(整理)基因工程笔记.

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1 .什么叫基因工程(Gene Engineering),试从理论和技术两个方面谈谈Gene Engineering

诞生的基础?

基因工程:在体外将核酸分子插入病毒、质粒或其它载体分子,构成遗传物质的新组合,

并使之参入到原来没有这类分子的宿主细胞内,而能持续稳定地繁殖。

理论基础:①1944年,美国生物学家Avery等通过细菌转化研究,证明DNA是基因载体,即基因的分子载体是DNA而不是蛋白质,从而明确了遗传的物质基础问题;

②1953年Watson和Crick建立了DNA分子的双螺旋结构模型,1958年至1972年揭示

了先后确立了中心法则,破译了64种密码子

技术基础:①20世纪60年代末70年代初,限制性核酸内切酶和DNA连接酶的发现使DNA

分子进行体外的切割和连接成为可能;

②1972年首次构建了一个重组DNA分子,提出了体外重组的DNA分子如何进入宿主细胞,并在其中进行复制和有效表达等问题。经研究发现,质粒分子是承载外源DNA片段的

理想载体,病毒,噬菌体的DNA(或RNA)也可改造成载体

③1973年大肠杆菌转化体系的建立,这实验结果说明基因工程问世,不仅宣告质粒分

子可作为基因克隆载体,能携带外源DNA导入宿主细胞,并且证实真核生物基因可转移到

原核生物细胞中,并在其中实现功能的表达(基因工程诞生的元年)

克隆:作为名词使用时,是指某一个体(或细胞、分子等)通过无性繁殖的方式产生的具有

相同遗传背景的后代(或子细胞、分子等)组成的集体(或群体);作为动词使用时,指产

生上述集体或群体的过程。

质粒小量提取中,溶液Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ作用是什么?

溶液Ⅰ是使细胞完全分散溶液Ⅱ是使细胞壁破裂,DNA变性溶液Ⅲ是使质粒选择性复性,而染色体DNA随同SDS和蛋白质一起沉淀下来

限制性核酸内切酶(Restriction endonuclease):是一类能够识别双链DNA分子中的某种

特定核苷酸序列(4—8bp),并由此处切割DNA双链的核酸内切酶。

RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)限制片段长度多态性:指用某一种限制性

内切酶来切割来自不同个体的基因组DNA或某一个基因,会得到不同长度的DNA片段。可

用于基因组图谱构建、致病基因检测、基因定位、生物进化和分类的研究等

限制性图谱(restriction map):是指一系列限制酶的特异识别序列在DNA链上的出现频率

和它们之间的相对位置。又称物理图谱(physical map)

核酸限制性内切酶的类型及主要特性

特性I类内切酶II类内切酶III类内切酶

限制和修饰活性单一多功能的酶内切酶和甲基化酶分开共同亚基的双功能酶内切酶的蛋白结构3种不同的亚基单一成分2种不同的亚基

限制作用所需要的辅助因子ATP、Mg2+和

SAM

Mg2+ ATP、Mg2+和SAM

寄主特异性位点识别序列EcoB:

TGA(N)8TGCT

EcoK:

回文序列

(IIs型除外)

EcoP1:

AGACC

EcoP15:

AAC(N)6GTGC CAGCAG

切割位点在距离识别位点至少

1000 bp处随机切开一

条单链。位于寄主特异性位点或其

附近

距寄主特异性位点

3‘端24—26bp处

酶催转换不能能能

DNA易位作用能不能不能

甲基化作用的位点寄主特异性位点寄主特异性位点寄主特异性位点识别未甲基化的序列

进行切割

能能能

序列特异的切割不是是是

基因工程中的用途无用十分有用

常用的DNA聚合酶的特点共同特点:把dNTPs连续地加到引物的3’—OH端。

主要区别:持续合成能力和外切酶活性不同。2 T7 DNA聚合酶可以连续添加数千个dNTPs 而不从模板上掉下来。其它几种DNA聚合酶只能连续添加10多个dNTPs就会从模板上解离下来。

3. 常用DNA聚合酶的特性比较

DNA聚合酶3’→5’外切酶活性5’→3’外切酶活性聚合速率持续能力

大肠杆菌DNA聚合酶低有中低

Klenow fragment 低无中低

T4DNA聚合酶高无中低

T7DNA聚合酶高无快高

化学修饰T7DNA聚合酶低无快高

遗传修饰T7DNA聚合酶无无快高

逆转录酶无无低中

Taq DNA聚合酶无有快高

Taq聚合酶:

TaqDN聚合酶的最大特点是热稳定性,耐高温,非常适合PCR过程的反复高温变性要求。最适温度高75-80 oC 功能缺点,具有5’?3’聚合酶活性和5’?3’外切酶活性,但没有3‘?5’外切酶活性。因此不能修复错误的碱基配对!Taq DNA聚合酶的激活剂金属离子敏感(尤其是Mg2+

末端脱氧核苷酸转移酶(terminal transferase):

特性:

(1)5’?3’DNA聚合酶活性

①需要3’—OH、二甲胂酸缓冲液。

②不需要模板!

③底物可以是单链DNA、是3’—OH突出的双链DNA、平末端在Co2+代替Mg2+下也可以。

④随机添加的dNTPs。如果只有一种dNTP,就添加上同聚物

末端转移酶的用途

(1)同聚物加尾给外源DNA片断和载体分子分别加上互补的同聚物尾巴,以使它们有效地连接。

(2)再生酶切位点,便于回收克隆片断。

(3)非放射性标记DNA片断的3’端催化非放射性标记物参入DNA片断的3’端。(生物素-11-dUTP等)

S1核酸酶:

特性(1)高度单链特异性(2)反应条件:①低水平Zn2+ ,②pH4.0~4.3、

S1核酸内切酶的功能(1)催化单链RNA或DNA降解。(2)切掉双链核酸中的单链区。发卡或有缺口的部位。3)降解限制酶切形成的单链突出端。(4)不能降解双链DNA或RNA-DNA杂交链

. S1核酸酶的用途(1)定位RNA 内切酶位点不能位于内含子序列中!

(2)用mRNA测定基因中的外显子序列不能配对的内含子区域形成的单链环被S1切掉。

pBR322: F. Bolivar和R.L. Rodriguez人工构建载体。

(1)元件来源

①复制起点ori pMB1系列(来源于ColE1)的高拷贝型复制起点

②Ampr基因pSP2124质粒的Ampr基因

③Tetr基因pSC101的Tetr 基因。

(2)长度

(3)选择标记氨苄青霉素和四环素抗性。

(4)克隆位点24个克隆位点。其中9个会导致Tetr基因失活(如BamH I、Hind Ⅲ、Sal I)3个会导致Ampr基因失活(Sca I、PvuI、Pst I)。见图P93

(5)pBR322的优点

①双抗菌素抗性选择标记插入失活,分两次先后选择:没有获得载体的寄主细胞? 在Amp或Tet中都死亡。获得载体的寄主细胞?在Amp或Tet其中之一中死亡。外源基因?BamH

I :Amp中存活,但在Tet中死亡外源基因?Pst I:Tet中存活,但在Amp中死亡

②分子小,克隆能力大载体越小越好。>10kb的DNA在纯化过程中容易断裂。

③高拷贝数氯霉素扩增之后,每个细胞可达1000~3000copy

④安全失去了转移蛋白基因mob(mobilization)。不能通过接合转移。

(6)pBR322的缺点保留了转移蛋白(mob)的作用位点。能够被ColK质粒编码的mob 蛋白识别,如果再有F质粒的参与,就有可能转移!

(7)PBR322的改进

①删除mob识别位点(如质粒pBR327、pAT153等)。pAT153:从pBR322上切去HaeII片断,既除去了mob识别位点,又增加质粒的拷贝数。

②改造EcoR I 位点pBR325:使EcoRI 也成为插入失活型位点。

在pBR322位点上接入一段来自噬菌体PICm的HaeII酶切片断(带有氯霉素抗性基因cmlr)。cmlr上也带一个EcoRI位点。

pUC系列

University of California的J. Messing和J. Vieria于1978年,在pBR322的基础上改造而成。属正选择载体。pUC7、pUC8、pUC9、pUC10、pUC11、pUC18、pUC19

(3)元件来源

①复制起点:pBR322的ori

②Ampr 基因pBR322的Ampr基因,但其上失去了克隆位点。

③lacZ的启动子:大肠杆菌

④lacZ’基因:大肠杆菌lacZ的a-肽链序列,是LacZ 的氨基端片断。

(2)长度约2.7kb

(3)克隆位点10个连续的单一限制酶切位点,位于lacZ’基因的5’端

Ti质粒: 存在于能引起植物形成冠瘿瘤的土壤农杆菌中,诱导冠瘿瘤形成,又称肿瘤诱导质粒(tumor inducing plasmid)

天然Ti质粒作载体的缺点

(1)分子量太大(200kb)!

