实用生物信息技术教学大纲

北京大学生命科学学院

“实用生物信息技术”教学大纲

2019年9月4日

本课程面向从事分子生物学、遗传学、基因组学等“湿实验”研究生。课上结合具体实例，介绍序列比对、数据库高级检索、数据库相似性搜索、系统发生树构建、蛋白质结构分析和预测等常用技术和分析方法。选修本课程的同学，通过上机操作，将上述技术和方法用于本人研究课题。

第一讲序列比对

1.基本概念

1.1.相似性和同源性

1.2.直系同源和旁系同源

1.3.动态规划算法和启发式算法

1.4.计分矩阵和空位罚分

1.5.PAM计分矩阵和BLOSUM计分矩阵

1.6.全局比对和局部比对

1.7.双序列比对和多序列比对

1.8.点阵图

1.9.序列图标

2.分析平台

2.1.美国国家生物信息中心

2.2.欧洲生物信息学研究所

2.3.瑞士生物信息中心

2.4.北大生物信息中心

2.5.荷兰瓦格宁根大学

2.6.中科院网络中心

3.简例

3.1.双序列全局比对

3.2.双序列局部比对

3.3.多序列全局比对

3.4.多序列局部比对

3.5.利用点阵图寻找重复序列

3.6.利用序列图标寻找保守位点

4.实例：人、小鼠和大鼠血红蛋白及其编码区序列比对

4.1.研究背景

4.2.血红蛋白alpha亚基氨基酸序列比对

4.3.Alpha珠蛋白编码区核苷酸序列比对

4.4.结果和讨论

第二讲数据库高级检索

1.蛋白质序列数据库UniProt

1.1.UniProt蛋白质序列数据库简介1.

2.序列条目注释信息

1.3.序列位点和结构域注释信息

1.4.与其它数据库的链接

1.5.UniRef参考数据集

1.6.UniParc归档库

1.7.蛋白组

1.8.高级检索

1.9.实用程序

1.10.用户界面

1.11.统计报表

1.1

2.帮助文档

2.核酸参考序列数据库RefSeq

2.1.RefSeq数据库简介

2.2.RefSeq与GenBank区别

2.3.序列条目登录号含义

2.4.高级检索

2.5.与NCBI其它数据库的链接

3.基因组数据库

3.1.常用基因组数据库和基因组浏览器3.2.Ensembl基因组数据库简介

3.3.Ensembl基因组数据库用户界面3.

4.Ensembl基因组数据库应用实例3.

5.主要模式生物基因组数据库

3.6.植物基因组资源网站

3.7.微生物基因组数据库

3.8.病毒资源数据库

4.常用生物大分子专业数据库

4.1.蛋白质家族和结构域

4.2.基因表达

4.3.蛋白质相互作用网络

4.4.代谢通路

4.5.反应过程

4.6.系统发生树

4.7.基因本体

4.8.蛋白质结构分类

4.9.单核苷酸多态性

4.10.microRNA数据库

4.11.拟南芥资源网站

4.12.数据库导航

4.13.NAR数据库专辑

4.14.Database数据库专刊

第三讲数据库序列相似性搜索

1.蛋白质搜索程序

1.1.蛋白质搜索常规程序

1.2.蛋白质位点特异性迭代搜索程序1.3.蛋白质序列模体特异搜索程序1.4.蛋白质结构域数据库搜索程序1.5.蛋白质快速搜索程序

1.6.核酸序列搜索蛋白质数据库

1.7.蛋白质序列搜索核酸序列数据库

2.Blast算法简介和参数设置

2.1.Blast算法简介

2.2.计分矩阵选择

2.3.空位罚分设置

2.4.错误率E值设置

2.5.字长选择

3.NCBI Blast平台

3.1.用户界面和常用程序

3.2.模式生物蛋白质序列数据库搜索3.3.测序载体接头序列检测

3.4.引物设计

3.5.免疫球蛋白搜索

4.Blast经验点滴

4.1.选择数据库

4.2.选择物种

4.3.选择不同程序

4.4.改变输出格式

4.5.分析输出结果

4.6.下载输出结果

4.7.保存搜索策略

4.8.搜索短序列

4.9.屏蔽重复序列

5.Linux系统本地Blast简介

5.1 Linux系统简介

5.2 Linux系统常用命令

5.3 SBP转录因子本地Blast运行实例

5.4 SBP转录因子搜索结果分析

第四讲系统发生树构建

1.分子演化和系统发生树基本概念

1.1.物种分化和分子演化

1.2.分支图和系统树

1.3.物种树和基因树

1.4.有根数和无根树

1.5.二叉树与多岐树

1.6.外部节点和内部节点

1.7.内部节点和根节点

1.8.系统发生树稳定性检验

2.常用系统发生树构建方法

2.1.距离法

2.2.最大简约法

2.3.最大似然法

2.4.贝叶斯推断

3.常用系统发生分析软件

3.1.MEGA

3.2.DAMBE

3.3.Phylip

3.4.PAML

4.系统发生树构建和分析实例

4.1.人珠蛋白家族12个成员基因树

4.2.人、小鼠、大鼠珠蛋白家族37个成员物种和基因树4.3.拟南芥和水稻SBP转录因子家族

4.4.典型系统发生树实例

第五讲蛋白质结构显示和分析

1.蛋白质结构基本概念

1.1.蛋白质结构层次

1.2.氨基酸种类和性质

1.3.多肽链构象特征

1.4.蛋白质分子内部作用力

1.5.蛋白质中的水分子、金属和有机小分子

2.蛋白质结构数据库PDB

2.1.PDB简介

2.2.PDB统计报表

2.3.高级检索

2.4.在线显示

2.5.分析工具

3.结构分析软件SPDBV

3.1.用户界面

3.2.基本操作

3.3.高级操作

4.蛋白质结构显示分析简例

4.1.胰岛素

4.2.免疫球蛋白

4.3.绿色荧光蛋白

4.4.锌脂蛋白

4.5.核小体

第六讲分析实例

1.豌豆内膜蛋白PPF1

1.1研究背景

1.2读码框分析

1.3一级结构分析

1.4跨膜螺旋预测

1.5螺旋轮显示

1.6亚细胞定位预测

1.7叶绿体定位预测

1.8蛋白质功能预测

1.9密码子分析

1.10限制性内切酶位点分析

2 河豚鱼多药耐药基因MDR

1.1研究背景

1.2重复序列鉴定

1.3基因结构预测

1.4基因组序列搜索

2.植物转录因子家族SBP

2.1研究背景

2.2植物转录因子数据库

2.3保守结构域预测

2.4结构域搜索

2.5序列谱分析

3.斑头雁血红蛋白

3.1研究背景

3.2斑头雁和灰雁序列比较

3.3斑头雁和灰雁结构比较

3.4突变模拟

3.5能量优化

3.6结果讨论

4.癌胚抗原

4.1蛋白质结构预测常用方法

4.2蛋白质结构预测常用网站

4.3同源模建基本原理和步骤

4.4癌胚抗原研究背景

4.5癌胚抗原结构预测

5.富含半胱氨酸多肽和蛋白质

5.1蜘蛛毒素序列结构分析

5.2抗菌肽结构预测

5.3金属硫蛋白序列结构分析

参考文献

1.罗静初，实用生物信息技术课程教学实例，《生物技术通报》，2015年，第31卷，第11期，第102-111页.

