要吸取中间的变性蛋白质层。 7.在基因组DNA提取过程中常用酚、氯仿、异戊醇试剂,它们各有什么作用? 答:酚——是蛋白质变性,抑制DNA酶的降解作用;氯仿——除去脂类,同时加速有机相与水相的分层;异戊醇——降低表面张力,从而减少气泡的产生。 8.提取DNA实验中,通常可选用哪些试剂沉淀DNA? 答:冷的无水乙醇、冷的异丙醇、终浓度为0.1~0.25mol/L 的NaCl 9.简述在DNA提取实验中个试剂的作用(SDS,EDTA,酚/氯仿/异戊醇、无水乙醇,70%乙醇)。 答:SDS——破坏细胞膜,解聚核蛋白;EDTA——整合金属离子,抑制DNase活性;酚/氯仿/异戊醇——见第7题;无水乙醇——沉淀DNA;70%乙醇——洗涤DNA沉淀。 10.简述PCR扩增技术的原理及各种试剂的作用(Mg2+,dNTP,引物,DNA,缓冲液,Taq DNA聚合酶)。 答:(1)利用半保留复制的原理,以待扩增的DNA为模板,通过一系列酶在体外引物介导下,

农杆菌介导的植物转基因技术实验指导

农杆菌介导的植物转基因技术 一、实验目的 1 了解低温离心机、恒温振荡培养箱、超净工作台等仪器的使用。 2 学习真核生物的转基因技术及农杆菌介导的转化原理;掌握农杆菌介导转化植物的实验方法,了解转基因技术的操作流程。 二、实验原理 农杆菌是普遍存在于土壤中的一种革兰氏阴性细菌,它能在自然条件下趋化性地感染大多数双子叶植物的受伤部位,并诱导产生冠瘿瘤。农杆菌通过侵染植物伤口进入细胞后,可将 T-DNA插入到植物基因组中。因此,农杆菌是一种天然的植物遗传转化体系。人们将目的基因插入到经过改造的T-DNA区,借助农杆菌的感染实现外源基因向植物细胞的转移与整合,然后通过细胞和组织培养技术,再生出转基因植株。 实验一培养基配制 一、仪器和试剂 1、仪器:高压灭菌锅,超净工作台 2、药品:Beef extract (牛肉浸膏) 5g/L ,Yeast extract (酵母提取物) 1g/L ,Peptone (蛋白胨) 5g/L ,Sucrose (蔗糖) 5g/L ,MgSO4.7H2O 0.4g/100ml ,Agar (琼脂)1.5g/100ml,MS粉,有机溶液,肌醇,Fe盐,NAA(萘乙酸),6-BA (6-苄氨基腺嘌呤),卡那霉素(kan),利福平(rif ),链霉素(str )。 二、实验方法 第一组配制YEB固体培养基 1、配制250mlYEB固体培养基:先称取1.25g Beef extract (牛肉浸膏); 1.25g Peptone (蛋白胨);0.25g Yeast extract (酵母提取物);1.25g Sucrose

(蔗糖);1g MgS04.7H2O琼脂粉3.75g ;将上述药品置于250ml三角瓶中,用量筒称取 200ml蒸馏水将其溶解混匀,然后再定容至250ml,用NaOH调pH=7.4。 2、灭菌:将盛有250ml 培养基的三角瓶封口,在三角瓶表面写清培养基名称,用高压灭菌锅进行灭菌。 3、抗生素的加入:高压灭菌后,待培养基温度降到50-60 C时(手可触摸)加入已经过滤好的抗生素(100用/ml kan+50⑷/ml Str+ 50旧/ml rif ),以免温度过高导致抗生素失效。 4 、倒板:将抗生素与培养基混匀,每个平皿倒15ml 培养基,可以倒16个平皿,倒完后打开平皿盖,在紫外灯下照10min,等待培养基凝固,盖上平皿盖,封口备用。 第二组配制YEB液体培养基 1、配制500mlYEB液体培养基:先称取2.5g Beef extract (牛肉浸膏);2.5g Peptone (蛋白胨); 0.5g Yeast extract (酵母提取物); 2.5g Sucrose (蔗糖); 2g MgSO4.7H2O将上述药品置于500ml三角瓶中,用量筒称取450ml蒸馏水将其溶解混匀,然后再定容至500ml,用NaOH调pH=7.4。 2、灭菌:将盛有500ml 培养基的三角瓶封口,在三角瓶表面写清培养基名称,用高压灭菌锅进行灭菌。 3、抗生素的加入:高压灭菌后,待培养基温度降到50-60 C时(手可触摸)加入已经过滤好的抗生素(100用/ml kan+50⑷/ml Str+ 50旧/ml rif ),以免温度过高导致抗生素失效。 4 、分装:将培养基分别分装到试管和三角瓶中,每个试管中分装5ml,分 装12个试管。每个三角瓶中倒入35ml,共12个三角瓶。 5、分装好后,封口备用。 第三组配制MS液体培养基 1、配制500mlMS液体培养基:先在500ml三角瓶中加入400ml蒸馏水,称取2.15gMS 粉置于蒸馏水中,搅拌均匀;再向其中加入5ml 100倍Fe盐浓缩液;5ml100倍肌醇浓缩液;5ml有机溶液的混合液,然后混匀定容至500ml,用NaOH 调pH=5.8。