(2)限制性酶切位点太多。

(3)被转化的植物细胞成为肿瘤,不能再分化。

(4)在大肠杆菌中不能复制。

. Ti质粒的改造

(1)保留T-DNA的转移功能部分(vir基因,左右边界)。

(2)减少限制性酶切位点,引入单一插入位点。

(3)取消T-DNA的致瘤基因,使被转化的植物细胞不再成为肿瘤,能正常分化。

(4)冠瘿碱合成对于植物无意义。应剔除掉。

(5)加入大肠杆菌的ori和选择标记。

(6)加上真核生物的转录信号和结束信号以及添加polyA的信号序列。

改造后的Ti质粒载体模式

双元质粒载体和共整合载体

应用聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR):在体外特异性地扩增某个基因。可用于目的基因的扩增和分离

Primer设计的一般原则:

1位置:与待扩增的模板DNA区段的两3’端序列互补( 5‘端相同)的短DNA

2引物长度至少16bp,一般引物设计为长15—30bp

3引物的碱基序列 3‘端必须与模板正确配对,5’端可以不配对

4引物的碱基组成 1)尽可能提高G+C含量,以提高引物与模板的结合力2)避免连续相同碱基排列或内部回文序列.

5避免形成引物二聚体(dimer)两个引物之间不能有两个以上的连续碱基序列互补

6当引物中的(G+C)含量低于50%时,复性温度低于55 oC。实际复性温度选择低于Tm 值5 oC。适当提高复性温度可以提高引物与模板结合的特异性,减少非特异产物的出现

7引物的浓度一般使用终浓度各0.5mmol/L

8简并引物如果引物的序列是从基因产物蛋白质的氨基酸序列反推出来的,就必须考虑密码的简并性。需要合成多种序列的引物,彼此间只有一个或几个碱基差异。这样的混合引物称简并引物

9套嵌引物(nested primers) 设计多组引物,结合位点依次位于前一组引物之间。增加扩增产物的特异性。

PCR技术的原理模板DNA变性

引物DNA复性引物DNA延伸

1)DNA模板变性95oC双链DNA在受热后,配对碱基的氢键断裂,DNA两条链分开成为单链。

(2)DNA模板与引物复性40-65oC

引物(primer): 人工合成的单链DNA小片断,碱基顺序分别与所要扩增的模板DNA双链的5‘端相同。

(3)DNA链的延伸72oC DNA聚合酶按碱基配对原则在模板上延伸DNA链。

PCR的过程

(1)第一步变性(denature)94-95 o C下5分钟,模板DNA双链完全变性成单链。(2)第二步复性(anneal)50-60 o C下1分钟,引物优先与模板复性。①引物的浓度高,②引物的链短。

(3)第三步延伸(extend)72 o C下1-2分钟,Taq DNA聚合酶在引物的3‘端上加上核苷酸。

(4)第四步变性(denature)94 o C下1分钟,新合成的DNA双链又变性成单链模板。(5)第五步重复(repeat)

温度循环

95o C 5min94o C 1min

72o C 2min

50o C 1min

PCR的特点

(1)特异性强①PCR使用专门合成的DNA引物。②延伸过程是在高温下进行。这就避免了一般DNA聚合酶污染和非引物延伸形成的DNA。提高了反映的特异性。

(2)敏感性高需要的模板量极低。理论上只要一条模板链,32次循环就可合成约109条!(3)快速整个PCR过程约4小时即可完成。

(4)简便对模板的纯度要求低,不需要纯化,甚至可以直接用细菌。已固定或包埋的组织切片也可以直接用于作模板。

(5)可以扩增mRNA 先用逆转录酶将mRNA合成cDNA,再以cDNA为模板进行扩增。

目的基因的制备:

目的基因:即供体,准备要分离、改造、扩增或表达的基因。主要是编码蛋白质(酶)的结构基因。是能满足人们特殊需要有价值的基因

目的基因的制备方法:(已知目的基因序列:直接分离法,,PCR法,化学合成法;未知目的基因序列:构建基因(DNA)文库分离法,差别杂交法和差示分析法)

直接分离法:限制性内切酶法随机片断化(1. 限制性内切酶局部消化法 2. 机械切割法)

化学合成法:磷酸二酯法、磷酸三酯法、亚磷酸三酯法、固相合成法自动化合成法。

PCR扩增获得目的基因

1. 直接从基因组中扩增

(1)提取基因组DNA作模板

(2)根据目的基因序列设计引物

(3)PCR扩增

适合扩增原核生物基因。

真核生物基因组含有内含子!

2. 从mRNA中扩增: RT-PCR

(1)提取基因组total RNA

(2)反转录合成总cDNA作模板

(3)根据目的基因序列设计引物

(4)PCR扩增

适合扩增真核生物基因。

原核生物不易得到mRNA,也不含有polyA尾。

.什么是Gene library?它与cDNA library有何区别?

由大量的含有基因组DNA(即某一生物的全部DNA序列)的不同DNA片段的克隆所构成的群体, 称之为基因文库。一个完全的基因文库,应该能够保证从中筛选到目的基因。

由某一生物的特定器官或特定发育时期细胞内的mRNA经反转录形成的cDNA,它们所构成的重组DNA克隆群体,则称之为cDNA基因文库

区别:①基因组文库克隆的是任何,包括未知功能的DNA序列、调控基因,cDNA文库克隆的是具有蛋白质产物的结构基因。

②基因组文库克隆的的全部遗传信息,不受时空影响;cDNA文库克隆的是不完全的编码DNA 序列,因它受发育的调控因子的影响。

③基因组文库中的编码基因是真实的基因,含有内含子和外显子;而cDNA克隆的是不含内含子的基因

基因组文库:

构建基因文库的载体选用

载体能够容载的DNA片断大小直接影响到构建完整的基因文库所需要的重组子的数目。(1)对载体的要求载体容量越大,所要求的DNA片断数目越少,所需的重组子越少。(2)目前常用的载体

载体系列:容量为24 kp

cosmid载体:容量为50 kb

YAC:容量为1 Mb

BAC: 容量为300 kb

YAC载体

基因组文库的大小

一个完整的基因组文库所需的克隆总数应取决于外源基因组的大小以及切割片段的大小

估算方法:

基因组文库的克隆数目=基因组DNA总长/DNA插入片段的平均长

例:某生物基因组总长3*106kb,酶切切后片段平均长15kb,

理论上,基因组文库含的克隆数为3*106/15=2*105

一个文库要包含99%的基因组DNA时所需要的克隆数目。

p: 文库包含了整个基因组DNA的概率(99%)

f: 插入载体的DNA片断的平均长度占整个基因

组DNA的百分数

N:所需的重组载体数(克隆数)

基因文库的质量标准

除了尽可能高的完备性(基因文库的完备性是指:在构建的基因文库中任一基因存在的概率)外,一个理想的基因文库应具备下列条件:

重组克隆的总数不宜过大以减轻筛选工作的压力

克隆载体的装载量最好大于基因的长度避免基因被分隔克隆

克隆与克隆之间必须存在足够长度的重叠区域以利克隆排序

克隆片段易于从载体分子上完整卸下

重组克隆能稳定保存、扩增、筛选

Λ噬菌体基因组文库的构建:

Λ噬菌体基因组文库的构建步骤:

获得含目的基因的DNA片段

与Λ噬菌体克隆载体进行重组

连接产物在体外进行包装

基因组文库扩增或目的基因的筛选

一种方法经过分级分离:以EMBL3载体构建文库为例

另一种不经分级分离,通过填充基因组DNA,也是一种较优良的方法(P173

cDNA library:利用某种生物的总mRNA合成cDNA,再将这些cDNA与载体连接,转入细菌细胞中进行保存和扩增,称cDNA文库。代表特定细胞或组织中mRNA的文库

cDNA文库的特点

(1)不含内含子序列。

(2)可以在细菌中直接表达。

(3)包含了所有编码蛋白质的基因。

(4)比DNA文库小的多,容易构建。

RACE法(rapid amplification of cDNA ends)

cDNA末端快速扩增技术,是基于PCR技术由已知的部分cDNA顺序来获得完整cDNA5’和

3‘端的方法,也称锚定PCR和单边PCR 书P186

是以mRNA为模板,反转录合成cDNA的第一条链,然后用PCR技术扩增出从某个特定位点到3‘端或到5’端之间的未知核苷酸序列

基因文库中cDNA 的克隆数目=细胞中总mRNA 的数目/细胞中某种mRNA 的拷贝数 例:获得一个能够代表全部低丰度mRNA 的cDNA 文库的克隆数为=(30*3500+1090*230+10670*14)/14=35750

但实际上所需构建的cDNA 文库的实际值远远超过理论值

估算cDNA 基因文库大小的经验公式:

N-cDNA 基因文库必须的克隆数

P-文库中含目的基因DNA 片段的出现概率 f-某种mRNA 的丰度与总mRNA 数的比值 例:以上述生物为例,若p-99%

则N=ln(1-0.99)/ln(1-14/500500)=16000

目前用同聚物加尾法或双衔接物法,每微克cDNA 都能产生出1*105-6*105个菌落

cDNA 文库对真核生物基因的分析是十分有用的 只含有编码蛋白质的基因文库,减少了无功能基因 ? cDNA 没有内含子,基因可直接在E.Coli 中表达 ? 对鉴别新基因是十分有用的 ? 具有组织和细胞类型特异性

一般不用原核生物的mRNA 构建cDNA 文库 ? 原核生物的mRNA 是很不稳定的

? 原核生物的基因组文库包括了所有的基因组序列,而且是比较容易构建的

cDNA 文库优越性:

1、 cDNA 克隆以mRNA 为材料,特别适用于某些RNA 病毒,

2、 cDNA 基因文库的筛选比较简单易行,一个完整的cDNA 基因文库所含克隆数,要比一个

完全的基因组文库所含的克隆数少得多

3、 cDNA 克隆出现的假阳性概率比较低(阳性克隆含有目的基因的序列)

4、 cDNA 克隆可用于在细菌中能进行表达的基因的克隆,直接用于基因工程的操作

5、 cDNA 克隆还可用于真核细胞mRNA 的结构和功能研究 局限性: 1·、cDNA 文库所包含的遗传信息要远远少于基因组DNA 文库,并且受细胞来源或发育时期的影响

2、cDNA

基因文库虽能反映mRNA 的分子结构和功能信息,但不能直接获得基因的内含子序列和基因编码区外大量的调控序列的结构与功能方面的信息

3、在cDNA 基因文库中,相应于高丰度的mRNA 的cDNA 克隆所占的比例比较高,分离起来容易,反之

mRNA 差异显示反转录PCR (DD RT-PCR )

mRNA differential display RT-PCR :分离鉴定差别表达基因 P223 mRNA 差别显示法的优点:

? 放大后,灵敏度高,快速,重复性好,所需材料少

?可以同时比较多种细胞类型,展现所有差异

?可用回收并经扩增的cDNA直接作探针

?缺点:

?需大范围的筛选

?出现漏检,高频率假阳性

?间距小,切割难度大

抑制性减法杂交(SSH) P231

抑制性减法杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)是RDA技术的发展,它是一种将检测子cDNA单链标准化步骤和消减杂交技术结合为一体的技术。用于分离两组基因表达差异较小的基因

(2)SSH技术的优点:

?特异性强,假阳性率低

?高灵敏性,保证低丰度mRNA检出

?速度快、效率高

不足之处:

?对起始材料要求较多,一般需要微克量级的的Mrna

?得到的cDNA是限制酶消化的cDNA,不是全长Cdna

?所研究材料的差异不能太大,最好是细微差异

因此,SSH法成为目前寻找有差别表达的基因的适用方法

EST(Expressed Sequence Tags):基因表达的短cDNA序列

ST(sequence tag):寡核苷酸序列标签

基因表达系列分析法(serial analysis of gene expression SAGE)用来分离在不同发育阶段和生理状态下差别表达的基因,也可以从大量基因的转录产物进行定量分析,从中找到新基因确定基因表达的种类和丰度。

原理:

一是从转录物某一特定位置上分离得到9—10bp的寡核苷酸序列标签(ST),它含有确定一个独特转录物的足够信息量,可代表此转录物的特异性

二是多个序列标签(ST)能以锚定酶(AE,识别位点为四碱基的限制性核酸内切酶)识别位点序列相隔相互连成双标签序列的多联体,

将该多联体序列克隆到一个载体中,用连续的方法进行多联体的序列分析,再通过计算机处理,确定每一种序列(ST)代表转录产物的种类和出现频率,由此实现对转录物的高效、快速和大量的分析

顺反子(cistron,又叫作用子):功能单位,从功能单位的意义上讲,一个顺反子相当于一个基因的DNA或RNA单元,它的产物是一个完整的肽链或者RNA分子,平均大小约为

500-1500bp。(顺反子是一个必须保存完整才具有正常生理功能的遗传物质最小单位,实际上它是基因的同义词,是一个功能水平上的基因, 不是一个突变单位和交换单位。)

重组子:重组单位,基因内部有多个重组单位,也称重组子(recon)不能由重组分开的最小单位。

转化子:导入的外源DNA能稳定存在的受体细胞

重组子:含有重组DNA分子的转化子

期望重组子:重组子含有外源目的基因,又称阳性克隆子

转化(transformation):大肠杆菌捕获质粒DNA的过程。

转染(transfection):大肠杆菌捕获噬菌体DNA的过程。

转导(transduction):借助噬菌体把外源DNA导入细菌的过程

DNA体外连接应注意的事项

1.插入片断与载体的酶切位点互补(相同的粘性末端才能有效地连接。尽量避免平端连接。

决不能进行非粘性末端连接

2. DNA插入的方向正确

3. 插入基因的开放阅读框(ORF)正确

4. 防止载体自身环化连接

(1)提高插入片断的用量连接反应体系中,插入片断比载体多10倍以上。

(2)用碱性磷酸酶处理载体载体切口的5’磷酸被除去,不能自我连接。但可以与插入片断以单链连接

扬州大学基因工程期末试题复习要点整理

基因工程期末试题复习要点整理 基因工程是70年代出现的一门科学,是生物学最具生命力和最引人注目的前沿科学之一,是现代生物技术的代表,是生命科学类专业中的一门重要的专业课。本课程主要介绍基因工程概述、重组DNA基本技术及原理、基因克隆、基因的分离及鉴定、基因工程的表达系统、基因工程的应用等。通过本课程的学习,使学生掌握基因工程技术的基本原理和了解该技术在动物、植物和微生物等方面的应用,为今后从事生物学教学、生物技术研究和产品开发,或进一步的研究生学习科研打下坚实的理论及专业基础。扬州大学试题纸 一、名词解释:共10题,每题2分,共20分。 1. 基因: 是DNA分子中含有特定遗传信息的一段核苷酸序列,是遗传物质的最小功能单位。 2. 定位克隆: 获取基因在染色体上的位置信息,然后采用各种方法对该基因进行定位和克隆 3. 融合基因: 是指应用DNA体外重组技术构建的一类具有来自两个或两个以上的不同基因核苷酸序列的新型基因。 4. 转化子: 导入外源DNA后获得了新遗传标志的细菌细胞或其他受体细胞,又称重组体。 5. 人工接头:是人工合成的具有一个或数个特定限制性内切酶识别和切割序列的双股平端DNA短序列。 6. RT-PCR: 是指以mRNA在反转录酶作用下合成cDNA第一链为模板进行的PCR。 7. ORF : 起始于AUG、止于UAA、UGA、UAG的连续的密码子区域,是潜在的编码区。 8. MCS: 指载体上人工合成的含有紧密排列的多种限制核酸内切酶的酶切位点的DNA片段。 9. gene targeting : 基因工程中利用活细胞染色体DNA可与外源DNA的同源性DNA序列发生重组的性质,来进行定点修饰改造染色体上某一目的基因的技术 10. 5’RACE: 是一种通过PCR进行cDNA末端快速克隆的技术,是以mRNA为模板反转录成cDNA第一链后用PCR技术扩增出某个特异位点到5’端之间未知序列的方法。 四、简答题:共4题,共20分。 1.简述获得目的基因常用的几种方法。(5分)