2.Luo J. Teaching the ABCs of bioinformatics: a brief introduction to the Applied Bioinformatics Course. Brief Bioinform. 2014 Nov;15(6):1004-1

普通生物学教学大纲

《普通生物学》教学大纲课程代码：课程名称：普通生物学英文名：Essential Biology 课程性质：普通教育选修课适用对象：非生物科学类专业学时：48学时学分：3学分考核方式：考查先修课程：无特别要求编写人：审定人：编写日期： 2012.1.12 一、课程的教学目的和教学要求（一）教学目的《普通生物学》是非生物科学类专业的一门普通教育选修课，其目的是让学生了解整个生物界和生命科学的概况，拓宽知识面，提高整体素质。在整个教学过程中，以生物体的基本结构和生命活动的基本规律为重点，以生物的演化为主线贯穿始终，以期让学生了解整个生命世界的发生、发展及演化规律，了解生命科学对人类的重要贡献以及对未来社会发展的重要作用，同时树立辨证的、发展的和普遍联系的观点，有利于提高学生独立思考问题、分析问题的能力。帮助学生树立环境意识和生态观念以及自然界和人类社会可持续发展的思想，为全面提高学生的素质服务。（二）教学要求 1、拓宽学生知识面，掌握生物学的基础知识，了解生命科学不同领域的最新研究成果及其对人类社会发展的重要贡献。 2、掌握动、植物个体发育中组织、器官的形态建成及其对机能和环境适应的基本理论和基本知识。 3、了解生物界各大类群的主要特征及其演化规律。 4、了解生物与环境间的相互关系。

二.教学内容、课时分配与教学手段三、主要参考书《普通生物学》（面向21世纪课程教材），顾德兴主编．北京：高等教育出版社，2000

教学内容绪论本章教学基本要求：掌握：什么是生命理解：生命的结构层次。了解：关于生命本质的一些理论。一、什么是生命二、关于生命本质的一些理论三、生物学的研究方法四、生物学的分科五、生命的结构层次第一章细胞的形态、结构与功能本章教学基本要求：掌握：细胞结构：细胞膜和细胞壁、细胞核、细胞质和细胞器；生物膜——流动镶嵌模型理解：细胞大小和数目，物质的穿膜运动：扩散、渗透、主动运输、内吞作用、外排作用。了解：细胞连接一、细胞大小和数目二、细胞结构：细胞膜和细胞壁、细胞核、细胞质和细胞器三、生物膜——流动镶嵌模型四、物质的穿膜运动：扩散、渗透、主动运输、内吞作用、外排作用五、细胞连接第二章细胞分裂和细胞周期本章教学基本要求掌握：有丝分裂的概念及其生物学意义。了解：癌细胞及其细胞分裂特点。

信息技术与生物教学的融合

信息技术与初中生物教学的融合，使初中生物课堂课堂充满了活力。整合教学时，我们教师遵循生物学习的规律，正确把握初中生物教学的特点，根据教学需要，找准融合的点，选择相应的信息资料和教学策略，使信息技术与初中生物学科的整合达到无缝隙的的融合。我们充分利用信息技术具有交互性，是发散性思维的工具这个特点，形成教师与学生及机器间的互动，互相交流的学习环境及身临其境的场景来达到尊重学生独特体验这个目标。能够帮助学生带着愉悦的心情更好的学习生物学这门功课，帮助学生把抽象的内容直观化,把静止的关系动态化,以增强学生学习的兴趣,能有效地突破重难点,从而促进学生非智力因素的开发。融合点之一：课件使用制作课件能增强课堂的互动性和开放性。在编写课件程序时充分利用文本输入工具、视频导入工具和自定义动画等工具，在教学过程中实现教学双方的随机交流。丰富我们的素材库，给学生多方位的感官刺激，多方位呈现生物知识，以达到最佳的学习效果。另外，课件能根据教学的需要随意调度，便于呈现学生的不同体验，并验证学生学习的成效。例如，在本节课最后我们设计了一个“望图识病”的环节，直观呈现各种病症患者的图片，同时紧接着利用自定义动画的工具，验证学生的学习成果。融合点二：创设丰富多彩的教学情境通过将多媒体信息技术有效地融合于生物学科的教学过程来营造一种新型教学环境，实现一种既能发挥教师主导作用又能充分体现学生主体地位的以“自主、探究、合作”为特征的教与学方式。①例如：教学设计中迷你情景剧—医生救救我的环节，有了多媒体作为依托，参与表演的学生能及时借助幻灯片获取表演的内容，其他的学生可以非常清晰的领会表演者的意图。充分发挥学生的主动性、积极性、创造性，使以教师为中心的传统课堂教学结构发生根本性改革，将学生的创新精神与实践能力的培养真正落到实处。 ②利用文本输入等工具，将小组合作的任务清晰直观地呈现在学生面前，使得小组合作有序高效开展。当小组交流展示时，课件又能紧密配合当前小组讲解内容，呈现相应图文，起到解释说明的作用。让小组合作的效果达到最佳。

实用生物信息技术选课考试.doc

实用生物信息技术选课考试 1 .填空 1) 瑞典植物学家林奈于 _18_ 世纪首先提出双名命名法 2) 英国博物学家达尔文于 1859 年发表《物种起源》提出了生物进化论 3) 奥地利学者孟德尔根据豌豆杂交实验结果，揭示了孟德尔遗传定律：分离定律和自由组合定律 4) 美国遗传学家摩尔根以果蝇为实验材料，创立了染色体遗传理论 5) DNA 分子双螺旋模型由沃森

克里克于 _1953 年提出，论文共页，发表在 _Nature_ 杂志上C 6) 现代智人的英文名为 _______ h o m o ________ ，拉丁文学名为 _Homo sapiens sapiens 9 其生物分类学地位为动物界行索动物门哺乳纲灵长目人 5 人