《基因工程》课程综合实验转基因斑马鱼的构建

《基因工程》课程综合实验转基因斑马鱼的构建 实施方案 《基因工程》课程综合实验教学在专业培养目标中的定位与目标 《基因工程》是生命科学学院等各专业的专业主干课,在这些专业的本科生教学打算中占有极为重要的地位。《基因工程》也是我们学校基地班和生技专业的专业必修课,差不多有10余年的开课历史。全国其他高等综合院校都十分重视《基因工程》课程建设,绝大多数院校都将《基因工程》作为学校精品课程进行建设。湖南师范大学大学在《基因工程》教学和研究方面具有坚实的基础,2008年《基因工程》建设成为了湖南省精品课程,从而为我校《基因工程》的教学改革提供了契机。 基因工程是以遗传学为理论基础的一门实践性专门强的学科,是生物学科中一门体系还欠完整却进展十分迅速的学科,对探究生命的本质、推动整个生物学科的进展起着庞大的作用;同时又是一门紧密联系生产实际的实验科学,对新品种选育和良种繁育、遗传疾病防治等都具有重要的应用价值。通过《基因工程》的学习,使学生把握基因工程的差不多原理、差不多方法和最新进展动态;通过《基因工程》课程综合实验教学,使学生熟悉基因工程的差不多操作方法,注重对学生的实验操作技能的培养。 基因工程课程综合实验---转基因斑马鱼的构建教学大纲 课程名称:基因工程(实践课程部分) 课程编号: 面向专业:生物技术、生物科学、基地班

课程总学时:理论51学时,实验34学时_ 实验学时:34_ 课程学分:理论3学分,实践2学分 一、实验目的 本课程的教学目的是让学生对基因工程技术所涉及的要紧环节的差不多原理和差不多技术进行系统地学习和把握,培养学生基因工程差不多实验操作、实验设计、实验结果分析和创新实验能力,通过基因工程综合实验的开设,注重学生综合素养和实践能力的培养。 二、实验内容、学时分配与组织