最新基因工程笔记总结

第二章Enzymes 第四节DNA连接酶Ligase 一、DNA连接酶的发现 二. 连接条件 必须是两条双链DNA。 DNA3’端有游离的-OH,5’端有一个磷酸基团(P)。需要能量。 三、连接反应的机理 1、A TP(NAD+)提供激活的AMP。 2、A TP与连接酶形成共价“连接酶-AMP”复合物,并释放出焦磷酸PPi。 3、AMP 与连接酶的赖氨酸-氨基相连。 4、AMP 随后从连接酶的赖氨酸-氨基转移到DNA 一条链的5’端P上,形成“DNA-腺苷酸”复合物。 5、3’-OH对磷原子作亲核攻击,形成磷酸二脂键,释放出AMP。 Ligase:只连“Nick切口”,不连“Gap缺口” 四. 两种DNA连接酶 1. E. Coli DNA ligase 来源:E.coli 适用:粘性末端(PEG与高浓度一价阳离子存在可连平末端) 2. T4 ligase 来源:T4 phage 适用:粘性末端及平末端 T4 vs. E.coli T4 DNA ligase制备容易,价格便宜,能进行各种类型连接反应,应用更广泛! 五.Ligase的反应温度 最佳温度: 界于酶作用速率和末端结合速率之间,一般认为是4-15℃比较合适。 六. DNA分子连接的四种形式 1. 粘性末端; 2. 平末端; 3. 平末端加尾; 4. 平末端加衔接物(linker)或接头(adaptor) (1)Digestion and Ligation 1.粘性末端连接 Problem: (自我环化作用) 解决方法:a、双酶切(两种内切酶)b、去磷酸 2.平末端连接 粘性末端连接效率高于平末端约100倍! 解决方法:化平末端为粘性末端 3. 平末端连接---同聚物加尾法(1)末端脱氧核苷酸转移酶 功能:5’至3’单链聚合 作用特点:单链;无模版 作用机理: a: 用5’-特异的核酸外切酶处理DNA分子,以便移去少数几个末端核苷酸, 获得3’-OH的单链延伸末端。 b: 加入dA TP/dTTP和末端脱氧核苷酸转移酶组成的反应混合物中,DNA分子的3-OH末端将会出现单纯由poly(dA)和poly(dT)组成的DNA单链延伸。 c: 获得poly(dA)和poly(dT)尾巴,就会彼此连接起来。缺点: 当poly(dA),Poly(dT)不严格等长时,重组DNA分子会有缺口。 需要用DNA聚合酶I填补,然后用DNA连接酶连接最后的缺口。 4. 平末端连接 ---衔接物连接法与接头连接法 (1) 平末端的衔接物连接法 衔接物的5’末端和待克隆的DNA片段的5’-末端,用多核苷酸激酶处理使之磷酸化。通过T4 DNA连接酶的作用使两者连接起来。用适当的限制酶消化具衔接物的DNA分子和克隆载体分子。 (2) 平末端的接头连接法 将具有某种限制性酶(BamHI)粘性末端的典型DNA 接头分子与平末端的DNA片段连接后,后者变成具有粘性末端的DNA分子。 七.热稳定的DNA连接酶——来自嗜热高温放线菌 热稳定的DNA连接酶的应用: 寡核苷酸连接测定法(oligonucleotide ligation assay, OLA) 连接酶链式反应(ligation chain reaction, LCR) 寡核苷酸连接测定法的作用 检测突变 寡核苷酸连接测定法的作用:检测突变。 1. 寡核苷酸连接测定法 (1)原理: 两条寡聚核苷酸探针分子,同一种与之互补变性的靶DNA之间的杂交作用,这两条寡聚核苷酸探针分子在靶DNA分子上的位置是彼此相邻的。 当他们同靶DNA链是完全碱基配对时,便可以被连接酶连接起来。 结合点或靠近结合点处存在和靶DNA错配的碱基两个探针之间不能形成磷酸二脂键。 精品文档

基因工程知识点梳理

生物选修3知识点 专题1 基因工程 基因工程的概念 基因工程是指按照人们的愿望,进行严格的设计,通过,赋予生物以,创造出。基因工程是在 上进行设计和施工的,又叫做。 (一)基因工程的基本工具 1.“分子手术刀”—— (1)来源:主要是从中分离纯化出来的。 (2)功能:能够识别的核苷酸序列,并且使每一条链中的两个核苷酸之间的断开,因此具有。(3)结果:经限制酶切割产生的DNA片段末端通常有两种形式: 和。 2.“分子缝合针”—— (1)两种DNA连接酶()的比较: ①相同点:都缝合键。 ②区别:来源于大肠杆菌,来源于T4噬菌体, 只能将双链DNA片段互补的黏性末端之间的磷酸二酯键连接起来; 而能缝合两种末端,但连接的之间的效率较低。 (2)与DNA聚合酶作用的异同: DNA聚合酶只能将加到已有的核苷酸片段的末端,形成磷酸二酯键。 DNA连接酶是连接两个DNA片段的末端,形成磷酸二酯键。 必须需要模板 3.“分子运输车”—— (1)载体具备的条件:①。 ②,供外源DNA片段插入。 ③,供重组DNA的鉴定和选择。 (2)最常用的载体是 ,它是一 种 。

(3)其它载体: (二)基因工程的基本操作程序 第一步: 1.目的基因是指:基因。 2.原核基因采取获得,真核基因是。人工合成目的基因的 常用方_ 和_。 3. 从基因文库中获取 基因文库(1)概念:将含有某种生物不同基因的许多DNA片段,导入受体菌的群体中储存,各个受体菌分别含有这种生物的不同的基因,称为基因文库。 (2)类型:基因组文库和部分基因文库(如cDNA文库) (1)原理: (2)过程:第一步:加热至90~95℃; 第二步:冷却到55~60℃,; 第三步:加热至70~75℃,。 第二步:(核心步骤)

基因工程简答题总结

基因工程原理复习题思考题 5、简单叙述同尾酶和同裂酶的差别。 同尾酶:来源不同,识别的序列不同,但能切出相同的粘性末端,连接后不能被相关的酶同时切割。 同裂酶:识别序列相同,切割位点有些相同,有些不同。分完全同裂酶和不完全同裂酶(PS:完全同裂酶:识别位点和切点完全相同。 不完全同裂酶:识别位点相同,但切点不同。) 6、连接酶主要有哪些类型?有何异同点?影响连接酶连接效果的因素主要有哪些? 类型:DNA连接酶和RNA连接酶 异同点: 相同点:都能以DNA为模板,从5'向3'进行核苷酸或脱氧核苷酸的聚合反应。 不同点:DNA聚合酶识别脱氧核糖核苷酸,在DNA复制中起作用;而RNA聚合酶聚合的是核糖核苷酸,在转录中起作用。 7、试分析提高平端DNA连接效率的可能方法。(传说中的网上答案) 1、低温下长时间的连接效率比室温下短时间连接的好。 2、在体系中加一点切载体的酶,只要连接后原来的酶切位点消失。这样可避免载体自连,应该可以大大提高平端连接的效率。 3、足够多的载体和插入片段是最重要的。 4、平端的连接对于离子浓度很敏感 5、尽可能缩小连接反应的体积 6、建议放在四度冰箱连接两天效率更高比14度好 8、基因工程中常用的DNA聚合酶主要有哪些? 1)大肠杆菌DNA聚合酶 2)Klenow fragment 3)T7 DNA聚合酶 4)T4 DNA聚合酶 5)修饰过的T7 DNA聚合酶 6)逆转录酶 7)Taq DNA聚合酶 第四章基因克隆的载体系统 1、作为基因工程载体,其应具备哪些条件? 具有针对受体细胞的亲缘性或亲和性(可转移性); 具有合适的筛选标记; 具有较高的外源DNA的载装能力; 具有多克隆位点(MCS); 具有与特定受体细胞相适应的复制位点或整合位点。 3、载体的类型主要有哪些?在基因工程操作中如何选择载体? 基因工程中常用的载体(vector)主要包括质粒(plasmid)、噬菌体(phage)和病毒(virus)三大类。这些载体均需经人工构建,除去致病基因,并赋予一些新的功能,如有利于进行筛选的标志基因、单一的限制酶切点等。 4、质粒转化原理,影响转化率的因素有哪些?

生物选修3专题1 基因工程知识点复习学案

专题1 基因工程 基因工程的概念 基因工程是指按照人们的愿望,进行严格的设计,通过________________________,赋予生物以 _____________________,创造出______________________________________。基因工程是在____________上进行设计和施工的,又叫做__________________。 1. (1 (2 (3 2. (1)两种DNA ②区别:E· (2)与DNA 酸二酯键。 3. (1 (2 _____________________的双链___________DNA (3)其它载体: _________________________________ (二)基因工程的基本操作程序 第一步:__________________________ 1.目的基因是指: ______________________________________________________ 。 2.目的基因可采取_______________-获得,也可以用_____________________。人工合成目的基因的常用方 法有________________和_________________。 3.PCR技术扩增目的基因 (1)原理:_____________________ 将目的基因导入植物细胞:采用最多的方法是________________,其次还有基因枪法和花粉管通道法等。将目的基因导入动物细胞:最常用的方法是 _______________。此方法的受体细胞多是 ____________。将目的基因导入微生物细胞:★原核生物作为受体细胞的原因是繁殖快、多为单细胞、遗传物质相对较少, 最常用的原核细胞是 ____________,其转化方法是:先用 ________处理细

基因工程知识点总结归纳(更新版)