智人种。 7) 拟南芥是二年生草本植物，植株高约 _7-40_ 厘米，其拉丁文学名为Arabidopsis thaliana _ 其生物分类学地位为植物界被子植物门双子叶植物纲白花菜十字花科拟南芥

拟南芥种。 8) 人类基因组有 _23_ 对染色体，约含 _3*10 9 个碱基对，其中蛋白质编码序列约占约编码 XXX 个蛋白质；人类基因组计划确定的模式生物包括酵母、线虫、果蝇、小鼠 9) 用英文单字符 / 三字符表示：苏氨酸 _T_/_Thr_ 精氨酸 _R_/_Arg 谷氨酰胺 _QJ_Gln_ 组氨酸 9 带负电氨基酸 _E_/_GI U_ 、 _D」_Asp_ ，带芳香环氛基酸 _F_/_Phe_ _Wj_Trp_ _Yj_Tyr_

分子生物学实验课程教学大纲

分子生物学实验课程教学大纲课程名称：分子生物学（Molecular Biology）课程编号：1313072215 课程类别：专业课总学时数：68实验时数：18 学分：3.5 开课单位：生命科学学院生物综合教研室适用专业：生物技术适用对象：本科（四年）一、课程的性质、类型、目的和任务分子生物学实验是生物技术专业一门必修的专业课，涵盖了分子与细胞生物学的许多内容，并与结构基因组学、功能基因组学、蛋白质组学、生物信息学、生物医学、分子病毒学、分子免疫学等学科有着重要的联系。分子生物学实验课程教学以理论课教学为基础，理论与实践相结合，加深对所学知识的理解，对实验仪器要求较高，因此开设本课程的目的是使学生掌握分子生物学实验设备的操作方法，使学生更加牢固地掌握基础知识，更重要的是培养学生的动手能力和科学研究能力，为学生学习生命科学中的其他相关课程作好基础准备。同时也使学生具备分子生物学基本的实验技能，学会发现问题和解决问题的能力，为毕业后从事生物学相关的科研和教学工作奠定基础。本课程的任务是通过实验教学，使学生了解和初步掌握分子生物学实验技术的基本原理和方法，教学内容包括植物基因组DNA的提取、琼脂糖凝胶电泳检测、PCR扩增目的基因及聚丙烯酰胺凝胶电泳等。在实验内容和方法、技术上进行合理安排，力争让学生在有限的课时中尽可能多地了解和掌握现代分子生物学基本理论和有关实验的基本方法和技术原理，并尽可能多地引进、介绍新的、先进的实验方法和技术，以开阔学生视野，提高学生的动手能力和创造性思维能力，培养高素质的生命科学人才。二、本课程与其它课程的联系与分工学习和研究分子生物学的目的在于阐明生命活动的化学物质基础，并与其它学科配合，来揭示生命活动的本质和规律。《生物化学》、《细胞生物学》和《遗传学》是先修课程。三、课程内容及教学基本要求 [1]表示“了解”；[2]表示“理解”或“熟悉”；[3]表示“掌握”；实验一植物基因组DNA的提取植物基因组DNA的提取的目的及原理[1]；植物基因组DNA的提取的实验步骤及操作方法[3]；作业：提取的DNA呈褐色的原因及解决办法？实验二琼脂糖凝胶电泳琼脂糖凝胶电泳的原理及操作步骤[1]，琼脂糖电泳的实验方法[3]；作业：琼脂糖凝胶电泳中电压如何设置？实验三聚合式酶联反应（PCR）扩增目的基因

2020年(生物科技行业)普通生物学基础实验A教学大纲(生科)动物生物学

（生物科技行业）普通生物学基础实验A教学大纲（生科）动物生物学

普通生物学基础实验A2教学大纲课程编号：08207313 学时：34 学分：1 开课对象：生物科学系本科生课程类别：专业必修课课程英文译名：BasicalbiologyexperimentA2 一、教学任务和目的本课程是高校生物类壹年级本科生的专业基础课。本课程从加强基础、培养能力、提高素质的教学目标出发，建立壹个科学、合理的动物生物学实验教学课程体系。使学生通过本课程实验教学，不只是加深理解和巩固所学理论知识，而是更能切实掌握动物生物学基本实验技能，正确使用常规仪器，学会正确记录，分析讨论实验结果，初步综合运用已学实验技术方法设计简单实验。在实验教学中，同时加强对学生进行科学素质和良好的实验室工作习惯的训练。为继续培养具有创新精神和实践能力的高素质人才奠定良好的基础。二、教学基本要求以动物生物学实验的基本操作、基本技能和基本理论为基础，精选重组验证性实验，增加综合性实验及知识范围，操作难度适宜的自选实验的比例，引导、指导学生初步设计实验。建立壹个既和理论课有壹定互补作用，又具有相对独立性的科学、合理、实用性强的实验教学课程体系。在切实培养提高学生实践能力的同时，理论联系实际地培养学生独立思考、综合分析、推理判断的能力，科学思维能力和创新意识，以及科学求实的态度，相互协作的团队精神。三、教学内容本课程实验教学内容在突出基本实验技能训练为先导的基础上，以进化上有重要地位门

类的代表动物（实验动物）为材料，贯穿生物学原理，由简单到综合，由基础性到提高层次的实验，构成包括基本实验—综合性实验—自选性和设计实验3个层次的实验教学课程体系。本课程总共34学时，1学分。实验壹动物细胞、组织的制片和观察实验目的 1、了解普通光学显微镜的基本构造，能够规范和较熟练地使用和维护。 2、学习掌握涂片法制作动物细胞显微玻片标本，动物组织平铺片等临时装片和涂片的制作方法。 3、了解动物细胞的基本结构。 4、掌握动物的4类基本组织结构特点及其结构和机能的关系。实验内容 1、双筒光学显微镜的构造和使用和维护方法。 2、制备口腔粘膜细胞标本，观察细胞形态结构。 3、制备和观察蛙的肠系膜平铺片、蝗虫的肌肉组织分离片、血涂片。 4、利用显微镜观察动物4类组织玻片标本。实验主要仪器设备及材料双筒光学显微镜，无菌牙签，解剖器材，玻片，注射器，染色缸，蛙，蝗虫 7%生理盐水，0.9%生理盐水，0.1M碘液或0.1%亚甲基蓝，1%硝酸银，甲醇，姬母萨染液。实验二原生动物系列实验实验目的 1、学习在显微镜下对运动活泼的原生动物的观察和实验方法。