遗传学实验指导

《遗传学实验》简介 课程名称:遗传学实验 课程性质:随课实验 课程属性:基础课 学时学分:学时16学分1 面向专业: 一、课程的任务和基本要求 遗传学实验是生物学所有专业的一门专业基础课程,是一门独立的实验课程,同时也是为了配合遗传学的教学而开设的一门实验课程,本课程由基础操作性、综合性和设计性等多层次实验内容构成,目的在于巩固和加深学生对遗传学知识的理解、验证遗传学理论、并初步掌握遗传学研究所必需的基本实验技术。在此基础上,进行一定比例的综合性、设计性实验,将实验理论和实验技能融为一体,从而培养学生的基本实验思想、实验方法、实验技能和综合应用能力。本课程的任务是从个体、细胞水平揭示遗传学的基本现象与规律,培养学生牢固掌握经典遗传学研究方法与技术,并初步掌握现代遗传学实验操作技能,熟悉遗传学分析方法,同时要求学生初步具备进行遗传学创新性研究的基本能力与素质。 二、实验项目 植物染色体核型分析 果蝇的培养及生活史和形态观察 小鼠骨髓染色体的制片及观察 人群中基因频率的调查 人类巴氏小体观察 三、有关说明 1、与其它课程和教学环节的联系 先修课程:动物学、植物学、生物化学、微生物学 后续课程:分子生物学、基因工程、人类遗传学 平行开设课程:细胞生物学 2、教材和主要参考书目 (1)教材:刘祖洞江绍慧遗传学实验高等教育出版社1987年第二版 (2)主要参考书目 ①张文霞等编遗传学实验指导高等教育出版社2005 年版 ②张贵友等编普通遗传学实验指导清华大学出版社2003 年 实验一1、洋葱根尖有丝分裂染色体标本制备及观察(3学时) 一、教学基本要求: 1. 掌握植物染色体压片法。 2. 掌握有丝分裂各时期的特征。 3. 掌握用秋水仙素诱发多倍体的一般方法 二、教学内容: 1、洋葱根尖有丝分裂染色体标本制备及观察 〖目的和要求〗 本次实验通过对植物根尖的制片和观察, 要求学生初步学会对植物组织、细胞的固定、离析和压片方法,了解有丝分裂的全过程及其染色体的动态变化情况,掌握有丝分裂各时期的特征。〖实验原理〗 有丝分裂是细胞均等增殖的过程, 是体细胞分裂的主要方式.在有丝分裂过程中.细胞内每条染色体都能复制一份, 然后分配到子细胞中,因此两个子细胞与母细胞所含的染色体在数目,形态和性质上均是相同的,在各种生长旺盛的植物组织中均存在着有丝分裂。分生组织→固定→解离→染色→压片→观察(间期、早期、中期、后期、末期) 〖材料和方法〗 洋葱或大蒜或种子根尖 水浴锅、显微镜 卡诺氏固定液、石炭酸品红(或醋酸洋红)染色液,1N盐酸(或0.5%果胶酶+纤维素酶),秋水仙素(0.1%)1、取材:大蒜、洋葱根尖,恒温箱

基因工程及其应用的试题研究(精)

基因工程及其应用的试题研究 周小建(苏州市第三中学 215001) 摘要基因工程及其应用是高中生物新教材选修3的重要内容,也是高考中常考的内容。因此,对该部分试题进行研究,探寻命题的方向和特点,是提高该类试题得分率的关键,也是提高整卷成绩、拉开差距的关键。 关键词基因工程及其应用江苏高考命题特点 基因工程及其应用是选修3<现代生物科技专题>的核心内容,其地位更是由《课程标准》上的Ⅰ级(了解层次)上升为《考试说明》上的B级(理解层次),是《考试说明》上对选修3要求的3个B级中的一个,其重要性显而易见。在近几年江苏生物高考试卷中,对该部分内容都给予了高度的重视,每年都会考到,尤其是大题,而且一般会与遗传变异或其他工程的有关内容联系起来考,考查更全面,更细致。所以,有必要针对近几年江苏生物高考卷中此类试题进行剖析和研究,探寻命题的方向和规律,把握命题的指导思想,切实提高学生的得分率。 1 近4年江苏高考该部分试题分析 项目 题号38 15、38(2)、41 38(1)(2)、42B 32、34B(4) 题型非选择题选择题、非选择题非选择题非选择题 合计分值9分11分8分9分 具体考点基因工程的工具、步骤、应用及安全性问题 从上表所列内容可以看出,这部分内容主要以非选择题的形式考查,题量在2 题左右,所占的分值大致在10分左右,涉及的知识点是相对集中、有侧重的,如基因工程的工具、步骤、应用及安全性问题等内容,显然是考查的重点。而对照08年的《考试说明》发现,这些知识点都是要求的,而且还有要求比较高的B级水平(基因工程的应用),符合重点知识重点考查的命题指导思想,体现了能综合运用知识进行分析、推理、解决实际问题的要求。 2 高考生物该部分试题的命题特点 从近几年江苏高考生物卷来看,该部分试题的命题是相对比较稳定的。分析具体考题,笔者认为大致体现了以下3个方面的命题特点。 2.1 重视基础,紧扣课本 高考对基础知识的考查力度一直是很大的。要重视生物学基础知识的教学与复习。分析这几年该部分的高考试题发现,贴近教材,强化对课本基本知识点的考查。但是许多学生在平时复习中轻基础、重难题,考到相关试题,不能及时领悟题目所考查的知识点,缺乏产生相关联想、提取出相关知识点来解决实际问题的能力,导致失分增多。事实上,没有扎实的基础知识就不会形成过硬的能力,能力的培养要建立在掌握厚实的生物学知识的基础上。解题时,思维的启动往往产生于对基本概念和基本原理等基础知识有正确深刻的理解。因此在今后的教学和复习中要引起足够的重视。 例1:(2007年江苏卷第42题B题)很久以前科学家在土壤中发现了某种细菌能制造对昆虫有毒的蛋白质,当时许多人就