基因工程 绪论 1、克隆(clone):作名词:含有目的基因的重组DNA分子或含有重组分子的无性繁殖。作动词:基因的分离和重组的过程。 2、基因工程(gene engineering):体外将目的基因插入病毒、质粒、或其他载体分子中,构成遗传物质的新组合,并使之掺入到原先没有这些基因的宿主细胞内,且能稳定的遗传。供体、受体和载体是基因工程的三大要素。 3、基因工程诞生的基础 三大理论基础:40年代发现了生物的遗传物质是DNA;50年代弄清楚DNA 的双螺旋结构和半保留复制机理;60年代确定遗传信息的遗传方式。以密码方式每三个核苷酸组成一个密码子代表一个氨基酸。 三大技术基础:限制性内切酶的发现;DNA连接酶的发现;载体的发现 3、基因工程的技术路线:切:DNA片段的获得;接:DNA片段与载体的连接;转:外源DNA片段进出受体细胞;选:选择基因;表达:目的基因的表达;基因工程的工具酶 1、限制性内切酶(restriction enzymes):主要是从原核生物中分离纯化出来的,是一类能识别双链DNA分子中某种特定核苷酸序列,并由此切割DNA双链的核酸内切酶。 2、限制酶的命名:属名(斜体)+种名+株系+序数 3、II型限制性内切酶识别特定序列并在特定位点切割 4、同裂酶:来源不同,其识别位点与切割位点均相同的限制酶。 5、同尾酶:来源不同,识别的靶序列不同,但产生相同的黏性末端的酶形成的新位点不能被原来的酶识别。 6、限制性内切酶的活性:在适当反应条件下,1小时内完全酶解1ug特定的DNA 底物,所需要的限制性内切酶的量为1个酶活力单位。 7、星号活性:改变反应条件,导致限制酶的专一性和酶活力的改变。 8、DNA连接酶的特点:具有双链特异性,不能连接两条单链DNA分子或闭合单链DNA,连接反应是吸能反应,最适反应温度是4至15度,最常用的是T4连接酶。 9、S1核酸酶:特异性降解单链DNA或RNA。

基因工程技术 笔记整理

基因工程技术:按照人们的愿望,进行严密的设计,通过体外DNA重组和转移等技术,有目的地改造生物种性,使现有物种在较短的时间内趋于完善,创造出新的生物类型。 质粒是一种染色体外的稳定遗传因子,大小从1-200kb不等,为双链、共价闭合环状DNA分子cccDNA,并以超螺旋状态存在于宿主细胞中,它具有自主的复制和转录系统。质粒在细胞内的复制一般有二种:紧密控制型(stringent control)和松弛控制型(relaxed control)。前者只在细胞周期的一定阶段进行复制,通常每个细胞内只含有一个或几个质粒分子;后者在整个细胞周期中随时可以复制,在每个细胞中有许多拷贝。 质粒的不相容性:利用共同复制系统的不同质粒不能在同一宿主细胞中共存。 从细胞中分离质粒DNA 的方法都包括3个基本步骤:培养细菌使质粒扩增;收集和裂解细胞;分离和纯化质粒DNA。 溶菌酶:破坏菌体细胞壁;SDS和Triton X-100:使细胞膜裂解。 染色体DNA通常用于构建基因组文库和Southern杂交等。 基因组DNA的提取 植物基因组DNA提取:提取缓冲液(Tris.Cl—保持pH,EDTA,NaCl,SDS),氯仿/戊醇/乙醇溶液—沉淀和抽提DNA,异丙醇—沉淀DNA(提染色体),TE(Tris.Cl,EDTA)--溶解DNA,RNase—保存液,降解RNA,NaAC—加盐,70%乙醇—漂洗。 细菌基因组DNA提取:SDS,蛋白酶K,氯仿:异戊醇(24:1)-- 沉淀DNA,苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)-- 抽提,70%乙醇—漂洗,TE,NaCl—调节离子强度,RNase A,CTAB/NaCl 溶液—CTAB--一种阳离子去污剂,具有从低离子强度溶液中沉淀核酸和酸性多聚糖的特性,异丙醇/无水乙醇—沉淀上清液。 总RNA制备 mRNA的分子结构容易受到RNA酶的攻击反应而降解,加上RNA 酶极为稳定而且广泛存在,因此,在提取过程中应严格防止RNA 酶的污染并设法抑制其活性,这是实验成败的关键。仪器—玻璃器皿:200℃烘2h,塑料器皿:DEPC水液处理—所有器皿最后硅烷化处理。 RNA酶抑制剂:DEPC--强烈但不彻底,与氨水溶液混合会产生致癌物;异硫氰酸胍--最有效,使RNA酶失活;其他--RNA酶蛋白抑制剂(RNasin)SDS, 尿素等。 细胞内总RNA制备方法:异硫氰酸胍热苯酚法、酚/SDS法、Trizol法。(均先将组织在液氮中研磨成粉末) 异硫氰酸胍热苯酚法:异硫氰酸胍(GIT)与β-巯基乙醇共同作用抑制RNase的活性,GIT与十二烷基肌氨酸钠(Sarcosyl)作用使蛋白质变性。 酚/SDS法:用酚和SDS破碎细胞和去除蛋白质,用LiCl选择沉淀RNA以去除DNA 和其它不纯物。 Trizol法:Trizol试剂(含酚、异硫氰酸胍和溶解剂等)。 mRNA提取 制备mRNA原理:分离的总RNA 可利用mRNA3’端含有poly(A)的特点,用oligo(dT)纤维素柱分离,当RNA流经oligo(dT)纤维素柱时,在高盐缓冲液作用下,mRNA被特异的吸附在oligo(dT)纤维素上,然后逐渐降低盐浓度洗脱,在低盐溶液或蒸馏水中,mRNA被洗下。然后经过两次oligo(dT)纤维素柱,可得到较纯的mRNA。纯化的mRNA在70%乙醇中-70℃可保存一年以上。(上样buffer和洗脱buffer)。溶液中无盐时要沉淀RNA,必须加盐NaAC。 琼脂糖凝胶电泳 DNA凝胶电泳:琼脂糖-- 分离DNA片段大小范围广;聚丙烯酰胺-- 小片段,分辨力高。

精编高一下册《基因工程及其应用》知识点梳理:生物篇

精编高一下册《基因工程及其应用》知识点 梳理:生物篇 1.概念:按照人们的意愿,把一种生物的某种基因提取出来,加以修饰改造,然后放到另一种生物的细胞里,定向地改造生物的遗传性状。 2.原理基因重组 3.工具: A.基因的剪刀:限制性内切酶 ①分布:主要在微生物中。 ②作用特点:特异性,即识别特定核苷酸序列,切割特定切点。 ③结果:产生黏性未端(碱基互补配对)。 B.基因的针线:DNA连接酶 ①连接的部位:磷酸二酯键,不是氢键。 ②结果:两个相同的黏性未端的连接。 C.基因的运载工具:运载体 ①作用:将外源基因送入受体细胞。 ②具备的条件:a、能在宿主细胞内复制并稳定地保存。b、具有多个限制酶切点。

c、有某些标记基因。 ③种类:质粒、噬菌体和动植物病毒。 ④质粒的特点:质粒是基因工程中最常用的运载体。 4.基因操作的基本步骤: ①提取目的基因:人们所需要的特定基因,如人的胰岛素基因、抗虫基因、抗病基因、干扰素基因等 ②目的基因与运载体结合(以质粒为运载体):用同一种限制酶分别切割目的基因和质粒DNA(运载体),使其产生相同的黏性末端,将切割下的目的基因与切割后的质粒混合,并加入适量的DNA连接酶,使之形成重组DNA分子(重组质粒) ③将目的基因导入受体细胞常用的受体细胞:大肠杆菌、枯草杆菌、土壤农杆菌、酵母菌、动植物细胞 ④目的基因检测与表达 检测方法如:质粒中有抗菌素抗性基因的大肠杆菌细胞放入到相应的抗菌素中,如果正常生长,说明细胞中含有重组质粒。 表达:受体细胞表现出特定性状,说明目的基因完成了表达过程。如:抗虫棉基因导入棉细胞后,棉铃虫食用棉的叶片时被杀死;胰岛素基因导入大肠杆菌后能合成出胰岛素等。 5.转基因生物和转基因食品的安全性

基因工程期末考试重点知识整理教学文案

基因工程期末考试重点知识整理

基因工程 第一章基因工程概述 1、基因工程的概念(基因工程基本技术路线PPT) 基因工程(Gene Engineering),是指在基因水平上的遗传工程,它是用人为方法将大分子(DNA)提取出来,在离体条件下用适当的工具酶进行切割后,把它与作为载体的DNA分子连接起来,然后与载体一起导入某一更易生长、繁殖的受体细胞中,以让外源遗传物质在其中“安家落户”,进行正常的复制和表达,从而获得新物种的一种崭新的育种技术. 2、基因工程的历史 基因工程准备阶段:1972,第一个重组DNA分子的构建,构建人:Paul Berg 及其同事PPT 基因工程诞生:1973,Cohen & Boyer首次完成重组质粒DNA对大肠杆菌的转化 基因工程发展阶段的几个重要事件: 一系列新的基因工程操作技术的出现; 各种表达克隆载体的成功构建; 一系列转基因菌株、转基因植物、转基因动物等的出现 3、基因工程的内容(P9) 4、基因克隆的通用策略(P12)(基因组文库(鸟枪法)+分子杂交筛选)