实用生物信息技术第一次作业汇总

实用生物信息技术课程第1 次作业网络书籍、文档和文献资源检索和应用一、分子月报（Molecular of the Month）： 1) 按功能分类，网站的生物大分子分为哪几大类？ 1、DNA, RNA, and Protein Synthesis - building the molecules of life 2、Enzymes - the cell's chemists 3、Molecular Infrastructure - supporting cells, tissues and organisms 4、Transport - delivering the cell's resources 5、Biological Energy - capturing and converting sources of power 6、Molecules and the Environment - proteins with global impact … 7、Photosynthesis - capturing energy from the sun 8、Molecular Motors - directed motion at the molecular level 9、Cellular Signaling - sending and receiving molecular message 二、2000 年12 篇月报中描述的蛋白质分子，你熟悉的有哪些Pepsin胃蛋白酶) Nucleosome 核小体 DNA Polymerase Myoglobin 肌红蛋白 · 三、有关DNA、rRNA、tRNA 的月报有哪几篇 1、DNA 2、Transfer Ribonucleic Acid (tRNA) 3、Transfer-Messenger RNA 四、该网站中和DNA 复制相关的蛋白质分子有哪些？ 1、DNA Helicase 解旋酶 2、DNA Polymerase 聚合酶 3、Sliding Clamps 4、DNA ligase 连接酶五、该网站中介绍的病毒有哪些？ HIV Adenovirus腺病毒 Ebola Virus Proteins 埃博拉病毒 Bacteriophage phiX174 噬菌体病毒 Dengue Virus 登革病毒 HIV艾滋病毒 Poliovirus and Rhinovirus脊髓灰质炎病毒 Simian Virus 40

基因组学与生物信息学教案

《基因组学与生物信息学》教案授课专业：生物学大类各专业课程名称：基因组学与生物信息学主讲教师：夏庆友程道军赵萍徐汉福

课程说明一、课程名称：基因组学与生物信息学二、总课时数：36学时（理论27学时实验9学时）三、先修课程：遗传学、分子生物学、基因工程四、使用教材：杨金水. 基因组学. 北京:高等教育出版社,2002. 张成岗. 贺福初, 生物信息学方法与实践. 北京:科学出版社，2002. 五、教学参考书： T.A.布朗著，袁建刚译著，基因组(2rd版)，北京：科学出版社,2006. 沈桂芳，丁仁瑞，走向后基因组时代的分子生物学，杭州：浙江教育出版社，2005. 罗静初译，生物信息学概论，北京：北京大学出版社，2002. 六、考核方式：考查七、教案编写说明：教案又称课时授课计划,是任课教师的教学实施方案。任课教师应遵循专业教学计划制订的培养目标，以教学大纲为依据，在熟悉教材、了解学生的基础上，结合教学实践经验，提前编写设计好每门课程每个章、节或主题的全部教学活动。教案可以按每堂课（指同一主题连续1~2节课）设计编写。教案编写说明如下： 1、编号：按施教的顺序标明序号。 2、教学课型表示所授课程的类型，请在相应课型栏内选择打“√”。 3、题目：标明章、节或主题。 4、教学内容：是授课的核心。将授课的内容按逻辑层次，有序设计编排，必要时标以“*”、“#”“？” 符号分别表示重点、难点或疑点。 5、教学方式既教学方法，如讲授、讨论、示教、指导等。教学手段指教科书、板书、多媒体、模型、标本、挂图、音像等教学工具。 6、讨论、思考题和作业：提出若干问题以供讨论，或作为课后复习时思考，亦可要求学生作为作业来完成，以供考核之用。 7、参考书目：列出参考书籍、有关资料。 8、日期的填写系指本堂课授课的时间。

基础生物学教学大纲

《普通生物学》考试大纲及参考书第一篇生命的基本构成第一章绪论【目的要求】概括地介绍生物科学的基本知识，使学生对生物科学能有一个较完整的认识，为学习后续章节打下了基础。尽可能结合讲述一些生物科学在各个学科领域的新成果，新进展。【教学内容】 1.生物科学（生命科学）.有机体，生命的基本特征 2.生命的层次性.生物科学的分科.发展简史及发展动向.生命科学世纪展望 3.物种概念与命名法，生命起源及多样性概述 4.研究生命科学的思维方法【重点难点】研究生命科学的思维方法第二章生命大分子【目的要求】概括介绍组成生命的化学基本物质，使学生了解生命分子的特性，认识细胞组成物质的特性及功能；掌握细胞的元素组成和物质组成。【教学内容】第一节细胞的元素组成第二节细胞的分子组成一.糖类二.脂类三.蛋白质的结构与功能四.核酸的结构与功能【重点难点】蛋白质的结构；核酸的结构第三章细胞膜系统和物质运输【目的要求】了解细胞学说，掌握细胞的基本结构和功能，掌握细胞膜结构和功能，内膜系统各细胞器结构和功能，物质跨膜运输方式，了解信号传递及信号转导第一节细胞的基本知识一．细胞的基本概念．二．细胞的共性三．非细胞形态的生命体---病毒及与细胞的关系四．原核细胞与真核细胞五．植物细胞与动物细胞

第二节细胞膜与细胞内膜系统一.细胞膜与细胞膜表面特化结构二.细胞内膜系统 1．内质网 2．高尔基复合体 3．溶酶体与过氧化物体 4．细胞蛋白质分选与细胞结构装配第三节物质跨膜运输与信号传递一．细胞跨膜运输二．细胞信号传递【重点难点】细胞膜结构和功能，内膜系统各细胞器结构和功能，物质跨膜运输方式，信号传递和信号转导第四章细胞能量代谢（一）光合作用【目的要求】通过本章的学习，使学生明确光合作用的概念和意义；了解光合色素的理化性质及其作用；掌握光合作用的基本过程和机理；了解光合产物在体内运输与分配原理；了解光合作用规律在农业生产上的应用。【教学内容】第一节参与光合作用的光合色素一.光合色素的化学特性二.光合色素的光学特性第二节光合作用的机制一.原初反应二.电子传递与光合磷酸化三.碳同化第三节光呼吸影响光合作用的因素第四节．【重点难点】光合作用的机制、光能的吸收与传递以及光合单位和光能的转化、电子传递链和光合磷酸化、光合碳代谢。第五章细胞能量代谢（二）呼吸作用【目的要求】了解呼吸作用的概念.意义和主要历程，了解完整的呼吸作用过程包括糖酵解，三羧酸循环，电子传递和氧化磷酸化几个相互衔接的过程。【教学内容】第一节细胞的能量——ATP 第二节植物的呼吸代谢途径一.糖酵解二.三羧酸循环三.戊糖磷酸途径第三节代谢途径及其调控