(通用版)2020版高考一轮复习课下达标检测(四十)基因工程(生物 解析版)

一、基础题点练 1.(2019·徐州模拟)已知限制性内切酶Xma Ⅰ和Sma Ⅰ的识别序列分别为C ↓CCGGG 和CCC ↓ GGG 。有关这两种酶及应用的叙述,错误的是( ) A .这两种酶作用的底物都是双链DNA B .DNA 中出现这两种酶识别序列的几率不同 C .Xma Ⅰ切割DNA 形成的黏性末端是—GGCC D .使用这两种酶时需注意控制反应温度、时间等 解析:选B 限制酶作用的底物是双链DNA 分子;这两种限制酶作用的核苷酸序列相同,所以这两种识别序列在DNA 中出现的的几率相同;根据碱基互补配对原则,CCCGGG 的互补链是GGGCCC ,并根据Xma Ⅰ的切割位点可知,切割后的黏性末端是—CCGG ;温度能影响酶的活性,所以使用酶时需要注意控制反应温度和时间等。 2.如图表示的是三种黏性末端,下列说法正确的是( ) A .图中所示黏性末端是由同种限制酶切割形成 B .若图甲中的G 碱基处发生突变,限制酶可能无法识别该切割位点 C .图中所示黏性末端是限制酶断开氢键形成 D .目前常用的运载体有质粒、噬菌体和动植物病毒等几类原核生物 解析:选B 产生甲黏性末端的限制酶的识别序列为=====GAA TTC CTTAAG ,产生乙黏性末端的限制酶的识别序列 为=====CAATTG GTTAAC ,产生丙黏性末端的限制酶的识别序列为=====CTTAAG GAA TTC ,可见甲、乙、丙黏性末端是由3种限制酶作用产生的;限制酶具有专一性,能够识别双链DNA 分子的某种特定核苷酸序列,如果甲中的G 发生突变,限制酶可能无法识别该切割位点;图中所示黏性末端是限制酶断开磷酸二酯键形成的;质粒是环状DNA 分子,噬菌体和动植物病毒都没有细胞结构,它们都不属于原核生物。 3.下列关于蛋白质工程的叙述,错误的是( ) A .蛋白质工程的基础是基因工程 B .蛋白质工程遵循的原理包括中心法则 C .蛋白质工程是在分子水平上对蛋白质分子直接进行操作,定向改变分子的结构 D .蛋白质工程能产生出自然界中不曾存在过的新型蛋白质分子 解析:选C 蛋白质工程是通过基因修饰或基因合成对现有蛋白质进行改造,或合成新的蛋白质,故蛋白质工程的基础是基因工程;蛋白质工程遵循的原理包括中心法则;蛋白质工程是通过改造基因来实现对蛋白质分子的改造的;蛋白质工程能产生出自然界中不曾存在过的新型蛋白质分子。 4.(2019·南通模拟)下列关于“DNA 的粗提取与鉴定”实验的叙述,错误的是( ) A .鸡的红细胞和菜花均可作为提取DNA 的材料,处理方法有所不同 B .在切碎的菜花中加入一定量的洗涤剂和食盐,充分研磨,过滤收集滤液