第二章分子克隆工具酶 5、限制性核酸内切酶的概念、特点、命名、分类(问答) 概念:一类能识别双链DNA中特殊核苷酸序列,并使每条链的一个磷酸二酯键断开的内脱氧核糖核酸酶,主要存在于细菌体内 特点(参加PPT) 命名:依次取宿主属名第一字母,种名头两个字母,菌株号,然后加上序号。如:从Haemophilus influenze Rd中提取到的第三种限制型核酸内切酶被命名为Hind Ⅲ,Hin指来源于流感嗜血杆菌,d表示来菌株Rd,Ⅲ表示序号。 分类:依据酶的亚单位组成、识别序列的种类以及是否需要辅助因子可分为:Ⅰ型酶、Ⅱ型(Ⅱs型)酶和Ⅲ型酶。 真核细胞中有4中DNA聚合酶:α,β,γ,线粒体DNA聚合酶 原核生物中3中DNA聚合酶:Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ

基因工程复习笔记

第一章 一、电泳 电泳(eletrophorosis) :带电荷的分子在电场中以一定的速率向与其电荷性质相反的电极移动.移动速度称为电泳迁移率。 影响因素:1 电泳迁移率同电场的强度和分子本身所带的净电荷数目成正比。 2. 电泳迁移率同分子与介质的摩擦系数成反比。 3当电场强度一定,电泳介质相同,电荷相同的分子在电场中迁移的速度主要取决于分子本身的大小和形状(构型)。 4分子形状相似的分子的迁移速度主要与分子量相关: 分子量越大,移动越慢。 指示剂:溴酚蓝(Bb):常用指示剂。分子量670,分子筛效应小,近似于自由电泳,呈蓝紫色。二甲苯青(Xc):分子量554.6,呈蓝色,迁移速度比Bb慢。 染料:溴化乙锭(EB) 1、聚丙烯酰胺凝胶电泳优点:比琼脂糖凝胶的分辨率高的多;回收DNA样品纯度高,无色透明,韧性好,银染的凝胶干燥后可长期保存;能装载的DNA量大,达每孔10μgDNA。 2 、SDS-PAGE 原理:SDS是蛋白质的变性剂,使煮沸变性的蛋白质维持线性状态,并与蛋白质结合,使蛋白质带上相同密度负电荷。SDS与蛋白质结合使蛋白质构象改变,成为形状近似雪茄状的长椭圆棒,SDS-蛋白质复合物短轴相同,而长轴与蛋白质的分子量成正比。

蛋白质-SDS复合物电泳的迁移率不受蛋白质原有电荷和形状的影响,只与椭圆棒的长度,即蛋白质分子量有关。 二、PCR技术 定义:聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)技术,以DNA为模板,在引物、dNTPs、Taq酶的作用下,经变性-退货-延伸反复循环,使某个基因在体外特异性地扩增。 PCR法的原理也是利用人工合成带突变位点的诱变引物,通过PCR 扩增而获得定点突变的基因或DNA片段。 影响因素:(1)Taq DNA聚合酶(具有5’→3’聚合酶活性和5’→3’外切酶活性,但没有3’→5’外切酶活性因此不能修复错误的碱基配对)。 (2)引物(primer)一般引物设计为长15—30bp;位置与待扩增的模板DNA区段的两3’端序列互补(5‘端相同)的短DNA;引物的碱基组成:尽可能提高G+C含量,避免连续相同碱基排列或内部回文序列,避免形成引物二聚体。 (3)引物的Tm值:实际复性温度选择低于Tm值5 oC。 (4)dNTPs 含量适中 (5)Mg 2+ 的浓度 (6)对照实验 三、PCR技术的扩展:反向PCR:不对称PCR:差异显示PCR。反向PCR 原理:扩增两个引物外侧的未知序列,使引物的外侧序列“转变” 成内侧序列。扩增前先用限制性内切酶酶切样品DNA,

专题一、基因工程知识点归纳

专题一基因工程 一【高考目标定位】 1、专题重点:DNA重组技术所需的三种基本工具;基因工程的基本操作 程序四个步骤;基因工程在农业和医疗等面的应用;蛋白质工程的原理。 2、专题难点:基因工程载体需要具备的条件;从基因文库中获取目的基 因;利用PCR技术扩增目的基因;基因治疗;蛋白质工程的原理。 二【课时安排】2课时 三【考纲知识梳理】 第1节DNA重组技术的基本工具 教材梳理: 知识点一基因工程的概念:基因工程是指按照人们的愿望,进行格的设计,并通过体外DNA重组和转基因等技术,赋予生物以新的遗传特性,从而创造出更符合人们需要的新的生物类型和生物产品。由于基因工程是在DNA分子水平上进行设计和施工的,因此又叫做DNA重组技术。 注意:对本概念应从以下几个面理解: 知识点二基因工程的基本工具 1.限制性核酸切酶——“分子手术刀” (1)限制性切酶的来源:主要是从原核生物中分离纯化来的。 (2)限制性切酶的作用:能够识别双链DNA分子的某种特定的核苷酸序列,并能将每一条链上特定部位的两个核苷酸之间的磷酸二酯键切开。(3)限制性切酶的切割式及结果:①在中心轴线两侧将DNA切开,切口是黏性末端。②沿着中心轴线切开DNA,切口是平末端。 2.DNA连接酶——“分子缝合针” (1)来源:大肠杆菌、T4噬菌体 (2)DNA连接酶的种类:E.coliDNA连接酶和T4DNA连接酶。 (3)作用及作用部位:E.coliDNA连接酶作用于黏性末端被切开的磷酸

二酯键,T4DNA连接酶作用于黏性末端和平末端被切开的磷酸二酯键。注意:比较有关的DNA酶 (1)DNA水解酶:能够将DNA水解成四种脱氧核苷酸,彻底水解成膦酸、脱氧核糖和含氮碱基 (2)DNA解旋酶:能够将DNA或DNA的某一段解成两条长链,作用的部位是碱基和碱基之间的氢键。注意:使DNA解成两条长链的法除用解旋酶以外,在适当的高温(如94℃)、重金属盐的作用下,也可使DNA 解旋。 (3)DNA聚合酶:能将单个的核苷酸通过磷酸二酯键连接成DNA长链。(4)DNA连接酶:是通过磷酸二酯键连接双链DNA的缺口。注意比较DNA聚合酶和DNA连接酶的异同点。 3.基因进入受体细胞的载体——“分子运输车” (1)分子运载车的种类:①质粒:常存在于原核细胞和酵母菌中,是一种分子质量较小的环状的裸露的DNA分子,独立于拟核之外。②病毒:常用的病毒有噬菌体、动植物病毒等。 (2)运载体作用:①是用它做运载工具,将目的基因转运到宿主细胞中去。②是利用它在受体细胞对目的基因进行大量复制。 (3)作为运载体必须具备的条件:①在宿主细胞中保存下来并大量复制②有多个限制性切酶切点③有一定的标记基因,便于筛选。 思维探究:知识点3、4、5主要是介绍DNA重组技术的三种基本工具及其作用。限制酶──“分子手术刀”,主要是介绍限制酶的作用,切割后产生的结果。在这部分容学习时,应关心的问题之一是:限制酶从哪里寻找?我们可以联想从前学过的容──噬菌体侵染细菌的实验,进而认识细菌等单细胞生物容易受到自然界外源DNA的入侵。那么这类原核生物之所以长期进化而不绝灭,有保护机制?进而联想到可能是有什么酶来切割外源DNA,而使之失效,达到保护自身的目的”。这样就对“限制酶主要是从原核生物中分离纯化出来”的认识提高了一个层次。 基因进入受体细胞的载体──“分子运 输车”的学习容,不能仅仅着眼于记住这几个 条件,而应该深入思考每一个条件的涵,通过 深思熟虑,才能真正明确为什么要有这些条件 才能充当载体。 教材拓展: 拓展点一限制酶所识别序列的特点 限制酶所识别的序列的特点是:呈现碱基互补对称,无论是奇数个碱

高三生物知识点归纳:基因工程及其应用

高三生物知识点归纳:基因工程及其应用 1.概念:按照人们的意愿,把一种生物的某种基因提取出来,加以修饰改造,然后放到另一种生物的细胞里,定向地改造生物的遗传性状。 高考生物知识点归纳 2.原理基因重组 3.工具: A.基因的”剪刀”:限制性内切酶 ①分布:主要在微生物中。 ②作用特点:特异性,即识别特定核苷酸序列,切割特定切点。 ③结果:产生黏性未端(碱基互补配对)。 B.基因的”针线”:DNA连接酶 ①连接的部位:磷酸二酯键,不是氢键。 ②结果:两个相同的黏性未端的连接。 C.基因的”运载工具”:运载体 ①作用:将外源基因送入受体细胞。 ②具备的条件:a、能在宿主细胞内复制并稳定地保存。b、具有多个限制酶切点。 c、有某些标记基因。 ③种类:质粒、噬菌体和动植物病毒。 ④质粒的特点:质粒是基因工程中最常用的运载体。 4.基因操作的基本步骤: ①提取目的基因:人们所需要的特定基因,如人的胰岛素基因、抗虫基因、抗病基因、干扰素基因等 ②目的基因与运载体结合(以质粒为运载体):用同一种限制酶分别切割目的基