信息技术与生物学科整合教学设计

职业高中生物学科《遗传和变异》一章整合课的教学设计一、本次整合活动的设计目的： 1、通过学生整合活动的经历，培养学生的创造精神、实干精神和服务精神，培养他们的领导才能和奉献他人事业的热情。 2、通过与学科整合，试图改变课堂以教师为主导权威的模式，形成“主导－主体”的教学模式。让学生在“做中学”，让学生在获得信息技术能力的同时，亦获得了具有创造意义的学习方法。培养学生主动学习的习惯。 3、通过与学科整合，让学生在信息技术学科与被整合学科上获得“双赢”。既理顺深化了学科知识性内容，又在潜移默化中培养了学生的科学思维方法，同时培养了学生如何在解决实际问题中运用信息技术的能力。以真正培养学生的信息素养。 4、试图通过本次整合活动，初步探究信息技术如何在课程整合中中充当什么样的角色？为老师的教学做什么？为学生的学做什么？怎样在教学过程各环节中把信息技术与学科教学有机地结合在一起,让信息技术恰倒好处地为学科教学服务？怎样真正既培养了学生的学科素养，又培养了学生的信息素养？ 5、试图探究如何在“应试教育”的重压下，通过信息技术与学科整合提高学科教育的效益。挖掘信息技术学科教育的真正潜力。二、本次整合活动的学情分析： 1、从学生心理特点：职业高中学生认知结构和个性等心理因素形成协同发展的局面，使他们的整体认知水平得以提高，这成为教师开展本次活动的心理学基础。 2、从信息技术学科的角度：（学生已有知识经验及能力水平）通过初中的学习，学生已经基本掌握信息的获取、加工、管理、表达与交流的基本方法；部分优秀的学生能够根据需要选择适当的信息技术工具交流思想，开展合作，解决日常生活、学习中的实际问题。 3、从生物学科的角度：学生正在学习《遗传与变异》的学习内容。学生了解该部分知识内容。三、本次整合活动的信息技术环境： 1、信息技术：是获取信息、探究问题、协作商讨、解决问题的认知工具。 2、资源：在教师机上提供了相关的生物学科的信息素材。（如：动画、图片等） 3、硬件环境：学校局域网。共享文件夹。展示投影仪，展示用单机。四、本次整合活动的阶段: 教学阶段及所用时间教师活动学生活动对学生学习过程的观察和考查要点信息技术的作用第一阶段(1个课时)引导引导学生进入正题选题学生的兴趣、爱好，对信息的处理能力利用局域网收集学生的选题信息第二阶段（4课时）形成作品引导分析技术支持讨论、分析制作、反思小组合作力作品制作能力综合分析选题的能力培养学生的综合分析能力培养学生的制作能力第三阶段（1课时）作品展示学生互评引导展示进行评价展示、评价学生对展示作品的理解力、表达能力和评价能力培养

实用生物信息技术课程第3次作业UniProt数据库高级检索及数据条目

实用生物信息技术课程第3次作业 1 序列比对姓名________ 学号______________ 编号_________ 日期__________ 1. 从UniProt 数据库中提取人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基蛋白质序列，进行全局比对，选择默认计分矩阵BLOSUM62和空位罚分，将比对结果填入表1。分析比对结果，说明得到上述结果的原因和进一步分析思路。表1 人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基蛋白质序列比对结果物种 Species 登录号 Accession 得分 Score 相同氨基酸 Identity 相同和相似氨基酸 Similarity 空位 Gaps 人/小鼠 / 人/大鼠 / 小鼠/大鼠 / 2. 从RefSeq 数据库中提取人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基编码区序列，进行全局比对，将结果填入表2。选择不同计分矩阵和空位罚分，分析比对结果。表2 人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基mRNA 编码区序列比对结果物种 Species 登录号 Accession 得分 Score 相同核苷酸 Identity 相同和相似核苷酸 Similarity 空位 Gaps 人/小鼠 / 人/大鼠 / 小鼠/大鼠 / 3. 从UniProt 数据库中检索并提取人血红蛋白alpha 亚基和胞红蛋白（Cytoglobin ）序列，分别进行全局比对和局部比对，将比对结果填入表3。分析比对结果，说明全局比对和局部比对的差别。表3 人血红蛋白alpha 亚基和beta 亚基蛋白质序列比对结果比对方法长度得分相同氨基酸相同和相似氨基酸空位 Needle Water 4. 将上述数据库检索、序列比对、结果分析的方法、思路、策略用于和你研究课题相关或你熟悉的蛋白质及其编码序列，分析比对结果，说明原因。

生物信息技术专业个人简历模板原创

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自荐信尊敬的领导：您好！今天我怀着对人生事业的追求，怀着激动的心情向您毛遂自荐，希望您在百忙之中给予我片刻的关注。我是生物信息技术专业的2014届毕业生。大学四年的熏陶，让我形成了严谨求学的态度、稳重踏实的作风；同时激烈的竞争让我敢于不断挑战自己，形成了积极向上的人生态度和生活理想。在大学四年里，我积极参加生物信息技术专业学科相关的竞赛，并获得过多次奖项。在各占学科竞赛中我养成了求真务实、努力拼搏的精神，并在实践中，加强自己的创新能力和实际操作动手能力。在大学就读期间，刻苦进取，兢兢业业，每个学期成绩能名列前茅。特别是在生物信息技术专业必修课都力求达到90分以上。在平时，自学一些关于本专业相关知识，并在实践中锻炼自己。在工作上，我担任生物信息技术01班班级班长、学习委员、协会部长等职务，从中锻炼自己的社会工作能力。我的座右铭是“我相信执着不一定能感动上苍，但坚持一定能创出奇迹”！求学的艰辛磨砺出我坚韧的品质，不断的努力造就我扎实的知识，传统的熏陶塑造我朴实的作风，青春的朝气赋予我满怀的激情。手捧菲薄求职之书，心怀自信诚挚之念，期待贵单位给我一个机会，我会倍加珍惜。下页是我的个人履历表，期待面谈。希望贵单位能够接纳我，让我有机会成为你们大家庭当中的一员，我将尽我最大的努力为贵单位发挥应有的水平与才能。此致敬礼！自荐人：××× 2014年11月12日唯图设计因为专业，所以精美。为您的求职锦上添花，Word 版欢迎下载。