基因工程实验报告

基因工程实验报告

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基因工程实验报告 、

小麦GAPDH截短体的重组与表达 摘要:本实验通过基因工程(genetic engineering)手段对小麦总RNA进行提取、PCR扩增及与质粒载体的重组构建的操作,并将重组质粒以氯化钙法导入大肠杆菌感受态细胞,诱导目的基因表达,并在蛋白水平进行Western检测。通过本对实验的实践,我们对基因工程技术将会有一个比较全面的认识和了解。 关键字:小麦基因;载体;感受态 前言 基因工程(genetic engineering)又称基因拼接技术和DNA重组技术。为在分子水平上对基因进行操作的复杂技术,是将外源基因通过体外重组后导入受体细胞内,使这个基因能在受体细胞内复制、转录、翻译表达的操作。它是用人为的方法将所需要的某一供体生物的遗传物质——DNA大分子提取出来,在离体条件下用适当的工具酶进行切割后,把它与作为载体的DNA分子连接起来,然后与载体一起导入某一更易生长、繁殖的受体细胞中,以让外源物质在其中“安家落户”,进行正常的复制和表达,从而获得新物种的一种崭新技术。它克服了远缘杂交的不亲和障碍。 (一)实验过程

1.实验部分流程: 片段胶 小麦幼苗小麦总RNA RT-PCR扩增小麦pGEX-4T-1 表达载体 表达菌株 目的蛋白 目的蛋白 Western

2.小麦总RNA提取(Trizol法) 2.1 材料 小麦幼苗 2.2 试剂配制及器具处理 ① 0.1%的DEPC H2O(DEPC:焦碳酸二乙酯) ②器具处理:试剂瓶、量筒、研钵、大小枪头和1.5ml和0.2ml 的EP管等用纱布包裹,在 0.1%的DEPC H2O中浸泡过夜(37℃),高压灭菌,80℃烘干备用。剪刀、镊子和药匙等160℃烘烤6h以上。 ③无RNA酶灭菌水(DEPC H2O):用将高温烘烤的玻璃瓶(180℃×2h)装蒸馏水,然后加入 0.1%的DEPC(体积/体积),处理过夜后高压灭菌。 ④Trizol ⑤ 75%乙醇:用新打开的无水乙醇和DEPC处理过的水配制75%乙醇(用高温灭菌器皿配制),然后装入高温烘烤的玻璃瓶中,存放于低温冰箱。 ⑥氯仿(最好用新的)。 ⑦异丙醇(最好用新的)。 2.3 操作步骤: ①先在研钵中加入液氮,再将小麦叶片剪成小段在液氮中磨成粉末,用液氮预冷的药匙取50~100mg组织粉末加入已盛有1ml的Trizol液的EP管中(注意研磨粉末总体积不能超过所用Trizol体积的10%),充分混合均匀。 ②室温放置5min,然后加入200μL的氯仿,盖紧EP管并剧烈摇荡15秒钟。 ③ 12000rpm离心10min,取上层水相于一新的EP管中(千万不要将中间的沉淀层和下层液混入,否则重新离心分离),加入500μL异丙醇,温和颠倒混匀。室温放置10min,12000rpm 离心10min。 ④小心地弃去上清液,加入1ml的75%乙醇,涡旋混匀,4℃下12000rpm离心5min。 ⑤重复步骤④。 ⑥弃去上清液(尽量将残余液体除去),室温或真空干燥5~10min(注意不要干燥过分,否则会降低RNA的溶解度)。用30μL DEPC处理过的水将RNA溶解,必要时可55℃~60℃水浴10min。RNA可进行mRNA分离,或贮存于70%乙醇并保存于-70℃。 3. RT-PCR扩增目的基因cDNA 3.1 试剂 ① RNA模板 ②Olig(dT)18 ③反转录缓冲液 ④dNTP ⑤ M-MULV反转录酶 ⑥ RNA抑制剂(RNasin) ⑦Premix EX Taq DNA聚合酶 ⑧ PCR特异引物 3.2操作步骤: 3.2.1 RNA的反转录 采用Thermo Scientific(Fermentas)RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit Total RNA 6μL(需加入RNA约1μg) OligodT primer 1μL H2O(nuclease-free)5μL 12μL 65℃ 5min,补加下列试剂: 5× Reaction buffer4μL RibolockRNase Inhibitor 1μL 10mM dNTP Mix 2μL RevertAid M-MuLV Reverse Transcriptase 1μL 20μL 42℃ 60min 70℃,5min,﹣20℃保存

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