因和质粒DNA(运载体),使其产生相同的黏性末端,将切割下的目的基因与切割后的质粒混合,并加入适量的DNA连接酶,使之形成重组DNA分子(重组质粒) ③将目的基因导入受体细胞常用的受体细胞:大肠杆菌、枯草杆菌、土壤农杆菌、酵母菌、动植物细胞 ④目的基因检测与表达 检测方法如:质粒中有抗菌素抗性基因的大肠杆菌细胞放入到相应的抗菌素中,如果正常生长,说明细胞中含有重组质粒。 表达:受体细胞表现出特定性状,说明目的基因完成了表达过程。如:抗虫棉基因导入棉细胞后,棉铃虫食用棉的叶片时被杀死;胰岛素基因导入大肠杆菌后能合成出胰岛素等。

基因工程期末考试重点知识整理

基因工程 第一章基因工程概述 1、基因工程的概念(基因工程基本技术路线PPT) 基因工程(Gene Engineering),是指在基因水平上的遗传工程,它是用人为方法将大分子(DNA)提取出来,在离体条件下用适当的工具酶进行切割后,把它与作为载体的DNA分子连接起来,然后与载体一起导入某一更易生长、繁殖的受体细胞中,以让外源遗传物质在其中“安家落户”,进行正常的复制和表达,从而获得新物种的一种崭新的育种技术. 2、基因工程的历史 基因工程准备阶段:1972,第一个重组DNA分子的构建,构建人:Paul Berg及其同事PPT 基因工程诞生:1973,Cohen & Boyer首次完成重组质粒DNA对大肠杆菌的转化 基因工程发展阶段的几个重要事件: 一系列新的基因工程操作技术的出现; 各种表达克隆载体的成功构建; 一系列转基因菌株、转基因植物、转基因动物等的出现 3、基因工程的内容(P9) 4、基因克隆的通用策略(P12)(基因组文库(鸟枪法)+分子杂交筛选) 第二章分子克隆工具酶 5、限制性核酸内切酶的概念、特点、命名、分类(问答) 概念:一类能识别双链DNA中特殊核苷酸序列,并使每条链的一个磷酸二酯键断开的内脱氧核糖核酸酶,主要存在于细菌体内 特点(参加PPT) 命名:依次取宿主属名第一字母,种名头两个字母,菌株号,然后加上序号。

如:从Haemophilus influenze Rd中提取到的第三种限制型核酸内切酶被命名为Hind Ⅲ,Hin指来源于流感嗜血杆菌,d表示来菌株Rd,Ⅲ表示序号。 分类:依据酶的亚单位组成、识别序列的种类以及是否需要辅助因子可分为:Ⅰ型酶、Ⅱ型(Ⅱs型)酶和Ⅲ型酶。 真核细胞中有4中DNA聚合酶:α,β,γ,线粒体DNA聚合酶 原核生物中3中DNA聚合酶:Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ 6、几个基本概念 粘性末端:两条多聚核苷酸链上磷酸二酯键断开的位置是交错的,对称地分布在识别序列中心位置两侧,这样形成的DNA片段末端称为~。 平末端:两条多聚核苷酸链上磷酸二酯键断开的位置处在识别序列的对称结构中心,这样切割的结果产生的DNA片段末端是平齐的,称之为~。 同裂酶:一些来源不同的限制性核酸内切酶具有相同的识别序列。如:BamHI和BstI均可识别GGATCC。 同尾酶:有些限制性内切酶虽然识别序列不同,但是切割DNA分子产生相同的DNA末端。如:TaqI:TCGA;ClaI:A TCGA T;AccI:GTCGAC 星星活性:某些限制性核酸内切酶在特定条件下,可以在不是原来的识别序列处切割DNA,这种现象称为Star活性。 DNA物理图谱:(多为质粒图谱)

《基因工程》专题复习总结

专题1 基因工程 知识体系构建 专题整合 一、基因工程的基本工具 A.重组DNA技术所用的工具酶是限制酶、连接酶、载体 B.为育成抗除草剂的作物新品种,导入抗除草剂基因时只能以受精卵为受体细胞 C.选用细菌作为重组质粒的受体细胞是因为细菌繁殖快

D.只要目的基因进入了受体细胞就能成功表达 二、基因工程的操作程序 1.目的基因的获取 (1)目的基因:指编码蛋白质的结构基因。 (2)获取方法:从基因文库获取,原核基因也可直接分离获得;真核基因主要是人工合成,人工合成目的基因的常用方法有反转录法和化学合成法。 2.基因表达载体的构建 (1)目的:使目的基因在受体细胞中稳定存在,并且可以遗传至下一代,使目的基因能够表达和发挥作用。 (2)组成:启动子+目的基因+标记基因+终止子。 ①启动子:是一段有特殊结构的DNA片段,位于基因的首端,是RNA聚合酶识别和结合的部位,能驱动基因转录出mRNA,最终获得所需要的蛋白质。 ②终止子:也是一段有特殊结构的DNA片段,位于基因的尾端。 ③标记基因的作用:鉴定受体细胞中是否含有目的基因,从而将含有目的基因的细胞筛选出来。常用的标记基因是抗生素抗性基因。 3.将目的基因导入受体细胞

A.提取目的基因→目的基因导入受体细胞→目的基因与载体结合→目的基因的检测与鉴定 B.目的基因的检测与鉴定→提取目的基因→目的基因与载体结合→目的基因导入受体细胞 C.提取目的基因→目的基因与载体结合→目的基因导入受体细胞→目的基因的检测与鉴定 D.目的基因与载体结合→提取目的基因→目的基因导入受体细胞→目的基因的检测与鉴定 三、蛋白质工程 1.蛋白质工程流程 2.蛋白质工程与基因工程的区别:蛋白质工程的本质是通过改造基因进而形成自然界不存在的蛋白质,所以被形象地称为第二代基因工程;基因工程在原则上只能生产自然界已存在的蛋白质。 训练3 利用蛋白质工程改造天然蛋白质,进而改变其功能,可获得毒副作用减小,专一性、药效和稳定性都增强的理想的药物。如胰岛素是治疗依赖型糖尿病的特效药物,但是天然胰岛素在人体内寿命只有几小时,重症病人每天得注射好几次药物,给病人增加了不便和痛苦。通过蛋白质工程改变胰岛素的空间结构,以延长胰岛素的半衰期,得到长效胰岛素;还可以在不改变胰岛素活性部位结构的前提下,增强其他部位结合强度,使之难以被酶破坏,从而增强其稳定性。 (1)若要批量生产以上提到的长效胰岛素,根据所学知识,需要用到哪些生物工程( )

基因工程及其应用完整版

基因工程及其应用集团标准化办公室:[VV986T-J682P28-JP266L8-68PNN]

第2节基因工程及其应用(第1课时) 知识链接及考试地位 本知识与“DNA分子的结构与复制”、“基因突变和基因重组”、“DNA重组技术的基本工具”、“基因工程的基本操作程序”等内容相联系,考试过程中常设计基因工程的原理、基本工具等基础知识,多以个别填空或选择题的形式呈现。 知识回顾 1、DNA分子的结构特点是什么? 2、什么是基因重组? 学习目标 1、简述基因工程的诞生。 2、简述基因工程的原理及技术。要明确基因工程操作的基本步骤和最基本的工具。 重难点 1.教学重点 基因工程的基本原理。 2.教学难点 基因工程的基本原理 新知探究 传统育种的方法一般只能在生物中进行,很难将一种生物的优良性状移植到生物身上。基因工程的出现使人类有可能按照自己的意愿地改变生物,培育出。 一、基因工程的原理 基因工程又叫做或。通俗地说,就是按照人们的意愿,把一种生物的某种基因提取出来,加以,然后放到另一种生物细胞里,地改造生物的遗传性状。基因工程是在DNA上进行的水平的设计施工,基因的剪刀是指,简称限制酶。其作用特点是一种限制酶只能识别一种序列。基因的针线是指。目前常用的运载体有、和等。质粒存在于许多以及等生物中,是细胞染色体外能够自主复制的小型分子。 基因工程的操作步骤是:、目的基因与运载体结合,目的基因导入受体细胞、目的基因的和。 二、基因工程的原理、操作对象各是什么? 三、限制性内切酶的分布、特点、作用部位和作用结果如何? 四、作为基因的运载体,需具备哪些条件? 五、DNA连接酶的作用对象、位置和结果如何? 六、基因工程的优点是什么?