生物信息学理论大纲

《生物信息学》课程教学大纲课程编号：E082042 课程类型: 专业选修课课程名称：生物信息学英文名称：Bioinformatics 学分：2 适用专业：生物工程第一部分大纲说明一、课程的性质、目的和任务生物信息学是应用信息科学研究生物体系和生物过程中信息的存贮、信息的内涵和信息的传递，研究和分析生物体细胞、组织、器官的生理、病理、药理过程的中各种生物信息，或者说是生命科学中的信息科学。生物信息学是数学、统计、计算机与生物命科学的交叉新兴学科,它广泛地渗透到生物学的各个研究领域中，更是生物工程研究中不可缺少的重要工具。随着人类基因组计划的快速发展，生物信息学技术在功能性基因的发现与识别、基因与蛋白质的表达与功能研究方面都发挥着关键的作用。本课程从生物信息学的基本理论和技术出发，结合该学科应用研究的教授，使学生能扎实掌握生物信息学的基本理论、国内外研究的前沿进展以及如何为经济建设和社会发展服务等内容。二、课程的基本要求本课程使学生了解生物信息学的基础知识，生物信息数据库的使用，生物信息工具的应用，熟悉生物信息学学科的发展和现状，熟悉几种主要数据库的内容、注释、检索，掌握常用数据库搜索工具的使用方法，了解上述方法在实际研究中的应用（包括基因序列信息分析、基因预测、分子进化及系统发育树和蛋白质结构预测等重要问题）。三、本课程与相关课程的联系本课程是以普通生物学、分子生物学、信息科学、数理统计、工程学为基础的交叉

学科。先修课程：普通生物学、生物化学、微生物学。四、学时分配五、教材与参考书教材：《生物信息学》(普通高等教育“十一五”规划教材)，许忠能主编，清华大学出版社，2008。参考书：1．Bioinformatics（英文原版），Westhead et al.,科学出版社，2003；2．Computational Molecular Biology，Pevzner，MIT Press，2000； 3．Biological Sequence Analysis（英文原版）, Durbin等,清华大学出版社，2002；

《解剖生理学》教学大纲 - 华中科技大学·生命科学与技术学院

《解剖生理学》课程教学大纲原芸、李臣鸿、黄瑛、陈祖建一. 课程名称解剖生理学Anatomy and Physiology 二. 课程编码0702761 三. 学时与学分64学时 / 4学分四. 先修课程普通生物学生物化学细胞生物学五. 课程教学目标 1．解剖学教学使学生掌握人类及实验动物大体解剖构造，掌握基本组织、器官组织的基本特点，掌握常用实验动物的基本实验操作方法。 2．生理学在医学教育中是一门重要的基础理论课，其目的在于使学生掌握正常人体生命活动的基本规律，尤其要掌握基本的理论知识，基本实验技术及培养学生分析解决问题的能力。六. 适用学科专业生物医学工程生物技术生物信息技术七. 基本教学内容与学时安排解剖学理论课部分(24学时) ●绪论(2学时) 分类、历史、学习的必要性、生物工程学科学习的必要性；解剖学姿势、方位术语、切面术语、变异和畸形定义；解剖学的未来及与其它学科的关系。 ●运动系统(2学时) 骨学骨连结肌学 ●呼吸系统(1学时) 呼吸道肺胸膜纵隔 ●循环系统(8学时) 心血管系统(心脏2学时;动脉2学时;静脉2学时;微循环1学时) 淋巴系(1学时) ●泌尿系统(2学时) 肾输尿管道 ●神经系统(8学时) 脊髓和脊神经(2学时) 脑和脑神经(2学时) 神经传导路(2学时) 内脏神经(2学时) 脑和脊髓的被膜、脑室、脑脊液、脑和脊髓的血管

●内分泌系统(1学时) 内分泌腺的特点、组成及主要功能；甲状腺、甲状旁腺、肾上腺、胸腺、松果体和垂体的形态、位置及主要功能，组织结构。生理学理论课部分(40学时) ●绪论(2学时) 人体的基本功能人体生理功能的调节人体生理学的研究内容和研究方法 ●细胞的基本功能(4学时) 细胞膜的基本结构和物质转运功能(2学时) 细胞的生物电现象及其产生机制兴奋的引起和传播 (2学时) 神经纤维的功能肌细胞的收缩功能 ●神经系统(10学时) 神经元活动的一般规律(2学时) 反射活动的一般规律中枢抑制(2学时) 中枢神经系统的感觉功能中枢神经系统对躯体运动的调节(2学时) 神经系统对内脏活动的调节(2学时) 脑的高级功能和脑电图(2学时) ●血液(2学时) 体液与内环境概念血液的组成和理化特性血型 ●血液循环(10学时) 心脏生理(心肌生物电2学时；心脏射血2学时) 血管生理(动脉血压2学时；微循环2学时) 心血管活动的调节(2学时) ●呼吸(6学时) 肺通气 (2学时) 肺换气与组织换气 (2学时) 气体在血液中的运输呼吸运动的调节(2学时) ●肾脏生理(6学时) 肾的结构与肾血液循环的特征(2学时) 肾小球的滤过功能肾小管和集合管的泌尿功能(2学时) 尿液的浓缩和稀释机制(2学时) 肾脏对机体水盐代谢的调节

实用生物信息技术课程期末总结

实用生物信息技术课程期末总结中国科学院大学级硕士研究生暑期课 – 姓名学号班组号电话邮箱成绩选题一 1．检索文献摘要数据库，找出你正在进行或准备开始的研究题相关论文。通过文献阅读，简述你课题的研究背景和科学意义。 2．以你课题相关基因或蛋白质为例，检索、、、等序列、结构、基因组等各种综合数据库，并通过数据库交叉链接，对各种数据库中的注释信息进行归纳总结，或利用模式生物中同源基因的相关注释信息，说明你研究课题涉及的基因或基因家族的基因结构和序列特征、及其所编码的蛋白质的序列特征、结构特点、代谢通路、调控网络等，分析或推测其可能的生物学功能。 3．选取代表性物种，从数据库中提取直系同源和旁系同源基因的核酸或蛋白质序列，进行系统发育分析，推断该基因家族的起源和演化。 4．利用序列分析、数据库搜索、结构分析等各种生物信息学工具，对你研究课题相关基因和蛋白质进行深入分析；根据上述分析结果，谈谈对课题下一步研究的计划和设想。选题二 . 文献检索 1)阅读分子月报（）中你最感兴趣的生物大分子，阐述该分子的结构、功能特点。 2)蛋白质分子精选（）中你最感兴趣的蛋白质分子有哪些？简述它们的生物学功能。 3)简述文献检索系统中的主要功能，列出你在中保存的常用检索策略。 4)检索文献摘要数据库，找出最近年内该数据库收录的与你研究方向或课题相关的的论文，列表说明前篇的第作者、期刊名、发表日期和。 2.数据库检索 1)以血红蛋白或你熟悉的蛋白质为例，简述数据库中该序列条目的序注释信息。 2)以你熟悉的物种和蛋白质为例，说明数据库的高级检索方法。 3.数据库搜索 1)简述数据库搜索网站的包括哪些程序，总结你已经使用过的程序的功能、特点和使用方法。 2)以血红蛋白或你熟悉的核酸和蛋白质序列为例，说明如何利用进行数据库搜索、参数设置，并对搜索结果进行分析。 4.生物信息分析平台 1)以你熟悉的核酸或蛋白质序列为例，利用、和等提供的工具进行序列分析，说明分析结果。 2)简述你常用或熟悉的生物信息分析平台、软件和教学网站，举例说明其用途、用法和结果分析。

【VIP专享】《普通生物学(实验部分)》课程教学大纲

《普通生物（实验部分）》课程教学大纲课程编码：学时数：24学时编写日期：2004年6月修订日期：2010年6月执笔者：田清涞审阅者：张亚兰一、实验的目的及在专业培养中的作用普通生物学实验是基础主干课普通生物学的辅助性实验课，通过实验验证加深对生物学理论的理解。通过实验训练学生最基本的操作和技能，了解当今生物学技术，生物工程进展，为学生今后从事生物工程、生物技术制药等方面的工作奠定基础。二、实验内容序号实验项目名称学时实验类型1显微镜的使用、动物细胞组织的制片观察2验证 2无脊椎动物实验4验证 3蟾蜍的解剖4验证 4家兔的外形和内部解剖4验证 5植物细胞、组织的观察4验证 6植物器官--根、茎、叶、花、果实和种子的结构观察4验证 1人血涂片的制备观察及ABO血型鉴定2综合实验一显微镜的使用、动物细胞组织的制片观察（2学时）实验性质：验证性实验实验教学要求： 1.了解普通光学显微镜的基本构造，能够规范和较熟练地使用和维护。 2.学习掌握涂片法制作动物细胞显微玻片标本。 3.掌握动物组织平铺片、分离片等临时装片和涂片的一般制作方法。 4.掌握动物的四类基本组织结构特点，理解组织结构与功能的密切关系。

5.了解动物细胞的基本结构。实验教学内容： 1.显微镜的结构使用方法 2.动物临时装片制作的基本实验技能 3.制备口腔粘膜细胞标本，观察细胞形态结构 4.动物四大组织玻片标本观察、示范、多媒体演示实验二无脊椎动物实验　（4学时）实验性质：验证性实验实验教学要求： 1.掌握原生动物到节肢动物的主要特征 2.了解无脊椎动物的进化过程 3.认识和理解原生动物的单个细胞是一个完整的能独立生活的有机体 4.认识一些常见的原生动物 5.学习在显微镜下对运动活泼的微型动物的观察和实验方法实验教学内容： 1.观察原生动物、海绵动物、腔肠动物、扁形动物门、线形动物门、软体动物、节肢动物的标本。 2.草履虫活体观察和实验 3.草履虫生殖装片的观察实验三蟾蜍的解剖（4学时）实验性质：验证性实验实验教学要求： 1.通过对蟾蜍外部形态及各器官系统的观察，熟悉其由水生到陆生的过渡性特征及适应性特征。 2.了解神经系统的基本反射过程。 3.掌握两栖动物的解剖技术。实验教学内容： 1．蟾蜍外形观察及各部位测量 2．学习双毁髓法处死蟾蜍，观察屈反射、搔扒反射，

实用生物信息技术课程教学实例_罗静初

自2000年起，本人在北京大学和中国农业科学院研究生院开设“实用生物信息技术”课程［1］。本课程以从事分子生物学实验研究的硕士或博士研究生为教学对象，重点介绍最基本、最常用的生物信息技术和方法，主要包括：（1）蛋白质和核酸序列相似性比对；（2）蛋白质序列数据库UniProt 和核酸序列数据库RefSeq 高级检索；（3）NCBI 数据库相似性搜索工具Blast 的应用；（4）利用MEGA 软件构建分子系统发生树；（5）利用Swiss -PdbViewer 软件显示、比较和分析蛋白质三维空间结构。本文以人、小鼠、大鼠、斑头雁、灰雁几个不同物种的血红蛋白序列和结构为例，介绍这些常用生物信息技术和方法的具体应用。学生通过这些实例，能够初步掌握这些方法的具体应用，并能举一反三，将这些方法用于自己的课题研究，学会如何利用丰富的网络生物信息资源和分析工具解决自己正在进行或即将开始的研究课题中的实际问题。 1 序列比对 1.1 研究背景血红蛋白是人体血液中重要蛋白质分子，其主收稿日期：2015-03-26作者简介：罗静初，男，教授，研究方向：生物信息学；E -mail ：luojc@https://www.360docs.net/doc/b87072197.html, 实用生物信息技术课程教学实例罗静初（北京大学生命科学学院北京大学蛋白质与植物基因研究重点实验室北京大学生物信息中心，北京 100871）摘要：介绍“实用生物信息技术”研究生课程的5个教学实例。以血红蛋白序列和结构为例，介绍常用生物信息技术和分析方法，包括蛋白质和核酸序列相似性比对、蛋白质和核酸序列数据库检索、Blast 数据库相似性搜索、分子系统发生树构建，以及蛋白质结构比较分析等。关键词：生物信息技术；血红蛋白；序列比对；数据库检索；Blast 数据库搜索；系统发生树构建；蛋白质结构比较分析DOI ：10.13560/https://www.360docs.net/doc/b87072197.html,ki.biotech.bull.1985.2015.07.001 Teaching Examples of Applied Bioinformatics Course Luo Jingchu （College of Life Sciences ，The State Key Laboratory of Protein and Plant Gene Research ，Center for Bioinformatics ， Peking University ，Beijing 100871） Abstract: In this article, we introduce the basic bioinformatics analysis methods and tools taking the hemoglobin as an example. The methods include ：1）protein and DNA sequence alignment ；2）advanced search for UniProt and RefSeq database ；3）Blast database similarity search ；4）phylogenetic tree construction under MEGA ；5）protein structure comparison using Swiss -PdbViewer. Key words: bioinformatics ；hemoglobin ；sequence alignment ；database query ；Blast database similarity search ；phylogenetic tree construction ；protein structure comparison 编者按: 自2000年起，罗静初教授在北京大学生命科学学院和中国农业科学院研究生院开设“实用生物信息技术”课程，教学方法以上机实习为主，指导学生利用丰富的生物信息网络数据资源和软件工具，结合自己的研究课题，进行生物信息分析。本文以血红蛋白为例，介绍常用生物信息技术与方法的具体应用，对生物信息领域科研人员具有一定参考价值。网络出版时间：2015-06-26 16:39 网络出版地址：https://www.360docs.net/doc/b87072197.html,/kcms/detail/11.2396.Q.20150626.1639.002.html