基因工程总结

简述Southern blot,northern blot,western blot的原理,比较它们的不同. 答:Southern Blot 原理:将待检测的DNA分子用/不用限制性内切酶消化后,通过琼脂糖凝胶电泳进行分离,继而将其变性并按其在凝胶中的位置转移到硝酸纤维素薄膜或尼龙膜上,固定后再与同位素或其它标记物标记的DNA或RNA探针进行反应。如果待检物中含有与探针互补的序列,则二者通过碱基互补的原理进行结合,游离探针洗涤后用自显影或其它合适的技术进行检测,从而显示出待检的片段及其相对大小。用途:检测样品中的DNA及其含量,了解基因的状态, 如是否有点突变、扩增重排等。DNA => 琼脂糖电泳=> 印迹转移=> 预杂交=> 杂交(变性探针)=> 洗膜=> 放射自显影或显色Northern Blot 原理:在变性条件下将待检的RNA样品进行琼脂糖凝胶电泳,继而按照同Southern Blot相同的原理进行转膜和用探针进行杂交检测。用途:检测样品中是否含有基因的转录产物(mRNA)及其含量。 mRNA提取=> 甲醛变性电泳=> 印迹转移=> 预杂交=> 杂交(变性探针)=> 洗膜=> 放射自显影或化学发光 Western Blot 与 Southern Blot或 Northern Blot杂交方法类似,但Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物是蛋白质,“探针”是抗体,“显色”用标记的二抗。经过PAGE分离的蛋白质样品,转移到固相载体(例如硝酸纤维素薄膜)上,固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,且能保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的抗体起免疫反应,再与酶或同位素标记的第二抗体起反应,经过底物显色或放射自显影以检测电泳分离的特异性目的基因表达的蛋白成分。该技术也广泛应用于检测蛋白水平的表达。 不同:所用于分析的对象不同。 Northern杂交用于分析RNA; Southern杂交用于分析DNA; Western杂交用于分析蛋白质。 转基因动物与转基因植物的产生有什么不同? 答:技术原理相同,用转基因技术将具体特殊经济价格的外源基因导入动植物体内,不但表达出人类所需要的优良性状(如抗虫,抗病,抗除草剂,抗倒伏,产肉,产蛋量高),还可以通过蛋白质重新组合得到新的品种。但是,对动物和植物进行目的基因导入的方法不同。动物一般采用显微注射法将带有目的基因的病毒注入细胞;而植物一般采用农杆菌转化法或基因枪法将目的基因导入受体细胞。

专题1基因工程知识点梳理(含教材答案)

专题1 基因工程 ※基因工程的概念: 基因工程是指按照人们的愿望,进行严格的设计,通过体外DNA重组和转基因技术,赋予生物以新的遗传特性,创造出更符合人们需要的新的生物类型和生物产品。基因工程是在DNA分子水平上进行设计和施工的,又叫做DNA重组技术。 ﹡原理:基因重组 ﹡目的:创造出更符合人们需要的新的生物类型和生物产品。 ﹡意义:能够打破生物种属的界限(即打破生殖隔离,克服远源杂交不亲和的障碍),在分子水平上定向改变生物的遗传特性。 ﹡操作水平:DNA分子水平 【思考】: (1)基因工程的物质基础是:所有生物的DNA均由四种脱氧核苷酸组成。 (2)基因工程的结构基础是:所有生物的DNA均为双螺旋结构。 (3)一种生物的DNA上的基因之所以能在其他生物体内得以进行相同的表达,是因为它们共用一套遗传密码子。 一、基因工程的基本工具 1.“分子手术刀”——限制性核酸内切酶(限制酶) (1)来源:主要是从原核生物中分离纯化出来的。 (2)功能:能够识别双链DNA分子的某种特定的核苷酸序列,并且使每一条链中特定部位的两个核苷酸之间的磷酸二酯键断开,因此具有专一性。 (3)结果:经限制酶切割产生的DNA片段末端通常有两种形式:黏性末端和平末端(回文结构特点)。 ①在中心轴线两侧将DNA切开,切口是黏性末端。 ②沿着中心轴线切开DNA,切口是平末端。 2.“分子缝合针”——DNA连接酶

(1)分类:根据酶的来源不同,可分为E·coliDNA连接酶和T4DNA连接酶两类 (2)功能:恢复被限制酶切开了的两个核苷酸之间的磷酸二酯键。 ★两种DNA连接酶(E·coliDNA连接酶和T4DNA连接酶)的比较: ①相同点:都缝合磷酸二酯键 ②区别:E.coIiDNA连接酶来源于大肠杆菌,只能使黏性末端之间连接; T4DNA连接酶能缝合两种末端,但连接平末端之间的效率较低。 (3)与DNA聚合酶作用的异同: DNA聚合酶只能将单个核苷酸加到已有的核苷酸片段的末端,形成磷酸二酯键。DNA连接酶是连接两个DNA片段的末端,形成磷酸二酯键。 (4)与DNA分子相关的酶

基因工程复习总结.docx

思考题 第二章分子克隆工具酶 1简述基因工程研究用的工具酶的类型和作用特点。 常用的工具酶 硝基序列内部进庁切割 DrU逵接癖 DT?A 1 i HaSe 将两条以上的纯性HA方子咸序喪傕化昭成磷酸二酣键逢接战一6盘傢 DNAJSt 合BBl DNA PDIytoeraSe 1通?u≡ιg'掰遥一蝎如械昔≡κ???板. 从3'方向令咸新生的互补谜 专一懺降解RMA 内切械肢晦.4?M4tl?或双1?DNA 2?说明限制性内切核酸酶命名原则(举例)

重点高中生物选修三知识点总结

重点高中生物选修三知识点总结

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高中生物选修三知识点总结 一、基因工程 1. 基因工程的诞生 (1)基因工程:按照人们的意愿,进行严格的设计,并通过体外DNA 重组和转基因等技术,从而创造出更符合人们需要的新的生物类型和生物产品。 (2)基因工程诞生的理论基础是在生物化学、分子生物学和微生物学科的基础上发展起来,技术支持有基因转移载体的发现、工具酶的发现,DNA 合成和测序仪技术的发明等。 2. 基因工程的原理及技术 (3)基因工程操作中用到了限制酶、DNA 连接酶、运载体 考点限制酶细化: 限制酶主要从原核生物生物中分离纯化出来,这种酶在原核生物中的作用是识别DNA 分子的特定核苷酸序列,并且使每条链中特定部位的两个核苷酸之间的磷酸二酯键断开。 ①限制酶的特性是识别特定核苷酸序列,切割特定切点。限制酶产生的末端有两种:粘性末端和平末端。 ②DNA 连接酶与DNA 聚合酶的作用部位是磷酸二酯键,二者在作用上的区别为前者是恢复被限制性内切酶切开的两个核苷酸之间的磷酸二酯键,后者单个的核苷酸连接到DNA分子上。 ③作为基因工程的载体应该具备标记基因、多个限制性内切酶切点、能够在宿主细胞内复制和稳定存等特点。 ⑤常见的载体种类有质粒、动植物病毒、噬菌体 (4)基因工程四步骤:目的基因的获取、基因表达载体的构建、将目的基因导入受体细胞、目的基因的检测和表达。 考点细化: ①目的基因的获取方法为根据基因的核苷酸序列、基因的功能、基因在载体上的位置、基因的转录产物、以及基因的表达产物蛋白质等特性来获取目的基因。 ②基因文库、基因组文库、cDNA 文库的区别:含有某种生物不同基因的许多DNA 片段,导入受体菌的群体中储存,各个受体菌体分别含有这种生物的不同基因,称之为基因文库。如果含有一种生物所有基因,叫做基因组文库。只包含一种生物的一部分基因,这种基因文库叫做部分基因文库,如cDNA 文库。 ③基因重组操作中构建基因表达载体的目的是将目的基因在受体细胞中稳定存在,并且遗传给下一代,同时目的基因能够表达和发挥作用。 ④一个完整的基因表达载体包括:目的基因、启动子、终止子、标记基因。 ⑤将目的基因导入植物细胞、动物细胞和微生物细胞的常用方法分别是脓杆菌转化法、显微注射法、Ca2+处理法。 ⑥基因工程的受体细胞选择,植物可以采用体细胞,动物不能用体细胞,一般采用受精卵细胞。因为受精卵具有全能性。 ⑦当受体细胞是大肠杆菌时常用Ca2+处理细胞,这样做的目的是使细胞处于一种能够吸收周围环境中的DNA 分子的感受态细胞。 ⑧目的基因的检测:转基因生物的DNA 是否插入了目的基因(DNA分子杂交技术); 目的基因是否转录出了mRNA(分子杂交技术); 目的基因是否翻译成蛋白质(抗原-抗体杂交); 个体生物学水平鉴定(直接观察和检测性状)。 ⑨目的基因的获取、基因表达载体的构建、目的基因的检测和表达一般需要碱基互补配对。将目的基因导入受体细胞不需要碱基互补配对

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