基因组学教学大纲

附件1：二、课程性质、地位和任务《比较基因组学》是在基因组图谱和序列分析的基础上，对已知基因和基因的结构进行比较，了解基因的功能，表达调控机制和物种进化过程的学科。它通过对不同物种的基因组数据进行比较分析，揭示彼此的相似性和差异性，以了解不同物种间进化上的差异。进行基因组比较分析时，研究并不仅限于基因编码区，还扩展到对序列相似性的分析、基因位置的比较、基因编码区长度或外显子数的变异、基因组上非编码区的比例、进化关系较远的物种间高度保守区域的比较分析等等（例如从最简单的细菌到非常复杂的人类基因组之间的比较）。比较基因组学和其它相关学科（如分子生物学、生物信息学和遗传学等）的交叉渗透，起着承前启后的作用，对这些学科的基础理论研究和生产实践都将产生巨大的影响。通过本课程的学习，希望使学生了解比较基因组学在生物学研究领域的重要地位，发展现状，能够全面掌握基因组学的发展历史，病毒、原核生物和真核生物的基因组结构，基因组水平上的遗传图谱与物理图谱的绘制，基因组的测序与序列组装，基因组的比较分析，基因组水平的表达与调控以及基因组进化的分子机制以及进化模式。三、课程基本要求理论和知识方面：通过课程讲授，使学生了解比较基因组学诞生的背景、发展概况和应用前景；掌握比较基因组学的基本理论和基本分析方法，包括基因组的结构、基因组水平上的遗传物理图谱绘制、基因组的测序与组装、基因组水平的基因表达与功能研究、基因组的比较分析（外显子数目、共线性分析、基因组上非编码区的变异）、基因组与生物进化等。能力和技能方面：以系统的理论知识学习为主，并以课堂讨论当前不断发展的基因组学新知识和新动态为辅助内容，在了解掌握基因组学基本知识的基础上，针对该学科的特点，要求学生能够进行简单的比较基因组学分析。同时注意培养分析思考问题的能力，能运用比较基因组学知识分析鉴定重要的功能基因，并在课堂上介绍当前一些领域的最新动态。课堂教学、课堂讨论、国内外发展动态介绍是基本学习方法。四、课程内容及学时分配第一章绪论（3学时）教学基本要求：通过对引论的学习，明确比较基因组学的含义，比较基因组学的研究对象、内容和课程的主要任务，了解比较基因组学的发展历程及其展望，为学习好本门课程奠定良好基础。教学重点和难点：基因组学及比较基因组学的产生及概念，比较基因组学的研究内容教学方法与手段：多媒体教学、自学与课堂讨论相结合第一节基因组学与（比较基因组学）的含义、研究范畴和发展历程第二节病毒、原核生物和真核生物基因组的特点第三节人类基因组计划

9、《普通生物学》教学大纲及习题、答案

9、《普通生物学》教学大纲及习题、答案课程内容与教学要求绪论第一章细胞和组织第二章营养——生物对物质和能的获取第三章气体交换——呼吸第四章物质在生物体内的运输第五章水盐平衡和体温调节第六章神经系统第七章感受器和效应器第八章激素第九章行为第十章花与果实第十一章生物的遗传与变异第十二章生命的起源与生物的进化第十三章生物的分界第十四章生物与环境第十五章生物多样性保护与利用一、课程概述《普通生物学》是研究生命现象和规律的一门基础科学，它包含生物学的多个分支学科，是生物学的一个缩影和通论。《普通生物学》是生物技术专业、生物技术专业（生物医药方向）、生物科学专业等的专、本科开设的主要专业基础课程。作为新生入学第一学年的必修课，其目的是让学生了解整个生物界和生命科学的概况，拓宽知识面，打下扎实的生物学基础，提高整体素质，为今后专业基础课和专业课如细胞生物学、微生物学、遗传学、生物化学、分子生物学等的学习奠定良好的基础。在整个教学过程中，以生物体的基本结构和生命活动的基本规律为重点，以生物的进化为主线贯穿始终，以期让学生了解整个生物界的发生、发展及演化规律，了解生命科学对人类的重要贡献以及对未来社会发展的重要作用，同时树立进化的、辨证的、发展的和联系的观点，有利于提高学生独立思考问题、分析问题的能力。帮助学生树立环境意识和生态观念以及自然界可持续发展思想，为全面提高学生的素质服务。返回二、课程目标本课程以培养学生的生物学能力，提高学生的生物学素养为总目标。学生通过本课程的学习，达到以下具体目标： 1 、知道《普通生物学》这门课程的性质、地位和价值。知道这门学科的研究范围、研究方法、学科进展和发展方向。 2 、了解生命科学中的植物学和动物学等学科领域的基本知识。理解该门学科的主要概念、基本原理和策略等。 3 、学会或掌握一定的生物学基本技能。 4 、学会运用基本理论及其基本原理去解决实际问题。 5 、初步形成对生命科学领域的整体认识，培养学生的创新意识和实践能力。 6 、了解人与自然的和谐统一，初步形成可持续发展的观念。三、课程内容与教学要求这门学科的知识与技能要求分为知道、了解、掌握、学会四个层次。这四个层次的涵义是：知道——是指对这门学科及生命现象的认知。理解或了解——是指这门学科涉及的概念、原理的说明和解释。掌握——是指运用已理解的概念和原理说明、解释、分析生命现象和生命活动规律。学会——是指能在教师指导下，独立地完成某些知识和技能的操作任务，或能识别操作中的一般差错。绪论 1. 什么是生命——生命的基本特征；2 ．关于生命本质的一些理论；3 ．生命科学方法；4 ．生物学的分科 5 ．生命的结构层次； 6 ．生物科学发展及新成就； 7 ．普通生物学学习方法和要求第一部分细胞与生物大分子第一章细胞和组织 1 ．细胞的化学组成； 2 ．细胞的形态结构； 3 ．细胞对物质的吸收作用； 4 ．细胞的连接； 5 ．细胞的代谢； 6 ．细胞周期的基本概念； 7 ．有丝分裂和减数分裂过程及其意义； 8 ．植物组织的概念和类型； 9 ．动物组织的概念和类型 10 ．内环境与稳态第二章营养——生物对物质和能的获取